Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H0EIX2

Protein Details
Accession H0EIX2    Localization Confidence High Confidence Score 24.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-31NAPGKFKSDARSLKRKRDVVDHydrophilic
143-174LKRLEQKKVPIQRTKPREKKQQSIKNQLQNMCHydrophilic
419-448DLDDKELAKQKKRERREKKKAKYAEENAGSBasic
474-514ADEEDSKPAKRPKKWFEDDSEDEKRKPKKNKRVIETADEPEAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-26KPNAPGKFKSDARSLKRK
225-238KIKFRKGEDAKKAK
352-370KRKEKLMTSKKKLLKLKEK
426-440AKQKKRERREKKKAK
483-487KRPKK
496-505EKRKPKKNKR
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 4, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025313  DUF4217  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF13959  DUF4217  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MAPPTARHKPNAPGKFKSDARSLKRKRDVVDHEKLQNLVDELFYVLCPLADKLDTLFSFIRSNIKAKIIVFLSSGKQVRFVYESFRHLQPARGLDFPAVDWVIQLDCPEDADTYIHRVGRTARYERAGKAVLFLDPSEEEGMLKRLEQKKVPIQRTKPREKKQQSIKNQLQNMCFQDPELKYLGQKAFVSYARSIFVQKDKEIYHINKYDLEGYAASMGLPGAPKIKFRKGEDAKKAKNIPRALLSSEEESDDEPKEPKKPEVRTKYDRMFERRNQDVLSGHYSKLIAEDGHDEIDDARKDADDDNDFLSVKRVVSVDESSDDDEASDEGDAIPGAKIIPGVGREAIVIDSKRKEKLMTSKKKLLKLKEKGTKLVFDDEGKPHEMYELEDERDFVRRGPADAQRAKFVELATEKVREADLDDKELAKQKKRERREKKKAKYAEENAGSEDEAPALVEDGDHQDPLELLASLPLADEEDSKPAKRPKKWFEDDSEDEKRKPKKNKRVIETADEPETLEDLEALAAGLLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.7
3 0.69
4 0.65
5 0.65
6 0.64
7 0.65
8 0.7
9 0.74
10 0.76
11 0.81
12 0.81
13 0.75
14 0.76
15 0.77
16 0.76
17 0.77
18 0.74
19 0.7
20 0.67
21 0.63
22 0.53
23 0.45
24 0.37
25 0.27
26 0.2
27 0.15
28 0.12
29 0.12
30 0.11
31 0.1
32 0.08
33 0.07
34 0.08
35 0.08
36 0.1
37 0.1
38 0.1
39 0.11
40 0.18
41 0.18
42 0.21
43 0.21
44 0.2
45 0.22
46 0.23
47 0.28
48 0.24
49 0.27
50 0.27
51 0.29
52 0.31
53 0.29
54 0.34
55 0.29
56 0.28
57 0.26
58 0.25
59 0.24
60 0.28
61 0.3
62 0.24
63 0.28
64 0.27
65 0.28
66 0.29
67 0.27
68 0.28
69 0.3
70 0.36
71 0.35
72 0.36
73 0.39
74 0.37
75 0.41
76 0.38
77 0.39
78 0.36
79 0.34
80 0.33
81 0.28
82 0.28
83 0.23
84 0.21
85 0.16
86 0.12
87 0.11
88 0.11
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.07
93 0.07
94 0.08
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.1
100 0.14
101 0.17
102 0.18
103 0.17
104 0.18
105 0.22
106 0.29
107 0.35
108 0.35
109 0.37
110 0.4
111 0.44
112 0.44
113 0.45
114 0.4
115 0.33
116 0.31
117 0.27
118 0.22
119 0.2
120 0.19
121 0.15
122 0.12
123 0.14
124 0.12
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.12
129 0.1
130 0.11
131 0.18
132 0.24
133 0.28
134 0.31
135 0.37
136 0.44
137 0.54
138 0.62
139 0.62
140 0.65
141 0.71
142 0.78
143 0.82
144 0.83
145 0.83
146 0.86
147 0.84
148 0.85
149 0.86
150 0.86
151 0.85
152 0.85
153 0.84
154 0.81
155 0.8
156 0.75
157 0.66
158 0.61
159 0.56
160 0.46
161 0.38
162 0.3
163 0.31
164 0.26
165 0.27
166 0.24
167 0.2
168 0.19
169 0.25
170 0.25
171 0.2
172 0.2
173 0.19
174 0.2
175 0.21
176 0.24
177 0.19
178 0.2
179 0.18
180 0.18
181 0.18
182 0.17
183 0.21
184 0.21
185 0.2
186 0.24
187 0.23
188 0.26
189 0.31
190 0.31
191 0.33
192 0.33
193 0.33
194 0.31
195 0.31
196 0.3
197 0.23
198 0.22
199 0.15
200 0.11
201 0.11
202 0.09
203 0.08
204 0.06
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.07
210 0.08
211 0.13
212 0.17
213 0.24
214 0.29
215 0.32
216 0.42
217 0.48
218 0.57
219 0.63
220 0.68
221 0.65
222 0.67
223 0.71
224 0.65
225 0.64
226 0.56
227 0.48
228 0.42
229 0.41
230 0.35
231 0.31
232 0.27
233 0.22
234 0.2
235 0.18
236 0.14
237 0.13
238 0.13
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.12
243 0.16
244 0.17
245 0.22
246 0.28
247 0.35
248 0.44
249 0.52
250 0.59
251 0.61
252 0.66
253 0.67
254 0.65
255 0.63
256 0.6
257 0.58
258 0.55
259 0.55
260 0.52
261 0.47
262 0.42
263 0.38
264 0.32
265 0.27
266 0.28
267 0.23
268 0.2
269 0.19
270 0.19
271 0.17
272 0.16
273 0.14
274 0.08
275 0.07
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.08
282 0.11
283 0.11
284 0.09
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.1
289 0.13
290 0.11
291 0.12
292 0.13
293 0.14
294 0.14
295 0.13
296 0.14
297 0.12
298 0.1
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.11
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.13
307 0.13
308 0.13
309 0.12
310 0.09
311 0.09
312 0.07
313 0.06
314 0.05
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.07
332 0.08
333 0.09
334 0.1
335 0.1
336 0.13
337 0.17
338 0.19
339 0.21
340 0.22
341 0.22
342 0.25
343 0.35
344 0.43
345 0.5
346 0.55
347 0.63
348 0.68
349 0.75
350 0.76
351 0.75
352 0.75
353 0.73
354 0.75
355 0.75
356 0.73
357 0.71
358 0.67
359 0.62
360 0.53
361 0.49
362 0.4
363 0.34
364 0.35
365 0.31
366 0.31
367 0.29
368 0.27
369 0.22
370 0.21
371 0.19
372 0.15
373 0.2
374 0.2
375 0.19
376 0.19
377 0.2
378 0.19
379 0.23
380 0.22
381 0.16
382 0.19
383 0.18
384 0.21
385 0.26
386 0.32
387 0.37
388 0.44
389 0.44
390 0.44
391 0.44
392 0.43
393 0.39
394 0.32
395 0.3
396 0.24
397 0.27
398 0.24
399 0.25
400 0.23
401 0.22
402 0.22
403 0.16
404 0.17
405 0.2
406 0.19
407 0.21
408 0.22
409 0.22
410 0.24
411 0.32
412 0.35
413 0.36
414 0.43
415 0.49
416 0.58
417 0.68
418 0.77
419 0.8
420 0.86
421 0.9
422 0.93
423 0.94
424 0.94
425 0.93
426 0.91
427 0.9
428 0.86
429 0.84
430 0.79
431 0.69
432 0.61
433 0.52
434 0.43
435 0.33
436 0.26
437 0.16
438 0.09
439 0.08
440 0.06
441 0.06
442 0.05
443 0.05
444 0.06
445 0.11
446 0.12
447 0.12
448 0.12
449 0.11
450 0.11
451 0.12
452 0.12
453 0.07
454 0.06
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.06
460 0.06
461 0.07
462 0.09
463 0.1
464 0.16
465 0.19
466 0.21
467 0.28
468 0.36
469 0.45
470 0.51
471 0.61
472 0.64
473 0.73
474 0.8
475 0.8
476 0.8
477 0.8
478 0.78
479 0.76
480 0.76
481 0.69
482 0.64
483 0.64
484 0.65
485 0.64
486 0.69
487 0.72
488 0.73
489 0.79
490 0.87
491 0.87
492 0.89
493 0.87
494 0.85
495 0.81
496 0.75
497 0.68
498 0.57
499 0.49
500 0.39
501 0.33
502 0.24
503 0.17
504 0.11
505 0.07
506 0.07
507 0.06
508 0.06