Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X6N3C3

Protein Details
Accession A0A1X6N3C3    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-121GSVTRTYAHKRARRNSSRTPRDQSPQHydrophilic
408-430SETQTPMKRPRGRPRKNSLPVPVHydrophilic
487-512APTQTQSPPKRPRGRPPKNKGKSNAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
415-423KRPRGRPRK
472-508KRPRGRPRKHSLPVPAPTQTQSPPKRPRGRPPKNKGK
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MSVKSSVGPGRNSTGFRGTIPSTAMGIRREPSSSGRDSPDVPDSEPSGEEDNIDIDNDAFDRLYTESFRDILVPLRTPSPLGQAPSSPFSSQRRSGSVTRTYAHKRARRNSSRTPRDQSPQPETRGRTRTGTTFRPTNLPSGPSRNSSTARSVSRGRKRNSTPFTRGSTAASRDVSPDLVPPPSAKARSASRGRQRNSARLARGSAVDSRDVSPDPAPARARPASTGRMRKPTPISSNSAVALRSDSPDPVPSYNARSASRGGRRTTALSVGDLAPGPSPSVAQGNSSRNKSISRGTRRMPAASPGPSVAGTRDVPTSTAPKQSSRAQSASRSAKRTPTMLDAEASVIDTVSAPVRLIVGRVPTRSSLSVVDAINQGLRQKASGEAQASTTPSSTLLQSRNVSQPHLSETQTPMKRPRGRPRKNSLPVPVPVPTLGRREGLRSAGLAERDGEVEEVVDIPQADRQEPEMVVKRPRGRPRKHSLPVPAPTQTQSPPKRPRGRPPKNKGKSNAGEMEAAVASVASLGSAPVAISAPLPRGGASSSRTEDPVRRRASGRPPTAYVSVPKPPATSGSADVSAQPRTCLSKDCDMVLPPASEYPYPLCVPCAKQLGARLYQHISNSSVAKASGSGSGPSASGSPDVPSAAFAAEVSATAATSTPAAARGELAATADAEARVRPTAATSTFLGKRKAIINTAEPSGGGWWLDPTSLTWRRAEPQKAPEMSLSTSGPHTSTATSSSSKTLTMVPPSGPSTSATTLVPPSHVLSIQNVQSSDQQRHSLPSPVSREASLGPIDHMDPIHPSFATPIPSHSLLPADIPFQEYQTSTELVNALAERFVTFRNPTRTTAVGASATANTTTAAPVSQPAAPPVRNYIQFKGSYAVVMNPESIIDESFIRRVANEIVWQSKIHIQLDRNHTIVILRGQSASMEMPCLCDADKHGKPATCGGHMKLAITETKSSQVVGIMKGMTVFVELVH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.36
3 0.34
4 0.36
5 0.32
6 0.29
7 0.29
8 0.26
9 0.23
10 0.24
11 0.27
12 0.24
13 0.26
14 0.25
15 0.26
16 0.26
17 0.27
18 0.29
19 0.32
20 0.35
21 0.37
22 0.39
23 0.4
24 0.4
25 0.42
26 0.44
27 0.39
28 0.35
29 0.34
30 0.31
31 0.3
32 0.28
33 0.27
34 0.24
35 0.21
36 0.2
37 0.17
38 0.17
39 0.15
40 0.15
41 0.12
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.08
47 0.07
48 0.08
49 0.09
50 0.12
51 0.13
52 0.15
53 0.16
54 0.17
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.21
59 0.23
60 0.24
61 0.23
62 0.25
63 0.25
64 0.26
65 0.26
66 0.27
67 0.27
68 0.27
69 0.28
70 0.29
71 0.32
72 0.35
73 0.36
74 0.3
75 0.33
76 0.36
77 0.41
78 0.44
79 0.44
80 0.45
81 0.47
82 0.51
83 0.53
84 0.55
85 0.52
86 0.48
87 0.51
88 0.54
89 0.57
90 0.61
91 0.6
92 0.62
93 0.68
94 0.77
95 0.79
96 0.8
97 0.83
98 0.84
99 0.88
100 0.87
101 0.86
102 0.82
103 0.79
104 0.79
105 0.76
106 0.74
107 0.71
108 0.68
109 0.68
110 0.66
111 0.67
112 0.65
113 0.6
114 0.55
115 0.51
116 0.54
117 0.53
118 0.56
119 0.53
120 0.53
121 0.51
122 0.53
123 0.51
124 0.48
125 0.44
126 0.4
127 0.39
128 0.4
129 0.42
130 0.39
131 0.42
132 0.42
133 0.42
134 0.42
135 0.43
136 0.43
137 0.42
138 0.42
139 0.46
140 0.51
141 0.58
142 0.64
143 0.63
144 0.66
145 0.71
146 0.77
147 0.77
148 0.77
149 0.74
150 0.71
151 0.73
152 0.66
153 0.59
154 0.53
155 0.5
156 0.45
157 0.42
158 0.37
159 0.31
160 0.3
161 0.3
162 0.26
163 0.2
164 0.19
165 0.17
166 0.16
167 0.16
168 0.15
169 0.19
170 0.24
171 0.25
172 0.24
173 0.27
174 0.31
175 0.4
176 0.47
177 0.51
178 0.55
179 0.63
180 0.65
181 0.69
182 0.7
183 0.7
184 0.7
185 0.68
186 0.63
187 0.57
188 0.57
189 0.49
190 0.45
191 0.38
192 0.34
193 0.28
194 0.25
195 0.23
196 0.22
197 0.22
198 0.21
199 0.21
200 0.17
201 0.2
202 0.2
203 0.24
204 0.25
205 0.24
206 0.3
207 0.3
208 0.31
209 0.3
210 0.33
211 0.36
212 0.42
213 0.51
214 0.5
215 0.57
216 0.56
217 0.59
218 0.61
219 0.61
220 0.6
221 0.55
222 0.56
223 0.49
224 0.51
225 0.45
226 0.4
227 0.31
228 0.24
229 0.22
230 0.16
231 0.16
232 0.14
233 0.14
234 0.14
235 0.17
236 0.19
237 0.18
238 0.2
239 0.19
240 0.24
241 0.27
242 0.3
243 0.28
244 0.28
245 0.3
246 0.36
247 0.42
248 0.42
249 0.4
250 0.39
251 0.4
252 0.41
253 0.4
254 0.36
255 0.28
256 0.23
257 0.23
258 0.2
259 0.18
260 0.15
261 0.14
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.09
269 0.09
270 0.12
271 0.17
272 0.24
273 0.3
274 0.32
275 0.33
276 0.32
277 0.33
278 0.33
279 0.35
280 0.38
281 0.42
282 0.47
283 0.48
284 0.54
285 0.55
286 0.55
287 0.49
288 0.43
289 0.39
290 0.34
291 0.33
292 0.25
293 0.24
294 0.21
295 0.2
296 0.16
297 0.14
298 0.13
299 0.13
300 0.13
301 0.13
302 0.13
303 0.14
304 0.18
305 0.17
306 0.24
307 0.24
308 0.25
309 0.29
310 0.35
311 0.4
312 0.41
313 0.43
314 0.39
315 0.41
316 0.47
317 0.53
318 0.52
319 0.49
320 0.46
321 0.48
322 0.47
323 0.45
324 0.39
325 0.35
326 0.33
327 0.29
328 0.27
329 0.21
330 0.2
331 0.18
332 0.16
333 0.1
334 0.06
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.12
347 0.14
348 0.15
349 0.17
350 0.17
351 0.2
352 0.2
353 0.2
354 0.16
355 0.15
356 0.18
357 0.17
358 0.17
359 0.16
360 0.15
361 0.14
362 0.13
363 0.12
364 0.09
365 0.1
366 0.08
367 0.08
368 0.1
369 0.11
370 0.14
371 0.15
372 0.14
373 0.15
374 0.16
375 0.16
376 0.14
377 0.12
378 0.1
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.12
383 0.14
384 0.18
385 0.18
386 0.21
387 0.26
388 0.26
389 0.26
390 0.23
391 0.22
392 0.22
393 0.24
394 0.22
395 0.19
396 0.22
397 0.3
398 0.31
399 0.33
400 0.35
401 0.41
402 0.49
403 0.55
404 0.62
405 0.65
406 0.72
407 0.8
408 0.83
409 0.84
410 0.83
411 0.81
412 0.76
413 0.7
414 0.61
415 0.54
416 0.46
417 0.35
418 0.29
419 0.24
420 0.21
421 0.18
422 0.18
423 0.17
424 0.16
425 0.18
426 0.2
427 0.19
428 0.17
429 0.14
430 0.14
431 0.15
432 0.14
433 0.12
434 0.11
435 0.1
436 0.1
437 0.1
438 0.08
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.08
452 0.1
453 0.1
454 0.13
455 0.17
456 0.19
457 0.23
458 0.27
459 0.32
460 0.38
461 0.48
462 0.55
463 0.56
464 0.63
465 0.69
466 0.74
467 0.73
468 0.71
469 0.69
470 0.67
471 0.64
472 0.57
473 0.5
474 0.4
475 0.36
476 0.32
477 0.28
478 0.29
479 0.3
480 0.37
481 0.44
482 0.52
483 0.62
484 0.64
485 0.72
486 0.75
487 0.81
488 0.83
489 0.84
490 0.86
491 0.84
492 0.87
493 0.81
494 0.79
495 0.71
496 0.65
497 0.59
498 0.49
499 0.41
500 0.33
501 0.29
502 0.19
503 0.16
504 0.1
505 0.06
506 0.04
507 0.03
508 0.03
509 0.02
510 0.02
511 0.02
512 0.02
513 0.02
514 0.02
515 0.03
516 0.03
517 0.03
518 0.04
519 0.04
520 0.05
521 0.07
522 0.07
523 0.06
524 0.07
525 0.08
526 0.1
527 0.11
528 0.14
529 0.15
530 0.16
531 0.17
532 0.18
533 0.23
534 0.27
535 0.34
536 0.33
537 0.34
538 0.35
539 0.4
540 0.49
541 0.53
542 0.52
543 0.46
544 0.46
545 0.46
546 0.46
547 0.41
548 0.33
549 0.27
550 0.26
551 0.25
552 0.24
553 0.21
554 0.2
555 0.21
556 0.2
557 0.18
558 0.16
559 0.16
560 0.16
561 0.16
562 0.17
563 0.16
564 0.16
565 0.15
566 0.13
567 0.12
568 0.14
569 0.15
570 0.17
571 0.19
572 0.24
573 0.25
574 0.26
575 0.27
576 0.24
577 0.25
578 0.23
579 0.2
580 0.13
581 0.13
582 0.13
583 0.11
584 0.11
585 0.11
586 0.12
587 0.13
588 0.13
589 0.13
590 0.15
591 0.17
592 0.2
593 0.23
594 0.2
595 0.22
596 0.27
597 0.3
598 0.32
599 0.31
600 0.29
601 0.27
602 0.28
603 0.27
604 0.24
605 0.21
606 0.18
607 0.18
608 0.16
609 0.14
610 0.12
611 0.12
612 0.11
613 0.1
614 0.1
615 0.1
616 0.1
617 0.1
618 0.1
619 0.1
620 0.1
621 0.09
622 0.07
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.08
628 0.07
629 0.07
630 0.07
631 0.06
632 0.06
633 0.05
634 0.05
635 0.05
636 0.05
637 0.05
638 0.04
639 0.04
640 0.04
641 0.04
642 0.04
643 0.04
644 0.04
645 0.04
646 0.07
647 0.07
648 0.07
649 0.07
650 0.07
651 0.08
652 0.08
653 0.08
654 0.06
655 0.05
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.06
660 0.06
661 0.07
662 0.07
663 0.07
664 0.07
665 0.08
666 0.11
667 0.12
668 0.14
669 0.14
670 0.2
671 0.25
672 0.29
673 0.3
674 0.27
675 0.29
676 0.31
677 0.33
678 0.31
679 0.28
680 0.3
681 0.3
682 0.31
683 0.28
684 0.23
685 0.2
686 0.17
687 0.14
688 0.09
689 0.06
690 0.06
691 0.06
692 0.07
693 0.06
694 0.07
695 0.16
696 0.22
697 0.23
698 0.24
699 0.26
700 0.32
701 0.4
702 0.45
703 0.43
704 0.44
705 0.51
706 0.51
707 0.5
708 0.46
709 0.41
710 0.36
711 0.32
712 0.25
713 0.17
714 0.17
715 0.16
716 0.15
717 0.13
718 0.13
719 0.11
720 0.12
721 0.13
722 0.15
723 0.16
724 0.17
725 0.18
726 0.18
727 0.17
728 0.17
729 0.19
730 0.19
731 0.21
732 0.22
733 0.21
734 0.23
735 0.25
736 0.24
737 0.21
738 0.19
739 0.2
740 0.19
741 0.2
742 0.17
743 0.17
744 0.19
745 0.19
746 0.18
747 0.15
748 0.15
749 0.15
750 0.16
751 0.15
752 0.16
753 0.2
754 0.21
755 0.22
756 0.21
757 0.21
758 0.27
759 0.3
760 0.32
761 0.31
762 0.31
763 0.3
764 0.34
765 0.34
766 0.35
767 0.33
768 0.35
769 0.38
770 0.39
771 0.4
772 0.36
773 0.35
774 0.29
775 0.3
776 0.24
777 0.18
778 0.15
779 0.15
780 0.15
781 0.14
782 0.14
783 0.11
784 0.13
785 0.13
786 0.14
787 0.13
788 0.12
789 0.14
790 0.17
791 0.2
792 0.17
793 0.19
794 0.22
795 0.24
796 0.24
797 0.22
798 0.21
799 0.17
800 0.19
801 0.18
802 0.14
803 0.13
804 0.15
805 0.15
806 0.14
807 0.15
808 0.14
809 0.15
810 0.16
811 0.17
812 0.14
813 0.15
814 0.15
815 0.13
816 0.14
817 0.12
818 0.1
819 0.09
820 0.1
821 0.08
822 0.09
823 0.1
824 0.13
825 0.17
826 0.24
827 0.32
828 0.35
829 0.38
830 0.42
831 0.42
832 0.41
833 0.39
834 0.35
835 0.27
836 0.24
837 0.22
838 0.18
839 0.18
840 0.15
841 0.13
842 0.1
843 0.1
844 0.09
845 0.08
846 0.08
847 0.07
848 0.08
849 0.1
850 0.12
851 0.13
852 0.16
853 0.22
854 0.23
855 0.24
856 0.29
857 0.33
858 0.38
859 0.42
860 0.43
861 0.43
862 0.43
863 0.43
864 0.39
865 0.33
866 0.28
867 0.24
868 0.23
869 0.19
870 0.19
871 0.18
872 0.15
873 0.14
874 0.14
875 0.14
876 0.11
877 0.1
878 0.11
879 0.12
880 0.14
881 0.15
882 0.14
883 0.13
884 0.16
885 0.18
886 0.19
887 0.22
888 0.25
889 0.28
890 0.29
891 0.29
892 0.29
893 0.31
894 0.33
895 0.31
896 0.32
897 0.33
898 0.4
899 0.48
900 0.5
901 0.46
902 0.41
903 0.38
904 0.33
905 0.33
906 0.29
907 0.24
908 0.2
909 0.2
910 0.2
911 0.2
912 0.21
913 0.19
914 0.14
915 0.14
916 0.13
917 0.15
918 0.15
919 0.16
920 0.15
921 0.14
922 0.19
923 0.25
924 0.29
925 0.32
926 0.38
927 0.39
928 0.41
929 0.47
930 0.47
931 0.45
932 0.45
933 0.42
934 0.44
935 0.42
936 0.41
937 0.35
938 0.33
939 0.3
940 0.29
941 0.29
942 0.23
943 0.27
944 0.26
945 0.25
946 0.23
947 0.24
948 0.24
949 0.22
950 0.23
951 0.19
952 0.19
953 0.19
954 0.18
955 0.13
956 0.11