Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2BHC6

Protein Details
Accession A0A1Y2BHC6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
201-220IPAHHLKSKASKTKKGKDGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
168-176KKGGSRSKK
209-216KASKTKKG
245-255GKIKRRKHKKA
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 8, mito 6, extr 5, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005595  TRAP_alpha  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF03896  TRAP_alpha  
Amino Acid Sequences MGFFSRDAEDDVIVSATFPDSNPFGLVVNGEQNALSLHFNNGGTKNYTLVSAGASYHDPGNHWALIKNASTLRYGVPLVSGANFSAPFSMHSEFRPQEIGLTVWANLAETGTTDIHRVIALNQTVSIVEPQASWFDPGLLFLYLILGSALLGGAWAAYNAFFPSSGSKKGGSRSKKVKAVVPAAQDKKQYPEVKPYEEEWIPAHHLKSKASKTKKGKDGGASSAGEEVLSGGDVTSGGETSGAEGKIKRRKHKKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.08
3 0.08
4 0.08
5 0.08
6 0.1
7 0.1
8 0.11
9 0.12
10 0.12
11 0.12
12 0.12
13 0.13
14 0.11
15 0.14
16 0.13
17 0.13
18 0.12
19 0.11
20 0.12
21 0.12
22 0.12
23 0.09
24 0.1
25 0.13
26 0.14
27 0.18
28 0.19
29 0.2
30 0.22
31 0.22
32 0.21
33 0.19
34 0.19
35 0.15
36 0.14
37 0.12
38 0.1
39 0.09
40 0.1
41 0.1
42 0.11
43 0.12
44 0.12
45 0.11
46 0.13
47 0.16
48 0.16
49 0.16
50 0.16
51 0.16
52 0.19
53 0.19
54 0.19
55 0.18
56 0.18
57 0.18
58 0.18
59 0.17
60 0.16
61 0.15
62 0.12
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.08
75 0.11
76 0.12
77 0.12
78 0.13
79 0.2
80 0.19
81 0.2
82 0.21
83 0.17
84 0.17
85 0.16
86 0.16
87 0.11
88 0.11
89 0.1
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.04
96 0.04
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.06
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.05
115 0.05
116 0.04
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.06
124 0.07
125 0.08
126 0.07
127 0.06
128 0.05
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.04
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.02
138 0.02
139 0.02
140 0.02
141 0.02
142 0.02
143 0.02
144 0.02
145 0.03
146 0.03
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.09
151 0.12
152 0.15
153 0.16
154 0.18
155 0.2
156 0.27
157 0.35
158 0.37
159 0.44
160 0.51
161 0.57
162 0.61
163 0.61
164 0.59
165 0.58
166 0.58
167 0.54
168 0.51
169 0.52
170 0.5
171 0.51
172 0.49
173 0.43
174 0.41
175 0.45
176 0.44
177 0.37
178 0.44
179 0.45
180 0.47
181 0.48
182 0.45
183 0.43
184 0.38
185 0.37
186 0.28
187 0.27
188 0.27
189 0.27
190 0.27
191 0.26
192 0.28
193 0.3
194 0.38
195 0.44
196 0.5
197 0.55
198 0.64
199 0.68
200 0.76
201 0.81
202 0.78
203 0.75
204 0.73
205 0.7
206 0.65
207 0.6
208 0.51
209 0.43
210 0.37
211 0.31
212 0.22
213 0.16
214 0.11
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.07
228 0.12
229 0.12
230 0.14
231 0.17
232 0.26
233 0.34
234 0.43
235 0.52