Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X6MSK5

Protein Details
Accession A0A1X6MSK5    Localization Confidence High Confidence Score 19.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-133VAKPADQKDKEKKQRKLKRKPGRRGSKAVPGBasic
152-177VTEEGAKPKKKKKSSRSKKARKAAAABasic
199-222PEAAAKKPRVRKPRAPRPARPAGEBasic
258-280VVSARIVRRRWGKPRKSKGFGFVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
110-129KDKEKKQRKLKRKPGRRGSK
157-174AKPKKKKKSSRSKKARKA
203-219AKKPRVRKPRAPRPARP
265-275RRRWGKPRKSK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.833, cyto 12.5, nucl 12, mito_nucl 7.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDAPAAPVTENGVPPAAQDQVVEETPGFKVFAGNLAYSTTDEGLRTFFAPVESEILSAQVILRGTRSAGYGFVAVATETAAQKAVELLNKQELDGREVIVEVAKPADQKDKEKKQRKLKRKPGRRGSKAVPGEVSEAEANGDVAKAEGAPVTEEGAKPKKKKKSSRSKKARKAAAADGATEGEGAVSGTEVAADGTTPEAAAKKPRVRKPRAPRPARPAGEDPVGEPSKSVLFVANLGFNIDDEGLAKLFTDADLPVVSARIVRRRWGKPRKSKGFGFVDVGDEENQQKAIEVLQGQEVEGRNIAVKIAVNSQIAEEGQEGDADADAAAPTTEREATPETTVVAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.17
4 0.16
5 0.12
6 0.12
7 0.13
8 0.17
9 0.17
10 0.17
11 0.15
12 0.15
13 0.15
14 0.16
15 0.14
16 0.1
17 0.11
18 0.1
19 0.15
20 0.16
21 0.16
22 0.15
23 0.16
24 0.17
25 0.16
26 0.17
27 0.13
28 0.11
29 0.11
30 0.11
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.12
35 0.11
36 0.11
37 0.12
38 0.13
39 0.15
40 0.13
41 0.13
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.09
46 0.09
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.09
52 0.1
53 0.1
54 0.11
55 0.1
56 0.1
57 0.11
58 0.1
59 0.09
60 0.09
61 0.08
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.07
66 0.06
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.09
72 0.1
73 0.12
74 0.13
75 0.15
76 0.21
77 0.21
78 0.21
79 0.24
80 0.23
81 0.23
82 0.23
83 0.21
84 0.15
85 0.15
86 0.15
87 0.11
88 0.1
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.08
93 0.09
94 0.17
95 0.19
96 0.27
97 0.38
98 0.48
99 0.58
100 0.68
101 0.75
102 0.78
103 0.86
104 0.89
105 0.9
106 0.91
107 0.91
108 0.92
109 0.94
110 0.93
111 0.94
112 0.9
113 0.86
114 0.8
115 0.79
116 0.71
117 0.61
118 0.51
119 0.41
120 0.36
121 0.28
122 0.24
123 0.14
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.07
128 0.05
129 0.05
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.11
143 0.18
144 0.23
145 0.29
146 0.36
147 0.44
148 0.53
149 0.63
150 0.7
151 0.74
152 0.81
153 0.87
154 0.9
155 0.92
156 0.93
157 0.91
158 0.87
159 0.79
160 0.73
161 0.65
162 0.61
163 0.5
164 0.41
165 0.33
166 0.26
167 0.21
168 0.16
169 0.12
170 0.04
171 0.04
172 0.03
173 0.02
174 0.02
175 0.02
176 0.02
177 0.02
178 0.02
179 0.02
180 0.02
181 0.02
182 0.02
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.05
189 0.11
190 0.17
191 0.24
192 0.33
193 0.41
194 0.51
195 0.59
196 0.68
197 0.75
198 0.8
199 0.84
200 0.84
201 0.84
202 0.82
203 0.84
204 0.76
205 0.7
206 0.62
207 0.55
208 0.49
209 0.41
210 0.33
211 0.3
212 0.29
213 0.23
214 0.2
215 0.17
216 0.15
217 0.15
218 0.14
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.1
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.06
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.09
248 0.12
249 0.18
250 0.2
251 0.26
252 0.35
253 0.44
254 0.55
255 0.63
256 0.71
257 0.75
258 0.85
259 0.88
260 0.87
261 0.82
262 0.8
263 0.76
264 0.68
265 0.61
266 0.51
267 0.43
268 0.36
269 0.34
270 0.26
271 0.2
272 0.18
273 0.14
274 0.14
275 0.11
276 0.1
277 0.09
278 0.09
279 0.11
280 0.11
281 0.11
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.18
286 0.18
287 0.16
288 0.15
289 0.15
290 0.13
291 0.13
292 0.13
293 0.1
294 0.11
295 0.12
296 0.15
297 0.19
298 0.18
299 0.18
300 0.19
301 0.19
302 0.17
303 0.17
304 0.13
305 0.11
306 0.11
307 0.1
308 0.1
309 0.09
310 0.09
311 0.08
312 0.07
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.08
320 0.1
321 0.09
322 0.13
323 0.17
324 0.2
325 0.23
326 0.23