Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1X6MVA3

Protein Details
Accession A0A1X6MVA3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
703-725DALSGRSSKRSRKPWEPFKVKTLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
286-321PKQGRGKRGRDRGVRGGRGARGGRGGRGGRPGARED
372-393WSRRGSGRGGARGGRGGRGDRP
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11, cyto 8.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001656  PsdUridine_synth_TruD  
IPR020119  PsdUridine_synth_TruD_CS  
IPR011760  PsdUridine_synth_TruD_insert  
IPR042214  TruD_catalytic  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01142  TruD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50984  TRUD  
PS01268  UPF0024  
CDD cd02576  PseudoU_synth_ScPUS7  
Amino Acid Sequences MSSPKSRPREDEEPGRSHKRAKIDVADVQDVAMAVDESNEPSADDTTPFEQPANDDPEVEQVEEPMLPPSHALLGAPPPVFSSDGTMQCIMETDVGISEYIGHDVPKIEGIIKQRFTDFLVYEVDLDGNVIHVKSLTKPESSPKKKEDTKENHPAAEEGAPSAQPTSDSTNGPVPPTTEPSEKADESTEAAENVVAEMAGTPNAAPNCESSQTQNEPWPEQFTAKLTAFLSEETVVKIKELYLEGPEPPFVSDSGWGGRQAKPAEDDNKPEGEDTPAAPEAPEEEPKQGRGKRGRDRGVRGGRGARGGRGGRGGRPGAREDHRRVLTDPIASKTTRTGLHQAVRELFGGKLDTETDLNTPADDEGSRIVIKWSRRGSGRGGARGGRGGRGDRPERGNYPPYIHFTMQKTNRDTQDALAHLSRILHVNVKDLSVAGTKDKRGVTVQRVSLRRGNKSVEDVWTMANGVNGRRTAEEALTRRGERGIRIADFNYRKASLELGLLKGNAFVITLRNVQVDSMETLDRAMNSIKNKGFINYYGMQRFGTASIPTHSIGLALLKSDWHRAVSLILRNRPGEHPDVVAARDAWLVDGDLDKALELMPRRVVAERCILESYKKQGGDTRNAMGTLSTIPKNLRLMYVHAYQSYVWNAIVSERIKMHGAEKPVVGDLVFDTSSEKGADEDPEATAELAEGEQPVEDKDADNDALSGRSSKRSRKPWEPFKVKTLTEEDVDKYSIFDVIMPLPGRDVAYPGGALGERYREFLRTDGLDPDNFVRKQKEYSLGGSYRKILHLPKELSWSVLRYTDPDVPLAQADEDKLLGFEPPVVVEDGKFLALQINLQLGTAAYATMALREVTKTETSSHYQTTLTQASEDQKYKASAEADGEVVET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.74
3 0.68
4 0.67
5 0.64
6 0.62
7 0.61
8 0.61
9 0.61
10 0.59
11 0.62
12 0.6
13 0.58
14 0.49
15 0.41
16 0.34
17 0.26
18 0.2
19 0.14
20 0.08
21 0.05
22 0.07
23 0.08
24 0.08
25 0.1
26 0.1
27 0.09
28 0.11
29 0.12
30 0.12
31 0.13
32 0.15
33 0.17
34 0.19
35 0.2
36 0.19
37 0.18
38 0.2
39 0.26
40 0.29
41 0.26
42 0.25
43 0.25
44 0.3
45 0.31
46 0.3
47 0.23
48 0.16
49 0.17
50 0.17
51 0.17
52 0.14
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.13
57 0.14
58 0.14
59 0.13
60 0.11
61 0.15
62 0.21
63 0.2
64 0.19
65 0.18
66 0.2
67 0.21
68 0.19
69 0.21
70 0.22
71 0.24
72 0.27
73 0.27
74 0.25
75 0.24
76 0.25
77 0.19
78 0.13
79 0.11
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.07
85 0.08
86 0.07
87 0.09
88 0.09
89 0.08
90 0.09
91 0.1
92 0.11
93 0.11
94 0.12
95 0.11
96 0.15
97 0.22
98 0.29
99 0.31
100 0.32
101 0.31
102 0.31
103 0.32
104 0.34
105 0.27
106 0.21
107 0.21
108 0.2
109 0.2
110 0.19
111 0.17
112 0.11
113 0.11
114 0.08
115 0.06
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.08
121 0.11
122 0.2
123 0.21
124 0.23
125 0.25
126 0.35
127 0.46
128 0.53
129 0.58
130 0.56
131 0.64
132 0.69
133 0.74
134 0.75
135 0.73
136 0.75
137 0.77
138 0.74
139 0.66
140 0.6
141 0.53
142 0.44
143 0.37
144 0.27
145 0.18
146 0.15
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.1
151 0.09
152 0.11
153 0.16
154 0.18
155 0.19
156 0.21
157 0.26
158 0.27
159 0.27
160 0.26
161 0.22
162 0.22
163 0.26
164 0.28
165 0.25
166 0.27
167 0.3
168 0.35
169 0.33
170 0.31
171 0.28
172 0.25
173 0.23
174 0.23
175 0.19
176 0.13
177 0.13
178 0.12
179 0.1
180 0.09
181 0.07
182 0.05
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.04
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.12
194 0.15
195 0.17
196 0.18
197 0.18
198 0.25
199 0.29
200 0.3
201 0.33
202 0.33
203 0.34
204 0.34
205 0.35
206 0.29
207 0.27
208 0.26
209 0.23
210 0.26
211 0.23
212 0.24
213 0.2
214 0.2
215 0.2
216 0.18
217 0.18
218 0.13
219 0.13
220 0.12
221 0.13
222 0.12
223 0.11
224 0.11
225 0.1
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.13
230 0.15
231 0.16
232 0.16
233 0.17
234 0.14
235 0.14
236 0.13
237 0.1
238 0.09
239 0.09
240 0.1
241 0.12
242 0.12
243 0.14
244 0.16
245 0.18
246 0.23
247 0.23
248 0.23
249 0.24
250 0.28
251 0.32
252 0.32
253 0.35
254 0.32
255 0.33
256 0.31
257 0.29
258 0.24
259 0.21
260 0.2
261 0.15
262 0.16
263 0.15
264 0.14
265 0.14
266 0.13
267 0.13
268 0.14
269 0.17
270 0.14
271 0.18
272 0.19
273 0.22
274 0.3
275 0.3
276 0.36
277 0.42
278 0.5
279 0.56
280 0.64
281 0.71
282 0.71
283 0.75
284 0.77
285 0.76
286 0.7
287 0.64
288 0.58
289 0.51
290 0.49
291 0.43
292 0.34
293 0.31
294 0.29
295 0.26
296 0.28
297 0.27
298 0.23
299 0.27
300 0.28
301 0.25
302 0.27
303 0.28
304 0.28
305 0.32
306 0.37
307 0.38
308 0.44
309 0.44
310 0.43
311 0.42
312 0.41
313 0.38
314 0.35
315 0.32
316 0.26
317 0.27
318 0.25
319 0.24
320 0.21
321 0.22
322 0.19
323 0.19
324 0.22
325 0.25
326 0.3
327 0.31
328 0.32
329 0.3
330 0.3
331 0.27
332 0.23
333 0.18
334 0.13
335 0.12
336 0.1
337 0.09
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.1
344 0.09
345 0.09
346 0.09
347 0.08
348 0.08
349 0.07
350 0.07
351 0.05
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.09
356 0.12
357 0.13
358 0.2
359 0.22
360 0.24
361 0.26
362 0.28
363 0.31
364 0.34
365 0.37
366 0.34
367 0.34
368 0.32
369 0.3
370 0.31
371 0.28
372 0.22
373 0.19
374 0.17
375 0.19
376 0.23
377 0.25
378 0.26
379 0.3
380 0.31
381 0.32
382 0.35
383 0.35
384 0.31
385 0.32
386 0.31
387 0.31
388 0.32
389 0.29
390 0.29
391 0.28
392 0.35
393 0.37
394 0.41
395 0.4
396 0.41
397 0.42
398 0.41
399 0.39
400 0.32
401 0.3
402 0.25
403 0.23
404 0.18
405 0.17
406 0.14
407 0.13
408 0.12
409 0.09
410 0.09
411 0.11
412 0.11
413 0.13
414 0.13
415 0.13
416 0.13
417 0.11
418 0.11
419 0.09
420 0.1
421 0.1
422 0.12
423 0.12
424 0.16
425 0.16
426 0.16
427 0.18
428 0.22
429 0.25
430 0.28
431 0.32
432 0.35
433 0.37
434 0.38
435 0.41
436 0.4
437 0.37
438 0.35
439 0.33
440 0.27
441 0.29
442 0.28
443 0.25
444 0.23
445 0.21
446 0.18
447 0.16
448 0.15
449 0.11
450 0.1
451 0.09
452 0.08
453 0.09
454 0.1
455 0.1
456 0.1
457 0.11
458 0.11
459 0.11
460 0.16
461 0.16
462 0.21
463 0.23
464 0.22
465 0.22
466 0.23
467 0.23
468 0.18
469 0.21
470 0.2
471 0.18
472 0.19
473 0.2
474 0.25
475 0.26
476 0.27
477 0.24
478 0.22
479 0.21
480 0.2
481 0.2
482 0.13
483 0.15
484 0.14
485 0.13
486 0.13
487 0.13
488 0.12
489 0.11
490 0.1
491 0.07
492 0.06
493 0.05
494 0.05
495 0.07
496 0.09
497 0.09
498 0.1
499 0.1
500 0.09
501 0.1
502 0.09
503 0.08
504 0.08
505 0.08
506 0.07
507 0.08
508 0.09
509 0.08
510 0.08
511 0.09
512 0.1
513 0.12
514 0.18
515 0.18
516 0.2
517 0.21
518 0.21
519 0.21
520 0.19
521 0.23
522 0.21
523 0.24
524 0.23
525 0.23
526 0.22
527 0.21
528 0.2
529 0.15
530 0.13
531 0.1
532 0.1
533 0.11
534 0.12
535 0.12
536 0.12
537 0.11
538 0.09
539 0.09
540 0.09
541 0.07
542 0.06
543 0.06
544 0.07
545 0.08
546 0.11
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.11
551 0.14
552 0.17
553 0.22
554 0.26
555 0.28
556 0.31
557 0.31
558 0.33
559 0.33
560 0.32
561 0.29
562 0.24
563 0.22
564 0.21
565 0.21
566 0.19
567 0.18
568 0.14
569 0.11
570 0.11
571 0.1
572 0.08
573 0.07
574 0.06
575 0.06
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.06
580 0.05
581 0.05
582 0.05
583 0.07
584 0.08
585 0.09
586 0.11
587 0.12
588 0.13
589 0.16
590 0.17
591 0.18
592 0.24
593 0.23
594 0.24
595 0.25
596 0.25
597 0.24
598 0.27
599 0.3
600 0.28
601 0.27
602 0.26
603 0.3
604 0.35
605 0.39
606 0.39
607 0.37
608 0.32
609 0.32
610 0.31
611 0.25
612 0.21
613 0.15
614 0.16
615 0.13
616 0.14
617 0.15
618 0.18
619 0.2
620 0.2
621 0.2
622 0.17
623 0.2
624 0.23
625 0.28
626 0.26
627 0.24
628 0.24
629 0.22
630 0.23
631 0.21
632 0.17
633 0.12
634 0.11
635 0.11
636 0.1
637 0.15
638 0.13
639 0.14
640 0.14
641 0.15
642 0.16
643 0.17
644 0.19
645 0.18
646 0.21
647 0.21
648 0.21
649 0.2
650 0.2
651 0.19
652 0.16
653 0.12
654 0.09
655 0.1
656 0.09
657 0.08
658 0.09
659 0.09
660 0.11
661 0.1
662 0.1
663 0.08
664 0.09
665 0.11
666 0.11
667 0.11
668 0.11
669 0.11
670 0.12
671 0.11
672 0.09
673 0.07
674 0.06
675 0.05
676 0.06
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.06
682 0.07
683 0.08
684 0.08
685 0.09
686 0.12
687 0.12
688 0.12
689 0.12
690 0.11
691 0.11
692 0.11
693 0.13
694 0.12
695 0.2
696 0.26
697 0.35
698 0.43
699 0.53
700 0.61
701 0.69
702 0.78
703 0.81
704 0.87
705 0.87
706 0.82
707 0.79
708 0.78
709 0.67
710 0.62
711 0.56
712 0.47
713 0.4
714 0.38
715 0.33
716 0.28
717 0.28
718 0.23
719 0.18
720 0.16
721 0.15
722 0.12
723 0.1
724 0.1
725 0.1
726 0.14
727 0.14
728 0.14
729 0.14
730 0.15
731 0.15
732 0.13
733 0.14
734 0.11
735 0.11
736 0.11
737 0.1
738 0.11
739 0.1
740 0.11
741 0.1
742 0.15
743 0.14
744 0.17
745 0.18
746 0.19
747 0.2
748 0.21
749 0.24
750 0.21
751 0.23
752 0.26
753 0.28
754 0.26
755 0.27
756 0.3
757 0.33
758 0.31
759 0.33
760 0.32
761 0.32
762 0.36
763 0.4
764 0.44
765 0.39
766 0.42
767 0.47
768 0.48
769 0.49
770 0.47
771 0.44
772 0.39
773 0.37
774 0.37
775 0.34
776 0.36
777 0.42
778 0.43
779 0.43
780 0.47
781 0.46
782 0.45
783 0.42
784 0.37
785 0.3
786 0.29
787 0.26
788 0.21
789 0.26
790 0.29
791 0.27
792 0.27
793 0.25
794 0.23
795 0.24
796 0.22
797 0.18
798 0.13
799 0.13
800 0.12
801 0.12
802 0.11
803 0.1
804 0.09
805 0.09
806 0.08
807 0.09
808 0.08
809 0.08
810 0.1
811 0.11
812 0.12
813 0.11
814 0.13
815 0.13
816 0.13
817 0.12
818 0.1
819 0.12
820 0.12
821 0.13
822 0.12
823 0.14
824 0.13
825 0.13
826 0.13
827 0.1
828 0.11
829 0.1
830 0.08
831 0.05
832 0.06
833 0.06
834 0.07
835 0.08
836 0.08
837 0.09
838 0.1
839 0.11
840 0.14
841 0.17
842 0.17
843 0.2
844 0.25
845 0.29
846 0.33
847 0.34
848 0.32
849 0.3
850 0.31
851 0.35
852 0.33
853 0.29
854 0.25
855 0.26
856 0.3
857 0.37
858 0.38
859 0.33
860 0.33
861 0.34
862 0.34
863 0.35
864 0.31
865 0.26
866 0.26
867 0.26
868 0.23