Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X6MRN6

Protein Details
Accession A0A1X6MRN6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MATTARQPKPQRKGMPEPGARRAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-14RKG
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 7.5, cyto_mito 5.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
Amino Acid Sequences MATTARQPKPQRKGMPEPGARRAPAWGGARASPTFSPGNNNARLPNGPPAATGAFPPLGHPAGNDKENPHDRILAQLIGLTTHIRYEGTIASTSGEGDTTGVTLRDVKDLSAPGAPLKETLFIAATNIEQWSSGPADAKAPTTTNGDSFKTDTDISKAPAPRRERELLAWADDIPGSGPGSPPLGAVGLGKDRDEQTFGPGANGSGWNQFEVNERLFGVKAGFDEEAYTTKLDRNAPDYKERERRAAAIANEIMQSTTNNVHIAEERVQNLAGDSVNEEERYGAVVRGANAYVPPGARKTNSASPGQGKQEVPKVAVNAPDGSAVSADKTQTGTSTPPPKATSPAPGATQAQPAADAVPAFRSFVSNEKDRLLKKKQALMKNEMDKRMAELVKFSQSFKLNKPIPDDLVPILAKDEDKQRQIREKSTKDAESAQARAIGTSGTAPVVARAPPVSQATMPLASGKPLQGQPITRQSVPGGKTRAAEAGKGRPSMFIQAIPPFKGKRTSTSNVPVSMSVSSAAPSGATSPLSPTAVNRLNVNASSFRPTVKSISPPVSLNIRMYWWMLIYDYAMQSGSPNLNGHASPKPKPGDTSSQGPPNPFFGTRLPKKGMPVHIKEDFNPFRHNKVADAAQVSPTWPYNGKRYMQMFPPLQTPPQQQSPPMAHPPPPPMPPPQYEDDPSAGQVATRGPYMYPYPPYYPGQPMMPGMGPPPPGAYMPPPFMHPMQYPHMPPNAMYGGAPMGQMPPPQAYLAPPPGAYPAPPNGAGPRPSMPPTPIPSHANPYYHQSPQLQHAMPYPMMMPPPGPPHPYDGSQAPPVQMGGVGHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.87
3 0.85
4 0.83
5 0.81
6 0.78
7 0.7
8 0.6
9 0.53
10 0.45
11 0.43
12 0.4
13 0.36
14 0.32
15 0.34
16 0.38
17 0.35
18 0.36
19 0.29
20 0.29
21 0.27
22 0.25
23 0.3
24 0.33
25 0.4
26 0.42
27 0.44
28 0.42
29 0.43
30 0.44
31 0.4
32 0.41
33 0.36
34 0.31
35 0.29
36 0.31
37 0.29
38 0.28
39 0.25
40 0.2
41 0.19
42 0.18
43 0.19
44 0.19
45 0.19
46 0.18
47 0.18
48 0.22
49 0.25
50 0.29
51 0.3
52 0.28
53 0.37
54 0.43
55 0.46
56 0.41
57 0.39
58 0.36
59 0.4
60 0.4
61 0.31
62 0.24
63 0.23
64 0.2
65 0.17
66 0.17
67 0.12
68 0.1
69 0.09
70 0.1
71 0.08
72 0.08
73 0.1
74 0.12
75 0.14
76 0.15
77 0.14
78 0.15
79 0.15
80 0.15
81 0.13
82 0.11
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.06
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.11
91 0.12
92 0.15
93 0.16
94 0.16
95 0.19
96 0.2
97 0.21
98 0.2
99 0.19
100 0.17
101 0.19
102 0.18
103 0.16
104 0.15
105 0.16
106 0.13
107 0.14
108 0.13
109 0.11
110 0.12
111 0.11
112 0.11
113 0.1
114 0.1
115 0.09
116 0.08
117 0.08
118 0.1
119 0.11
120 0.11
121 0.12
122 0.12
123 0.15
124 0.17
125 0.18
126 0.18
127 0.17
128 0.18
129 0.21
130 0.22
131 0.22
132 0.25
133 0.24
134 0.25
135 0.25
136 0.24
137 0.23
138 0.23
139 0.2
140 0.21
141 0.22
142 0.22
143 0.27
144 0.31
145 0.33
146 0.4
147 0.44
148 0.45
149 0.5
150 0.52
151 0.49
152 0.47
153 0.49
154 0.43
155 0.41
156 0.36
157 0.29
158 0.26
159 0.22
160 0.19
161 0.12
162 0.1
163 0.08
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.11
176 0.12
177 0.12
178 0.14
179 0.15
180 0.16
181 0.19
182 0.17
183 0.17
184 0.2
185 0.2
186 0.19
187 0.18
188 0.17
189 0.16
190 0.17
191 0.14
192 0.14
193 0.14
194 0.14
195 0.14
196 0.14
197 0.17
198 0.19
199 0.19
200 0.16
201 0.16
202 0.16
203 0.16
204 0.16
205 0.12
206 0.1
207 0.09
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.1
212 0.1
213 0.11
214 0.12
215 0.12
216 0.1
217 0.13
218 0.17
219 0.19
220 0.19
221 0.23
222 0.29
223 0.32
224 0.4
225 0.42
226 0.47
227 0.53
228 0.54
229 0.54
230 0.49
231 0.48
232 0.44
233 0.45
234 0.37
235 0.33
236 0.31
237 0.27
238 0.25
239 0.23
240 0.19
241 0.13
242 0.12
243 0.09
244 0.1
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.11
249 0.11
250 0.14
251 0.17
252 0.18
253 0.18
254 0.18
255 0.18
256 0.17
257 0.16
258 0.14
259 0.09
260 0.07
261 0.07
262 0.08
263 0.09
264 0.09
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.09
269 0.09
270 0.07
271 0.08
272 0.09
273 0.1
274 0.11
275 0.11
276 0.1
277 0.09
278 0.1
279 0.09
280 0.08
281 0.09
282 0.1
283 0.12
284 0.12
285 0.15
286 0.19
287 0.25
288 0.28
289 0.29
290 0.3
291 0.32
292 0.36
293 0.37
294 0.36
295 0.3
296 0.29
297 0.33
298 0.31
299 0.29
300 0.26
301 0.25
302 0.22
303 0.24
304 0.23
305 0.17
306 0.16
307 0.15
308 0.13
309 0.11
310 0.1
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.09
320 0.1
321 0.15
322 0.23
323 0.23
324 0.26
325 0.28
326 0.28
327 0.3
328 0.3
329 0.29
330 0.26
331 0.27
332 0.25
333 0.24
334 0.26
335 0.24
336 0.24
337 0.19
338 0.15
339 0.13
340 0.12
341 0.1
342 0.08
343 0.07
344 0.05
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.14
352 0.18
353 0.18
354 0.2
355 0.21
356 0.26
357 0.27
358 0.34
359 0.34
360 0.37
361 0.39
362 0.44
363 0.49
364 0.52
365 0.55
366 0.54
367 0.55
368 0.57
369 0.57
370 0.53
371 0.46
372 0.39
373 0.36
374 0.35
375 0.28
376 0.19
377 0.17
378 0.17
379 0.21
380 0.22
381 0.2
382 0.19
383 0.23
384 0.26
385 0.26
386 0.34
387 0.32
388 0.34
389 0.38
390 0.35
391 0.33
392 0.31
393 0.3
394 0.21
395 0.21
396 0.19
397 0.14
398 0.13
399 0.11
400 0.1
401 0.09
402 0.16
403 0.16
404 0.2
405 0.24
406 0.27
407 0.35
408 0.38
409 0.45
410 0.48
411 0.48
412 0.49
413 0.51
414 0.49
415 0.42
416 0.41
417 0.37
418 0.3
419 0.28
420 0.23
421 0.2
422 0.19
423 0.17
424 0.15
425 0.1
426 0.08
427 0.07
428 0.06
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.05
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.07
438 0.09
439 0.1
440 0.1
441 0.09
442 0.11
443 0.12
444 0.11
445 0.11
446 0.11
447 0.1
448 0.1
449 0.11
450 0.1
451 0.11
452 0.12
453 0.14
454 0.14
455 0.16
456 0.19
457 0.27
458 0.3
459 0.26
460 0.26
461 0.26
462 0.29
463 0.29
464 0.3
465 0.25
466 0.23
467 0.24
468 0.24
469 0.28
470 0.23
471 0.23
472 0.21
473 0.26
474 0.27
475 0.28
476 0.27
477 0.23
478 0.24
479 0.25
480 0.22
481 0.16
482 0.15
483 0.19
484 0.21
485 0.21
486 0.24
487 0.21
488 0.22
489 0.28
490 0.27
491 0.27
492 0.34
493 0.36
494 0.4
495 0.47
496 0.48
497 0.43
498 0.43
499 0.37
500 0.3
501 0.26
502 0.2
503 0.12
504 0.09
505 0.08
506 0.07
507 0.07
508 0.05
509 0.05
510 0.06
511 0.06
512 0.07
513 0.06
514 0.08
515 0.09
516 0.1
517 0.1
518 0.09
519 0.16
520 0.2
521 0.21
522 0.2
523 0.2
524 0.21
525 0.21
526 0.23
527 0.18
528 0.15
529 0.19
530 0.19
531 0.18
532 0.19
533 0.2
534 0.21
535 0.22
536 0.25
537 0.25
538 0.29
539 0.3
540 0.29
541 0.29
542 0.3
543 0.28
544 0.25
545 0.21
546 0.18
547 0.17
548 0.17
549 0.15
550 0.11
551 0.1
552 0.09
553 0.08
554 0.08
555 0.09
556 0.08
557 0.08
558 0.08
559 0.07
560 0.08
561 0.1
562 0.1
563 0.09
564 0.09
565 0.1
566 0.12
567 0.12
568 0.15
569 0.19
570 0.23
571 0.24
572 0.31
573 0.33
574 0.33
575 0.36
576 0.38
577 0.4
578 0.4
579 0.43
580 0.41
581 0.46
582 0.46
583 0.45
584 0.41
585 0.35
586 0.33
587 0.28
588 0.26
589 0.24
590 0.32
591 0.36
592 0.42
593 0.43
594 0.42
595 0.47
596 0.51
597 0.54
598 0.53
599 0.53
600 0.53
601 0.56
602 0.55
603 0.52
604 0.55
605 0.51
606 0.44
607 0.47
608 0.42
609 0.4
610 0.43
611 0.42
612 0.34
613 0.33
614 0.34
615 0.29
616 0.3
617 0.27
618 0.24
619 0.23
620 0.22
621 0.19
622 0.17
623 0.16
624 0.17
625 0.18
626 0.24
627 0.3
628 0.32
629 0.37
630 0.41
631 0.42
632 0.43
633 0.48
634 0.44
635 0.39
636 0.42
637 0.37
638 0.35
639 0.37
640 0.37
641 0.34
642 0.39
643 0.39
644 0.36
645 0.4
646 0.44
647 0.44
648 0.47
649 0.44
650 0.41
651 0.44
652 0.5
653 0.48
654 0.47
655 0.44
656 0.43
657 0.46
658 0.44
659 0.45
660 0.43
661 0.43
662 0.42
663 0.42
664 0.38
665 0.33
666 0.3
667 0.27
668 0.21
669 0.16
670 0.15
671 0.14
672 0.12
673 0.12
674 0.12
675 0.1
676 0.13
677 0.17
678 0.2
679 0.23
680 0.26
681 0.28
682 0.32
683 0.35
684 0.36
685 0.38
686 0.36
687 0.33
688 0.31
689 0.28
690 0.27
691 0.24
692 0.21
693 0.17
694 0.19
695 0.17
696 0.16
697 0.17
698 0.15
699 0.15
700 0.16
701 0.2
702 0.21
703 0.24
704 0.24
705 0.25
706 0.28
707 0.28
708 0.31
709 0.28
710 0.29
711 0.31
712 0.36
713 0.36
714 0.37
715 0.41
716 0.37
717 0.34
718 0.35
719 0.3
720 0.26
721 0.23
722 0.19
723 0.16
724 0.16
725 0.16
726 0.1
727 0.11
728 0.12
729 0.13
730 0.14
731 0.14
732 0.15
733 0.16
734 0.16
735 0.17
736 0.22
737 0.26
738 0.26
739 0.24
740 0.23
741 0.26
742 0.26
743 0.24
744 0.22
745 0.22
746 0.24
747 0.25
748 0.26
749 0.27
750 0.32
751 0.33
752 0.33
753 0.31
754 0.32
755 0.35
756 0.36
757 0.36
758 0.37
759 0.41
760 0.43
761 0.45
762 0.47
763 0.47
764 0.52
765 0.53
766 0.49
767 0.45
768 0.47
769 0.48
770 0.44
771 0.46
772 0.42
773 0.4
774 0.44
775 0.51
776 0.44
777 0.4
778 0.41
779 0.42
780 0.37
781 0.35
782 0.29
783 0.23
784 0.23
785 0.22
786 0.18
787 0.17
788 0.25
789 0.28
790 0.31
791 0.29
792 0.35
793 0.38
794 0.4
795 0.4
796 0.36
797 0.37
798 0.39
799 0.4
800 0.35
801 0.31
802 0.28
803 0.24
804 0.22