Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2BCB6

Protein Details
Accession A0A1Y2BCB6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-29ASTSTPRPPKPAKQAKPPSQSSSTHydrophilic
32-51GDAPKAKSAKELKKEKRAAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-49PKAKSAKELKKEKRA
Subcellular Location(s) mito 10, cyto 6, nucl 5, plas 2, pero 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000649  IF-2B-related  
IPR042529  IF_2B-like_C  
IPR037171  NagB/RpiA_transferase-like  
Gene Ontology GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01008  IF-2B  
Amino Acid Sequences MSTPEASTSTPRPPKPAKQAKPPSQSSSTGTGDAPKAKSAKELKKEKRAAAVASRGPVDDPSDPRSSTGPESATTNKNRPSGNSTTPASASHPTLSLPNSSQSRRPPILTSTSEYTVNTPQNLFFSHLPTHRPPQTPAALVSAKLPPLIVRLGVLMSSGTLRGANARTMATMAAFAEVVREYTCPDQAVLWKDLPVYLSPMIAFLEDCRPKGVGGGNAIRWLKGEINRLGELGDRTDAEQKEYLVEAIGVYIRDRIEYADKVIADNAKEKIKPGNTVVTYARSSVVERVILEAWRDMRSKDPSASFSVIVVDSRPLNEGKHLLSALKSAGVPCTYTLLPLLSAVLPGTNLVLLGASALHSDGALYSRAGTAVVAMLAKECRVPVMACVETYKFGERVVLDAVASNELGDAEALLDIPVKGLGLGKGGKDGVLPLSLTYDLTPPALITVVCTEIGFIPPSSVPTVLGKASGVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.7
3 0.77
4 0.76
5 0.78
6 0.87
7 0.88
8 0.9
9 0.86
10 0.82
11 0.77
12 0.71
13 0.65
14 0.6
15 0.52
16 0.45
17 0.38
18 0.36
19 0.34
20 0.37
21 0.34
22 0.32
23 0.32
24 0.3
25 0.38
26 0.43
27 0.49
28 0.53
29 0.63
30 0.67
31 0.76
32 0.83
33 0.79
34 0.78
35 0.72
36 0.67
37 0.64
38 0.63
39 0.55
40 0.51
41 0.47
42 0.38
43 0.35
44 0.31
45 0.27
46 0.24
47 0.24
48 0.26
49 0.29
50 0.29
51 0.3
52 0.31
53 0.31
54 0.29
55 0.29
56 0.25
57 0.23
58 0.27
59 0.31
60 0.37
61 0.39
62 0.42
63 0.44
64 0.47
65 0.48
66 0.47
67 0.49
68 0.49
69 0.49
70 0.48
71 0.44
72 0.42
73 0.41
74 0.38
75 0.34
76 0.3
77 0.26
78 0.21
79 0.19
80 0.17
81 0.19
82 0.19
83 0.19
84 0.18
85 0.22
86 0.27
87 0.29
88 0.34
89 0.38
90 0.45
91 0.45
92 0.46
93 0.43
94 0.42
95 0.47
96 0.45
97 0.42
98 0.38
99 0.37
100 0.36
101 0.33
102 0.31
103 0.3
104 0.28
105 0.25
106 0.22
107 0.21
108 0.21
109 0.22
110 0.23
111 0.18
112 0.19
113 0.23
114 0.24
115 0.29
116 0.31
117 0.38
118 0.41
119 0.43
120 0.42
121 0.44
122 0.45
123 0.42
124 0.39
125 0.37
126 0.3
127 0.28
128 0.27
129 0.22
130 0.19
131 0.17
132 0.16
133 0.1
134 0.12
135 0.12
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.07
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.11
154 0.1
155 0.11
156 0.11
157 0.08
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.08
170 0.1
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.13
175 0.17
176 0.18
177 0.17
178 0.17
179 0.17
180 0.17
181 0.16
182 0.13
183 0.12
184 0.1
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.06
192 0.14
193 0.15
194 0.15
195 0.16
196 0.16
197 0.15
198 0.17
199 0.19
200 0.13
201 0.16
202 0.18
203 0.17
204 0.22
205 0.22
206 0.2
207 0.18
208 0.17
209 0.16
210 0.17
211 0.22
212 0.2
213 0.23
214 0.24
215 0.23
216 0.22
217 0.2
218 0.17
219 0.12
220 0.1
221 0.07
222 0.08
223 0.14
224 0.13
225 0.14
226 0.14
227 0.13
228 0.14
229 0.14
230 0.13
231 0.07
232 0.07
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.1
244 0.11
245 0.12
246 0.13
247 0.13
248 0.13
249 0.14
250 0.15
251 0.12
252 0.15
253 0.15
254 0.16
255 0.16
256 0.17
257 0.22
258 0.22
259 0.24
260 0.23
261 0.29
262 0.26
263 0.29
264 0.29
265 0.27
266 0.25
267 0.23
268 0.22
269 0.15
270 0.15
271 0.14
272 0.14
273 0.12
274 0.11
275 0.13
276 0.13
277 0.13
278 0.12
279 0.12
280 0.13
281 0.14
282 0.15
283 0.14
284 0.18
285 0.23
286 0.25
287 0.27
288 0.27
289 0.27
290 0.31
291 0.32
292 0.27
293 0.22
294 0.21
295 0.17
296 0.15
297 0.13
298 0.1
299 0.08
300 0.09
301 0.1
302 0.09
303 0.1
304 0.12
305 0.13
306 0.13
307 0.15
308 0.15
309 0.14
310 0.14
311 0.15
312 0.13
313 0.12
314 0.11
315 0.09
316 0.11
317 0.11
318 0.11
319 0.1
320 0.13
321 0.11
322 0.11
323 0.12
324 0.1
325 0.1
326 0.09
327 0.1
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.06
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.05
350 0.06
351 0.06
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.08
356 0.07
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.05
362 0.07
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.07
367 0.08
368 0.09
369 0.1
370 0.11
371 0.17
372 0.18
373 0.18
374 0.2
375 0.21
376 0.21
377 0.22
378 0.23
379 0.17
380 0.16
381 0.19
382 0.16
383 0.17
384 0.18
385 0.16
386 0.13
387 0.14
388 0.15
389 0.13
390 0.12
391 0.1
392 0.08
393 0.07
394 0.07
395 0.06
396 0.05
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.05
402 0.05
403 0.06
404 0.06
405 0.05
406 0.05
407 0.07
408 0.07
409 0.11
410 0.13
411 0.13
412 0.16
413 0.16
414 0.16
415 0.15
416 0.16
417 0.13
418 0.13
419 0.13
420 0.1
421 0.13
422 0.13
423 0.13
424 0.13
425 0.13
426 0.12
427 0.12
428 0.12
429 0.1
430 0.1
431 0.11
432 0.09
433 0.1
434 0.11
435 0.12
436 0.12
437 0.12
438 0.12
439 0.13
440 0.15
441 0.15
442 0.12
443 0.13
444 0.14
445 0.16
446 0.18
447 0.17
448 0.17
449 0.18
450 0.21
451 0.19
452 0.2