FuNGI

A0A1X6MW08

Protein Details

Accession

A0A1X6MW08

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-33	GMDLLFHPKKRRPGQPPPPPPPKKEGL	Basic
40-66	DKPSEKPAERPARPPRPRPPNPDDDSD	Acidic
170-195	GGDKGKEKAPPKKRFQKKTKQVFLVP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
14-58	PKKRRPGQPPPPPPPKKEGLPPSAPPDKPSEKPAERPARPPRPRP
169-189	AGGDKGKEKAPPKKRFQKKTK

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MAPKRTGMDLLFHPKKRRPGQPPPPPPPKKEGLPPSAPPDKPSEKPAERPARPPRPRPPNPDDDSDLRPPPPEGRFSEFRLMSSSLNGWKYDIMKFDSRKPVDPLLWELPIRLNRKDLRREADDAPAAVPQAVGPMLGPDGKPVIGVDGKIVMVDAEGRPIQGGGGGGAGGDKGKEKAPPKKRFQKKTKQVFLVPEEVRKLRREERYPWVIEDATQKEMWLGRMEEVSKSETHAMFMPAPDNAFKFVPAHRWYKFQQKPKHHVPTLEEAESLMTKIQKNKDPERWLLRRRNGQAPSEATTALFKAGREGTPAGMPAGAGSGGRKLKVVDDGMAGLFGDDDDEDGEFRKRKLRRELGAEGDVDELDFEETFQDDEEKMEPEEADDEEAKELEASNIRFERLKREYKNANKTREGYIDESDDEDDITLTRAGKNLQKTLQKLEKDGGYDDSDEENPYMSEQEEEEEEEPTPVHTGPAIIAPEPKASRTPSQPPSTPAPANGVKAPTGSQPPLQIKTESQTDALSPTADTLSWRNAR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.69
3	0.73
4	0.76
5	0.75
6	0.78
7	0.83
8	0.86
9	0.9
10	0.9
11	0.92
12	0.89
13	0.85
14	0.81
15	0.76
16	0.71
17	0.7
18	0.7
19	0.67
20	0.66
21	0.66
22	0.66
23	0.68
24	0.63
25	0.55
26	0.54
27	0.52
28	0.48
29	0.51
30	0.53
31	0.49
32	0.57
33	0.65
34	0.67
35	0.64
36	0.71
37	0.75
38	0.76
39	0.79
40	0.82
41	0.82
42	0.82
43	0.87
44	0.87
45	0.85
46	0.84
47	0.8
48	0.77
49	0.72
50	0.66
51	0.62
52	0.59
53	0.53
54	0.44
55	0.4
56	0.36
57	0.36
58	0.35
59	0.35
60	0.34
61	0.38
62	0.41
63	0.45
64	0.52
65	0.46
66	0.43
67	0.41
68	0.38
69	0.31
70	0.29
71	0.27
72	0.24
73	0.26
74	0.25
75	0.22
76	0.23
77	0.25
78	0.25
79	0.26
80	0.25
81	0.31
82	0.33
83	0.41
84	0.48
85	0.49
86	0.5
87	0.51
88	0.52
89	0.46
90	0.46
91	0.44
92	0.38
93	0.38
94	0.34
95	0.3
96	0.3
97	0.35
98	0.36
99	0.31
100	0.34
101	0.38
102	0.46
103	0.55
104	0.56
105	0.56
106	0.57
107	0.6
108	0.55
109	0.56
110	0.49
111	0.4
112	0.34
113	0.28
114	0.23
115	0.18
116	0.15
117	0.08
118	0.07
119	0.06
120	0.05
121	0.05
122	0.05
123	0.06
124	0.07
125	0.07
126	0.07
127	0.08
128	0.08
129	0.08
130	0.08
131	0.1
132	0.1
133	0.1
134	0.1
135	0.1
136	0.1
137	0.09
138	0.09
139	0.06
140	0.05
141	0.07
142	0.06
143	0.08
144	0.08
145	0.08
146	0.08
147	0.08
148	0.08
149	0.07
150	0.07
151	0.04
152	0.04
153	0.04
154	0.04
155	0.04
156	0.04
157	0.03
158	0.04
159	0.04
160	0.06
161	0.07
162	0.13
163	0.2
164	0.3
165	0.41
166	0.51
167	0.6
168	0.7
169	0.79
170	0.84
171	0.88
172	0.89
173	0.89
174	0.91
175	0.9
176	0.85
177	0.79
178	0.75
179	0.68
180	0.65
181	0.55
182	0.47
183	0.41
184	0.38
185	0.35
186	0.32
187	0.33
188	0.32
189	0.39
190	0.42
191	0.44
192	0.5
193	0.55
194	0.54
195	0.5
196	0.45
197	0.37
198	0.33
199	0.34
200	0.27
201	0.22
202	0.21
203	0.19
204	0.18
205	0.19
206	0.18
207	0.14
208	0.12
209	0.1
210	0.12
211	0.13
212	0.13
213	0.13
214	0.14
215	0.12
216	0.12
217	0.15
218	0.13
219	0.13
220	0.14
221	0.14
222	0.13
223	0.13
224	0.12
225	0.09
226	0.1
227	0.1
228	0.09
229	0.09
230	0.08
231	0.09
232	0.1
233	0.1
234	0.17
235	0.2
236	0.25
237	0.24
238	0.29
239	0.31
240	0.4
241	0.46
242	0.49
243	0.54
244	0.58
245	0.65
246	0.71
247	0.78
248	0.69
249	0.65
250	0.59
251	0.58
252	0.52
253	0.45
254	0.34
255	0.25
256	0.23
257	0.2
258	0.17
259	0.09
260	0.08
261	0.09
262	0.14
263	0.19
264	0.23
265	0.3
266	0.37
267	0.44
268	0.47
269	0.51
270	0.56
271	0.59
272	0.63
273	0.65
274	0.65
275	0.65
276	0.65
277	0.67
278	0.62
279	0.56
280	0.52
281	0.45
282	0.42
283	0.35
284	0.31
285	0.23
286	0.19
287	0.17
288	0.14
289	0.12
290	0.08
291	0.1
292	0.11
293	0.11
294	0.13
295	0.13
296	0.13
297	0.13
298	0.13
299	0.1
300	0.09
301	0.08
302	0.06
303	0.05
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.08
308	0.09
309	0.1
310	0.1
311	0.1
312	0.12
313	0.15
314	0.16
315	0.12
316	0.12
317	0.13
318	0.12
319	0.12
320	0.1
321	0.06
322	0.05
323	0.04
324	0.04
325	0.03
326	0.03
327	0.03
328	0.04
329	0.04
330	0.05
331	0.09
332	0.1
333	0.12
334	0.19
335	0.23
336	0.31
337	0.42
338	0.5
339	0.52
340	0.59
341	0.63
342	0.62
343	0.6
344	0.52
345	0.42
346	0.34
347	0.27
348	0.19
349	0.13
350	0.08
351	0.06
352	0.05
353	0.04
354	0.04
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.06
359	0.06
360	0.07
361	0.09
362	0.1
363	0.1
364	0.11
365	0.1
366	0.1
367	0.11
368	0.1
369	0.11
370	0.1
371	0.11
372	0.1
373	0.1
374	0.1
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.11
379	0.11
380	0.16
381	0.17
382	0.18
383	0.21
384	0.21
385	0.29
386	0.33
387	0.42
388	0.41
389	0.49
390	0.58
391	0.65
392	0.76
393	0.75
394	0.75
395	0.72
396	0.7
397	0.67
398	0.61
399	0.55
400	0.47
401	0.42
402	0.36
403	0.3
404	0.29
405	0.24
406	0.2
407	0.15
408	0.12
409	0.1
410	0.07
411	0.08
412	0.08
413	0.09
414	0.09
415	0.11
416	0.14
417	0.19
418	0.24
419	0.29
420	0.34
421	0.4
422	0.43
423	0.5
424	0.55
425	0.52
426	0.5
427	0.48
428	0.44
429	0.39
430	0.38
431	0.32
432	0.26
433	0.25
434	0.24
435	0.23
436	0.21
437	0.2
438	0.18
439	0.15
440	0.13
441	0.13
442	0.12
443	0.09
444	0.1
445	0.09
446	0.1
447	0.11
448	0.14
449	0.14
450	0.14
451	0.14
452	0.13
453	0.13
454	0.12
455	0.13
456	0.1
457	0.09
458	0.08
459	0.09
460	0.09
461	0.13
462	0.14
463	0.13
464	0.16
465	0.17
466	0.23
467	0.24
468	0.25
469	0.25
470	0.28
471	0.34
472	0.39
473	0.47
474	0.49
475	0.56
476	0.57
477	0.58
478	0.61
479	0.62
480	0.56
481	0.48
482	0.47
483	0.43
484	0.43
485	0.42
486	0.36
487	0.3
488	0.29
489	0.29
490	0.27
491	0.29
492	0.29
493	0.28
494	0.34
495	0.4
496	0.44
497	0.45
498	0.42
499	0.38
500	0.41
501	0.44
502	0.38
503	0.32
504	0.29
505	0.27
506	0.26
507	0.24
508	0.2
509	0.14
510	0.13
511	0.13
512	0.12
513	0.14
514	0.15

A0A1X6MW08

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer