FuNGI

A0A1X6NF78

Protein Details

Accession

A0A1X6NF78

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
485-525	RVTVTRPKNESKEDKKARKQAIKVERQVRRADKKATKEQFS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
113-121	KPKPKGKGK
492-523	KNESKEDKKARKQAIKVERQVRRADKKATKEQ
528-542	AKRQNRTLANKEKSK

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKSVFRQPGTQHFQLVHRSQRDPLIHDPEASQHVLKAFERGNVVKGKSRADLERILPSADLAHDTERANIGEAAVYGVYYDDTDYDYMKHLRPVGLQEDGVDSILIEAPSKPKPKGKGKEPITLLDLPPEALPSTAEAPRNFESQENIPSSIAGFQPDLDPHLRQVLEALEDDAFVDEGLDEDFFGELVAEGELAAGENLEFEFQEEGIEGDERAEVSAASAEEVVEDGEEESWEARFSKFKKAQKAQPRSEGSDIDDFSEGGDTVGSLPQMSVIGGKRRRRGASDASGYSMSSSSMFRNEGLTMLDERFDEIQKEYDSDEDEEADDMSDASGEAPELITSREDFDAIMNEFLDNYEILGGKMRPVLAGETAADKLDTFRKALGQVHLREHDEDSEEDDILMPLDIDEKKDTWDCETILTTYSNLENHPRLIKSRQDKPVPKIRLDPKTGLPVVLGKQPASRREDDATSSSGSDTEDGSRVQRVTVTRPKNESKEDKKARKQAIKVERQVRRADKKATKEQFSVEAKRQNRTLANKEKSKAKQL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.54
3	0.53
4	0.54
5	0.52
6	0.5
7	0.5
8	0.5
9	0.55
10	0.54
11	0.51
12	0.53
13	0.52
14	0.47
15	0.46
16	0.44
17	0.4
18	0.4
19	0.37
20	0.29
21	0.22
22	0.22
23	0.25
24	0.24
25	0.26
26	0.24
27	0.24
28	0.3
29	0.29
30	0.32
31	0.35
32	0.38
33	0.39
34	0.41
35	0.41
36	0.4
37	0.43
38	0.42
39	0.41
40	0.44
41	0.4
42	0.44
43	0.41
44	0.38
45	0.33
46	0.29
47	0.25
48	0.2
49	0.18
50	0.13
51	0.14
52	0.16
53	0.17
54	0.18
55	0.19
56	0.19
57	0.18
58	0.17
59	0.15
60	0.13
61	0.12
62	0.12
63	0.09
64	0.08
65	0.06
66	0.06
67	0.06
68	0.05
69	0.06
70	0.05
71	0.07
72	0.08
73	0.08
74	0.09
75	0.13
76	0.17
77	0.18
78	0.21
79	0.22
80	0.24
81	0.26
82	0.3
83	0.29
84	0.28
85	0.27
86	0.24
87	0.23
88	0.21
89	0.19
90	0.14
91	0.1
92	0.08
93	0.1
94	0.09
95	0.08
96	0.08
97	0.12
98	0.19
99	0.23
100	0.26
101	0.3
102	0.4
103	0.5
104	0.58
105	0.64
106	0.68
107	0.7
108	0.75
109	0.72
110	0.66
111	0.6
112	0.53
113	0.44
114	0.37
115	0.31
116	0.23
117	0.2
118	0.18
119	0.13
120	0.1
121	0.1
122	0.08
123	0.12
124	0.15
125	0.19
126	0.18
127	0.23
128	0.25
129	0.27
130	0.26
131	0.23
132	0.23
133	0.23
134	0.28
135	0.25
136	0.25
137	0.23
138	0.22
139	0.21
140	0.2
141	0.17
142	0.12
143	0.1
144	0.09
145	0.11
146	0.11
147	0.13
148	0.13
149	0.13
150	0.13
151	0.17
152	0.17
153	0.15
154	0.16
155	0.14
156	0.13
157	0.13
158	0.13
159	0.09
160	0.09
161	0.09
162	0.08
163	0.07
164	0.05
165	0.05
166	0.03
167	0.04
168	0.04
169	0.04
170	0.03
171	0.04
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.03
176	0.03
177	0.04
178	0.04
179	0.03
180	0.03
181	0.03
182	0.03
183	0.03
184	0.03
185	0.02
186	0.02
187	0.03
188	0.03
189	0.03
190	0.03
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.05
195	0.05
196	0.05
197	0.05
198	0.06
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.04
206	0.04
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.04
215	0.03
216	0.03
217	0.03
218	0.03
219	0.03
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.05
224	0.05
225	0.06
226	0.11
227	0.13
228	0.23
229	0.31
230	0.36
231	0.46
232	0.52
233	0.6
234	0.67
235	0.75
236	0.69
237	0.71
238	0.69
239	0.63
240	0.58
241	0.5
242	0.42
243	0.35
244	0.31
245	0.23
246	0.19
247	0.15
248	0.13
249	0.12
250	0.09
251	0.05
252	0.05
253	0.03
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.06
263	0.07
264	0.15
265	0.21
266	0.26
267	0.31
268	0.36
269	0.38
270	0.39
271	0.43
272	0.42
273	0.44
274	0.44
275	0.4
276	0.37
277	0.35
278	0.32
279	0.27
280	0.2
281	0.12
282	0.08
283	0.08
284	0.07
285	0.09
286	0.09
287	0.09
288	0.1
289	0.1
290	0.1
291	0.1
292	0.1
293	0.1
294	0.09
295	0.1
296	0.08
297	0.09
298	0.1
299	0.1
300	0.09
301	0.09
302	0.11
303	0.11
304	0.12
305	0.11
306	0.11
307	0.12
308	0.13
309	0.12
310	0.1
311	0.1
312	0.09
313	0.09
314	0.08
315	0.06
316	0.05
317	0.04
318	0.04
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.03
324	0.03
325	0.03
326	0.04
327	0.04
328	0.05
329	0.05
330	0.07
331	0.08
332	0.08
333	0.08
334	0.08
335	0.1
336	0.1
337	0.1
338	0.09
339	0.08
340	0.08
341	0.08
342	0.08
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.06
348	0.08
349	0.08
350	0.09
351	0.1
352	0.1
353	0.09
354	0.1
355	0.11
356	0.09
357	0.1
358	0.09
359	0.1
360	0.1
361	0.1
362	0.09
363	0.08
364	0.09
365	0.13
366	0.14
367	0.13
368	0.13
369	0.15
370	0.18
371	0.22
372	0.26
373	0.29
374	0.31
375	0.36
376	0.39
377	0.39
378	0.37
379	0.35
380	0.3
381	0.25
382	0.22
383	0.2
384	0.17
385	0.16
386	0.14
387	0.13
388	0.11
389	0.09
390	0.09
391	0.05
392	0.04
393	0.08
394	0.08
395	0.1
396	0.12
397	0.12
398	0.15
399	0.18
400	0.19
401	0.19
402	0.21
403	0.2
404	0.2
405	0.21
406	0.19
407	0.18
408	0.18
409	0.15
410	0.13
411	0.15
412	0.13
413	0.13
414	0.18
415	0.19
416	0.21
417	0.25
418	0.25
419	0.28
420	0.32
421	0.4
422	0.43
423	0.5
424	0.56
425	0.62
426	0.69
427	0.72
428	0.77
429	0.74
430	0.69
431	0.69
432	0.69
433	0.67
434	0.65
435	0.62
436	0.56
437	0.59
438	0.56
439	0.47
440	0.38
441	0.34
442	0.3
443	0.31
444	0.28
445	0.2
446	0.25
447	0.3
448	0.35
449	0.37
450	0.38
451	0.37
452	0.4
453	0.42
454	0.4
455	0.38
456	0.35
457	0.3
458	0.28
459	0.23
460	0.2
461	0.18
462	0.14
463	0.13
464	0.12
465	0.13
466	0.13
467	0.15
468	0.18
469	0.18
470	0.17
471	0.2
472	0.21
473	0.28
474	0.37
475	0.43
476	0.47
477	0.54
478	0.62
479	0.65
480	0.71
481	0.73
482	0.72
483	0.75
484	0.79
485	0.83
486	0.85
487	0.87
488	0.88
489	0.87
490	0.85
491	0.84
492	0.84
493	0.84
494	0.83
495	0.84
496	0.81
497	0.78
498	0.8
499	0.8
500	0.79
501	0.76
502	0.77
503	0.75
504	0.77
505	0.82
506	0.82
507	0.78
508	0.72
509	0.67
510	0.66
511	0.65
512	0.63
513	0.6
514	0.6
515	0.57
516	0.6
517	0.6
518	0.58
519	0.58
520	0.59
521	0.62
522	0.64
523	0.7
524	0.72
525	0.74
526	0.77

A0A1X6NF78

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer