Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H0EPW4

Protein Details
Accession H0EPW4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
232-255RDNDRDPNDWKKRRENDQASGHKNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
241-282WKKRRENDQASGHKNDKGGRNARGRGRGRGRGRGGGGRGGNR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002344  Lupus_La  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
CDD cd12291  RRM1_La  
Amino Acid Sequences MSSIPVEAGAVPDPAATSVANDTPLETAETSAPTVAEVEMADPETAEANGETKEAEKTEAVKAEEGDAEKKNGEANKPLAALKEESPLVKYVEVDGVDMVQRVQPFDPASRTPSKVIAKTMYVKGFGEEQALTQKHIEIFFNKLFPPKAIETRLRRGPHREFKGSVFVEVQSEEVLDEFLARDPKPTFEGKELTFMKKLDYMEKKNEDIREGRVIPQKTRYEGGGRGRGNGRDNDRDPNDWKKRRENDQASGHKNDKGGRNARGRGRGRGRGRGGGGRGGNRDNRDRNDDRNREHNGDKYDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.08
4 0.08
5 0.11
6 0.12
7 0.14
8 0.13
9 0.14
10 0.13
11 0.14
12 0.15
13 0.12
14 0.13
15 0.12
16 0.13
17 0.13
18 0.13
19 0.12
20 0.1
21 0.1
22 0.09
23 0.08
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.09
28 0.08
29 0.07
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.1
41 0.1
42 0.12
43 0.12
44 0.14
45 0.18
46 0.23
47 0.23
48 0.22
49 0.22
50 0.22
51 0.23
52 0.22
53 0.22
54 0.19
55 0.19
56 0.18
57 0.18
58 0.2
59 0.2
60 0.21
61 0.23
62 0.24
63 0.26
64 0.27
65 0.28
66 0.25
67 0.24
68 0.24
69 0.2
70 0.21
71 0.19
72 0.17
73 0.18
74 0.18
75 0.17
76 0.15
77 0.14
78 0.11
79 0.13
80 0.13
81 0.12
82 0.1
83 0.1
84 0.09
85 0.09
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.09
91 0.1
92 0.12
93 0.14
94 0.17
95 0.17
96 0.22
97 0.25
98 0.27
99 0.26
100 0.31
101 0.33
102 0.32
103 0.33
104 0.3
105 0.29
106 0.31
107 0.34
108 0.28
109 0.25
110 0.23
111 0.21
112 0.2
113 0.18
114 0.15
115 0.11
116 0.1
117 0.15
118 0.15
119 0.15
120 0.14
121 0.15
122 0.14
123 0.15
124 0.15
125 0.1
126 0.15
127 0.15
128 0.16
129 0.16
130 0.17
131 0.16
132 0.16
133 0.19
134 0.16
135 0.19
136 0.22
137 0.29
138 0.32
139 0.38
140 0.44
141 0.43
142 0.44
143 0.47
144 0.52
145 0.54
146 0.55
147 0.53
148 0.48
149 0.47
150 0.53
151 0.46
152 0.37
153 0.28
154 0.22
155 0.19
156 0.17
157 0.16
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.05
162 0.04
163 0.03
164 0.03
165 0.04
166 0.06
167 0.08
168 0.08
169 0.11
170 0.12
171 0.13
172 0.16
173 0.18
174 0.18
175 0.2
176 0.24
177 0.21
178 0.29
179 0.3
180 0.3
181 0.31
182 0.29
183 0.27
184 0.26
185 0.27
186 0.27
187 0.33
188 0.35
189 0.41
190 0.45
191 0.46
192 0.47
193 0.47
194 0.42
195 0.37
196 0.35
197 0.34
198 0.32
199 0.35
200 0.37
201 0.38
202 0.38
203 0.44
204 0.43
205 0.39
206 0.39
207 0.36
208 0.33
209 0.36
210 0.41
211 0.41
212 0.38
213 0.4
214 0.42
215 0.43
216 0.43
217 0.43
218 0.41
219 0.41
220 0.43
221 0.47
222 0.47
223 0.48
224 0.49
225 0.54
226 0.59
227 0.59
228 0.63
229 0.65
230 0.69
231 0.74
232 0.81
233 0.78
234 0.76
235 0.79
236 0.82
237 0.77
238 0.76
239 0.69
240 0.61
241 0.56
242 0.52
243 0.49
244 0.49
245 0.5
246 0.51
247 0.58
248 0.62
249 0.67
250 0.71
251 0.68
252 0.68
253 0.7
254 0.72
255 0.7
256 0.73
257 0.7
258 0.67
259 0.67
260 0.64
261 0.58
262 0.55
263 0.53
264 0.48
265 0.47
266 0.46
267 0.48
268 0.47
269 0.53
270 0.54
271 0.55
272 0.59
273 0.6
274 0.64
275 0.69
276 0.73
277 0.7
278 0.71
279 0.73
280 0.7
281 0.7
282 0.67