Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2B3H2

Protein Details
Accession A0A1Y2B3H2    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
121-152EEGEEERRERKKKKRKTEKRRRDRDRADEVVVBasic
175-196IDNIGKKSKIIRRKKKGDDVDIBasic
358-380IALAARERKREKRFDARKATEENHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
127-144RRERKKKKRKTEKRRRDR
179-190GKKSKIIRRKKK
363-386RERKREKRFDARKATEENKGKKGA
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 13.333, cyto 10.5, mito_nucl 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSSSLASSASPVAEAATEATAPHAGDATQADLYDQVFGGGSDVSELSDEDDEPAASRRLPFPSRPTAVQDDEDDDEEEDDDDDDEEEVDAYVPATESSAAKIPSFKKVREPVDEDEDEEGEEGEEERRERKKKKRKTEKRRRDRDRADEVVVEEEEVEPVQDEQTLRRMALDEKIDNIGKKSKIIRRKKKGDDVDIVDSYHDEVCVRLRTRMMNAAERDKQSNDAKLPAFAKLAMLDEAMAVLRNTTLWQSIVDNGVLEAVRQWLEPIYPSGALPAVGIQKAIFEVLPKMDLDTTTLKECRLGPIVLFYTKTKRVTPAINRQADDLVQAWSRPIIKGGSGGARRRDQEEDQEGAAEIIALAARERKREKRFDARKATEENKGKKGARLFNTRDVQYTITPQSRTHQAEDLQHVSRIQSDNRKFNKFSRQVKSGRAGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.08
4 0.08
5 0.08
6 0.09
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.09
11 0.08
12 0.1
13 0.11
14 0.12
15 0.11
16 0.11
17 0.11
18 0.12
19 0.12
20 0.11
21 0.1
22 0.08
23 0.07
24 0.07
25 0.08
26 0.07
27 0.06
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.07
32 0.07
33 0.08
34 0.09
35 0.09
36 0.1
37 0.11
38 0.1
39 0.11
40 0.14
41 0.13
42 0.13
43 0.15
44 0.18
45 0.24
46 0.29
47 0.33
48 0.38
49 0.46
50 0.49
51 0.5
52 0.52
53 0.51
54 0.5
55 0.47
56 0.41
57 0.35
58 0.33
59 0.32
60 0.27
61 0.21
62 0.18
63 0.16
64 0.14
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.06
83 0.06
84 0.08
85 0.12
86 0.13
87 0.13
88 0.19
89 0.2
90 0.29
91 0.34
92 0.34
93 0.39
94 0.47
95 0.52
96 0.54
97 0.58
98 0.53
99 0.56
100 0.55
101 0.47
102 0.4
103 0.34
104 0.27
105 0.21
106 0.16
107 0.08
108 0.08
109 0.07
110 0.06
111 0.08
112 0.09
113 0.14
114 0.22
115 0.3
116 0.39
117 0.5
118 0.59
119 0.69
120 0.79
121 0.85
122 0.89
123 0.93
124 0.95
125 0.96
126 0.96
127 0.97
128 0.95
129 0.95
130 0.93
131 0.91
132 0.88
133 0.81
134 0.72
135 0.63
136 0.53
137 0.44
138 0.35
139 0.25
140 0.16
141 0.11
142 0.09
143 0.07
144 0.06
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.12
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.14
157 0.18
158 0.21
159 0.16
160 0.17
161 0.2
162 0.21
163 0.2
164 0.21
165 0.22
166 0.19
167 0.22
168 0.28
169 0.32
170 0.41
171 0.52
172 0.61
173 0.66
174 0.76
175 0.8
176 0.83
177 0.83
178 0.8
179 0.75
180 0.69
181 0.63
182 0.53
183 0.45
184 0.35
185 0.28
186 0.22
187 0.15
188 0.1
189 0.05
190 0.05
191 0.07
192 0.12
193 0.13
194 0.13
195 0.15
196 0.16
197 0.18
198 0.24
199 0.24
200 0.25
201 0.27
202 0.31
203 0.33
204 0.33
205 0.34
206 0.27
207 0.3
208 0.26
209 0.28
210 0.23
211 0.23
212 0.22
213 0.23
214 0.23
215 0.2
216 0.18
217 0.14
218 0.13
219 0.1
220 0.1
221 0.08
222 0.07
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.07
243 0.08
244 0.07
245 0.06
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.08
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.06
271 0.05
272 0.06
273 0.07
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.11
280 0.13
281 0.14
282 0.17
283 0.18
284 0.17
285 0.19
286 0.19
287 0.2
288 0.2
289 0.19
290 0.15
291 0.19
292 0.22
293 0.21
294 0.22
295 0.2
296 0.23
297 0.28
298 0.31
299 0.28
300 0.3
301 0.32
302 0.4
303 0.47
304 0.52
305 0.57
306 0.59
307 0.58
308 0.55
309 0.52
310 0.43
311 0.36
312 0.25
313 0.18
314 0.13
315 0.13
316 0.12
317 0.13
318 0.14
319 0.12
320 0.13
321 0.12
322 0.12
323 0.14
324 0.16
325 0.21
326 0.26
327 0.31
328 0.35
329 0.39
330 0.4
331 0.42
332 0.45
333 0.4
334 0.43
335 0.44
336 0.4
337 0.36
338 0.34
339 0.31
340 0.25
341 0.22
342 0.13
343 0.07
344 0.05
345 0.05
346 0.04
347 0.04
348 0.11
349 0.12
350 0.2
351 0.27
352 0.37
353 0.45
354 0.55
355 0.63
356 0.69
357 0.77
358 0.81
359 0.85
360 0.82
361 0.8
362 0.79
363 0.74
364 0.73
365 0.72
366 0.68
367 0.64
368 0.65
369 0.61
370 0.58
371 0.63
372 0.62
373 0.61
374 0.64
375 0.63
376 0.65
377 0.7
378 0.66
379 0.6
380 0.53
381 0.48
382 0.4
383 0.4
384 0.38
385 0.36
386 0.36
387 0.35
388 0.38
389 0.44
390 0.46
391 0.44
392 0.42
393 0.41
394 0.47
395 0.53
396 0.53
397 0.46
398 0.43
399 0.4
400 0.35
401 0.36
402 0.33
403 0.33
404 0.38
405 0.45
406 0.53
407 0.6
408 0.67
409 0.65
410 0.69
411 0.73
412 0.72
413 0.74
414 0.72
415 0.74
416 0.72
417 0.77