FuNGI

A0A1X6MSF1

Protein Details

Accession

A0A1X6MSF1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
58-79	ATFPTTKPEKRRRLDEASNSTT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 10, mito 9, cyto 4, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MSAVSISGPSRPGSPSSVTSKSSNYFDQLENIDPYMPLLDDTDNPEHTTSSFGQPLAATFPTTKPEKRRRLDEASNSTTGRPVKVQKTQSSPSVMRGLAAVASPEERDHSTPYIIAELPEFREETRRLPYGAQWEIARLISAGISRDAFTPEVLLRFRGENATAAPEVARSVGRATAGVSITDDAFAAAFAKEKATQLPWDELDREERILRYDPYGGLGCNSDKEYLQNYPDWYGGRIQFTGKLSLVNRTPTFKVSLNRPVLGASNRFARRFGSRHLLRLQIPEDLRLALQNIPGGDISLLSFFGQPLIVHDWIFRAFYAKEDNVFLYQTSERWDGDTIQKRGSIKCRGIPKELTFYDFLMWHNPMHFNSNQASPNNTSRFTQNRIRLQAERIREEEDIVCDAFCGEGKIPSEMIMTDGCGFIHRQALRRIEEQLGWTLDTMVVQMRIGGAKACPFPEQCLSRLTREQGLLLADPRSLCGEETGADVRLRPSQIKIKLSQDSESIDPAMLTVDILRPGRLTGPARLSTETIVNFTENGVPAQVVFQLMRDTMQEKVDRLTTWNDPASVYELWWNVQQAGGVIMERLSREARGAARAKGYTSRDGISHKKGSSSDADEDDDLDSALQERSLAWWKDPISGCPSSLEETVLVLLDSGFTPDACPVLAAKLREVAKKALTNYVDKFHIDVMMSCKAFMVPDPCGVLKPGEIHVRSSSRSLVNQDGEKTDLVLGDVLVTRHPCKVPTDTQKVKAVFHEKLRSYTDVVIVSTEDHFHNGKSLHRHLASMTGGGDFDGDTLEVFWDPTIVSEFKNADPSFAQEPLDVQSVLVQQRETVDEFVQRTTALREERLTWEYQKYLLAALNNSRRVGMYSTWWETSIYEKGYDHPETIFLAYMFTTVLDGSKTGAVVSQDIFSKHQRMYERGPLPWSRLDTKSSSRKQPTRSPGLPPFILERLKEEIDKAKGVQEKLIDERLPYRLSTLRDEDLAKPWLDAMARAAEAMQRHNNENMQQELEAIRTHVEQTYTQHRQMTLRGLRRHASGGGSSTFASARKSSDTPMTSLPIEQRQDMLRELSYKFACGPAGADGTPTALVYFDDASLRRVRASYAYVYDQKTSSKGWSRFPWDVALGTLCEIKAGTLGPTKMVTDDFYARMTLAKSFLK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.3
3	0.35
4	0.39
5	0.4
6	0.41
7	0.43
8	0.43
9	0.43
10	0.41
11	0.37
12	0.36
13	0.34
14	0.36
15	0.34
16	0.34
17	0.31
18	0.29
19	0.26
20	0.22
21	0.21
22	0.18
23	0.15
24	0.11
25	0.11
26	0.12
27	0.13
28	0.2
29	0.23
30	0.24
31	0.25
32	0.25
33	0.24
34	0.22
35	0.25
36	0.22
37	0.23
38	0.25
39	0.23
40	0.24
41	0.24
42	0.24
43	0.23
44	0.21
45	0.17
46	0.17
47	0.19
48	0.23
49	0.29
50	0.35
51	0.41
52	0.51
53	0.6
54	0.66
55	0.73
56	0.76
57	0.8
58	0.83
59	0.83
60	0.81
61	0.77
62	0.73
63	0.65
64	0.57
65	0.53
66	0.45
67	0.37
68	0.34
69	0.36
70	0.4
71	0.48
72	0.55
73	0.58
74	0.64
75	0.66
76	0.65
77	0.65
78	0.58
79	0.54
80	0.52
81	0.44
82	0.36
83	0.32
84	0.27
85	0.19
86	0.18
87	0.14
88	0.09
89	0.1
90	0.1
91	0.1
92	0.13
93	0.15
94	0.17
95	0.2
96	0.22
97	0.22
98	0.22
99	0.23
100	0.23
101	0.21
102	0.19
103	0.17
104	0.17
105	0.18
106	0.19
107	0.19
108	0.16
109	0.23
110	0.24
111	0.27
112	0.31
113	0.31
114	0.31
115	0.32
116	0.36
117	0.37
118	0.38
119	0.37
120	0.3
121	0.29
122	0.29
123	0.28
124	0.23
125	0.15
126	0.12
127	0.1
128	0.11
129	0.11
130	0.11
131	0.12
132	0.12
133	0.13
134	0.15
135	0.15
136	0.13
137	0.15
138	0.15
139	0.18
140	0.18
141	0.18
142	0.17
143	0.18
144	0.2
145	0.2
146	0.19
147	0.17
148	0.17
149	0.2
150	0.19
151	0.18
152	0.16
153	0.14
154	0.13
155	0.13
156	0.11
157	0.08
158	0.09
159	0.1
160	0.11
161	0.11
162	0.11
163	0.14
164	0.14
165	0.14
166	0.14
167	0.13
168	0.13
169	0.13
170	0.11
171	0.07
172	0.06
173	0.06
174	0.06
175	0.05
176	0.07
177	0.07
178	0.09
179	0.1
180	0.11
181	0.14
182	0.16
183	0.2
184	0.21
185	0.26
186	0.26
187	0.28
188	0.28
189	0.27
190	0.29
191	0.27
192	0.26
193	0.24
194	0.22
195	0.23
196	0.25
197	0.25
198	0.22
199	0.23
200	0.21
201	0.22
202	0.23
203	0.19
204	0.17
205	0.18
206	0.16
207	0.16
208	0.17
209	0.15
210	0.14
211	0.16
212	0.19
213	0.21
214	0.23
215	0.24
216	0.24
217	0.25
218	0.27
219	0.25
220	0.23
221	0.24
222	0.24
223	0.24
224	0.23
225	0.22
226	0.25
227	0.26
228	0.28
229	0.23
230	0.25
231	0.23
232	0.28
233	0.29
234	0.31
235	0.32
236	0.32
237	0.34
238	0.31
239	0.34
240	0.33
241	0.34
242	0.35
243	0.43
244	0.43
245	0.42
246	0.4
247	0.37
248	0.36
249	0.36
250	0.31
251	0.24
252	0.28
253	0.31
254	0.32
255	0.31
256	0.3
257	0.33
258	0.34
259	0.37
260	0.39
261	0.38
262	0.43
263	0.47
264	0.49
265	0.44
266	0.46
267	0.42
268	0.38
269	0.36
270	0.31
271	0.28
272	0.23
273	0.21
274	0.17
275	0.17
276	0.12
277	0.12
278	0.12
279	0.11
280	0.12
281	0.11
282	0.11
283	0.09
284	0.08
285	0.07
286	0.06
287	0.07
288	0.06
289	0.07
290	0.06
291	0.07
292	0.07
293	0.06
294	0.09
295	0.13
296	0.13
297	0.13
298	0.14
299	0.15
300	0.15
301	0.16
302	0.12
303	0.11
304	0.1
305	0.12
306	0.18
307	0.17
308	0.18
309	0.19
310	0.2
311	0.18
312	0.19
313	0.17
314	0.14
315	0.14
316	0.13
317	0.16
318	0.17
319	0.16
320	0.17
321	0.18
322	0.17
323	0.26
324	0.34
325	0.32
326	0.32
327	0.35
328	0.35
329	0.39
330	0.43
331	0.43
332	0.38
333	0.41
334	0.49
335	0.5
336	0.54
337	0.55
338	0.51
339	0.51
340	0.48
341	0.45
342	0.37
343	0.33
344	0.29
345	0.24
346	0.21
347	0.16
348	0.17
349	0.14
350	0.15
351	0.17
352	0.16
353	0.2
354	0.19
355	0.19
356	0.2
357	0.24
358	0.26
359	0.25
360	0.27
361	0.26
362	0.33
363	0.33
364	0.32
365	0.28
366	0.3
367	0.34
368	0.36
369	0.41
370	0.42
371	0.47
372	0.51
373	0.54
374	0.51
375	0.52
376	0.52
377	0.5
378	0.45
379	0.39
380	0.37
381	0.33
382	0.32
383	0.27
384	0.22
385	0.18
386	0.15
387	0.13
388	0.1
389	0.1
390	0.08
391	0.07
392	0.07
393	0.05
394	0.08
395	0.09
396	0.1
397	0.1
398	0.11
399	0.11
400	0.09
401	0.1
402	0.08
403	0.08
404	0.07
405	0.07
406	0.07
407	0.07
408	0.08
409	0.07
410	0.13
411	0.14
412	0.18
413	0.23
414	0.29
415	0.31
416	0.32
417	0.34
418	0.3
419	0.3
420	0.27
421	0.25
422	0.2
423	0.17
424	0.16
425	0.13
426	0.11
427	0.1
428	0.09
429	0.06
430	0.06
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.05
435	0.05
436	0.06
437	0.05
438	0.08
439	0.1
440	0.11
441	0.12
442	0.13
443	0.15
444	0.21
445	0.22
446	0.2
447	0.24
448	0.25
449	0.27
450	0.3
451	0.29
452	0.26
453	0.25
454	0.24
455	0.2
456	0.19
457	0.16
458	0.14
459	0.13
460	0.1
461	0.1
462	0.1
463	0.1
464	0.09
465	0.08
466	0.07
467	0.07
468	0.07
469	0.09
470	0.1
471	0.1
472	0.1
473	0.1
474	0.11
475	0.13
476	0.14
477	0.13
478	0.15
479	0.21
480	0.27
481	0.3
482	0.33
483	0.35
484	0.39
485	0.4
486	0.37
487	0.31
488	0.28
489	0.25
490	0.22
491	0.17
492	0.12
493	0.1
494	0.09
495	0.08
496	0.05
497	0.04
498	0.04
499	0.04
500	0.07
501	0.07
502	0.07
503	0.07
504	0.08
505	0.09
506	0.13
507	0.14
508	0.15
509	0.19
510	0.22
511	0.23
512	0.24
513	0.23
514	0.2
515	0.21
516	0.17
517	0.14
518	0.12
519	0.11
520	0.1
521	0.1
522	0.1
523	0.08
524	0.08
525	0.07
526	0.06
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.05
531	0.05
532	0.05
533	0.05
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.07
538	0.08
539	0.11
540	0.12
541	0.12
542	0.13
543	0.14
544	0.13
545	0.14
546	0.16
547	0.15
548	0.17
549	0.17
550	0.16
551	0.15
552	0.15
553	0.16
554	0.13
555	0.12
556	0.11
557	0.11
558	0.11
559	0.12
560	0.12
561	0.08
562	0.08
563	0.08
564	0.06
565	0.06
566	0.05
567	0.05
568	0.04
569	0.05
570	0.05
571	0.05
572	0.06
573	0.06
574	0.06
575	0.06
576	0.09
577	0.09
578	0.15
579	0.17
580	0.17
581	0.19
582	0.19
583	0.2
584	0.23
585	0.25
586	0.21
587	0.21
588	0.2
589	0.19
590	0.23
591	0.27
592	0.27
593	0.29
594	0.27
595	0.27
596	0.27
597	0.28
598	0.27
599	0.27
600	0.23
601	0.2
602	0.21
603	0.18
604	0.19
605	0.16
606	0.13
607	0.09
608	0.06
609	0.05
610	0.05
611	0.05
612	0.04
613	0.04
614	0.04
615	0.06
616	0.13
617	0.13
618	0.13
619	0.16
620	0.17
621	0.24
622	0.24
623	0.24
624	0.23
625	0.23
626	0.23
627	0.21
628	0.21
629	0.17
630	0.17
631	0.15
632	0.1
633	0.09
634	0.09
635	0.08
636	0.06
637	0.04
638	0.04
639	0.04
640	0.03
641	0.04
642	0.04
643	0.04
644	0.04
645	0.05
646	0.05
647	0.04
648	0.05
649	0.04
650	0.07
651	0.09
652	0.09
653	0.1
654	0.15
655	0.17
656	0.19
657	0.21
658	0.21
659	0.22
660	0.25
661	0.26
662	0.26
663	0.26
664	0.28
665	0.28
666	0.28
667	0.26
668	0.23
669	0.22
670	0.17
671	0.16
672	0.12
673	0.12
674	0.13
675	0.17
676	0.16
677	0.15
678	0.15
679	0.14
680	0.14
681	0.14
682	0.13
683	0.1
684	0.11
685	0.13
686	0.13
687	0.13
688	0.14
689	0.13
690	0.11
691	0.11
692	0.13
693	0.17
694	0.18
695	0.19
696	0.22
697	0.24
698	0.24
699	0.24
700	0.24
701	0.2
702	0.21
703	0.23
704	0.24
705	0.24
706	0.25
707	0.25
708	0.23
709	0.22
710	0.2
711	0.18
712	0.13
713	0.11
714	0.09
715	0.07
716	0.06
717	0.06
718	0.07
719	0.06
720	0.07
721	0.08
722	0.09
723	0.12
724	0.13
725	0.13
726	0.16
727	0.21
728	0.28
729	0.36
730	0.45
731	0.48
732	0.52
733	0.57
734	0.56
735	0.51
736	0.48
737	0.45
738	0.39
739	0.41
740	0.44
741	0.38
742	0.41
743	0.43
744	0.39
745	0.35
746	0.32
747	0.29
748	0.22
749	0.2
750	0.17
751	0.14
752	0.13
753	0.11
754	0.11
755	0.09
756	0.1
757	0.1
758	0.1
759	0.13
760	0.13
761	0.17
762	0.22
763	0.26
764	0.3
765	0.3
766	0.31
767	0.27
768	0.31
769	0.27
770	0.22
771	0.19
772	0.13
773	0.12
774	0.11
775	0.11
776	0.06
777	0.05
778	0.04
779	0.04
780	0.03
781	0.04
782	0.04
783	0.04
784	0.04
785	0.04
786	0.04
787	0.04
788	0.05
789	0.08
790	0.08
791	0.08
792	0.12
793	0.14
794	0.14
795	0.23
796	0.22
797	0.21
798	0.2
799	0.24
800	0.23
801	0.22
802	0.22
803	0.14
804	0.15
805	0.16
806	0.17
807	0.14
808	0.11
809	0.12
810	0.15
811	0.16
812	0.17
813	0.14
814	0.13
815	0.14
816	0.16
817	0.15
818	0.13
819	0.13
820	0.16
821	0.17
822	0.17
823	0.16
824	0.14
825	0.14
826	0.14
827	0.18
828	0.16
829	0.17
830	0.18
831	0.21
832	0.25
833	0.27
834	0.28
835	0.26
836	0.27
837	0.26
838	0.25
839	0.23
840	0.19
841	0.18
842	0.17
843	0.16
844	0.15
845	0.22
846	0.28
847	0.29
848	0.29
849	0.28
850	0.26
851	0.26
852	0.27
853	0.21
854	0.19
855	0.23
856	0.26
857	0.26
858	0.26
859	0.25
860	0.22
861	0.25
862	0.24
863	0.19
864	0.17
865	0.17
866	0.19
867	0.25
868	0.25
869	0.22
870	0.19
871	0.19
872	0.18
873	0.19
874	0.17
875	0.11
876	0.1
877	0.09
878	0.09
879	0.08
880	0.06
881	0.06
882	0.05
883	0.05
884	0.05
885	0.05
886	0.06
887	0.07
888	0.07
889	0.07
890	0.08
891	0.09
892	0.1
893	0.1
894	0.11
895	0.12
896	0.14
897	0.17
898	0.18
899	0.22
900	0.22
901	0.26
902	0.28
903	0.32
904	0.37
905	0.45
906	0.45
907	0.43
908	0.48
909	0.45
910	0.45
911	0.44
912	0.42
913	0.37
914	0.36
915	0.37
916	0.37
917	0.43
918	0.5
919	0.52
920	0.58
921	0.63
922	0.67
923	0.71
924	0.75
925	0.76
926	0.75
927	0.72
928	0.71
929	0.69
930	0.68
931	0.61
932	0.53
933	0.48
934	0.43
935	0.42
936	0.33
937	0.29
938	0.28
939	0.3
940	0.29
941	0.27
942	0.29
943	0.29
944	0.31
945	0.28
946	0.29
947	0.33
948	0.33
949	0.33
950	0.29
951	0.3
952	0.32
953	0.36
954	0.3
955	0.27
956	0.29
957	0.3
958	0.29
959	0.25
960	0.25
961	0.25
962	0.27
963	0.32
964	0.33
965	0.31
966	0.32
967	0.35
968	0.33
969	0.34
970	0.34
971	0.28
972	0.23
973	0.22
974	0.21
975	0.19
976	0.17
977	0.14
978	0.14
979	0.13
980	0.13
981	0.13
982	0.13
983	0.15
984	0.2
985	0.24
986	0.24
987	0.26
988	0.3
989	0.33
990	0.35
991	0.38
992	0.35
993	0.3
994	0.28
995	0.26
996	0.24
997	0.22
998	0.18
999	0.14
1000	0.13
1001	0.11
1002	0.13
1003	0.14
1004	0.15
1005	0.15
1006	0.2
1007	0.3
1008	0.35
1009	0.37
1010	0.39
1011	0.39
1012	0.39
1013	0.41
1014	0.46
1015	0.45
1016	0.49
1017	0.52
1018	0.53
1019	0.54
1020	0.54
1021	0.53
1022	0.45
1023	0.39
1024	0.32
1025	0.29
1026	0.26
1027	0.24
1028	0.22
1029	0.2
1030	0.19
1031	0.17
1032	0.18
1033	0.16
1034	0.17
1035	0.21
1036	0.22
1037	0.24
1038	0.31
1039	0.33
1040	0.32
1041	0.34
1042	0.35
1043	0.31
1044	0.32
1045	0.34
1046	0.33
1047	0.33
1048	0.31
1049	0.31
1050	0.3
1051	0.32
1052	0.32
1053	0.29
1054	0.24
1055	0.26
1056	0.26
1057	0.3
1058	0.28
1059	0.26
1060	0.25
1061	0.24
1062	0.22
1063	0.19
1064	0.19
1065	0.15
1066	0.18
1067	0.16
1068	0.16
1069	0.14
1070	0.15
1071	0.15
1072	0.13
1073	0.1
1074	0.07
1075	0.07
1076	0.08
1077	0.09
1078	0.09
1079	0.12
1080	0.13
1081	0.16
1082	0.2
1083	0.21
1084	0.21
1085	0.21
1086	0.22
1087	0.23
1088	0.26
1089	0.28
1090	0.29
1091	0.35
1092	0.39
1093	0.41
1094	0.42
1095	0.39
1096	0.37
1097	0.35
1098	0.32
1099	0.34
1100	0.38
1101	0.4
1102	0.45
1103	0.52
1104	0.58
1105	0.61
1106	0.6
1107	0.56
1108	0.48
1109	0.45
1110	0.39
1111	0.32
1112	0.24
1113	0.21
1114	0.2
1115	0.15
1116	0.14
1117	0.13
1118	0.11
1119	0.1
1120	0.1
1121	0.12
1122	0.17
1123	0.17
1124	0.19
1125	0.2
1126	0.21
1127	0.21
1128	0.22
1129	0.2
1130	0.19
1131	0.23
1132	0.22
1133	0.22
1134	0.22
1135	0.2
1136	0.22
1137	0.21
1138	0.18

A0A1X6MSF1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer