Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H0EK32

Protein Details
Accession H0EK32    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-130EVDEKMDRRRKVRREAREQAEREEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-119RRKVR
Subcellular Location(s) nucl 9, cyto 7.5, cyto_mito 7.5, mito 6.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
Amino Acid Sequences MSGRRDFLSQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEDQIKEALAKRAAQLGAAPPTAYGAPEKKEEDDDDPRFQDPENEVGLFAGGAYDKDDDEADRIYQEVDEKMDRRRKVRREAREQAEREEYERNNPKIQQQFADLKRALGTVSDEDWANLPEVGDLTGKNRRSKQALRQRFYAVPDSVIAGARDSSELGTSIADDGNSGSGDNPDGAMTNFADIGAARDKVLKVRLDQASQGSGIDSVAGSATNIDPKGYLTSLAKSQINEGEAQVGDIKRVRVLLESVIRTNPKHAPGWIAAARLEELAGKTVAARNVIARGCEFCPKSEDVWLENIRLNDNHNAKIIASNAIQKNDRSVRLWVEAMKLESESRAKKSVLRKALDHIPQSVMLWKEAVNLEEDPADARLLLAKATEIIPLSVELWLALARLETSDNAKKVLNKARKAIPTSHEIWIAAARLQEQIGNAGKVNVMKHAVQALAEKSAMLKREEWITEAEKCEDEGAILTCGNIIRETLGWSLDEDDDRKEIWMEDAKSSINRGKYETARAMYAYALRVFVNSRKLWLAAADLEKNHGTKEALWQLLEKAVEACPQSEVLWMMLAKEKWQAGEIDNARRVLGRAFNQNPNNEDIWLAAVKLEAENNEPEQARELLKTARQEAPTDRVWMKSVAYERQLGNPEAALDLVNQALQLFPAAPKLWMMKGQIYDADGKTPQAREAYSTGTKACPRSVPLWLLYSRLEERLGALVKARSVLDRARLAVPKSPQLWTESVRIERRANNITQAKVLMAKALQEVPNSGLLYSESIWYLEARTQRKPRALEAIKKVDNDPILFVTIARIFWGERRLEKAQNWFEKAVVLDSDLGDTWAWYFKFLMQHGTDEKRADVIAKCILSEPRHGEFWQAIAKDPKNAKMGTEEVLKAVVARLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.3
3 0.26
4 0.23
5 0.18
6 0.15
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.3
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.28
37 0.3
38 0.3
39 0.36
40 0.35
41 0.29
42 0.27
43 0.26
44 0.28
45 0.27
46 0.25
47 0.19
48 0.2
49 0.2
50 0.18
51 0.18
52 0.18
53 0.2
54 0.25
55 0.28
56 0.29
57 0.32
58 0.35
59 0.37
60 0.42
61 0.45
62 0.46
63 0.45
64 0.44
65 0.41
66 0.38
67 0.37
68 0.3
69 0.29
70 0.26
71 0.24
72 0.23
73 0.22
74 0.22
75 0.15
76 0.12
77 0.08
78 0.05
79 0.05
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.09
84 0.09
85 0.1
86 0.11
87 0.13
88 0.12
89 0.11
90 0.12
91 0.11
92 0.12
93 0.13
94 0.13
95 0.14
96 0.19
97 0.21
98 0.3
99 0.38
100 0.42
101 0.48
102 0.57
103 0.62
104 0.69
105 0.76
106 0.78
107 0.81
108 0.86
109 0.87
110 0.88
111 0.81
112 0.76
113 0.74
114 0.64
115 0.56
116 0.53
117 0.45
118 0.45
119 0.51
120 0.49
121 0.47
122 0.48
123 0.54
124 0.54
125 0.56
126 0.49
127 0.46
128 0.52
129 0.49
130 0.55
131 0.47
132 0.4
133 0.38
134 0.35
135 0.29
136 0.2
137 0.2
138 0.14
139 0.15
140 0.15
141 0.14
142 0.14
143 0.15
144 0.15
145 0.13
146 0.1
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.12
154 0.19
155 0.24
156 0.3
157 0.35
158 0.4
159 0.48
160 0.55
161 0.62
162 0.66
163 0.72
164 0.71
165 0.7
166 0.69
167 0.65
168 0.61
169 0.57
170 0.46
171 0.36
172 0.32
173 0.29
174 0.24
175 0.22
176 0.18
177 0.11
178 0.11
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.08
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.13
216 0.13
217 0.17
218 0.22
219 0.21
220 0.21
221 0.29
222 0.32
223 0.31
224 0.33
225 0.32
226 0.28
227 0.26
228 0.24
229 0.16
230 0.13
231 0.11
232 0.09
233 0.06
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.1
245 0.12
246 0.11
247 0.13
248 0.11
249 0.13
250 0.16
251 0.2
252 0.21
253 0.19
254 0.21
255 0.21
256 0.21
257 0.19
258 0.17
259 0.16
260 0.14
261 0.14
262 0.15
263 0.12
264 0.13
265 0.14
266 0.14
267 0.12
268 0.13
269 0.13
270 0.11
271 0.12
272 0.16
273 0.19
274 0.21
275 0.22
276 0.24
277 0.26
278 0.25
279 0.28
280 0.27
281 0.25
282 0.25
283 0.24
284 0.25
285 0.24
286 0.3
287 0.28
288 0.24
289 0.21
290 0.2
291 0.2
292 0.16
293 0.14
294 0.09
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.1
301 0.11
302 0.11
303 0.11
304 0.1
305 0.15
306 0.15
307 0.15
308 0.13
309 0.15
310 0.16
311 0.22
312 0.22
313 0.18
314 0.22
315 0.23
316 0.23
317 0.25
318 0.25
319 0.2
320 0.26
321 0.26
322 0.24
323 0.25
324 0.24
325 0.21
326 0.2
327 0.21
328 0.22
329 0.23
330 0.23
331 0.22
332 0.21
333 0.2
334 0.21
335 0.19
336 0.15
337 0.13
338 0.19
339 0.2
340 0.23
341 0.24
342 0.22
343 0.28
344 0.29
345 0.3
346 0.25
347 0.26
348 0.25
349 0.27
350 0.28
351 0.23
352 0.2
353 0.2
354 0.18
355 0.16
356 0.14
357 0.12
358 0.12
359 0.16
360 0.16
361 0.17
362 0.2
363 0.2
364 0.25
365 0.33
366 0.4
367 0.43
368 0.43
369 0.42
370 0.43
371 0.5
372 0.5
373 0.43
374 0.36
375 0.29
376 0.27
377 0.26
378 0.25
379 0.18
380 0.13
381 0.12
382 0.1
383 0.12
384 0.12
385 0.12
386 0.1
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.08
392 0.07
393 0.07
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.05
400 0.05
401 0.06
402 0.06
403 0.07
404 0.06
405 0.05
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.05
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.03
417 0.03
418 0.04
419 0.04
420 0.05
421 0.09
422 0.13
423 0.13
424 0.14
425 0.16
426 0.17
427 0.23
428 0.32
429 0.35
430 0.35
431 0.39
432 0.45
433 0.48
434 0.49
435 0.47
436 0.4
437 0.37
438 0.37
439 0.34
440 0.28
441 0.24
442 0.21
443 0.18
444 0.16
445 0.12
446 0.09
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.07
452 0.1
453 0.09
454 0.1
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.1
459 0.11
460 0.09
461 0.1
462 0.09
463 0.1
464 0.11
465 0.1
466 0.09
467 0.11
468 0.1
469 0.09
470 0.09
471 0.08
472 0.08
473 0.1
474 0.11
475 0.11
476 0.11
477 0.11
478 0.14
479 0.15
480 0.15
481 0.16
482 0.16
483 0.18
484 0.18
485 0.18
486 0.15
487 0.15
488 0.14
489 0.11
490 0.09
491 0.07
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.05
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.07
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.09
509 0.09
510 0.1
511 0.09
512 0.09
513 0.1
514 0.1
515 0.1
516 0.08
517 0.08
518 0.09
519 0.14
520 0.14
521 0.14
522 0.15
523 0.16
524 0.15
525 0.18
526 0.19
527 0.17
528 0.17
529 0.19
530 0.23
531 0.24
532 0.29
533 0.31
534 0.28
535 0.25
536 0.25
537 0.23
538 0.18
539 0.17
540 0.14
541 0.1
542 0.1
543 0.09
544 0.1
545 0.11
546 0.13
547 0.18
548 0.17
549 0.18
550 0.18
551 0.18
552 0.18
553 0.17
554 0.15
555 0.12
556 0.15
557 0.15
558 0.14
559 0.16
560 0.16
561 0.16
562 0.15
563 0.13
564 0.11
565 0.1
566 0.17
567 0.2
568 0.2
569 0.2
570 0.21
571 0.2
572 0.22
573 0.21
574 0.14
575 0.1
576 0.09
577 0.12
578 0.12
579 0.12
580 0.1
581 0.1
582 0.1
583 0.1
584 0.1
585 0.08
586 0.09
587 0.08
588 0.09
589 0.12
590 0.11
591 0.11
592 0.14
593 0.14
594 0.13
595 0.14
596 0.15
597 0.12
598 0.21
599 0.23
600 0.26
601 0.29
602 0.29
603 0.28
604 0.27
605 0.26
606 0.2
607 0.22
608 0.19
609 0.26
610 0.3
611 0.38
612 0.42
613 0.44
614 0.43
615 0.42
616 0.39
617 0.3
618 0.26
619 0.18
620 0.16
621 0.13
622 0.11
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.08
628 0.06
629 0.09
630 0.1
631 0.11
632 0.14
633 0.14
634 0.14
635 0.16
636 0.17
637 0.16
638 0.14
639 0.15
640 0.15
641 0.18
642 0.21
643 0.23
644 0.27
645 0.27
646 0.29
647 0.31
648 0.33
649 0.31
650 0.34
651 0.3
652 0.26
653 0.27
654 0.25
655 0.22
656 0.22
657 0.24
658 0.23
659 0.24
660 0.27
661 0.26
662 0.3
663 0.33
664 0.29
665 0.26
666 0.22
667 0.2
668 0.16
669 0.15
670 0.1
671 0.07
672 0.07
673 0.06
674 0.06
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.04
679 0.05
680 0.05
681 0.05
682 0.08
683 0.09
684 0.09
685 0.1
686 0.13
687 0.14
688 0.17
689 0.19
690 0.2
691 0.21
692 0.22
693 0.22
694 0.21
695 0.24
696 0.21
697 0.22
698 0.18
699 0.18
700 0.2
701 0.2
702 0.21
703 0.19
704 0.19
705 0.19
706 0.21
707 0.25
708 0.24
709 0.25
710 0.24
711 0.26
712 0.3
713 0.29
714 0.29
715 0.26
716 0.27
717 0.29
718 0.32
719 0.31
720 0.3
721 0.32
722 0.3
723 0.3
724 0.27
725 0.29
726 0.25
727 0.24
728 0.22
729 0.17
730 0.18
731 0.21
732 0.21
733 0.17
734 0.18
735 0.18
736 0.18
737 0.19
738 0.19
739 0.14
740 0.16
741 0.19
742 0.22
743 0.23
744 0.25
745 0.29
746 0.33
747 0.33
748 0.36
749 0.37
750 0.38
751 0.37
752 0.37
753 0.33
754 0.33
755 0.34
756 0.32
757 0.34
758 0.33
759 0.38
760 0.4
761 0.43
762 0.44
763 0.45
764 0.48
765 0.48
766 0.44
767 0.47
768 0.47
769 0.44
770 0.42
771 0.38
772 0.32
773 0.3
774 0.28
775 0.21
776 0.16
777 0.16
778 0.16
779 0.2
780 0.21
781 0.18
782 0.2
783 0.19
784 0.23
785 0.22
786 0.19
787 0.15
788 0.14
789 0.15
790 0.14
791 0.14
792 0.1
793 0.1
794 0.11
795 0.11
796 0.11
797 0.13
798 0.2
799 0.23
800 0.32
801 0.4
802 0.47
803 0.54
804 0.56
805 0.57
806 0.61
807 0.65
808 0.65
809 0.66
810 0.69
811 0.66
812 0.64
813 0.61
814 0.55
815 0.5
816 0.41
817 0.34
818 0.26
819 0.24
820 0.21
821 0.2
822 0.19
823 0.17
824 0.16
825 0.14
826 0.13
827 0.12
828 0.16
829 0.22
830 0.23
831 0.24
832 0.31
833 0.36
834 0.41
835 0.46
836 0.52
837 0.56
838 0.6
839 0.62
840 0.56
841 0.51
842 0.47
843 0.43
844 0.35
845 0.26
846 0.19
847 0.15
848 0.15
849 0.16
850 0.13
851 0.13
852 0.11
853 0.1
854 0.1
855 0.14
856 0.13
857 0.13
858 0.14
859 0.17
860 0.23
861 0.24
862 0.31
863 0.27
864 0.32
865 0.38
866 0.43
867 0.43
868 0.38
869 0.38
870 0.32
871 0.31
872 0.29
873 0.25
874 0.24
875 0.26
876 0.25
877 0.25
878 0.27
879 0.32
880 0.3
881 0.35
882 0.37
883 0.35
884 0.38
885 0.38
886 0.38
887 0.33
888 0.35
889 0.34
890 0.29
891 0.3
892 0.35
893 0.37
894 0.42
895 0.45
896 0.48
897 0.47
898 0.46
899 0.43
900 0.4
901 0.41
902 0.37
903 0.39
904 0.33
905 0.28
906 0.28
907 0.26
908 0.21