Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y2AUP2

Protein Details
Accession A0A1Y2AUP2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
331-406QERSRDSRERDRPRESRYRDREGESRDGERERHRERNRDRDGEDKYERSSKYDDRDRRDHDRKRERSRSPAKRRLVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
338-405RERDRPRESRYRDREGESRDGERERHRERNRDRDGEDKYERSSKYDDRDRRDHDRKRERSRSPAKRRL
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.5, nucl 12, cyto 9, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004882  Luc7-rel  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006376  P:mRNA splice site selection  
Pfam View protein in Pfam  
PF03194  LUC7  
Amino Acid Sequences MGKMAEAQHKLLEQMMGAEAMGGKVEHLDWWSEKVCRNFLFGACPHVLFGNTKMDLGPCPKTHSEKILEQFREAQAANPNDPRFAAYKQQHENHLLGLIDDVDRRIRASQRKLEKTPEENRKTIDLMREIGEIELSIQGGTDEIEALGEAGKVEESMEKLAAVDALKQLKADKERELQNLNENAGASGHQKLRVCETCGAMLSVLDSDKRLADHFGGKMHLGYHEIRQVLAKLGEERMLARNGYGGGAPQQAQPPPNAPSAPSGPRGSNVFAPPPPQLTPAKNEAVPHTPLGPRVPPPEEMPAVGHGDKVKREAGELVEDIKEERAREYDQERSRDSRERDRPRESRYRDREGESRDGERERHRERNRDRDGEDKYERSSKYDDRDRRDHDRKRERSRSPAKRRLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.11
4 0.1
5 0.1
6 0.08
7 0.08
8 0.08
9 0.06
10 0.05
11 0.06
12 0.07
13 0.07
14 0.08
15 0.12
16 0.13
17 0.17
18 0.21
19 0.24
20 0.29
21 0.33
22 0.39
23 0.36
24 0.39
25 0.38
26 0.36
27 0.4
28 0.35
29 0.36
30 0.31
31 0.3
32 0.26
33 0.24
34 0.24
35 0.18
36 0.2
37 0.22
38 0.21
39 0.21
40 0.21
41 0.21
42 0.23
43 0.27
44 0.3
45 0.24
46 0.3
47 0.34
48 0.4
49 0.43
50 0.46
51 0.47
52 0.48
53 0.55
54 0.58
55 0.55
56 0.5
57 0.52
58 0.45
59 0.43
60 0.36
61 0.32
62 0.3
63 0.32
64 0.34
65 0.36
66 0.36
67 0.32
68 0.32
69 0.31
70 0.26
71 0.25
72 0.31
73 0.3
74 0.38
75 0.45
76 0.49
77 0.52
78 0.52
79 0.5
80 0.41
81 0.38
82 0.29
83 0.21
84 0.17
85 0.13
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.09
90 0.09
91 0.1
92 0.14
93 0.2
94 0.28
95 0.36
96 0.44
97 0.53
98 0.61
99 0.64
100 0.69
101 0.69
102 0.69
103 0.7
104 0.72
105 0.68
106 0.61
107 0.6
108 0.54
109 0.49
110 0.44
111 0.39
112 0.31
113 0.27
114 0.26
115 0.24
116 0.22
117 0.19
118 0.16
119 0.1
120 0.08
121 0.07
122 0.06
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.09
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.12
156 0.15
157 0.19
158 0.21
159 0.22
160 0.27
161 0.32
162 0.35
163 0.37
164 0.34
165 0.36
166 0.35
167 0.31
168 0.26
169 0.21
170 0.17
171 0.15
172 0.14
173 0.09
174 0.11
175 0.11
176 0.14
177 0.15
178 0.16
179 0.22
180 0.24
181 0.25
182 0.24
183 0.24
184 0.21
185 0.2
186 0.2
187 0.14
188 0.11
189 0.08
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.11
201 0.12
202 0.13
203 0.13
204 0.13
205 0.13
206 0.12
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.11
211 0.14
212 0.14
213 0.14
214 0.14
215 0.14
216 0.13
217 0.13
218 0.12
219 0.1
220 0.1
221 0.11
222 0.11
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.12
227 0.11
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.09
232 0.07
233 0.07
234 0.09
235 0.1
236 0.11
237 0.13
238 0.14
239 0.15
240 0.16
241 0.17
242 0.18
243 0.2
244 0.18
245 0.17
246 0.19
247 0.22
248 0.25
249 0.26
250 0.25
251 0.23
252 0.24
253 0.26
254 0.24
255 0.24
256 0.23
257 0.22
258 0.21
259 0.23
260 0.23
261 0.23
262 0.22
263 0.22
264 0.24
265 0.23
266 0.27
267 0.29
268 0.31
269 0.29
270 0.3
271 0.3
272 0.3
273 0.3
274 0.26
275 0.24
276 0.23
277 0.23
278 0.25
279 0.24
280 0.23
281 0.27
282 0.28
283 0.26
284 0.28
285 0.32
286 0.3
287 0.27
288 0.25
289 0.22
290 0.24
291 0.22
292 0.21
293 0.18
294 0.21
295 0.21
296 0.23
297 0.23
298 0.19
299 0.2
300 0.21
301 0.2
302 0.21
303 0.2
304 0.2
305 0.18
306 0.18
307 0.17
308 0.18
309 0.18
310 0.14
311 0.15
312 0.16
313 0.18
314 0.23
315 0.26
316 0.33
317 0.38
318 0.43
319 0.45
320 0.47
321 0.5
322 0.54
323 0.56
324 0.57
325 0.61
326 0.67
327 0.71
328 0.77
329 0.79
330 0.79
331 0.83
332 0.81
333 0.81
334 0.78
335 0.8
336 0.75
337 0.73
338 0.72
339 0.68
340 0.68
341 0.61
342 0.57
343 0.52
344 0.51
345 0.5
346 0.51
347 0.54
348 0.53
349 0.59
350 0.63
351 0.69
352 0.75
353 0.82
354 0.83
355 0.81
356 0.77
357 0.75
358 0.74
359 0.73
360 0.7
361 0.62
362 0.57
363 0.57
364 0.54
365 0.5
366 0.49
367 0.47
368 0.5
369 0.57
370 0.61
371 0.62
372 0.71
373 0.74
374 0.78
375 0.82
376 0.82
377 0.82
378 0.85
379 0.87
380 0.88
381 0.92
382 0.89
383 0.89
384 0.91
385 0.91
386 0.91