Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2BDW6

Protein Details
Accession A0A1Y2BDW6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
332-356VGAAGDAKRKRGRPRTKGVGEKDVKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
130-144KRKAPPEPYPRPQKR
338-376AKRKRGRPRTKGVGEKDVKGVGRGRKKGNGMAKKIKPPA
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 10, cyto_nucl 8.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
Amino Acid Sequences MAATTAQQQQQQQQAPPLSLPPARSRTPQPTPVPVQQALPTTPQMSTRPSFGVATPPPIAQPLPQTQGSYHPSLLSTPPQASSTPTRMPSPPRPPATARRPSVPITQAFIPASQPVQPPTRPGSPAESLKRKAPPEPYPRPQKRPVERPPNAPNVAPQVYFAGAGGKPRESSPIIDLSNENHVGDRRASEPQAPVTEVKRKRDERMRRTMRDDIARLMYACGDVIEPDVDTVDYVEDLVVDFLADMCRPSPLIRTNPQSTYQAHPLTAPILRHRLSSSPSMRKYLDRFDELSAKSVEIAAQRRMMRGTENPNDLVNIVGKDYLEVDEEGKEVGAAGDAKRKRGRPRTKGVGEKDVKGVGRGRKKGNGMAKKIKPPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.46
3 0.43
4 0.39
5 0.36
6 0.33
7 0.34
8 0.34
9 0.37
10 0.39
11 0.43
12 0.48
13 0.52
14 0.58
15 0.63
16 0.61
17 0.63
18 0.67
19 0.69
20 0.68
21 0.6
22 0.54
23 0.48
24 0.46
25 0.4
26 0.36
27 0.31
28 0.26
29 0.25
30 0.27
31 0.26
32 0.28
33 0.27
34 0.27
35 0.26
36 0.27
37 0.27
38 0.24
39 0.3
40 0.26
41 0.3
42 0.28
43 0.26
44 0.25
45 0.25
46 0.25
47 0.18
48 0.23
49 0.23
50 0.26
51 0.27
52 0.28
53 0.27
54 0.34
55 0.37
56 0.34
57 0.29
58 0.25
59 0.24
60 0.25
61 0.26
62 0.23
63 0.22
64 0.2
65 0.2
66 0.21
67 0.21
68 0.24
69 0.27
70 0.29
71 0.31
72 0.32
73 0.33
74 0.36
75 0.43
76 0.49
77 0.53
78 0.56
79 0.55
80 0.57
81 0.6
82 0.66
83 0.68
84 0.68
85 0.61
86 0.57
87 0.56
88 0.55
89 0.55
90 0.5
91 0.42
92 0.36
93 0.35
94 0.33
95 0.29
96 0.27
97 0.21
98 0.17
99 0.16
100 0.16
101 0.15
102 0.16
103 0.2
104 0.2
105 0.23
106 0.27
107 0.3
108 0.29
109 0.29
110 0.31
111 0.32
112 0.39
113 0.43
114 0.45
115 0.43
116 0.47
117 0.51
118 0.47
119 0.47
120 0.48
121 0.49
122 0.52
123 0.59
124 0.63
125 0.68
126 0.74
127 0.76
128 0.78
129 0.78
130 0.77
131 0.78
132 0.79
133 0.79
134 0.76
135 0.77
136 0.75
137 0.73
138 0.65
139 0.55
140 0.47
141 0.42
142 0.39
143 0.31
144 0.24
145 0.17
146 0.16
147 0.15
148 0.13
149 0.1
150 0.08
151 0.1
152 0.11
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.14
157 0.13
158 0.14
159 0.14
160 0.18
161 0.18
162 0.18
163 0.18
164 0.16
165 0.19
166 0.18
167 0.16
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.12
175 0.13
176 0.14
177 0.15
178 0.16
179 0.17
180 0.16
181 0.16
182 0.17
183 0.25
184 0.27
185 0.32
186 0.38
187 0.4
188 0.46
189 0.54
190 0.62
191 0.62
192 0.69
193 0.73
194 0.69
195 0.73
196 0.72
197 0.66
198 0.61
199 0.53
200 0.45
201 0.37
202 0.33
203 0.27
204 0.21
205 0.17
206 0.11
207 0.1
208 0.07
209 0.05
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.03
221 0.04
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.06
236 0.07
237 0.11
238 0.17
239 0.23
240 0.29
241 0.36
242 0.4
243 0.42
244 0.44
245 0.43
246 0.4
247 0.39
248 0.4
249 0.35
250 0.31
251 0.28
252 0.26
253 0.25
254 0.24
255 0.21
256 0.18
257 0.23
258 0.23
259 0.24
260 0.25
261 0.26
262 0.26
263 0.33
264 0.38
265 0.41
266 0.44
267 0.47
268 0.47
269 0.49
270 0.5
271 0.5
272 0.47
273 0.42
274 0.41
275 0.4
276 0.45
277 0.41
278 0.4
279 0.32
280 0.26
281 0.23
282 0.21
283 0.2
284 0.17
285 0.2
286 0.2
287 0.25
288 0.26
289 0.28
290 0.29
291 0.28
292 0.26
293 0.3
294 0.36
295 0.37
296 0.4
297 0.39
298 0.38
299 0.38
300 0.34
301 0.28
302 0.21
303 0.15
304 0.12
305 0.11
306 0.11
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.1
317 0.09
318 0.07
319 0.06
320 0.07
321 0.08
322 0.09
323 0.18
324 0.2
325 0.28
326 0.34
327 0.41
328 0.5
329 0.6
330 0.7
331 0.71
332 0.8
333 0.84
334 0.87
335 0.89
336 0.86
337 0.86
338 0.79
339 0.72
340 0.65
341 0.59
342 0.5
343 0.44
344 0.44
345 0.43
346 0.48
347 0.52
348 0.55
349 0.58
350 0.62
351 0.67
352 0.71
353 0.72
354 0.71
355 0.75
356 0.76