Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H0EK07

Protein Details
Accession H0EK07    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-60IKPDMAKREKEERRKRWEQVVEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-53KREKEERRK
199-228PAPSKGKGRAKAASSKVTKPKAKGKGKSKA
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024974  Sde2_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF13019  Sde2_N_Ubi  
Amino Acid Sequences MSSKRKRGQGEENGSSRNLDGRRLRTVNEAKALAEYLAIKPDMAKREKEERRKRWEQVVELAERREEEIKSGNKGKVDGKWVEDKEEAGERTREAVLAAMKSGNYKDNLIETSGAGTRAASSSEDDAGEGSSKATTPPSEPEAKPKSLGFFGFDDDDEFMSDSDEEEESGIKNLPDITEADESEEEVEEIVEKEPTPPPAPSKGKGRAKAASSKVTKPKAKGKGKSKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.53
3 0.42
4 0.38
5 0.29
6 0.29
7 0.33
8 0.35
9 0.44
10 0.45
11 0.46
12 0.49
13 0.56
14 0.53
15 0.51
16 0.47
17 0.38
18 0.38
19 0.37
20 0.26
21 0.2
22 0.16
23 0.11
24 0.13
25 0.13
26 0.12
27 0.13
28 0.18
29 0.25
30 0.26
31 0.29
32 0.32
33 0.43
34 0.52
35 0.61
36 0.67
37 0.69
38 0.76
39 0.82
40 0.81
41 0.8
42 0.78
43 0.71
44 0.68
45 0.64
46 0.59
47 0.52
48 0.48
49 0.39
50 0.32
51 0.3
52 0.24
53 0.18
54 0.15
55 0.2
56 0.22
57 0.26
58 0.32
59 0.32
60 0.3
61 0.32
62 0.33
63 0.29
64 0.33
65 0.29
66 0.27
67 0.33
68 0.33
69 0.34
70 0.31
71 0.28
72 0.24
73 0.26
74 0.24
75 0.18
76 0.18
77 0.15
78 0.16
79 0.16
80 0.14
81 0.1
82 0.11
83 0.1
84 0.09
85 0.1
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.07
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.11
125 0.14
126 0.2
127 0.21
128 0.3
129 0.33
130 0.34
131 0.34
132 0.32
133 0.31
134 0.27
135 0.27
136 0.2
137 0.16
138 0.17
139 0.16
140 0.15
141 0.14
142 0.13
143 0.12
144 0.1
145 0.1
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.09
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.13
165 0.14
166 0.14
167 0.16
168 0.16
169 0.16
170 0.15
171 0.15
172 0.1
173 0.08
174 0.08
175 0.06
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.1
181 0.13
182 0.17
183 0.19
184 0.21
185 0.25
186 0.34
187 0.4
188 0.42
189 0.49
190 0.55
191 0.62
192 0.66
193 0.68
194 0.65
195 0.64
196 0.68
197 0.65
198 0.65
199 0.6
200 0.63
201 0.66
202 0.69
203 0.7
204 0.68
205 0.72
206 0.73
207 0.78
208 0.79