Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y2AY83

Protein Details
Accession A0A1Y2AY83    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-130FYDKVKIEEKQAHKRKRNKTGFKVGQGGTHydrophilic
476-498RDYFSHRRIKERRMARPLREWETBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-120HKRKRNK
Subcellular Location(s) mito 19, mito_nucl 12.333, cyto_mito 11.833, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MSKSIRPALKSLSAFLDRPASTNTSQQLSSTSKHPTAVTSNPTIPSSLTSKTSATSLVRMSGDTPMPPLPLNGLFPIAKPSGILSMRLIDQMAELFEDSRLFYDKVKIEEKQAHKRKRNKTGFKVGQGGTLDPLADGVLGERAEHFLRPRLALRTAVIGVNRGTKYLQAYLDGTKEYVSTGLLGAATDTMDADGKVLSTAPWEHVTREMIEQVLDQFRGTIKQTPPIFSALKMEGKQLYEYARENKPLPRPIPVRDCTVSIDLIDFQPASKPDIPNSGHEYRWPSTRLSPEEKQVFTSLTQIVKDAKTEDPTVQVAAMPDVAAEDVPEVSSTGLRPPIFTVRMSVSKGTYVRSLINDIGLAIGSAAHVVVLTRTRQGQFFLQEDRVDGDGKKHGISPPTSPGPNKKAHTENGGEAATSSHIKNEAASSSSTFTPSSVAMRWEIWDRAFKERAKMLKDEQEEREEMTACGKLEAEIRDYFSHRRIKERRMARPLREWETEMLKHFHPVEVPVPGGHGHERPWQERRDNAAGDGMTEEERMNV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.37
3 0.39
4 0.31
5 0.32
6 0.33
7 0.31
8 0.28
9 0.34
10 0.35
11 0.31
12 0.31
13 0.29
14 0.31
15 0.3
16 0.31
17 0.3
18 0.33
19 0.32
20 0.34
21 0.34
22 0.33
23 0.35
24 0.39
25 0.4
26 0.39
27 0.4
28 0.4
29 0.4
30 0.37
31 0.31
32 0.28
33 0.26
34 0.23
35 0.23
36 0.23
37 0.23
38 0.23
39 0.23
40 0.25
41 0.22
42 0.23
43 0.22
44 0.23
45 0.23
46 0.23
47 0.23
48 0.23
49 0.23
50 0.19
51 0.21
52 0.18
53 0.19
54 0.19
55 0.18
56 0.17
57 0.17
58 0.19
59 0.17
60 0.19
61 0.18
62 0.18
63 0.23
64 0.2
65 0.17
66 0.16
67 0.16
68 0.19
69 0.2
70 0.21
71 0.17
72 0.19
73 0.2
74 0.21
75 0.2
76 0.12
77 0.12
78 0.11
79 0.1
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.09
87 0.12
88 0.12
89 0.13
90 0.2
91 0.23
92 0.28
93 0.32
94 0.32
95 0.35
96 0.43
97 0.5
98 0.54
99 0.61
100 0.67
101 0.72
102 0.8
103 0.84
104 0.86
105 0.89
106 0.89
107 0.88
108 0.89
109 0.88
110 0.83
111 0.81
112 0.7
113 0.64
114 0.54
115 0.45
116 0.35
117 0.27
118 0.21
119 0.13
120 0.12
121 0.07
122 0.06
123 0.05
124 0.04
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.09
130 0.09
131 0.11
132 0.13
133 0.16
134 0.18
135 0.21
136 0.24
137 0.26
138 0.27
139 0.27
140 0.26
141 0.24
142 0.23
143 0.23
144 0.2
145 0.18
146 0.16
147 0.21
148 0.2
149 0.17
150 0.16
151 0.16
152 0.19
153 0.21
154 0.2
155 0.16
156 0.18
157 0.19
158 0.2
159 0.18
160 0.16
161 0.12
162 0.12
163 0.1
164 0.08
165 0.07
166 0.06
167 0.05
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.05
186 0.06
187 0.08
188 0.12
189 0.12
190 0.13
191 0.15
192 0.17
193 0.16
194 0.17
195 0.15
196 0.12
197 0.12
198 0.11
199 0.11
200 0.11
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.11
206 0.12
207 0.17
208 0.16
209 0.24
210 0.25
211 0.27
212 0.28
213 0.3
214 0.29
215 0.23
216 0.25
217 0.2
218 0.23
219 0.21
220 0.21
221 0.19
222 0.19
223 0.19
224 0.17
225 0.16
226 0.14
227 0.17
228 0.2
229 0.2
230 0.22
231 0.24
232 0.28
233 0.33
234 0.37
235 0.35
236 0.38
237 0.39
238 0.42
239 0.48
240 0.45
241 0.44
242 0.38
243 0.38
244 0.32
245 0.3
246 0.25
247 0.17
248 0.15
249 0.11
250 0.1
251 0.09
252 0.07
253 0.05
254 0.07
255 0.08
256 0.11
257 0.14
258 0.14
259 0.14
260 0.22
261 0.23
262 0.24
263 0.31
264 0.29
265 0.26
266 0.28
267 0.32
268 0.26
269 0.29
270 0.27
271 0.22
272 0.24
273 0.29
274 0.32
275 0.33
276 0.34
277 0.37
278 0.4
279 0.39
280 0.36
281 0.32
282 0.28
283 0.22
284 0.22
285 0.18
286 0.14
287 0.14
288 0.14
289 0.15
290 0.14
291 0.15
292 0.14
293 0.13
294 0.15
295 0.16
296 0.16
297 0.16
298 0.16
299 0.15
300 0.13
301 0.12
302 0.1
303 0.08
304 0.08
305 0.05
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.05
318 0.05
319 0.07
320 0.11
321 0.11
322 0.12
323 0.13
324 0.18
325 0.19
326 0.19
327 0.2
328 0.19
329 0.22
330 0.24
331 0.23
332 0.18
333 0.21
334 0.22
335 0.21
336 0.19
337 0.17
338 0.18
339 0.18
340 0.2
341 0.16
342 0.16
343 0.14
344 0.12
345 0.1
346 0.08
347 0.07
348 0.04
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.02
354 0.02
355 0.02
356 0.04
357 0.06
358 0.07
359 0.09
360 0.12
361 0.14
362 0.15
363 0.17
364 0.2
365 0.22
366 0.24
367 0.26
368 0.25
369 0.24
370 0.24
371 0.24
372 0.21
373 0.19
374 0.16
375 0.15
376 0.17
377 0.18
378 0.18
379 0.19
380 0.21
381 0.24
382 0.26
383 0.26
384 0.29
385 0.33
386 0.35
387 0.36
388 0.41
389 0.43
390 0.48
391 0.47
392 0.47
393 0.47
394 0.48
395 0.51
396 0.47
397 0.42
398 0.39
399 0.36
400 0.29
401 0.24
402 0.21
403 0.17
404 0.15
405 0.13
406 0.1
407 0.11
408 0.12
409 0.12
410 0.14
411 0.13
412 0.13
413 0.14
414 0.15
415 0.16
416 0.17
417 0.17
418 0.15
419 0.14
420 0.14
421 0.14
422 0.15
423 0.14
424 0.15
425 0.15
426 0.16
427 0.18
428 0.2
429 0.21
430 0.21
431 0.26
432 0.27
433 0.33
434 0.38
435 0.38
436 0.41
437 0.45
438 0.49
439 0.46
440 0.49
441 0.47
442 0.5
443 0.54
444 0.54
445 0.52
446 0.51
447 0.47
448 0.44
449 0.41
450 0.33
451 0.28
452 0.24
453 0.22
454 0.17
455 0.17
456 0.15
457 0.14
458 0.17
459 0.19
460 0.2
461 0.19
462 0.22
463 0.24
464 0.27
465 0.3
466 0.33
467 0.4
468 0.38
469 0.47
470 0.52
471 0.59
472 0.65
473 0.71
474 0.74
475 0.77
476 0.84
477 0.8
478 0.82
479 0.82
480 0.79
481 0.73
482 0.65
483 0.59
484 0.57
485 0.53
486 0.47
487 0.43
488 0.36
489 0.37
490 0.35
491 0.32
492 0.26
493 0.27
494 0.26
495 0.25
496 0.25
497 0.2
498 0.21
499 0.2
500 0.21
501 0.21
502 0.2
503 0.2
504 0.27
505 0.34
506 0.39
507 0.45
508 0.5
509 0.53
510 0.57
511 0.62
512 0.63
513 0.58
514 0.53
515 0.51
516 0.43
517 0.38
518 0.32
519 0.26
520 0.18
521 0.17