Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H0ECQ8

Protein Details
Accession H0ECQ8    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
272-293TTTTNGGRKKKRKGAMTNPSTYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
279-284RKKKRK
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MARKKWIDKKTATHFTLVHRPQNDPLLHDAEASSMVLNPTNVPNSSKVKQLDDLASELGSDVNHIRDNEGEAASYGHMRELGSGSGEAHFVEAPAPTNKGKGKQSLEDALRNAKLEDREGIELDEEILPSKNLRKVTYQAQQDVPDALAGFQPDMDPRLREVLEALEDEAYVDEDEDIFGQLAKDGEEIDEEEFEQGAFEDDDEEGWESDDTAKPSKEYSDAPKGPPELLDDEREDHGDGDWMANFSKFKKDQKAQVPLAPSQSDLQSSMMTTTTNGGRKKKRKGAMTNPSTYSMTSSSMFRTEGMSTLDTRFEKLEEKYNEDMDDDNSVSAVSSVSSVQGPVRGDFNNIMDDFLGNYTMSGKKHVKKGKYQSGMEQLDEVRRGLGPAIIRKQYV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.6
3 0.63
4 0.6
5 0.57
6 0.5
7 0.51
8 0.5
9 0.55
10 0.5
11 0.42
12 0.41
13 0.37
14 0.35
15 0.33
16 0.28
17 0.21
18 0.2
19 0.17
20 0.12
21 0.09
22 0.1
23 0.1
24 0.11
25 0.12
26 0.14
27 0.17
28 0.18
29 0.2
30 0.25
31 0.31
32 0.32
33 0.37
34 0.37
35 0.38
36 0.4
37 0.42
38 0.41
39 0.36
40 0.36
41 0.29
42 0.26
43 0.22
44 0.18
45 0.14
46 0.1
47 0.09
48 0.08
49 0.1
50 0.13
51 0.13
52 0.14
53 0.15
54 0.18
55 0.19
56 0.18
57 0.16
58 0.13
59 0.14
60 0.14
61 0.14
62 0.11
63 0.08
64 0.09
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.09
75 0.09
76 0.08
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.09
81 0.1
82 0.13
83 0.13
84 0.18
85 0.21
86 0.27
87 0.31
88 0.36
89 0.39
90 0.41
91 0.45
92 0.48
93 0.49
94 0.47
95 0.44
96 0.41
97 0.38
98 0.34
99 0.29
100 0.25
101 0.22
102 0.2
103 0.2
104 0.18
105 0.19
106 0.18
107 0.18
108 0.15
109 0.14
110 0.13
111 0.11
112 0.09
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.13
118 0.15
119 0.17
120 0.19
121 0.22
122 0.26
123 0.33
124 0.4
125 0.4
126 0.4
127 0.41
128 0.4
129 0.38
130 0.34
131 0.26
132 0.19
133 0.14
134 0.11
135 0.09
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.13
146 0.13
147 0.12
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.11
152 0.11
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.08
198 0.09
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.12
203 0.13
204 0.14
205 0.15
206 0.2
207 0.28
208 0.3
209 0.31
210 0.34
211 0.34
212 0.32
213 0.29
214 0.25
215 0.2
216 0.19
217 0.2
218 0.18
219 0.19
220 0.19
221 0.19
222 0.17
223 0.13
224 0.11
225 0.1
226 0.09
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.09
233 0.09
234 0.16
235 0.2
236 0.26
237 0.35
238 0.4
239 0.47
240 0.56
241 0.64
242 0.59
243 0.59
244 0.56
245 0.49
246 0.47
247 0.39
248 0.31
249 0.22
250 0.2
251 0.18
252 0.15
253 0.14
254 0.11
255 0.11
256 0.1
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.09
261 0.13
262 0.19
263 0.23
264 0.31
265 0.41
266 0.5
267 0.6
268 0.67
269 0.69
270 0.73
271 0.79
272 0.82
273 0.83
274 0.82
275 0.78
276 0.71
277 0.67
278 0.57
279 0.47
280 0.38
281 0.29
282 0.23
283 0.18
284 0.17
285 0.16
286 0.17
287 0.17
288 0.15
289 0.16
290 0.14
291 0.15
292 0.16
293 0.16
294 0.16
295 0.17
296 0.22
297 0.2
298 0.2
299 0.19
300 0.18
301 0.21
302 0.21
303 0.3
304 0.28
305 0.34
306 0.36
307 0.37
308 0.36
309 0.33
310 0.31
311 0.23
312 0.23
313 0.17
314 0.14
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.09
319 0.08
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.07
324 0.07
325 0.08
326 0.09
327 0.12
328 0.14
329 0.14
330 0.17
331 0.17
332 0.19
333 0.21
334 0.22
335 0.23
336 0.22
337 0.21
338 0.18
339 0.18
340 0.16
341 0.14
342 0.14
343 0.08
344 0.08
345 0.11
346 0.14
347 0.15
348 0.21
349 0.29
350 0.35
351 0.45
352 0.54
353 0.58
354 0.65
355 0.76
356 0.79
357 0.8
358 0.77
359 0.76
360 0.77
361 0.72
362 0.62
363 0.55
364 0.47
365 0.43
366 0.41
367 0.33
368 0.23
369 0.21
370 0.21
371 0.18
372 0.19
373 0.19
374 0.26
375 0.34