Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X6MSF8

Protein Details
Accession A0A1X6MSF8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
871-900ISRQSIATMKRHRSRRARRQRKNVIGFSQTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
880-892KRHRSRRARRQRK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007259  GCP  
IPR040457  GCP_C  
IPR042241  GCP_C_sf  
IPR041470  GCP_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000930  C:gamma-tubulin complex  
GO:0005874  C:microtubule  
GO:0000922  C:spindle pole  
GO:0005816  C:spindle pole body  
GO:0043015  F:gamma-tubulin binding  
GO:0007020  P:microtubule nucleation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04130  GCP_C_terminal  
PF17681  GCP_N_terminal  
Amino Acid Sequences MDFVSKNLDQTARPAGNVEMSSVVRHIKGQIQKARINSQDALAAALDTAFRELNARAQQPDDLDSEIKTFLAMPPTDATLRVAEEYLENIKNPPKPPLGLTWKDILAEEPFEGQHWEGAYNLPPGSTVEDWDTHSGGSTPSLSPWDDSDDPDESLSSSDSLAPTAEPDELDAAQKSISSSHPRMAFGHRQDVEQLQARQYWRPGWRPDIPISQRFDIGDASTLAGPEKEIYIYEHDAVREVLTGLQGRKNVMMKWEYTGNEAFSFVPNTSMRLLHLTAGAQLSIITSFTQSATTLEHLRKFVSAVYKKASETPTHTHTEPVYLNSVSRRNPLTLEACAAAVDSQLQKFNAWCASREEQICLAQAGVRPPLVVSLLSLDKAIKDEFSASFSVILDVLKEVVRRALRNSEPLKEIWTYPELPMRILPSAFTTLLLDSLLVAVQERNSMGDTVTSDVLMRVFTQTAEPIWEMVGRWMKNGMPVQEMGLYESRPPATKLDDEFFVEDNELPLLDPDFWADGFVLKNSQEDESRTSSVPAVLALFAQDILDAGKAIGMLRALGTSATFERGTEQQWLASWRPFTSLIESPPAFSDKDLSSKVDPATLPGQARRVAATNDDLAGLIQDELLPHCRLAQEMLQRVIIDECDLWLHLSAMEDLFLMRQGDALSRFVDVLFARMDNKQAWSDFHFLNRAFRDVVEASSYKWIDASLVRFSHRGSKDKSITRTVRAIDGLLLEYAVPFPLTYIFGPRVMQAYSSIFSFILQIRRAKSVLERILVFYALRSKLSWFVNTLLDFVATNVLHSQLLSFHEAFRQAKSLNDMIHLHDDHLTKIQSRCLLQQNTSPFQRAIISILDMALHFSDYFVAFAGDTTHDISRQSIATMKRHRSRRARRQRKNVIGFSQTLKKADVSSESSDSEFDDDLAEGRVPPEPSFSLAMSTVSAPDESFVDRLDKMSSELDTHVRFIRRWAESLAAGSGEAAPTFGMFAFALDDWDR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.27
3 0.3
4 0.29
5 0.26
6 0.2
7 0.19
8 0.2
9 0.2
10 0.22
11 0.17
12 0.18
13 0.2
14 0.24
15 0.31
16 0.4
17 0.46
18 0.51
19 0.55
20 0.59
21 0.65
22 0.61
23 0.6
24 0.51
25 0.45
26 0.4
27 0.36
28 0.31
29 0.23
30 0.18
31 0.12
32 0.11
33 0.1
34 0.07
35 0.09
36 0.07
37 0.07
38 0.09
39 0.1
40 0.18
41 0.24
42 0.27
43 0.27
44 0.29
45 0.32
46 0.32
47 0.34
48 0.28
49 0.24
50 0.22
51 0.21
52 0.21
53 0.19
54 0.16
55 0.14
56 0.13
57 0.12
58 0.18
59 0.17
60 0.18
61 0.19
62 0.22
63 0.23
64 0.23
65 0.22
66 0.17
67 0.19
68 0.17
69 0.16
70 0.13
71 0.13
72 0.15
73 0.19
74 0.19
75 0.18
76 0.2
77 0.26
78 0.31
79 0.32
80 0.37
81 0.36
82 0.37
83 0.39
84 0.46
85 0.5
86 0.48
87 0.49
88 0.46
89 0.42
90 0.41
91 0.38
92 0.3
93 0.23
94 0.2
95 0.17
96 0.15
97 0.14
98 0.14
99 0.16
100 0.14
101 0.13
102 0.12
103 0.12
104 0.11
105 0.13
106 0.15
107 0.16
108 0.16
109 0.14
110 0.13
111 0.14
112 0.18
113 0.17
114 0.16
115 0.16
116 0.18
117 0.21
118 0.23
119 0.22
120 0.17
121 0.17
122 0.16
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.11
127 0.12
128 0.15
129 0.15
130 0.15
131 0.16
132 0.21
133 0.2
134 0.22
135 0.24
136 0.24
137 0.24
138 0.23
139 0.22
140 0.15
141 0.15
142 0.14
143 0.1
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.09
150 0.09
151 0.1
152 0.1
153 0.08
154 0.09
155 0.11
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.1
161 0.11
162 0.1
163 0.1
164 0.15
165 0.21
166 0.23
167 0.28
168 0.31
169 0.33
170 0.35
171 0.41
172 0.44
173 0.41
174 0.48
175 0.44
176 0.41
177 0.42
178 0.41
179 0.38
180 0.36
181 0.33
182 0.26
183 0.29
184 0.3
185 0.31
186 0.32
187 0.35
188 0.35
189 0.41
190 0.44
191 0.47
192 0.52
193 0.54
194 0.56
195 0.59
196 0.58
197 0.57
198 0.57
199 0.51
200 0.46
201 0.41
202 0.37
203 0.28
204 0.22
205 0.18
206 0.13
207 0.13
208 0.11
209 0.11
210 0.1
211 0.09
212 0.09
213 0.07
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.09
218 0.13
219 0.15
220 0.16
221 0.18
222 0.17
223 0.18
224 0.17
225 0.16
226 0.12
227 0.1
228 0.09
229 0.1
230 0.13
231 0.14
232 0.16
233 0.17
234 0.18
235 0.21
236 0.23
237 0.22
238 0.24
239 0.25
240 0.23
241 0.24
242 0.28
243 0.25
244 0.26
245 0.26
246 0.22
247 0.2
248 0.2
249 0.18
250 0.14
251 0.15
252 0.12
253 0.15
254 0.13
255 0.15
256 0.15
257 0.15
258 0.15
259 0.16
260 0.17
261 0.14
262 0.14
263 0.13
264 0.13
265 0.13
266 0.12
267 0.09
268 0.08
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.09
280 0.11
281 0.15
282 0.18
283 0.21
284 0.21
285 0.21
286 0.21
287 0.2
288 0.2
289 0.25
290 0.26
291 0.26
292 0.29
293 0.31
294 0.31
295 0.36
296 0.36
297 0.29
298 0.31
299 0.33
300 0.33
301 0.35
302 0.35
303 0.32
304 0.3
305 0.31
306 0.26
307 0.23
308 0.22
309 0.18
310 0.19
311 0.2
312 0.25
313 0.22
314 0.24
315 0.24
316 0.22
317 0.23
318 0.26
319 0.25
320 0.22
321 0.22
322 0.18
323 0.16
324 0.15
325 0.14
326 0.1
327 0.07
328 0.08
329 0.07
330 0.08
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.11
335 0.13
336 0.17
337 0.17
338 0.17
339 0.22
340 0.24
341 0.28
342 0.29
343 0.28
344 0.24
345 0.25
346 0.24
347 0.18
348 0.15
349 0.12
350 0.13
351 0.13
352 0.12
353 0.11
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.09
358 0.08
359 0.06
360 0.07
361 0.08
362 0.08
363 0.09
364 0.08
365 0.08
366 0.09
367 0.09
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.08
372 0.11
373 0.11
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.08
379 0.08
380 0.06
381 0.05
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.1
387 0.13
388 0.13
389 0.16
390 0.23
391 0.23
392 0.31
393 0.34
394 0.33
395 0.33
396 0.32
397 0.32
398 0.26
399 0.25
400 0.19
401 0.19
402 0.17
403 0.16
404 0.2
405 0.18
406 0.17
407 0.18
408 0.17
409 0.15
410 0.13
411 0.13
412 0.1
413 0.13
414 0.12
415 0.11
416 0.1
417 0.09
418 0.09
419 0.09
420 0.07
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.04
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.07
436 0.08
437 0.08
438 0.07
439 0.07
440 0.06
441 0.07
442 0.06
443 0.06
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.06
456 0.1
457 0.14
458 0.13
459 0.13
460 0.14
461 0.14
462 0.18
463 0.2
464 0.18
465 0.14
466 0.14
467 0.14
468 0.15
469 0.15
470 0.12
471 0.11
472 0.1
473 0.09
474 0.11
475 0.1
476 0.09
477 0.1
478 0.1
479 0.12
480 0.14
481 0.15
482 0.16
483 0.16
484 0.17
485 0.17
486 0.16
487 0.13
488 0.12
489 0.1
490 0.08
491 0.07
492 0.06
493 0.05
494 0.04
495 0.05
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.05
500 0.04
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.06
506 0.07
507 0.06
508 0.07
509 0.08
510 0.09
511 0.09
512 0.1
513 0.14
514 0.16
515 0.18
516 0.18
517 0.17
518 0.17
519 0.16
520 0.14
521 0.11
522 0.08
523 0.06
524 0.05
525 0.05
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.03
530 0.03
531 0.03
532 0.03
533 0.03
534 0.03
535 0.03
536 0.04
537 0.04
538 0.04
539 0.04
540 0.04
541 0.04
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.04
546 0.04
547 0.05
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.09
552 0.1
553 0.12
554 0.14
555 0.14
556 0.12
557 0.13
558 0.17
559 0.16
560 0.17
561 0.17
562 0.14
563 0.16
564 0.17
565 0.16
566 0.18
567 0.18
568 0.18
569 0.22
570 0.22
571 0.2
572 0.2
573 0.21
574 0.16
575 0.14
576 0.15
577 0.11
578 0.15
579 0.16
580 0.17
581 0.17
582 0.2
583 0.2
584 0.2
585 0.18
586 0.17
587 0.18
588 0.18
589 0.19
590 0.17
591 0.2
592 0.19
593 0.19
594 0.17
595 0.18
596 0.15
597 0.16
598 0.16
599 0.14
600 0.12
601 0.12
602 0.11
603 0.09
604 0.08
605 0.07
606 0.05
607 0.04
608 0.04
609 0.04
610 0.05
611 0.08
612 0.09
613 0.08
614 0.09
615 0.09
616 0.09
617 0.11
618 0.15
619 0.18
620 0.21
621 0.23
622 0.23
623 0.22
624 0.23
625 0.21
626 0.16
627 0.11
628 0.07
629 0.06
630 0.06
631 0.06
632 0.06
633 0.06
634 0.06
635 0.05
636 0.06
637 0.06
638 0.06
639 0.06
640 0.06
641 0.05
642 0.05
643 0.06
644 0.06
645 0.05
646 0.06
647 0.06
648 0.08
649 0.1
650 0.11
651 0.1
652 0.1
653 0.1
654 0.09
655 0.12
656 0.09
657 0.1
658 0.09
659 0.09
660 0.1
661 0.11
662 0.13
663 0.12
664 0.14
665 0.15
666 0.15
667 0.17
668 0.2
669 0.23
670 0.22
671 0.23
672 0.25
673 0.24
674 0.29
675 0.28
676 0.26
677 0.22
678 0.21
679 0.24
680 0.2
681 0.2
682 0.17
683 0.16
684 0.16
685 0.21
686 0.21
687 0.16
688 0.16
689 0.15
690 0.13
691 0.15
692 0.17
693 0.16
694 0.18
695 0.19
696 0.2
697 0.21
698 0.29
699 0.31
700 0.34
701 0.34
702 0.42
703 0.48
704 0.55
705 0.59
706 0.59
707 0.58
708 0.56
709 0.56
710 0.48
711 0.43
712 0.37
713 0.32
714 0.24
715 0.21
716 0.17
717 0.12
718 0.1
719 0.07
720 0.07
721 0.06
722 0.06
723 0.05
724 0.04
725 0.04
726 0.05
727 0.07
728 0.07
729 0.11
730 0.13
731 0.14
732 0.15
733 0.16
734 0.16
735 0.15
736 0.15
737 0.13
738 0.14
739 0.14
740 0.13
741 0.13
742 0.11
743 0.11
744 0.13
745 0.14
746 0.17
747 0.2
748 0.24
749 0.25
750 0.28
751 0.28
752 0.27
753 0.29
754 0.33
755 0.34
756 0.34
757 0.32
758 0.31
759 0.32
760 0.31
761 0.26
762 0.18
763 0.2
764 0.18
765 0.18
766 0.16
767 0.17
768 0.22
769 0.25
770 0.25
771 0.21
772 0.22
773 0.26
774 0.26
775 0.25
776 0.19
777 0.17
778 0.15
779 0.13
780 0.15
781 0.11
782 0.11
783 0.11
784 0.12
785 0.11
786 0.11
787 0.11
788 0.08
789 0.11
790 0.15
791 0.15
792 0.15
793 0.17
794 0.23
795 0.23
796 0.23
797 0.24
798 0.21
799 0.23
800 0.27
801 0.28
802 0.24
803 0.27
804 0.26
805 0.25
806 0.31
807 0.29
808 0.25
809 0.26
810 0.26
811 0.23
812 0.26
813 0.25
814 0.23
815 0.25
816 0.28
817 0.28
818 0.29
819 0.35
820 0.4
821 0.43
822 0.41
823 0.45
824 0.48
825 0.5
826 0.5
827 0.47
828 0.37
829 0.34
830 0.34
831 0.28
832 0.23
833 0.18
834 0.17
835 0.14
836 0.14
837 0.13
838 0.11
839 0.12
840 0.09
841 0.09
842 0.07
843 0.07
844 0.08
845 0.08
846 0.08
847 0.07
848 0.07
849 0.07
850 0.07
851 0.09
852 0.08
853 0.09
854 0.12
855 0.12
856 0.13
857 0.14
858 0.15
859 0.15
860 0.15
861 0.15
862 0.18
863 0.22
864 0.31
865 0.4
866 0.48
867 0.54
868 0.63
869 0.72
870 0.77
871 0.83
872 0.86
873 0.88
874 0.9
875 0.92
876 0.95
877 0.96
878 0.96
879 0.94
880 0.91
881 0.86
882 0.8
883 0.72
884 0.66
885 0.64
886 0.56
887 0.47
888 0.4
889 0.35
890 0.31
891 0.3
892 0.3
893 0.27
894 0.29
895 0.3
896 0.3
897 0.29
898 0.28
899 0.27
900 0.24
901 0.18
902 0.14
903 0.11
904 0.1
905 0.1
906 0.12
907 0.11
908 0.09
909 0.1
910 0.14
911 0.15
912 0.15
913 0.19
914 0.18
915 0.21
916 0.23
917 0.22
918 0.2
919 0.19
920 0.2
921 0.17
922 0.16
923 0.14
924 0.13
925 0.13
926 0.1
927 0.1
928 0.11
929 0.12
930 0.12
931 0.12
932 0.14
933 0.14
934 0.16
935 0.17
936 0.16
937 0.17
938 0.19
939 0.19
940 0.18
941 0.21
942 0.25
943 0.25
944 0.27
945 0.3
946 0.31
947 0.31
948 0.34
949 0.4
950 0.37
951 0.39
952 0.39
953 0.37
954 0.35
955 0.36
956 0.32
957 0.23
958 0.19
959 0.17
960 0.15
961 0.12
962 0.1
963 0.08
964 0.06
965 0.06
966 0.07
967 0.06
968 0.07
969 0.06
970 0.07
971 0.09
972 0.09