Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X6NED3

Protein Details
Accession A0A1X6NED3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-214NTIKTAHKPIRRTNIQKRDWAHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
470-503GARAAAPQRGQRGGPVGRGGQRGGMPARGGAPSA
Subcellular Location(s) cyto 13, nucl 7, cysk 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MGDLMHHILHPDPSNSAELLSELGLSGLPSREQVHAQIEEKLLLPKERLPDHWLSTYQVHWEHELSVPSLLSLDPSPPPTTLAFVRTGLQGRVTGYTEVSTPRISSGLTSTSLDRAPGPSSNFVRGKAGYVPFWPGGLEDVAAESKAIDSLSENSKGLRKVAPGLTRGLRLPGDDTEEALDDLEDLSQRTHLNTIKTAHKPIRRTNIQKRDWAHEVDINRPMTNFHELVPEMAHKYPFELDTFQKEAVYHLEMGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAVKHMTRAIYTSPIKALSNQKYRDFKQTFSSSSVGILTGDVQINPEASCLIMTTEILRSMLYKGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDAERGVVWEEVIIMLPDHVNIILLSATVPNTKEFADWVGRTKKKDIYVISTAKRPVPLEHYLYAGRDLHKIVDANRQFLGQGYKGAGEALRRKQDKEREAAGLAPVQRLGARAAAPQRGQRGGPVGRGGQRGGMPARGGAPSARGGAPRTFHQPDKNLYVHLLGNLRKKALLPVVVFTLSKKRCEENASTLTNADLCTSVEKSEVHVAIEKALSRLKGSDRKLPQIRRMRDLLSRGIGVHHGGLLPIVKEVVEILFARGLVKVLFATETFAMGVNMPAKCVVFSGIRKHDGRSFRDILPGEYTQMAGRAGRRGLDTTGTVVITSNDELPEQGTLQQMILGAPSKLQSQFRLTYNMILNLLRVEALRVEEMIKRSFSENRTQKLLPDHMKKVIESEKTLSRLPKLSCDVCSPDIERFYDISYEIVERNDVLHATAASHPQGNKMLSAGRVVILRDGHFKWHIAAILKSAPVIENLKSYFVLAMVDPETKRGANDVDPQSLPPRWPPLPASLLVDDATYELRAVPLTSIAMVTAQTIKVDVDLIVLGHRISHMQDAVKSLSIVLDQWLQSDTIPEIDWSRVRSLDFQETLGARNELVVKSAECQSVNCEDFEDHYAIIHGEKILKANIAELKRTISDQNLELIPDYEQRIAVLQDLKFIDDNSTVLLKGRVACEINSANELVLTELILENTLAPFDPEEVVALLSCFVFQEKTDSEPKIPPKLEEGRDAILAIADRVARTQDYHKVPGQDFRQLKFGLMEVVYEWAKGMPFEQITELTDVPEGTIVRVITRLDETCREVRDAARVIGDAELFKKMEEAQIKIKRDIVFAASLYF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.22
3 0.21
4 0.17
5 0.14
6 0.14
7 0.12
8 0.1
9 0.07
10 0.07
11 0.07
12 0.07
13 0.09
14 0.09
15 0.09
16 0.11
17 0.14
18 0.16
19 0.18
20 0.22
21 0.26
22 0.3
23 0.31
24 0.34
25 0.33
26 0.32
27 0.31
28 0.32
29 0.29
30 0.26
31 0.27
32 0.27
33 0.33
34 0.35
35 0.37
36 0.39
37 0.43
38 0.45
39 0.48
40 0.45
41 0.42
42 0.4
43 0.38
44 0.38
45 0.35
46 0.32
47 0.3
48 0.29
49 0.27
50 0.28
51 0.28
52 0.24
53 0.21
54 0.19
55 0.16
56 0.16
57 0.13
58 0.12
59 0.11
60 0.12
61 0.13
62 0.17
63 0.19
64 0.19
65 0.22
66 0.2
67 0.23
68 0.23
69 0.24
70 0.23
71 0.22
72 0.24
73 0.26
74 0.28
75 0.25
76 0.24
77 0.22
78 0.21
79 0.23
80 0.24
81 0.2
82 0.18
83 0.18
84 0.18
85 0.19
86 0.19
87 0.17
88 0.15
89 0.16
90 0.16
91 0.15
92 0.15
93 0.15
94 0.16
95 0.17
96 0.18
97 0.19
98 0.21
99 0.21
100 0.21
101 0.19
102 0.18
103 0.19
104 0.22
105 0.24
106 0.29
107 0.31
108 0.39
109 0.4
110 0.39
111 0.41
112 0.37
113 0.36
114 0.35
115 0.34
116 0.28
117 0.27
118 0.31
119 0.27
120 0.26
121 0.24
122 0.17
123 0.16
124 0.15
125 0.13
126 0.08
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.07
137 0.11
138 0.16
139 0.19
140 0.19
141 0.2
142 0.25
143 0.26
144 0.27
145 0.27
146 0.25
147 0.29
148 0.36
149 0.39
150 0.36
151 0.41
152 0.41
153 0.4
154 0.38
155 0.35
156 0.29
157 0.25
158 0.25
159 0.21
160 0.25
161 0.22
162 0.22
163 0.2
164 0.2
165 0.19
166 0.16
167 0.14
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.06
173 0.07
174 0.09
175 0.1
176 0.11
177 0.16
178 0.19
179 0.21
180 0.26
181 0.3
182 0.36
183 0.41
184 0.48
185 0.51
186 0.54
187 0.58
188 0.62
189 0.68
190 0.7
191 0.75
192 0.78
193 0.81
194 0.8
195 0.8
196 0.75
197 0.72
198 0.66
199 0.6
200 0.52
201 0.46
202 0.42
203 0.4
204 0.43
205 0.37
206 0.33
207 0.29
208 0.27
209 0.25
210 0.29
211 0.24
212 0.18
213 0.21
214 0.21
215 0.22
216 0.23
217 0.22
218 0.19
219 0.2
220 0.21
221 0.16
222 0.17
223 0.19
224 0.18
225 0.18
226 0.18
227 0.19
228 0.24
229 0.27
230 0.26
231 0.24
232 0.23
233 0.22
234 0.22
235 0.22
236 0.16
237 0.13
238 0.13
239 0.12
240 0.13
241 0.11
242 0.08
243 0.05
244 0.05
245 0.04
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.05
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.09
271 0.11
272 0.12
273 0.18
274 0.2
275 0.21
276 0.22
277 0.24
278 0.24
279 0.27
280 0.35
281 0.36
282 0.44
283 0.47
284 0.53
285 0.58
286 0.6
287 0.66
288 0.59
289 0.52
290 0.51
291 0.52
292 0.47
293 0.44
294 0.42
295 0.31
296 0.3
297 0.28
298 0.19
299 0.14
300 0.11
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.08
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.06
318 0.07
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.09
324 0.12
325 0.11
326 0.1
327 0.11
328 0.14
329 0.15
330 0.14
331 0.15
332 0.13
333 0.13
334 0.13
335 0.12
336 0.09
337 0.09
338 0.1
339 0.08
340 0.07
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.1
345 0.09
346 0.08
347 0.1
348 0.1
349 0.07
350 0.07
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.05
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.05
373 0.06
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.1
379 0.09
380 0.09
381 0.12
382 0.15
383 0.16
384 0.22
385 0.3
386 0.33
387 0.36
388 0.39
389 0.41
390 0.4
391 0.45
392 0.41
393 0.38
394 0.43
395 0.47
396 0.45
397 0.45
398 0.43
399 0.39
400 0.38
401 0.32
402 0.27
403 0.26
404 0.28
405 0.28
406 0.27
407 0.28
408 0.26
409 0.26
410 0.26
411 0.22
412 0.18
413 0.16
414 0.16
415 0.14
416 0.15
417 0.16
418 0.16
419 0.23
420 0.23
421 0.23
422 0.23
423 0.23
424 0.21
425 0.21
426 0.22
427 0.13
428 0.13
429 0.12
430 0.12
431 0.12
432 0.12
433 0.11
434 0.12
435 0.18
436 0.22
437 0.3
438 0.31
439 0.34
440 0.41
441 0.49
442 0.5
443 0.49
444 0.46
445 0.41
446 0.4
447 0.39
448 0.32
449 0.27
450 0.22
451 0.17
452 0.13
453 0.11
454 0.1
455 0.1
456 0.1
457 0.09
458 0.08
459 0.11
460 0.14
461 0.18
462 0.19
463 0.21
464 0.23
465 0.23
466 0.23
467 0.21
468 0.24
469 0.22
470 0.22
471 0.21
472 0.21
473 0.23
474 0.24
475 0.23
476 0.19
477 0.18
478 0.19
479 0.18
480 0.16
481 0.12
482 0.12
483 0.13
484 0.11
485 0.11
486 0.08
487 0.09
488 0.09
489 0.11
490 0.11
491 0.1
492 0.12
493 0.14
494 0.16
495 0.16
496 0.22
497 0.23
498 0.25
499 0.29
500 0.31
501 0.33
502 0.37
503 0.36
504 0.29
505 0.27
506 0.26
507 0.22
508 0.2
509 0.21
510 0.18
511 0.23
512 0.23
513 0.23
514 0.21
515 0.21
516 0.22
517 0.2
518 0.21
519 0.16
520 0.16
521 0.17
522 0.18
523 0.17
524 0.15
525 0.22
526 0.18
527 0.21
528 0.22
529 0.22
530 0.24
531 0.29
532 0.32
533 0.31
534 0.35
535 0.34
536 0.32
537 0.31
538 0.28
539 0.23
540 0.2
541 0.13
542 0.07
543 0.06
544 0.07
545 0.07
546 0.08
547 0.08
548 0.08
549 0.09
550 0.13
551 0.13
552 0.12
553 0.13
554 0.13
555 0.13
556 0.14
557 0.12
558 0.1
559 0.11
560 0.11
561 0.09
562 0.1
563 0.15
564 0.21
565 0.24
566 0.31
567 0.33
568 0.41
569 0.49
570 0.51
571 0.55
572 0.58
573 0.58
574 0.54
575 0.53
576 0.47
577 0.43
578 0.42
579 0.35
580 0.27
581 0.24
582 0.2
583 0.18
584 0.16
585 0.12
586 0.09
587 0.07
588 0.06
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.05
593 0.04
594 0.04
595 0.04
596 0.03
597 0.04
598 0.03
599 0.04
600 0.04
601 0.05
602 0.05
603 0.05
604 0.06
605 0.06
606 0.06
607 0.05
608 0.05
609 0.04
610 0.04
611 0.05
612 0.04
613 0.06
614 0.06
615 0.06
616 0.06
617 0.06
618 0.06
619 0.05
620 0.06
621 0.08
622 0.08
623 0.08
624 0.08
625 0.08
626 0.08
627 0.08
628 0.09
629 0.09
630 0.12
631 0.19
632 0.22
633 0.27
634 0.28
635 0.3
636 0.34
637 0.37
638 0.38
639 0.39
640 0.38
641 0.34
642 0.39
643 0.38
644 0.33
645 0.31
646 0.27
647 0.21
648 0.17
649 0.17
650 0.11
651 0.12
652 0.11
653 0.08
654 0.09
655 0.1
656 0.1
657 0.11
658 0.12
659 0.12
660 0.13
661 0.13
662 0.12
663 0.11
664 0.12
665 0.11
666 0.1
667 0.09
668 0.08
669 0.08
670 0.08
671 0.07
672 0.06
673 0.07
674 0.07
675 0.07
676 0.07
677 0.06
678 0.07
679 0.07
680 0.07
681 0.07
682 0.07
683 0.07
684 0.07
685 0.07
686 0.06
687 0.06
688 0.06
689 0.07
690 0.08
691 0.1
692 0.12
693 0.13
694 0.17
695 0.21
696 0.22
697 0.27
698 0.25
699 0.28
700 0.28
701 0.27
702 0.23
703 0.2
704 0.18
705 0.13
706 0.13
707 0.08
708 0.07
709 0.06
710 0.05
711 0.06
712 0.06
713 0.06
714 0.08
715 0.1
716 0.12
717 0.14
718 0.13
719 0.14
720 0.16
721 0.2
722 0.22
723 0.29
724 0.34
725 0.35
726 0.4
727 0.39
728 0.4
729 0.41
730 0.46
731 0.44
732 0.44
733 0.44
734 0.44
735 0.45
736 0.42
737 0.41
738 0.39
739 0.34
740 0.29
741 0.29
742 0.28
743 0.3
744 0.33
745 0.3
746 0.26
747 0.3
748 0.28
749 0.31
750 0.31
751 0.31
752 0.3
753 0.32
754 0.33
755 0.29
756 0.3
757 0.26
758 0.24
759 0.24
760 0.23
761 0.21
762 0.17
763 0.16
764 0.15
765 0.14
766 0.11
767 0.1
768 0.1
769 0.1
770 0.09
771 0.09
772 0.08
773 0.08
774 0.09
775 0.08
776 0.07
777 0.07
778 0.07
779 0.08
780 0.1
781 0.11
782 0.11
783 0.13
784 0.13
785 0.15
786 0.19
787 0.17
788 0.16
789 0.15
790 0.16
791 0.15
792 0.15
793 0.13
794 0.11
795 0.12
796 0.12
797 0.13
798 0.12
799 0.13
800 0.16
801 0.16
802 0.19
803 0.19
804 0.19
805 0.18
806 0.18
807 0.2
808 0.17
809 0.17
810 0.16
811 0.17
812 0.17
813 0.15
814 0.14
815 0.12
816 0.12
817 0.14
818 0.12
819 0.13
820 0.14
821 0.15
822 0.15
823 0.15
824 0.13
825 0.11
826 0.11
827 0.07
828 0.09
829 0.09
830 0.12
831 0.12
832 0.13
833 0.14
834 0.14
835 0.14
836 0.14
837 0.14
838 0.15
839 0.24
840 0.26
841 0.28
842 0.28
843 0.29
844 0.31
845 0.31
846 0.28
847 0.23
848 0.26
849 0.23
850 0.26
851 0.27
852 0.28
853 0.3
854 0.3
855 0.3
856 0.24
857 0.25
858 0.22
859 0.19
860 0.14
861 0.12
862 0.11
863 0.07
864 0.06
865 0.05
866 0.06
867 0.06
868 0.06
869 0.06
870 0.06
871 0.06
872 0.06
873 0.06
874 0.06
875 0.06
876 0.06
877 0.06
878 0.07
879 0.07
880 0.07
881 0.08
882 0.07
883 0.07
884 0.08
885 0.07
886 0.06
887 0.06
888 0.06
889 0.06
890 0.06
891 0.06
892 0.05
893 0.06
894 0.06
895 0.07
896 0.09
897 0.11
898 0.12
899 0.14
900 0.17
901 0.18
902 0.18
903 0.17
904 0.14
905 0.13
906 0.11
907 0.1
908 0.09
909 0.11
910 0.1
911 0.11
912 0.12
913 0.11
914 0.11
915 0.12
916 0.11
917 0.09
918 0.09
919 0.09
920 0.1
921 0.13
922 0.15
923 0.16
924 0.17
925 0.18
926 0.19
927 0.22
928 0.25
929 0.3
930 0.29
931 0.27
932 0.29
933 0.28
934 0.29
935 0.27
936 0.23
937 0.15
938 0.16
939 0.18
940 0.14
941 0.15
942 0.14
943 0.13
944 0.15
945 0.19
946 0.2
947 0.17
948 0.18
949 0.2
950 0.26
951 0.26
952 0.24
953 0.21
954 0.19
955 0.21
956 0.24
957 0.21
958 0.14
959 0.13
960 0.14
961 0.13
962 0.12
963 0.11
964 0.09
965 0.1
966 0.11
967 0.13
968 0.13
969 0.14
970 0.14
971 0.17
972 0.22
973 0.22
974 0.24
975 0.23
976 0.24
977 0.24
978 0.26
979 0.24
980 0.22
981 0.23
982 0.22
983 0.25
984 0.23
985 0.22
986 0.21
987 0.19
988 0.17
989 0.17
990 0.18
991 0.15
992 0.14
993 0.14
994 0.15
995 0.14
996 0.16
997 0.19
998 0.16
999 0.21
1000 0.21
1001 0.23
1002 0.22
1003 0.22
1004 0.21
1005 0.16
1006 0.16
1007 0.13
1008 0.14
1009 0.12
1010 0.13
1011 0.14
1012 0.13
1013 0.15
1014 0.16
1015 0.18
1016 0.18
1017 0.19
1018 0.23
1019 0.25
1020 0.25
1021 0.23
1022 0.23
1023 0.18
1024 0.17
1025 0.17
1026 0.12
1027 0.09
1028 0.07
1029 0.06
1030 0.06
1031 0.07
1032 0.07
1033 0.06
1034 0.06
1035 0.06
1036 0.07
1037 0.06
1038 0.06
1039 0.06
1040 0.08
1041 0.08
1042 0.08
1043 0.09
1044 0.09
1045 0.09
1046 0.09
1047 0.08
1048 0.07
1049 0.07
1050 0.06
1051 0.06
1052 0.06
1053 0.07
1054 0.07
1055 0.13
1056 0.14
1057 0.19
1058 0.25
1059 0.28
1060 0.3
1061 0.37
1062 0.43
1063 0.47
1064 0.47
1065 0.44
1066 0.46
1067 0.52
1068 0.52
1069 0.51
1070 0.49
1071 0.42
1072 0.41
1073 0.39
1074 0.31
1075 0.23
1076 0.2
1077 0.14
1078 0.12
1079 0.1
1080 0.1
1081 0.1
1082 0.12
1083 0.12
1084 0.15
1085 0.2
1086 0.27
1087 0.32
1088 0.37
1089 0.41
1090 0.46
1091 0.47
1092 0.52
1093 0.51
1094 0.52
1095 0.5
1096 0.47
1097 0.5
1098 0.43
1099 0.42
1100 0.35
1101 0.32
1102 0.27
1103 0.22
1104 0.21
1105 0.14
1106 0.18
1107 0.16
1108 0.15
1109 0.15
1110 0.11
1111 0.11
1112 0.11
1113 0.11
1114 0.13
1115 0.14
1116 0.15
1117 0.17
1118 0.17
1119 0.19
1120 0.23
1121 0.22
1122 0.17
1123 0.17
1124 0.16
1125 0.14
1126 0.15
1127 0.13
1128 0.11
1129 0.14
1130 0.13
1131 0.13
1132 0.15
1133 0.15
1134 0.15
1135 0.18
1136 0.2
1137 0.22
1138 0.26
1139 0.31
1140 0.34
1141 0.36
1142 0.36
1143 0.35
1144 0.34
1145 0.38
1146 0.37
1147 0.33
1148 0.3
1149 0.28
1150 0.26
1151 0.25
1152 0.24
1153 0.18
1154 0.16
1155 0.17
1156 0.16
1157 0.15
1158 0.16
1159 0.15
1160 0.21
1161 0.24
1162 0.27
1163 0.34
1164 0.43
1165 0.48
1166 0.49
1167 0.54
1168 0.48
1169 0.45
1170 0.44
1171 0.37
1172 0.32