Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1X6N3C3

Protein Details
Accession A0A1X6N3C3    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-121GSVTRTYAHKRARRNSSRTPRDQSPQHydrophilic
408-430SETQTPMKRPRGRPRKNSLPVPVHydrophilic
487-512APTQTQSPPKRPRGRPPKNKGKSNAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
415-423KRPRGRPRK
472-508KRPRGRPRKHSLPVPAPTQTQSPPKRPRGRPPKNKGK
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MSVKSSVGPGRNSTGFRGTIPSTAMGIRREPSSSGRDSPDVPDSEPSGEEDNIDIDNDAFDRLYTESFRDILVPLRTPSPLGQAPSSPFSSQRRSGSVTRTYAHKRARRNSSRTPRDQSPQPETRGRTRTGTTFRPTNLPSGPSRNSSTARSVSRGRKRNSTPFTRGSTAASRDVSPDLVPPPSAKARSASRGRQRNSARLARGSAVDSRDVSPDPAPARARPASTGRMRKPTPISSNSAVALRSDSPDPVPSYNARSASRGGRRTTALSVGDLAPGPSPSVAQGNSSRNKSISRGTRRMPAASPGPSVAGTRDVPTSTAPKQSSRAQSASRSAKRTPTMLDAEASVIDTVSAPVRLIVGRVPTRSSLSVVDAINQGLRQKASGEAQASTTPSSTLLQSRNVSQPHLSETQTPMKRPRGRPRKNSLPVPVPVPTLGRREGLRSAGLAERDGEVEEVVDIPQADRQEPEMVVKRPRGRPRKHSLPVPAPTQTQSPPKRPRGRPPKNKGKSNAGEMEAAVASVASLGSAPVAISAPLPRGGASSSRTEDPVRRRASGRPPTAYVSVPKPPATSGSADVSAQPRTCLSKDCDMVLPPASEYPYPLCVPCAKQLGARLYQHISNSSVAKASGSGSGPSASGSPDVPSAAFAAEVSATAATSTPAAARGELAATADAEARVRPTAATSTFLGKRKAIINTAEPSGGGWWLDPTSLTWRRAEPQKAPEMSLSTSGPHTSTATSSSSKTLTMVPPSGPSTSATTLVPPSHVLSIQNVQSSDQQRHSLPSPVSREASLGPIDHMDPIHPSFATPIPSHSLLPADIPFQEYQTSTELVNALAERFVTFRNPTRTTAVGASATANTTTAAPVSQPAAPPVRNYIQFKGSYAVVMNPESIIDESFIRRVANEIVWQSKIHIQLDRNHTIVILRGQSASMEMPCLCDADKHGKPATCGGHMKLAITETKSSQVVGIMKGMTVFVELVH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.36
3 0.34
4 0.36
5 0.32
6 0.29
7 0.29
8 0.26
9 0.23
10 0.24
11 0.27
12 0.24
13 0.26
14 0.25
15 0.26
16 0.26
17 0.27
18 0.29
19 0.32
20 0.35
21 0.37
22 0.39
23 0.4
24 0.4
25 0.42
26 0.44
27 0.39
28 0.35
29 0.34
30 0.31
31 0.3
32 0.28
33 0.27
34 0.24
35 0.21
36 0.2
37 0.17
38 0.17
39 0.15
40 0.15
41 0.12
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.08
47 0.07
48 0.08
49 0.09
50 0.12
51 0.13
52 0.15
53 0.16
54 0.17
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.21
59 0.23
60 0.24
61 0.23
62 0.25
63 0.25
64 0.26
65 0.26
66 0.27
67 0.27
68 0.27
69 0.28
70 0.29
71 0.32
72 0.35
73 0.36
74 0.3
75 0.33
76 0.36
77 0.41
78 0.44
79 0.44
80 0.45
81 0.47
82 0.51
83 0.53
84 0.55
85 0.52
86 0.48
87 0.51
88 0.54
89 0.57
90 0.61
91 0.6
92 0.62
93 0.68
94 0.77
95 0.79
96 0.8
97 0.83
98 0.84
99 0.88
100 0.87
101 0.86
102 0.82
103 0.79
104 0.79
105 0.76
106 0.74
107 0.71
108 0.68
109 0.68
110 0.66
111 0.67
112 0.65
113 0.6
114 0.55
115 0.51
116 0.54
117 0.53
118 0.56
119 0.53
120 0.53
121 0.51
122 0.53
123 0.51
124 0.48
125 0.44
126 0.4
127 0.39
128 0.4
129 0.42
130 0.39
131 0.42
132 0.42
133 0.42
134 0.42
135 0.43
136 0.43
137 0.42
138 0.42
139 0.46
140 0.51
141 0.58
142 0.64
143 0.63
144 0.66
145 0.71
146 0.77
147 0.77
148 0.77
149 0.74
150 0.71
151 0.73
152 0.66
153 0.59
154 0.53
155 0.5
156 0.45
157 0.42
158 0.37
159 0.31
160 0.3
161 0.3
162 0.26
163 0.2
164 0.19
165 0.17
166 0.16
167 0.16
168 0.15
169 0.19
170 0.24
171 0.25
172 0.24
173 0.27
174 0.31
175 0.4
176 0.47
177 0.51
178 0.55
179 0.63
180 0.65
181 0.69
182 0.7
183 0.7
184 0.7
185 0.68
186 0.63
187 0.57
188 0.57
189 0.49
190 0.45
191 0.38
192 0.34
193 0.28
194 0.25
195 0.23
196 0.22
197 0.22
198 0.21
199 0.21
200 0.17
201 0.2
202 0.2
203 0.24
204 0.25
205 0.24
206 0.3
207 0.3
208 0.31
209 0.3
210 0.33
211 0.36
212 0.42
213 0.51
214 0.5
215 0.57
216 0.56
217 0.59
218 0.61
219 0.61
220 0.6
221 0.55
222 0.56
223 0.49
224 0.51
225 0.45
226 0.4
227 0.31
228 0.24
229 0.22
230 0.16
231 0.16
232 0.14
233 0.14
234 0.14
235 0.17
236 0.19
237 0.18
238 0.2
239 0.19
240 0.24
241 0.27
242 0.3
243 0.28
244 0.28
245 0.3
246 0.36
247 0.42
248 0.42
249 0.4
250 0.39
251 0.4
252 0.41
253 0.4
254 0.36
255 0.28
256 0.23
257 0.23
258 0.2
259 0.18
260 0.15
261 0.14
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.09
269 0.09
270 0.12
271 0.17
272 0.24
273 0.3
274 0.32
275 0.33
276 0.32
277 0.33
278 0.33
279 0.35
280 0.38
281 0.42
282 0.47
283 0.48
284 0.54
285 0.55
286 0.55
287 0.49
288 0.43
289 0.39
290 0.34
291 0.33
292 0.25
293 0.24
294 0.21
295 0.2
296 0.16
297 0.14
298 0.13
299 0.13
300 0.13
301 0.13
302 0.13
303 0.14
304 0.18
305 0.17
306 0.24
307 0.24
308 0.25
309 0.29
310 0.35
311 0.4
312 0.41
313 0.43
314 0.39
315 0.41
316 0.47
317 0.53
318 0.52
319 0.49
320 0.46
321 0.48
322 0.47
323 0.45
324 0.39
325 0.35
326 0.33
327 0.29
328 0.27
329 0.21
330 0.2
331 0.18
332 0.16
333 0.1
334 0.06
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.12
347 0.14
348 0.15
349 0.17
350 0.17
351 0.2
352 0.2
353 0.2
354 0.16
355 0.15
356 0.18
357 0.17
358 0.17
359 0.16
360 0.15
361 0.14
362 0.13
363 0.12
364 0.09
365 0.1
366 0.08
367 0.08
368 0.1
369 0.11
370 0.14
371 0.15
372 0.14
373 0.15
374 0.16
375 0.16
376 0.14
377 0.12
378 0.1
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.12
383 0.14
384 0.18
385 0.18
386 0.21
387 0.26
388 0.26
389 0.26
390 0.23
391 0.22
392 0.22
393 0.24
394 0.22
395 0.19
396 0.22
397 0.3
398 0.31
399 0.33
400 0.35
401 0.41
402 0.49
403 0.55
404 0.62
405 0.65
406 0.72
407 0.8
408 0.83
409 0.84
410 0.83
411 0.81
412 0.76
413 0.7
414 0.61
415 0.54
416 0.46
417 0.35
418 0.29
419 0.24
420 0.21
421 0.18
422 0.18
423 0.17
424 0.16
425 0.18
426 0.2
427 0.19
428 0.17
429 0.14
430 0.14
431 0.15
432 0.14
433 0.12
434 0.11
435 0.1
436 0.1
437 0.1
438 0.08
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.08
452 0.1
453 0.1
454 0.13
455 0.17
456 0.19
457 0.23
458 0.27
459 0.32
460 0.38
461 0.48
462 0.55
463 0.56
464 0.63
465 0.69
466 0.74
467 0.73
468 0.71
469 0.69
470 0.67
471 0.64
472 0.57
473 0.5
474 0.4
475 0.36
476 0.32
477 0.28
478 0.29
479 0.3
480 0.37
481 0.44
482 0.52
483 0.62
484 0.64
485 0.72
486 0.75
487 0.81
488 0.83
489 0.84
490 0.86
491 0.84
492 0.87
493 0.81
494 0.79
495 0.71
496 0.65
497 0.59
498 0.49
499 0.41
500 0.33
501 0.29
502 0.19
503 0.16
504 0.1
505 0.06
506 0.04
507 0.03
508 0.03
509 0.02
510 0.02
511 0.02
512 0.02
513 0.02
514 0.02
515 0.03
516 0.03
517 0.03
518 0.04
519 0.04
520 0.05
521 0.07
522 0.07
523 0.06
524 0.07
525 0.08
526 0.1
527 0.11
528 0.14
529 0.15
530 0.16
531 0.17
532 0.18
533 0.23
534 0.27
535 0.34
536 0.33
537 0.34
538 0.35
539 0.4
540 0.49
541 0.53
542 0.52
543 0.46
544 0.46
545 0.46
546 0.46
547 0.41
548 0.33
549 0.27
550 0.26
551 0.25
552 0.24
553 0.21
554 0.2
555 0.21
556 0.2
557 0.18
558 0.16
559 0.16
560 0.16
561 0.16
562 0.17
563 0.16
564 0.16
565 0.15
566 0.13
567 0.12
568 0.14
569 0.15
570 0.17
571 0.19
572 0.24
573 0.25
574 0.26
575 0.27
576 0.24
577 0.25
578 0.23
579 0.2
580 0.13
581 0.13
582 0.13
583 0.11
584 0.11
585 0.11
586 0.12
587 0.13
588 0.13
589 0.13
590 0.15
591 0.17
592 0.2
593 0.23
594 0.2
595 0.22
596 0.27
597 0.3
598 0.32
599 0.31
600 0.29
601 0.27
602 0.28
603 0.27
604 0.24
605 0.21
606 0.18
607 0.18
608 0.16
609 0.14
610 0.12
611 0.12
612 0.11
613 0.1
614 0.1
615 0.1
616 0.1
617 0.1
618 0.1
619 0.1
620 0.1
621 0.09
622 0.07
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.08
628 0.07
629 0.07
630 0.07
631 0.06
632 0.06
633 0.05
634 0.05
635 0.05
636 0.05
637 0.05
638 0.04
639 0.04
640 0.04
641 0.04
642 0.04
643 0.04
644 0.04
645 0.04
646 0.07
647 0.07
648 0.07
649 0.07
650 0.07
651 0.08
652 0.08
653 0.08
654 0.06
655 0.05
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.06
660 0.06
661 0.07
662 0.07
663 0.07
664 0.07
665 0.08
666 0.11
667 0.12
668 0.14
669 0.14
670 0.2
671 0.25
672 0.29
673 0.3
674 0.27
675 0.29
676 0.31
677 0.33
678 0.31
679 0.28
680 0.3
681 0.3
682 0.31
683 0.28
684 0.23
685 0.2
686 0.17
687 0.14
688 0.09
689 0.06
690 0.06
691 0.06
692 0.07
693 0.06
694 0.07
695 0.16
696 0.22
697 0.23
698 0.24
699 0.26
700 0.32
701 0.4
702 0.45
703 0.43
704 0.44
705 0.51
706 0.51
707 0.5
708 0.46
709 0.41
710 0.36
711 0.32
712 0.25
713 0.17
714 0.17
715 0.16
716 0.15
717 0.13
718 0.13
719 0.11
720 0.12
721 0.13
722 0.15
723 0.16
724 0.17
725 0.18
726 0.18
727 0.17
728 0.17
729 0.19
730 0.19
731 0.21
732 0.22
733 0.21
734 0.23
735 0.25
736 0.24
737 0.21
738 0.19
739 0.2
740 0.19
741 0.2
742 0.17
743 0.17
744 0.19
745 0.19
746 0.18
747 0.15
748 0.15
749 0.15
750 0.16
751 0.15
752 0.16
753 0.2
754 0.21
755 0.22
756 0.21
757 0.21
758 0.27
759 0.3
760 0.32
761 0.31
762 0.31
763 0.3
764 0.34
765 0.34
766 0.35
767 0.33
768 0.35
769 0.38
770 0.39
771 0.4
772 0.36
773 0.35
774 0.29
775 0.3
776 0.24
777 0.18
778 0.15
779 0.15
780 0.15
781 0.14
782 0.14
783 0.11
784 0.13
785 0.13
786 0.14
787 0.13
788 0.12
789 0.14
790 0.17
791 0.2
792 0.17
793 0.19
794 0.22
795 0.24
796 0.24
797 0.22
798 0.21
799 0.17
800 0.19
801 0.18
802 0.14
803 0.13
804 0.15
805 0.15
806 0.14
807 0.15
808 0.14
809 0.15
810 0.16
811 0.17
812 0.14
813 0.15
814 0.15
815 0.13
816 0.14
817 0.12
818 0.1
819 0.09
820 0.1
821 0.08
822 0.09
823 0.1
824 0.13
825 0.17
826 0.24
827 0.32
828 0.35
829 0.38
830 0.42
831 0.42
832 0.41
833 0.39
834 0.35
835 0.27
836 0.24
837 0.22
838 0.18
839 0.18
840 0.15
841 0.13
842 0.1
843 0.1
844 0.09
845 0.08
846 0.08
847 0.07
848 0.08
849 0.1
850 0.12
851 0.13
852 0.16
853 0.22
854 0.23
855 0.24
856 0.29
857 0.33
858 0.38
859 0.42
860 0.43
861 0.43
862 0.43
863 0.43
864 0.39
865 0.33
866 0.28
867 0.24
868 0.23
869 0.19
870 0.19
871 0.18
872 0.15
873 0.14
874 0.14
875 0.14
876 0.11
877 0.1
878 0.11
879 0.12
880 0.14
881 0.15
882 0.14
883 0.13
884 0.16
885 0.18
886 0.19
887 0.22
888 0.25
889 0.28
890 0.29
891 0.29
892 0.29
893 0.31
894 0.33
895 0.31
896 0.32
897 0.33
898 0.4
899 0.48
900 0.5
901 0.46
902 0.41
903 0.38
904 0.33
905 0.33
906 0.29
907 0.24
908 0.2
909 0.2
910 0.2
911 0.2
912 0.21
913 0.19
914 0.14
915 0.14
916 0.13
917 0.15
918 0.15
919 0.16
920 0.15
921 0.14
922 0.19
923 0.25
924 0.29
925 0.32
926 0.38
927 0.39
928 0.41
929 0.47
930 0.47
931 0.45
932 0.45
933 0.42
934 0.44
935 0.42
936 0.41
937 0.35
938 0.33
939 0.3
940 0.29
941 0.29
942 0.23
943 0.27
944 0.26
945 0.25
946 0.23
947 0.24
948 0.24
949 0.22
950 0.23
951 0.19
952 0.19
953 0.19
954 0.18
955 0.13
956 0.11