Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2BJM2

Protein Details
Accession A0A1Y2BJM2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
402-431PDVILVKKTYPNRRRKSRPRNWKLRSIAKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
412-426PNRRRKSRPRNWKLR
Subcellular Location(s) cyto 14, nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039768  Nmd3  
IPR007064  Nmd3_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0043023  F:ribosomal large subunit binding  
GO:0015031  P:protein transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF04981  NMD3  
Amino Acid Sequences MVAMEYDPDSIGQESYILCADCGTVIPSSNGAGLCVGCLRNTVDITEGIPKEATLNFCRGCERFLSPPQAWMHAQPESRELLAICLKKISRPLQKVRLIDASFVWTEPHSRRIKIKVTVQKEVLANTVLQQTFVLTLVVHTGQCPSCTRLAAKNTWKAAVQVRQKVTHKRTFLWLEQLILKHNAHKDTININEKRDGLDFFYTERNAAIKMVEFLTGVVPVRTKSSEQLISSDTHSNTANYKFTYSVEIVPVCKDDLVVLPKAQAKAWGNISPLTICSRVGNTIHLLDPMTLQQTDVTAPIYWRQPFDSLATVADLVEFIVLDIEPSGPVRGKYVLADAQVTRASSSGSKADQEGMGDDGVYHTRTHLGSILQPGDTVLGYHLTNANFNSDAFEALEQTRIPDVILVKKTYPNRRRKSRPRNWKLRSIAKEAEDATNDSNVVGRGALGRRGGNDQKNVERDYELFLRDLEEDREMRAAINLYRTDPVKKDASGDVEMGAVDLNKKSGSGMAGGKRRTGAKEQAAVAKESEMEVEEDGAQPTDAEVEADDEEEEEEEEEEDFPEIAMDELLEHFEEMDMRDELEGGQEVD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.11
3 0.13
4 0.11
5 0.1
6 0.1
7 0.11
8 0.1
9 0.1
10 0.1
11 0.09
12 0.1
13 0.11
14 0.12
15 0.12
16 0.14
17 0.13
18 0.12
19 0.12
20 0.11
21 0.11
22 0.14
23 0.13
24 0.11
25 0.13
26 0.14
27 0.17
28 0.18
29 0.18
30 0.16
31 0.16
32 0.18
33 0.24
34 0.23
35 0.2
36 0.2
37 0.19
38 0.19
39 0.22
40 0.25
41 0.2
42 0.27
43 0.27
44 0.28
45 0.33
46 0.31
47 0.3
48 0.29
49 0.31
50 0.31
51 0.37
52 0.44
53 0.4
54 0.46
55 0.46
56 0.46
57 0.43
58 0.39
59 0.36
60 0.34
61 0.36
62 0.3
63 0.32
64 0.29
65 0.28
66 0.25
67 0.21
68 0.2
69 0.24
70 0.25
71 0.22
72 0.25
73 0.25
74 0.26
75 0.34
76 0.39
77 0.43
78 0.5
79 0.6
80 0.64
81 0.71
82 0.71
83 0.68
84 0.67
85 0.58
86 0.5
87 0.41
88 0.36
89 0.29
90 0.27
91 0.23
92 0.14
93 0.19
94 0.2
95 0.28
96 0.28
97 0.31
98 0.37
99 0.44
100 0.51
101 0.53
102 0.61
103 0.61
104 0.63
105 0.67
106 0.62
107 0.6
108 0.53
109 0.47
110 0.39
111 0.3
112 0.23
113 0.18
114 0.23
115 0.18
116 0.16
117 0.15
118 0.14
119 0.14
120 0.14
121 0.12
122 0.06
123 0.06
124 0.08
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.11
129 0.12
130 0.14
131 0.16
132 0.17
133 0.18
134 0.2
135 0.23
136 0.26
137 0.32
138 0.38
139 0.44
140 0.48
141 0.48
142 0.48
143 0.45
144 0.41
145 0.42
146 0.42
147 0.42
148 0.43
149 0.44
150 0.5
151 0.55
152 0.62
153 0.64
154 0.63
155 0.58
156 0.52
157 0.56
158 0.55
159 0.52
160 0.49
161 0.42
162 0.37
163 0.37
164 0.35
165 0.3
166 0.29
167 0.26
168 0.23
169 0.26
170 0.26
171 0.24
172 0.24
173 0.25
174 0.26
175 0.33
176 0.38
177 0.36
178 0.36
179 0.39
180 0.38
181 0.37
182 0.33
183 0.26
184 0.2
185 0.19
186 0.18
187 0.16
188 0.19
189 0.17
190 0.16
191 0.16
192 0.13
193 0.12
194 0.12
195 0.1
196 0.07
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.09
209 0.1
210 0.11
211 0.12
212 0.17
213 0.2
214 0.2
215 0.22
216 0.21
217 0.21
218 0.23
219 0.25
220 0.2
221 0.18
222 0.18
223 0.17
224 0.18
225 0.19
226 0.19
227 0.15
228 0.16
229 0.15
230 0.15
231 0.18
232 0.16
233 0.15
234 0.15
235 0.15
236 0.15
237 0.15
238 0.15
239 0.11
240 0.1
241 0.08
242 0.07
243 0.09
244 0.11
245 0.12
246 0.11
247 0.14
248 0.16
249 0.17
250 0.16
251 0.19
252 0.18
253 0.2
254 0.23
255 0.23
256 0.21
257 0.22
258 0.22
259 0.17
260 0.16
261 0.15
262 0.12
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.11
267 0.11
268 0.12
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.09
275 0.09
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.06
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.09
288 0.12
289 0.13
290 0.13
291 0.14
292 0.14
293 0.15
294 0.16
295 0.16
296 0.12
297 0.12
298 0.12
299 0.1
300 0.09
301 0.08
302 0.06
303 0.04
304 0.03
305 0.03
306 0.02
307 0.03
308 0.02
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.04
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.09
321 0.11
322 0.12
323 0.12
324 0.14
325 0.13
326 0.13
327 0.14
328 0.13
329 0.11
330 0.09
331 0.09
332 0.08
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.11
338 0.12
339 0.12
340 0.12
341 0.11
342 0.09
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.06
351 0.09
352 0.09
353 0.1
354 0.11
355 0.11
356 0.12
357 0.16
358 0.17
359 0.14
360 0.14
361 0.13
362 0.12
363 0.11
364 0.09
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.07
369 0.1
370 0.1
371 0.11
372 0.12
373 0.13
374 0.12
375 0.12
376 0.13
377 0.11
378 0.11
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.09
383 0.11
384 0.09
385 0.1
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.11
391 0.16
392 0.19
393 0.2
394 0.21
395 0.27
396 0.34
397 0.43
398 0.51
399 0.55
400 0.63
401 0.72
402 0.81
403 0.87
404 0.91
405 0.91
406 0.93
407 0.93
408 0.95
409 0.9
410 0.89
411 0.86
412 0.84
413 0.8
414 0.76
415 0.7
416 0.6
417 0.58
418 0.49
419 0.43
420 0.35
421 0.3
422 0.24
423 0.2
424 0.18
425 0.14
426 0.13
427 0.11
428 0.09
429 0.07
430 0.06
431 0.1
432 0.11
433 0.14
434 0.15
435 0.16
436 0.17
437 0.24
438 0.31
439 0.33
440 0.38
441 0.4
442 0.44
443 0.48
444 0.48
445 0.43
446 0.37
447 0.33
448 0.32
449 0.3
450 0.25
451 0.21
452 0.19
453 0.19
454 0.19
455 0.2
456 0.16
457 0.17
458 0.16
459 0.16
460 0.18
461 0.16
462 0.15
463 0.15
464 0.15
465 0.13
466 0.19
467 0.19
468 0.19
469 0.22
470 0.24
471 0.26
472 0.26
473 0.29
474 0.28
475 0.27
476 0.29
477 0.29
478 0.32
479 0.3
480 0.29
481 0.24
482 0.2
483 0.2
484 0.16
485 0.13
486 0.08
487 0.08
488 0.07
489 0.08
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.1
494 0.11
495 0.13
496 0.19
497 0.26
498 0.33
499 0.34
500 0.36
501 0.37
502 0.39
503 0.4
504 0.4
505 0.42
506 0.42
507 0.47
508 0.48
509 0.52
510 0.51
511 0.47
512 0.41
513 0.33
514 0.26
515 0.2
516 0.18
517 0.12
518 0.11
519 0.1
520 0.11
521 0.11
522 0.11
523 0.12
524 0.11
525 0.1
526 0.09
527 0.09
528 0.09
529 0.08
530 0.07
531 0.06
532 0.08
533 0.08
534 0.09
535 0.09
536 0.08
537 0.09
538 0.09
539 0.09
540 0.07
541 0.07
542 0.07
543 0.08
544 0.08
545 0.08
546 0.09
547 0.08
548 0.08
549 0.07
550 0.07
551 0.07
552 0.06
553 0.06
554 0.06
555 0.06
556 0.08
557 0.08
558 0.08
559 0.07
560 0.08
561 0.09
562 0.1
563 0.13
564 0.12
565 0.12
566 0.12
567 0.13
568 0.12
569 0.13