Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2BD71

Protein Details
Accession A0A1Y2BD71    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
238-286SLLNPKRGRGRPKGSKNKPKARPPPPPPRKPTPPPPKPRGRPPKVRTSABasic
297-319EMALGIKRRKGRPRKFPGYLVREBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
242-312PKRGRGRPKGSKNKPKARPPPPPPRKPTPPPPKPRGRPPKVRTSAEQAEYERRKHEMALGIKRRKGRPRKF
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Amino Acid Sequences MQGDIHQHHHHQQQQQQSQPQYDPALLELSKSSINTTSNPSAHHDPIGIGVGVGEYVAIDPALFEIEDVVNDVRRGKIRLDEVQVQVDDEHPQEQGQGHGHGHGTGGGGGGNEGMTLDDEEIDPALREIVNSLTNAQQAGHPGPGLTHAQAAAAIGAHLAESDERERLQQSFQTTLDDLARDDFGGLFAPNFPHSPTSTNYLLPPAEGDPLAGPSSPHIPLHEQLSDTPHADTLDSSSLLNPKRGRGRPKGSKNKPKARPPPPPPRKPTPPPPKPRGRPPKVRTSAEQAEYERRKHEMALGIKRRKGRPRKFPGYLVREMRLSKNRSEFNELLRAYEEGRFPRPSGEDQEADGEGVDDEADGGGNGNGDGDGGEYDTWDYSQVGVDVADGQTLLDVVGVAQQQEAHVVDEEPGPSGLDRSDAGMRAMFGLDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.7
3 0.71
4 0.68
5 0.66
6 0.6
7 0.59
8 0.5
9 0.43
10 0.35
11 0.28
12 0.28
13 0.22
14 0.21
15 0.18
16 0.17
17 0.17
18 0.17
19 0.18
20 0.16
21 0.19
22 0.2
23 0.27
24 0.32
25 0.32
26 0.34
27 0.38
28 0.41
29 0.41
30 0.39
31 0.33
32 0.26
33 0.26
34 0.26
35 0.19
36 0.13
37 0.11
38 0.09
39 0.08
40 0.07
41 0.05
42 0.03
43 0.03
44 0.03
45 0.03
46 0.03
47 0.03
48 0.04
49 0.05
50 0.04
51 0.04
52 0.06
53 0.06
54 0.07
55 0.09
56 0.09
57 0.1
58 0.11
59 0.13
60 0.14
61 0.18
62 0.2
63 0.2
64 0.25
65 0.3
66 0.36
67 0.41
68 0.44
69 0.43
70 0.45
71 0.43
72 0.37
73 0.32
74 0.26
75 0.22
76 0.16
77 0.15
78 0.11
79 0.11
80 0.12
81 0.12
82 0.14
83 0.14
84 0.16
85 0.15
86 0.17
87 0.17
88 0.15
89 0.15
90 0.13
91 0.11
92 0.08
93 0.08
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.06
116 0.08
117 0.09
118 0.09
119 0.1
120 0.12
121 0.12
122 0.13
123 0.12
124 0.11
125 0.12
126 0.14
127 0.13
128 0.11
129 0.1
130 0.1
131 0.12
132 0.13
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.06
140 0.05
141 0.04
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.05
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.09
153 0.1
154 0.11
155 0.13
156 0.14
157 0.15
158 0.18
159 0.18
160 0.19
161 0.18
162 0.18
163 0.17
164 0.15
165 0.13
166 0.1
167 0.1
168 0.08
169 0.08
170 0.06
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.09
181 0.1
182 0.12
183 0.13
184 0.18
185 0.18
186 0.19
187 0.18
188 0.19
189 0.18
190 0.15
191 0.15
192 0.1
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.06
197 0.07
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.08
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.11
207 0.12
208 0.15
209 0.15
210 0.13
211 0.13
212 0.16
213 0.16
214 0.15
215 0.14
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.08
223 0.08
224 0.09
225 0.13
226 0.14
227 0.19
228 0.18
229 0.22
230 0.3
231 0.36
232 0.43
233 0.48
234 0.57
235 0.63
236 0.73
237 0.79
238 0.81
239 0.86
240 0.89
241 0.9
242 0.88
243 0.89
244 0.88
245 0.87
246 0.87
247 0.86
248 0.87
249 0.87
250 0.88
251 0.84
252 0.83
253 0.82
254 0.79
255 0.81
256 0.81
257 0.81
258 0.81
259 0.83
260 0.84
261 0.82
262 0.85
263 0.86
264 0.83
265 0.84
266 0.8
267 0.82
268 0.79
269 0.76
270 0.68
271 0.66
272 0.64
273 0.55
274 0.53
275 0.44
276 0.46
277 0.46
278 0.45
279 0.38
280 0.33
281 0.31
282 0.28
283 0.3
284 0.28
285 0.32
286 0.4
287 0.49
288 0.53
289 0.56
290 0.62
291 0.65
292 0.68
293 0.71
294 0.71
295 0.72
296 0.76
297 0.82
298 0.81
299 0.82
300 0.82
301 0.79
302 0.77
303 0.7
304 0.61
305 0.55
306 0.51
307 0.5
308 0.48
309 0.44
310 0.42
311 0.45
312 0.49
313 0.49
314 0.56
315 0.5
316 0.47
317 0.52
318 0.46
319 0.39
320 0.35
321 0.32
322 0.25
323 0.27
324 0.26
325 0.2
326 0.25
327 0.26
328 0.25
329 0.29
330 0.3
331 0.3
332 0.33
333 0.35
334 0.31
335 0.3
336 0.33
337 0.29
338 0.25
339 0.21
340 0.15
341 0.1
342 0.09
343 0.07
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.03
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.05
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.05
360 0.05
361 0.06
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.08
367 0.07
368 0.09
369 0.09
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.09
374 0.09
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.04
382 0.04
383 0.03
384 0.07
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.09
389 0.09
390 0.12
391 0.13
392 0.11
393 0.12
394 0.12
395 0.13
396 0.15
397 0.15
398 0.14
399 0.14
400 0.13
401 0.12
402 0.13
403 0.11
404 0.11
405 0.11
406 0.13
407 0.17
408 0.17
409 0.18
410 0.18
411 0.19
412 0.18