Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2AVU1

Protein Details
Accession A0A1Y2AVU1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
250-276ATGGEGEKKKSKKKRPAPDDTDEKKTGBasic
285-312EGEVKKKKPAAKDGEVKKKKKPKVEEASBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
256-308EKKKSKKKRPAPDDTDEKKTGKKKKTDGAEGEVKKKKPAAKDGEVKKKKKPKV
Subcellular Location(s) mito 11.5, cyto_mito 9.5, nucl 9, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MASASGYNHHRFARAVLKKSRKWEPSLTVQLYASYWRFENSQMPFQYDGPMRPFLLALRAQVIPASLIPFLYDIRPYLSFVDGCLVVEIQDFRKMPEARSRVVMRPAAEALIGTMGVLLARKNITDEGTALELESRIIAATSPPLYLGSSILATRNAALAVTLTTPAPPNLAADGSFRHPTASTTDERSDAERMRKLLAIGPQRSGTFQPNWSILRLQERIANHHRMKERAQLAPGGPQAQPDGTANGAATGGEGEKKKSKKKRPAPDDTDEKKTGKKKKTDGAEGEVKKKKPAAKDGEVKKKKKPKVEEAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.46
3 0.52
4 0.61
5 0.65
6 0.72
7 0.77
8 0.73
9 0.71
10 0.71
11 0.67
12 0.67
13 0.72
14 0.67
15 0.59
16 0.53
17 0.47
18 0.39
19 0.37
20 0.28
21 0.2
22 0.18
23 0.17
24 0.18
25 0.19
26 0.25
27 0.26
28 0.33
29 0.33
30 0.36
31 0.36
32 0.36
33 0.4
34 0.35
35 0.33
36 0.29
37 0.3
38 0.27
39 0.25
40 0.25
41 0.19
42 0.22
43 0.2
44 0.17
45 0.17
46 0.17
47 0.17
48 0.16
49 0.16
50 0.11
51 0.1
52 0.11
53 0.08
54 0.07
55 0.08
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.1
60 0.09
61 0.12
62 0.13
63 0.14
64 0.15
65 0.16
66 0.15
67 0.14
68 0.16
69 0.12
70 0.12
71 0.11
72 0.09
73 0.07
74 0.08
75 0.09
76 0.08
77 0.13
78 0.13
79 0.14
80 0.22
81 0.23
82 0.25
83 0.33
84 0.35
85 0.32
86 0.38
87 0.41
88 0.36
89 0.41
90 0.41
91 0.33
92 0.31
93 0.3
94 0.24
95 0.2
96 0.16
97 0.11
98 0.08
99 0.07
100 0.04
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.04
105 0.03
106 0.04
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.1
117 0.09
118 0.08
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.04
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.05
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.04
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.09
162 0.11
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.14
169 0.16
170 0.16
171 0.19
172 0.2
173 0.21
174 0.21
175 0.22
176 0.22
177 0.22
178 0.25
179 0.24
180 0.24
181 0.25
182 0.25
183 0.24
184 0.23
185 0.26
186 0.3
187 0.28
188 0.29
189 0.29
190 0.29
191 0.29
192 0.28
193 0.26
194 0.21
195 0.21
196 0.22
197 0.24
198 0.25
199 0.25
200 0.24
201 0.22
202 0.26
203 0.25
204 0.23
205 0.23
206 0.23
207 0.3
208 0.35
209 0.42
210 0.37
211 0.43
212 0.46
213 0.46
214 0.48
215 0.49
216 0.48
217 0.42
218 0.42
219 0.39
220 0.35
221 0.37
222 0.35
223 0.29
224 0.24
225 0.21
226 0.21
227 0.17
228 0.18
229 0.13
230 0.13
231 0.11
232 0.11
233 0.1
234 0.09
235 0.09
236 0.07
237 0.06
238 0.05
239 0.06
240 0.09
241 0.1
242 0.14
243 0.22
244 0.28
245 0.38
246 0.48
247 0.59
248 0.66
249 0.76
250 0.83
251 0.86
252 0.91
253 0.9
254 0.88
255 0.89
256 0.83
257 0.81
258 0.73
259 0.65
260 0.61
261 0.62
262 0.62
263 0.61
264 0.64
265 0.65
266 0.69
267 0.77
268 0.8
269 0.77
270 0.75
271 0.76
272 0.72
273 0.73
274 0.72
275 0.63
276 0.58
277 0.57
278 0.55
279 0.53
280 0.58
281 0.58
282 0.61
283 0.69
284 0.75
285 0.81
286 0.85
287 0.82
288 0.82
289 0.83
290 0.81
291 0.81
292 0.81