FuNGI

A0A1Y2B6S3

Protein Details

Accession

A0A1Y2B6S3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
56-79	STVLSSKRRRIDKSPPKKVRYFAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
63-73	RRRIDKSPPKK

Subcellular Location(s)

mito 12, cyto_nucl 7, nucl 6.5, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045116 Clp1/Grc3 IPR032319 CLP1_P IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0051731 F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity GO:0006396 P:RNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF16575 CLP1_P

Amino Acid Sequences

MSALAARRAAAAAESLTTRQVTIDSSLKKTIAPPSPTQSALIFDVDSDTSSQASTSTVLSSKRRRIDKSPPKKVRYFAQPSTNDEDEPHRETARKARTRKAFSPSAPASDSGLDNDSSDDELLGGGLDVDRDAELELSAASTPGPSRTRFATELTTGVPTTSRFEPKWGVNLHKVSAFDLSNMGIHETPTSTGGGVVVSLSSNENLMLAGMFSLTPLRGSLDLLSSTLHASTPTAPRSYPVFAPTSHPLPVICPSKNSVTSSDLHELPLPSTFALGDDTSDLRTVFLVREHHCGLEELRHGAVPGFSHIWLDHSGAWGLKGVHPVIGSFPTPVYPHITSPSWQSALDSLKSDEASEEAINDEPVVVLVKGPKRSGKSTLARASVNRLLEQYERVAWLECDLGQGEFGCGGVVGLWTIDQPVLGPPFTHPLSPQRAHYLGTYTPLTCPDEYIAAVRHILEHHRYEVQYPLNPTTSETGKRTDIVPLVVNTQGWVKGLGEELLVAIEDMAKPTHVFAFTQPPLDEANYMGNGAGWTSSPIFTSTALPSYADRDQSKVQMFSVDPAPISSLQARHTAADLRILSMISYFHARLSPSVPTTWDISKPILAMRPWQVDLGGAISGVYLSGEGSDGIIPDDLHLALNGAVVALIEYVDNDSYSPPVYIQGRPLPLPEESNFLGLALIRAVRLSTSSYRTKSTISLLSPLSPSVLMTANGMIKNGAIELPLCGMLDWKSSGEMAAGLAGVNWDEVPFLDVGMAGGVGVEKRRFRRNLMRKGM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.12
3	0.14
4	0.14
5	0.14
6	0.12
7	0.13
8	0.13
9	0.16
10	0.23
11	0.26
12	0.3
13	0.33
14	0.33
15	0.34
16	0.36
17	0.4
18	0.41
19	0.42
20	0.44
21	0.47
22	0.51
23	0.51
24	0.49
25	0.41
26	0.35
27	0.32
28	0.27
29	0.2
30	0.16
31	0.17
32	0.15
33	0.15
34	0.13
35	0.11
36	0.1
37	0.1
38	0.1
39	0.08
40	0.09
41	0.09
42	0.09
43	0.11
44	0.14
45	0.19
46	0.28
47	0.37
48	0.44
49	0.52
50	0.59
51	0.63
52	0.68
53	0.74
54	0.77
55	0.79
56	0.82
57	0.84
58	0.84
59	0.84
60	0.8
61	0.78
62	0.77
63	0.75
64	0.71
65	0.71
66	0.67
67	0.67
68	0.7
69	0.63
70	0.52
71	0.45
72	0.44
73	0.39
74	0.39
75	0.36
76	0.3
77	0.31
78	0.34
79	0.42
80	0.46
81	0.5
82	0.52
83	0.59
84	0.67
85	0.73
86	0.77
87	0.75
88	0.73
89	0.66
90	0.69
91	0.63
92	0.57
93	0.5
94	0.44
95	0.38
96	0.31
97	0.3
98	0.21
99	0.21
100	0.16
101	0.15
102	0.14
103	0.13
104	0.12
105	0.11
106	0.09
107	0.07
108	0.07
109	0.06
110	0.06
111	0.04
112	0.04
113	0.04
114	0.04
115	0.03
116	0.04
117	0.04
118	0.04
119	0.05
120	0.05
121	0.05
122	0.05
123	0.05
124	0.05
125	0.05
126	0.05
127	0.05
128	0.05
129	0.06
130	0.12
131	0.15
132	0.16
133	0.18
134	0.22
135	0.27
136	0.28
137	0.31
138	0.3
139	0.28
140	0.28
141	0.27
142	0.26
143	0.2
144	0.19
145	0.17
146	0.13
147	0.16
148	0.19
149	0.23
150	0.22
151	0.26
152	0.3
153	0.32
154	0.38
155	0.39
156	0.4
157	0.41
158	0.44
159	0.41
160	0.39
161	0.37
162	0.31
163	0.3
164	0.25
165	0.18
166	0.16
167	0.15
168	0.13
169	0.13
170	0.13
171	0.1
172	0.1
173	0.1
174	0.1
175	0.1
176	0.1
177	0.1
178	0.08
179	0.08
180	0.08
181	0.07
182	0.06
183	0.05
184	0.04
185	0.04
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.06
190	0.06
191	0.06
192	0.05
193	0.05
194	0.04
195	0.04
196	0.03
197	0.04
198	0.03
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.05
203	0.05
204	0.06
205	0.07
206	0.08
207	0.08
208	0.1
209	0.1
210	0.1
211	0.1
212	0.09
213	0.09
214	0.09
215	0.08
216	0.06
217	0.07
218	0.11
219	0.16
220	0.18
221	0.18
222	0.18
223	0.2
224	0.23
225	0.25
226	0.22
227	0.2
228	0.2
229	0.19
230	0.24
231	0.26
232	0.25
233	0.23
234	0.22
235	0.19
236	0.19
237	0.25
238	0.26
239	0.23
240	0.22
241	0.24
242	0.28
243	0.31
244	0.31
245	0.27
246	0.24
247	0.25
248	0.29
249	0.3
250	0.26
251	0.23
252	0.23
253	0.21
254	0.18
255	0.18
256	0.13
257	0.09
258	0.09
259	0.08
260	0.07
261	0.08
262	0.07
263	0.07
264	0.07
265	0.08
266	0.08
267	0.09
268	0.09
269	0.07
270	0.07
271	0.08
272	0.07
273	0.1
274	0.15
275	0.16
276	0.21
277	0.22
278	0.22
279	0.21
280	0.22
281	0.19
282	0.19
283	0.18
284	0.15
285	0.14
286	0.14
287	0.14
288	0.13
289	0.13
290	0.08
291	0.09
292	0.08
293	0.08
294	0.09
295	0.09
296	0.1
297	0.11
298	0.12
299	0.1
300	0.1
301	0.1
302	0.1
303	0.1
304	0.1
305	0.09
306	0.1
307	0.12
308	0.11
309	0.11
310	0.11
311	0.11
312	0.11
313	0.11
314	0.1
315	0.08
316	0.08
317	0.08
318	0.09
319	0.1
320	0.14
321	0.13
322	0.14
323	0.17
324	0.18
325	0.17
326	0.2
327	0.22
328	0.18
329	0.17
330	0.17
331	0.17
332	0.18
333	0.18
334	0.16
335	0.14
336	0.14
337	0.14
338	0.13
339	0.1
340	0.08
341	0.09
342	0.07
343	0.07
344	0.06
345	0.07
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.08
355	0.11
356	0.13
357	0.15
358	0.18
359	0.21
360	0.24
361	0.28
362	0.33
363	0.35
364	0.41
365	0.45
366	0.44
367	0.42
368	0.4
369	0.4
370	0.35
371	0.31
372	0.23
373	0.18
374	0.17
375	0.17
376	0.18
377	0.13
378	0.1
379	0.1
380	0.1
381	0.1
382	0.08
383	0.08
384	0.08
385	0.07
386	0.07
387	0.06
388	0.06
389	0.05
390	0.06
391	0.05
392	0.04
393	0.04
394	0.03
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.02
399	0.02
400	0.02
401	0.02
402	0.03
403	0.03
404	0.03
405	0.03
406	0.03
407	0.05
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.07
412	0.11
413	0.12
414	0.12
415	0.12
416	0.17
417	0.24
418	0.26
419	0.26
420	0.27
421	0.27
422	0.28
423	0.27
424	0.24
425	0.17
426	0.19
427	0.19
428	0.14
429	0.14
430	0.15
431	0.17
432	0.13
433	0.14
434	0.11
435	0.11
436	0.11
437	0.11
438	0.11
439	0.09
440	0.09
441	0.09
442	0.09
443	0.09
444	0.11
445	0.14
446	0.14
447	0.15
448	0.18
449	0.18
450	0.19
451	0.22
452	0.23
453	0.22
454	0.23
455	0.23
456	0.22
457	0.22
458	0.22
459	0.2
460	0.21
461	0.21
462	0.2
463	0.21
464	0.21
465	0.22
466	0.21
467	0.21
468	0.19
469	0.17
470	0.17
471	0.15
472	0.16
473	0.16
474	0.15
475	0.12
476	0.12
477	0.1
478	0.09
479	0.09
480	0.07
481	0.07
482	0.08
483	0.08
484	0.07
485	0.06
486	0.06
487	0.05
488	0.05
489	0.04
490	0.03
491	0.03
492	0.03
493	0.04
494	0.04
495	0.05
496	0.05
497	0.06
498	0.08
499	0.08
500	0.08
501	0.1
502	0.19
503	0.19
504	0.23
505	0.22
506	0.21
507	0.22
508	0.22
509	0.2
510	0.12
511	0.14
512	0.11
513	0.11
514	0.09
515	0.08
516	0.08
517	0.07
518	0.07
519	0.04
520	0.06
521	0.07
522	0.07
523	0.07
524	0.09
525	0.09
526	0.1
527	0.13
528	0.12
529	0.13
530	0.13
531	0.14
532	0.13
533	0.16
534	0.18
535	0.2
536	0.2
537	0.22
538	0.23
539	0.28
540	0.31
541	0.27
542	0.25
543	0.24
544	0.23
545	0.22
546	0.23
547	0.18
548	0.15
549	0.14
550	0.16
551	0.13
552	0.15
553	0.14
554	0.14
555	0.15
556	0.19
557	0.2
558	0.19
559	0.2
560	0.21
561	0.19
562	0.23
563	0.22
564	0.18
565	0.18
566	0.18
567	0.16
568	0.13
569	0.13
570	0.08
571	0.1
572	0.09
573	0.1
574	0.12
575	0.12
576	0.13
577	0.15
578	0.18
579	0.17
580	0.18
581	0.19
582	0.19
583	0.22
584	0.23
585	0.23
586	0.21
587	0.21
588	0.21
589	0.2
590	0.21
591	0.22
592	0.2
593	0.23
594	0.26
595	0.29
596	0.29
597	0.28
598	0.26
599	0.21
600	0.21
601	0.17
602	0.11
603	0.07
604	0.06
605	0.05
606	0.05
607	0.05
608	0.04
609	0.03
610	0.03
611	0.03
612	0.03
613	0.04
614	0.05
615	0.05
616	0.05
617	0.06
618	0.07
619	0.06
620	0.07
621	0.08
622	0.07
623	0.07
624	0.07
625	0.07
626	0.07
627	0.07
628	0.06
629	0.05
630	0.04
631	0.04
632	0.04
633	0.03
634	0.04
635	0.03
636	0.04
637	0.05
638	0.05
639	0.06
640	0.06
641	0.07
642	0.08
643	0.09
644	0.09
645	0.08
646	0.13
647	0.16
648	0.17
649	0.23
650	0.28
651	0.31
652	0.31
653	0.32
654	0.3
655	0.28
656	0.31
657	0.26
658	0.25
659	0.23
660	0.23
661	0.22
662	0.19
663	0.18
664	0.13
665	0.13
666	0.09
667	0.08
668	0.07
669	0.07
670	0.07
671	0.07
672	0.08
673	0.12
674	0.16
675	0.21
676	0.29
677	0.31
678	0.35
679	0.37
680	0.38
681	0.36
682	0.36
683	0.37
684	0.31
685	0.34
686	0.31
687	0.32
688	0.31
689	0.28
690	0.24
691	0.18
692	0.16
693	0.13
694	0.14
695	0.12
696	0.12
697	0.15
698	0.17
699	0.18
700	0.18
701	0.16
702	0.14
703	0.14
704	0.13
705	0.11
706	0.07
707	0.07
708	0.08
709	0.09
710	0.1
711	0.09
712	0.08
713	0.1
714	0.1
715	0.13
716	0.14
717	0.13
718	0.13
719	0.13
720	0.13
721	0.12
722	0.12
723	0.09
724	0.08
725	0.07
726	0.06
727	0.06
728	0.06
729	0.05
730	0.06
731	0.05
732	0.05
733	0.05
734	0.05
735	0.07
736	0.07
737	0.07
738	0.06
739	0.06
740	0.07
741	0.06
742	0.06
743	0.04
744	0.04
745	0.05
746	0.06
747	0.1
748	0.15
749	0.21
750	0.27
751	0.37
752	0.41
753	0.49
754	0.6
755	0.66

A0A1Y2B6S3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer