Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2BJD2

Protein Details
Accession A0A1Y2BJD2    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
357-384AKPSNKLLKDPAQRKKKKTSMGMSRPSGHydrophilic
420-439LRWAKRNSVAPSKKDKKDKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
356-374RAKPSNKLLKDPAQRKKKK
425-439RNSVAPSKKDKKDKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000014  PAS  
IPR035965  PAS-like_dom_sf  
IPR013767  PAS_fold  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PF00989  PAS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00130  PAS  
cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MSYIASAMNSASYATNTSDDRDNSNGFEFTRRKRWPSLLLQELVGSALFCLKPIPDQRSSVDPNNGRPESTLGWKILFASPSAQEMLNQKPSELEGRDFFDLVFTPDHPQLQVLFLSLLNPGHPPLAHNSDSSASNSTDSSGGLGFGQPAIFSGPSGAGRTQTAYVRILAASEPSHPGTSSVATIGKGSSSSSSSSSGPVVWELRAHATGLDGPLFGGPAFGMAGQGTVEPQSQGNEGSLRGKAVWVMGRKVGQGQGEAESNGTSQSLDAFLELKLENERLREELQELQLDLDDDDYSRPVYVDPAPIPIYNPDDSDSVSDSSDSSTNGDAGTGTGGGGGGGTGGAGEGSSNSSPRAKPSNKLLKDPAQRKKKKTSMGMSRPSGQEGEGMHVCVSCGRTDSPEWRKGPLGPKTLCNACGLRWAKRNSVAPSKKDKKDKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.15
3 0.15
4 0.18
5 0.24
6 0.24
7 0.28
8 0.3
9 0.3
10 0.29
11 0.32
12 0.3
13 0.25
14 0.33
15 0.35
16 0.38
17 0.47
18 0.51
19 0.54
20 0.59
21 0.65
22 0.65
23 0.69
24 0.72
25 0.69
26 0.64
27 0.59
28 0.52
29 0.45
30 0.36
31 0.26
32 0.16
33 0.08
34 0.1
35 0.09
36 0.09
37 0.1
38 0.1
39 0.17
40 0.24
41 0.31
42 0.31
43 0.35
44 0.37
45 0.45
46 0.51
47 0.5
48 0.52
49 0.49
50 0.52
51 0.58
52 0.56
53 0.48
54 0.43
55 0.41
56 0.34
57 0.37
58 0.34
59 0.26
60 0.26
61 0.25
62 0.27
63 0.26
64 0.23
65 0.18
66 0.17
67 0.16
68 0.17
69 0.19
70 0.16
71 0.16
72 0.19
73 0.25
74 0.29
75 0.28
76 0.26
77 0.26
78 0.27
79 0.31
80 0.29
81 0.26
82 0.21
83 0.25
84 0.26
85 0.25
86 0.23
87 0.18
88 0.16
89 0.15
90 0.14
91 0.11
92 0.14
93 0.15
94 0.16
95 0.15
96 0.16
97 0.14
98 0.15
99 0.14
100 0.11
101 0.1
102 0.09
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.14
113 0.2
114 0.2
115 0.2
116 0.21
117 0.22
118 0.23
119 0.24
120 0.21
121 0.15
122 0.15
123 0.15
124 0.14
125 0.13
126 0.11
127 0.1
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.11
148 0.13
149 0.13
150 0.14
151 0.14
152 0.14
153 0.13
154 0.13
155 0.12
156 0.1
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.09
180 0.12
181 0.12
182 0.13
183 0.13
184 0.12
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.09
189 0.09
190 0.08
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.12
233 0.13
234 0.14
235 0.15
236 0.16
237 0.16
238 0.17
239 0.18
240 0.15
241 0.14
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.13
246 0.11
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.05
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.05
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.11
264 0.11
265 0.12
266 0.13
267 0.13
268 0.14
269 0.14
270 0.15
271 0.17
272 0.18
273 0.18
274 0.17
275 0.15
276 0.14
277 0.14
278 0.12
279 0.08
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.07
287 0.06
288 0.09
289 0.1
290 0.14
291 0.14
292 0.17
293 0.19
294 0.19
295 0.2
296 0.19
297 0.21
298 0.18
299 0.18
300 0.17
301 0.16
302 0.16
303 0.17
304 0.17
305 0.14
306 0.13
307 0.12
308 0.11
309 0.12
310 0.12
311 0.11
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.09
317 0.08
318 0.07
319 0.07
320 0.06
321 0.05
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.03
327 0.02
328 0.02
329 0.02
330 0.02
331 0.02
332 0.02
333 0.02
334 0.02
335 0.03
336 0.06
337 0.07
338 0.08
339 0.1
340 0.14
341 0.15
342 0.2
343 0.3
344 0.31
345 0.36
346 0.46
347 0.55
348 0.55
349 0.61
350 0.63
351 0.63
352 0.7
353 0.74
354 0.74
355 0.74
356 0.79
357 0.8
358 0.84
359 0.83
360 0.82
361 0.82
362 0.82
363 0.82
364 0.83
365 0.85
366 0.79
367 0.76
368 0.68
369 0.61
370 0.51
371 0.4
372 0.33
373 0.24
374 0.26
375 0.21
376 0.21
377 0.18
378 0.18
379 0.17
380 0.17
381 0.17
382 0.12
383 0.13
384 0.14
385 0.17
386 0.22
387 0.32
388 0.38
389 0.46
390 0.47
391 0.48
392 0.5
393 0.52
394 0.57
395 0.56
396 0.57
397 0.51
398 0.54
399 0.58
400 0.59
401 0.53
402 0.49
403 0.41
404 0.33
405 0.4
406 0.39
407 0.4
408 0.45
409 0.49
410 0.51
411 0.57
412 0.64
413 0.61
414 0.68
415 0.69
416 0.69
417 0.75
418 0.78
419 0.8