Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2AUX0

Protein Details
Accession A0A1Y2AUX0    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
945-969RDMLDRQRGKKAKRARRGVAREIGQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
951-963QRGKKAKRARRGV
Subcellular Location(s) cyto 6cyto_nucl 6, plas 5, extr 5, E.R. 5, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014801  Mediator_Med5_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08689  Med5  
Amino Acid Sequences MDERCQPDFLRRVQLGEVVVLHDYQVDQRMTVADIGCAEIVNAAYRRGVPAKKFVKLLSKLENESNPVDVADQLASSLLDQLLQPPGTPAIVLSYLSQSLSDSTGPAILPAQTFLVHLLFRLALPPPPSTSALAAIASLLLACPSSLFSPLSGELHCPASLVPDVGSSTSTSPTPTLGLVLPLLRLCSTSAPAPIVSLTARILGLVQPYPAPPLDVGLEAGGLLQTLPEMVSTPLRDSLGGLMADLAISQDTTGMGLSLDGMTGMENVIPNQGDITMHGGDENAQTVTLPPLGTDISSLPLPQSLAFLLNYLRRSSRWTDNADSSGDQVLLRLAPHLAPDPTTFLAQLLEASIVAFSGQADGDSPGGIEKWLFISEGLPSLLQSWKGHGDLGYPYPDTLATSLKSVFERQSGRLAENNTWMAQRYDALVSAVDSEDETGGYVAPDGWSLCSLEVTLLLRLIELDLLSRQDARSVLPGVTIPSSSSGESLSNRVAVASPSHLPPLAHLIIYSPGAARSFASEVSETIQSLTTNPPPDNLFSNLSASPSLIACLAAASPPAVLLGLLEKNLLDRPDDVNLRADDPQGTMTRFGEGVMLVEAAVHTFDLPLPRLLVEGRRALSLGDWEQTQRGLLNGWIKALFGSDGIDDQILSATSLQDFYRLAPSLIQQAIAARAAGQIDIDTLYSGLSYFSQDLLSWSLGGIVAWLCEETVRNGPVSGLHLQVLQRLVLGDAFPEALLRVAGGAIAGLLAPSSGLHEVFAASGIDVAAVRLKLEAIGVDVNQAPPLSFAQRIANLRVTLQTVRQPELSQSSWTDALLPAFNSCLVSIGDLEALQLVLSEILFPSSINNESGDPLGRLFAILTVLGLGRAHSPLLSVLLDVTIPNVFEYNSPLAIAQPQSQPYAALGLAKLIKHSLLMATSLQIDTGGLVHAFADDLEYQSSRPVRDMLDRQRGKKAKRARRGVAREIGQAQKAVLEMVVHALGADEELRGTWPVFERFT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.37
3 0.32
4 0.27
5 0.19
6 0.19
7 0.16
8 0.14
9 0.11
10 0.11
11 0.11
12 0.17
13 0.16
14 0.15
15 0.16
16 0.17
17 0.18
18 0.2
19 0.18
20 0.13
21 0.13
22 0.14
23 0.14
24 0.12
25 0.11
26 0.09
27 0.09
28 0.12
29 0.13
30 0.12
31 0.14
32 0.15
33 0.19
34 0.25
35 0.31
36 0.3
37 0.4
38 0.46
39 0.49
40 0.52
41 0.52
42 0.55
43 0.56
44 0.59
45 0.58
46 0.57
47 0.56
48 0.59
49 0.57
50 0.51
51 0.46
52 0.41
53 0.32
54 0.26
55 0.23
56 0.17
57 0.15
58 0.12
59 0.1
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.07
64 0.09
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.1
69 0.15
70 0.15
71 0.15
72 0.14
73 0.15
74 0.15
75 0.15
76 0.12
77 0.1
78 0.11
79 0.12
80 0.12
81 0.13
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.11
86 0.12
87 0.13
88 0.12
89 0.1
90 0.1
91 0.12
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.1
100 0.1
101 0.11
102 0.12
103 0.11
104 0.1
105 0.11
106 0.11
107 0.1
108 0.12
109 0.12
110 0.14
111 0.16
112 0.18
113 0.2
114 0.23
115 0.25
116 0.25
117 0.25
118 0.23
119 0.22
120 0.2
121 0.17
122 0.13
123 0.11
124 0.09
125 0.07
126 0.05
127 0.04
128 0.03
129 0.03
130 0.04
131 0.05
132 0.06
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.12
137 0.14
138 0.16
139 0.15
140 0.16
141 0.16
142 0.18
143 0.18
144 0.15
145 0.13
146 0.14
147 0.15
148 0.13
149 0.11
150 0.1
151 0.11
152 0.11
153 0.12
154 0.1
155 0.11
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.13
162 0.11
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.12
169 0.11
170 0.12
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.13
176 0.14
177 0.15
178 0.16
179 0.15
180 0.15
181 0.14
182 0.14
183 0.12
184 0.11
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.13
197 0.13
198 0.12
199 0.1
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.09
205 0.09
206 0.07
207 0.07
208 0.05
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.02
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.04
217 0.05
218 0.09
219 0.1
220 0.12
221 0.14
222 0.14
223 0.14
224 0.14
225 0.14
226 0.15
227 0.13
228 0.12
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.07
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.05
254 0.05
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.07
262 0.11
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.09
289 0.08
290 0.08
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.1
296 0.14
297 0.15
298 0.16
299 0.16
300 0.15
301 0.2
302 0.25
303 0.31
304 0.34
305 0.38
306 0.41
307 0.43
308 0.44
309 0.41
310 0.36
311 0.29
312 0.24
313 0.19
314 0.14
315 0.11
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.11
327 0.13
328 0.14
329 0.14
330 0.13
331 0.11
332 0.11
333 0.1
334 0.09
335 0.06
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.04
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.04
356 0.04
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.07
363 0.08
364 0.08
365 0.07
366 0.06
367 0.08
368 0.09
369 0.11
370 0.1
371 0.11
372 0.13
373 0.13
374 0.14
375 0.12
376 0.13
377 0.13
378 0.15
379 0.15
380 0.13
381 0.12
382 0.12
383 0.12
384 0.1
385 0.09
386 0.09
387 0.08
388 0.09
389 0.1
390 0.11
391 0.12
392 0.13
393 0.13
394 0.16
395 0.18
396 0.19
397 0.25
398 0.24
399 0.25
400 0.27
401 0.28
402 0.24
403 0.25
404 0.25
405 0.19
406 0.18
407 0.18
408 0.15
409 0.13
410 0.12
411 0.1
412 0.09
413 0.08
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.04
424 0.04
425 0.03
426 0.04
427 0.03
428 0.04
429 0.03
430 0.03
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.06
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.04
449 0.03
450 0.04
451 0.04
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.06
456 0.07
457 0.07
458 0.08
459 0.1
460 0.1
461 0.1
462 0.1
463 0.1
464 0.1
465 0.1
466 0.09
467 0.07
468 0.08
469 0.09
470 0.08
471 0.08
472 0.08
473 0.09
474 0.1
475 0.11
476 0.1
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.08
481 0.07
482 0.07
483 0.08
484 0.09
485 0.09
486 0.09
487 0.1
488 0.09
489 0.09
490 0.14
491 0.12
492 0.11
493 0.1
494 0.1
495 0.11
496 0.11
497 0.11
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.07
505 0.07
506 0.08
507 0.08
508 0.08
509 0.09
510 0.1
511 0.08
512 0.08
513 0.09
514 0.07
515 0.08
516 0.11
517 0.12
518 0.14
519 0.14
520 0.15
521 0.15
522 0.16
523 0.18
524 0.18
525 0.17
526 0.15
527 0.18
528 0.16
529 0.16
530 0.15
531 0.12
532 0.1
533 0.08
534 0.08
535 0.05
536 0.05
537 0.04
538 0.04
539 0.04
540 0.04
541 0.04
542 0.04
543 0.03
544 0.03
545 0.03
546 0.03
547 0.03
548 0.03
549 0.05
550 0.05
551 0.05
552 0.05
553 0.05
554 0.06
555 0.08
556 0.08
557 0.07
558 0.08
559 0.1
560 0.14
561 0.16
562 0.16
563 0.18
564 0.18
565 0.19
566 0.18
567 0.17
568 0.13
569 0.13
570 0.14
571 0.13
572 0.13
573 0.12
574 0.12
575 0.12
576 0.11
577 0.11
578 0.09
579 0.07
580 0.07
581 0.06
582 0.05
583 0.04
584 0.04
585 0.04
586 0.03
587 0.04
588 0.03
589 0.03
590 0.03
591 0.04
592 0.06
593 0.07
594 0.07
595 0.08
596 0.08
597 0.09
598 0.09
599 0.11
600 0.13
601 0.15
602 0.16
603 0.15
604 0.16
605 0.15
606 0.15
607 0.15
608 0.13
609 0.1
610 0.1
611 0.1
612 0.11
613 0.11
614 0.11
615 0.08
616 0.07
617 0.06
618 0.09
619 0.12
620 0.12
621 0.13
622 0.13
623 0.13
624 0.12
625 0.12
626 0.1
627 0.06
628 0.06
629 0.05
630 0.05
631 0.06
632 0.06
633 0.05
634 0.05
635 0.05
636 0.04
637 0.05
638 0.05
639 0.05
640 0.05
641 0.06
642 0.06
643 0.07
644 0.07
645 0.08
646 0.12
647 0.12
648 0.12
649 0.12
650 0.13
651 0.17
652 0.17
653 0.16
654 0.12
655 0.12
656 0.13
657 0.13
658 0.11
659 0.06
660 0.07
661 0.07
662 0.07
663 0.06
664 0.05
665 0.05
666 0.05
667 0.05
668 0.04
669 0.04
670 0.04
671 0.04
672 0.04
673 0.04
674 0.04
675 0.06
676 0.06
677 0.07
678 0.07
679 0.07
680 0.09
681 0.11
682 0.1
683 0.09
684 0.08
685 0.08
686 0.08
687 0.07
688 0.07
689 0.04
690 0.04
691 0.04
692 0.04
693 0.04
694 0.04
695 0.05
696 0.07
697 0.11
698 0.12
699 0.12
700 0.12
701 0.12
702 0.13
703 0.16
704 0.15
705 0.13
706 0.12
707 0.14
708 0.14
709 0.17
710 0.16
711 0.13
712 0.11
713 0.1
714 0.1
715 0.09
716 0.08
717 0.06
718 0.05
719 0.06
720 0.05
721 0.05
722 0.05
723 0.05
724 0.04
725 0.04
726 0.04
727 0.03
728 0.03
729 0.03
730 0.03
731 0.02
732 0.02
733 0.02
734 0.02
735 0.02
736 0.02
737 0.02
738 0.02
739 0.04
740 0.05
741 0.05
742 0.06
743 0.06
744 0.06
745 0.06
746 0.07
747 0.06
748 0.05
749 0.05
750 0.05
751 0.05
752 0.05
753 0.05
754 0.06
755 0.06
756 0.06
757 0.06
758 0.06
759 0.06
760 0.07
761 0.07
762 0.06
763 0.07
764 0.07
765 0.09
766 0.1
767 0.1
768 0.1
769 0.1
770 0.09
771 0.09
772 0.11
773 0.12
774 0.12
775 0.13
776 0.16
777 0.22
778 0.25
779 0.27
780 0.3
781 0.28
782 0.28
783 0.28
784 0.27
785 0.23
786 0.23
787 0.26
788 0.24
789 0.26
790 0.27
791 0.26
792 0.26
793 0.3
794 0.29
795 0.26
796 0.24
797 0.25
798 0.24
799 0.23
800 0.21
801 0.16
802 0.17
803 0.15
804 0.14
805 0.11
806 0.11
807 0.12
808 0.11
809 0.1
810 0.1
811 0.08
812 0.09
813 0.09
814 0.09
815 0.09
816 0.08
817 0.08
818 0.06
819 0.06
820 0.05
821 0.05
822 0.04
823 0.04
824 0.04
825 0.04
826 0.04
827 0.05
828 0.05
829 0.05
830 0.06
831 0.09
832 0.11
833 0.11
834 0.13
835 0.13
836 0.14
837 0.16
838 0.16
839 0.13
840 0.12
841 0.12
842 0.11
843 0.1
844 0.09
845 0.08
846 0.07
847 0.07
848 0.06
849 0.06
850 0.06
851 0.07
852 0.07
853 0.07
854 0.07
855 0.08
856 0.08
857 0.07
858 0.08
859 0.08
860 0.11
861 0.1
862 0.09
863 0.08
864 0.08
865 0.09
866 0.08
867 0.08
868 0.07
869 0.07
870 0.07
871 0.07
872 0.08
873 0.08
874 0.13
875 0.15
876 0.14
877 0.14
878 0.14
879 0.14
880 0.18
881 0.2
882 0.19
883 0.21
884 0.23
885 0.25
886 0.25
887 0.24
888 0.21
889 0.21
890 0.17
891 0.14
892 0.12
893 0.14
894 0.17
895 0.17
896 0.17
897 0.16
898 0.16
899 0.14
900 0.15
901 0.13
902 0.11
903 0.13
904 0.12
905 0.13
906 0.14
907 0.14
908 0.13
909 0.11
910 0.1
911 0.08
912 0.08
913 0.08
914 0.06
915 0.06
916 0.06
917 0.06
918 0.06
919 0.05
920 0.07
921 0.07
922 0.08
923 0.11
924 0.11
925 0.11
926 0.17
927 0.21
928 0.19
929 0.21
930 0.22
931 0.23
932 0.32
933 0.41
934 0.46
935 0.54
936 0.6
937 0.62
938 0.7
939 0.75
940 0.71
941 0.71
942 0.72
943 0.71
944 0.75
945 0.82
946 0.81
947 0.84
948 0.88
949 0.88
950 0.86
951 0.79
952 0.75
953 0.7
954 0.66
955 0.56
956 0.48
957 0.39
958 0.31
959 0.27
960 0.21
961 0.15
962 0.1
963 0.08
964 0.1
965 0.1
966 0.09
967 0.08
968 0.08
969 0.07
970 0.08
971 0.08
972 0.05
973 0.05
974 0.06
975 0.08
976 0.09
977 0.09
978 0.12
979 0.17