Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y2AT80

Protein Details
Accession A0A1Y2AT80    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
186-207LETYIVKRRKHNPNEQRDHPGVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13.333, cyto 9.5, mito_nucl 9.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR005574  Rpb4/RPC9  
IPR038324  Rpb4/RPC9_sf  
IPR038846  RPC9  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0006384  P:transcription initiation at RNA polymerase III promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF03874  RNA_pol_Rpb4  
Amino Acid Sequences MKLSTNPPIHLSNYEVLTHFVSVKKETDELAERIAAAELRAKVVAATQIPPNKSDKDFEQLPSFEELPILSAEEAKKEREANRRGLSQELVWIQNQVIKYLCSEDMLMTARQSEEGVTRLADELQDHNLSKAEVLTISNLVPLVPAEIYCMIEEVDLRFRPDPASQLDAIINLVDSTLLPAPPPELETYIVKRRKHNPNEQRDHPGVVLDMQGDVMMEGGIEDEFVHEAEWGRDKEDGVGEEREGDMD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.26
3 0.25
4 0.23
5 0.22
6 0.2
7 0.19
8 0.2
9 0.21
10 0.22
11 0.23
12 0.22
13 0.22
14 0.25
15 0.27
16 0.26
17 0.26
18 0.24
19 0.21
20 0.21
21 0.21
22 0.15
23 0.1
24 0.14
25 0.12
26 0.13
27 0.13
28 0.13
29 0.12
30 0.13
31 0.16
32 0.12
33 0.14
34 0.19
35 0.24
36 0.25
37 0.27
38 0.3
39 0.3
40 0.3
41 0.32
42 0.28
43 0.3
44 0.32
45 0.33
46 0.35
47 0.31
48 0.31
49 0.32
50 0.29
51 0.22
52 0.2
53 0.16
54 0.12
55 0.12
56 0.11
57 0.07
58 0.09
59 0.09
60 0.13
61 0.15
62 0.15
63 0.17
64 0.2
65 0.27
66 0.34
67 0.39
68 0.43
69 0.46
70 0.49
71 0.48
72 0.46
73 0.4
74 0.31
75 0.3
76 0.24
77 0.21
78 0.17
79 0.16
80 0.14
81 0.15
82 0.15
83 0.12
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.11
88 0.11
89 0.09
90 0.1
91 0.09
92 0.1
93 0.11
94 0.11
95 0.09
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.08
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.09
118 0.08
119 0.06
120 0.05
121 0.05
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.06
135 0.07
136 0.06
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.11
143 0.11
144 0.13
145 0.13
146 0.14
147 0.16
148 0.16
149 0.18
150 0.17
151 0.2
152 0.18
153 0.19
154 0.18
155 0.17
156 0.16
157 0.13
158 0.09
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.03
163 0.05
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.08
169 0.08
170 0.1
171 0.09
172 0.1
173 0.12
174 0.16
175 0.21
176 0.3
177 0.37
178 0.39
179 0.45
180 0.53
181 0.62
182 0.68
183 0.73
184 0.74
185 0.79
186 0.85
187 0.83
188 0.82
189 0.73
190 0.66
191 0.55
192 0.45
193 0.35
194 0.26
195 0.21
196 0.13
197 0.11
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.06
202 0.05
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.06
215 0.08
216 0.1
217 0.17
218 0.17
219 0.18
220 0.19
221 0.19
222 0.22
223 0.24
224 0.24
225 0.22
226 0.23
227 0.22
228 0.22