Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2B153

Protein Details
Accession A0A1Y2B153    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-65GDDGEVKKKKTHRAGRRNRPKQAEVTGBasic
88-109PEVKKDVKVKMKKDRGREREGWBasic
310-333EQEQRGGKRKKHAPARNGERGVKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-60KKKKTHRAGRRNRPKQ
85-107KKDPEVKKDVKVKMKKDRGRERE
314-333RGGKRKKHAPARNGERGVKK
Subcellular Location(s) mito 17.5, mito_nucl 12, nucl 5.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042246  ZCCHC9  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MARFTSIGMKRKSFVASAAEETRGSEAGPSTFSPPTTGGDDGEVKKKKTHRAGRRNRPKQAEVTGETGAGHGREGEVKASSSNVKKDPEVKKDVKVKMKKDRGREREGWGRDPIIAQRANLNAAHADALRAKRVDQRYASTTCFACRAVGHAAKDCPNVLLASRGQGGEDLGEESNVGMKRKRGKQGGEVTGGKCYRCNSIDHSLSQCPEPIDASDPTPFATCFICLGTGHLSSLCPANKERGIYVNGGSCKICGSVAHRAKDCPSLPQKEQREERDRGKGRREVVLGDGTGAGADEDDFMVQARQAGGEQEQRGGKRKKHAPARNGERGVKKGVEDGGYAGSEQVTGIDQVEEVIKPVVKVKPKVISF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.33
3 0.31
4 0.34
5 0.35
6 0.33
7 0.3
8 0.3
9 0.28
10 0.22
11 0.18
12 0.14
13 0.13
14 0.12
15 0.15
16 0.15
17 0.17
18 0.19
19 0.19
20 0.2
21 0.19
22 0.21
23 0.22
24 0.22
25 0.18
26 0.2
27 0.26
28 0.27
29 0.35
30 0.37
31 0.35
32 0.41
33 0.47
34 0.53
35 0.58
36 0.65
37 0.67
38 0.74
39 0.83
40 0.89
41 0.94
42 0.94
43 0.93
44 0.9
45 0.84
46 0.8
47 0.76
48 0.73
49 0.64
50 0.58
51 0.49
52 0.41
53 0.36
54 0.29
55 0.22
56 0.14
57 0.11
58 0.07
59 0.07
60 0.09
61 0.1
62 0.11
63 0.11
64 0.12
65 0.12
66 0.14
67 0.19
68 0.21
69 0.26
70 0.29
71 0.3
72 0.32
73 0.41
74 0.48
75 0.5
76 0.55
77 0.53
78 0.57
79 0.64
80 0.69
81 0.7
82 0.7
83 0.7
84 0.72
85 0.79
86 0.77
87 0.78
88 0.82
89 0.8
90 0.8
91 0.76
92 0.72
93 0.71
94 0.7
95 0.63
96 0.55
97 0.47
98 0.39
99 0.36
100 0.3
101 0.27
102 0.24
103 0.2
104 0.2
105 0.2
106 0.22
107 0.2
108 0.19
109 0.13
110 0.12
111 0.13
112 0.09
113 0.09
114 0.11
115 0.12
116 0.15
117 0.15
118 0.16
119 0.22
120 0.26
121 0.3
122 0.29
123 0.32
124 0.34
125 0.37
126 0.38
127 0.33
128 0.3
129 0.25
130 0.24
131 0.2
132 0.16
133 0.12
134 0.14
135 0.17
136 0.19
137 0.2
138 0.21
139 0.23
140 0.24
141 0.25
142 0.22
143 0.17
144 0.14
145 0.13
146 0.1
147 0.11
148 0.09
149 0.1
150 0.11
151 0.1
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.06
156 0.07
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.08
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.14
167 0.22
168 0.29
169 0.36
170 0.38
171 0.4
172 0.47
173 0.55
174 0.56
175 0.53
176 0.49
177 0.42
178 0.42
179 0.4
180 0.31
181 0.24
182 0.21
183 0.19
184 0.18
185 0.19
186 0.2
187 0.26
188 0.29
189 0.29
190 0.32
191 0.3
192 0.29
193 0.28
194 0.24
195 0.17
196 0.15
197 0.13
198 0.1
199 0.12
200 0.12
201 0.13
202 0.12
203 0.12
204 0.12
205 0.13
206 0.12
207 0.1
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.13
222 0.12
223 0.12
224 0.13
225 0.17
226 0.19
227 0.2
228 0.21
229 0.21
230 0.22
231 0.22
232 0.22
233 0.23
234 0.22
235 0.22
236 0.21
237 0.17
238 0.15
239 0.14
240 0.13
241 0.09
242 0.13
243 0.22
244 0.28
245 0.33
246 0.34
247 0.35
248 0.37
249 0.43
250 0.39
251 0.37
252 0.39
253 0.41
254 0.44
255 0.52
256 0.57
257 0.59
258 0.66
259 0.66
260 0.66
261 0.66
262 0.68
263 0.69
264 0.71
265 0.68
266 0.69
267 0.65
268 0.6
269 0.6
270 0.55
271 0.46
272 0.41
273 0.37
274 0.29
275 0.24
276 0.21
277 0.15
278 0.13
279 0.11
280 0.07
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.07
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.09
295 0.12
296 0.18
297 0.19
298 0.22
299 0.26
300 0.29
301 0.38
302 0.44
303 0.46
304 0.5
305 0.58
306 0.63
307 0.7
308 0.77
309 0.77
310 0.8
311 0.85
312 0.85
313 0.83
314 0.81
315 0.76
316 0.7
317 0.66
318 0.57
319 0.48
320 0.41
321 0.38
322 0.33
323 0.27
324 0.25
325 0.22
326 0.2
327 0.19
328 0.15
329 0.11
330 0.1
331 0.09
332 0.08
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.1
340 0.09
341 0.1
342 0.12
343 0.12
344 0.13
345 0.19
346 0.24
347 0.31
348 0.36
349 0.42