Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2AVE3

Protein Details
Accession A0A1Y2AVE3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-95ANAVVAREERRNKKRKKGEAGPSYKASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-87ERRNKKRKKGE
226-245AKKAEKKKLTAEEKQRISKR
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10.5, cyto 9.5, pero 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034393  TatSF1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MPAPLPGRFDEDPRVHFDKTAGNYQYEDEETGKEYEWNGKVWIELVDEEQWRAQQAAYSIAGVDESTPANAVVAREERRNKKRKKGEAGPSYKASSISASTSAPQPPSAPKRTAVFVSNLPPTTTAAQLASVFSKAGVLMLGDDGEPRIKLYHDDAGNFKGEALVMFFKEGSVDLAITLLDDTELELGTGWGNIRVKEAEYGSGQGQGQGQAEEKKNGDAAEADGAKKAEKKKLTAEEKQRISKRIKTMQNKVTWHSDDDSDDPAAPIDGAPAPGANRMNRVVVLKGMFSVEDVEKDPGLLLELKEDVREEAETLGTVTSVQLYDQEEDGVMTIKFKDAVSAQACVMKMNGRFFDGRQIFAGIYSGKERYRKSGGGGLGDDDEEEQDRLEGFASWLVDDDGEPN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.41
3 0.41
4 0.39
5 0.38
6 0.37
7 0.44
8 0.39
9 0.35
10 0.36
11 0.36
12 0.37
13 0.31
14 0.28
15 0.2
16 0.19
17 0.2
18 0.21
19 0.2
20 0.18
21 0.18
22 0.24
23 0.24
24 0.24
25 0.23
26 0.22
27 0.22
28 0.21
29 0.21
30 0.15
31 0.14
32 0.15
33 0.18
34 0.19
35 0.19
36 0.19
37 0.18
38 0.18
39 0.17
40 0.15
41 0.12
42 0.13
43 0.16
44 0.15
45 0.15
46 0.14
47 0.13
48 0.13
49 0.1
50 0.1
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.08
58 0.08
59 0.11
60 0.16
61 0.19
62 0.26
63 0.36
64 0.46
65 0.55
66 0.66
67 0.71
68 0.76
69 0.84
70 0.87
71 0.88
72 0.88
73 0.88
74 0.89
75 0.88
76 0.83
77 0.76
78 0.67
79 0.58
80 0.48
81 0.38
82 0.29
83 0.22
84 0.18
85 0.16
86 0.14
87 0.15
88 0.18
89 0.2
90 0.19
91 0.18
92 0.18
93 0.25
94 0.32
95 0.36
96 0.35
97 0.35
98 0.37
99 0.39
100 0.4
101 0.34
102 0.29
103 0.26
104 0.29
105 0.3
106 0.28
107 0.26
108 0.24
109 0.23
110 0.22
111 0.19
112 0.15
113 0.11
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.11
118 0.09
119 0.09
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.08
138 0.11
139 0.17
140 0.17
141 0.19
142 0.2
143 0.22
144 0.22
145 0.2
146 0.17
147 0.11
148 0.1
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.04
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.11
185 0.11
186 0.1
187 0.1
188 0.11
189 0.11
190 0.13
191 0.12
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.1
197 0.11
198 0.13
199 0.15
200 0.16
201 0.16
202 0.15
203 0.15
204 0.15
205 0.14
206 0.09
207 0.09
208 0.11
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.12
214 0.15
215 0.18
216 0.21
217 0.23
218 0.26
219 0.32
220 0.42
221 0.48
222 0.53
223 0.59
224 0.62
225 0.65
226 0.7
227 0.67
228 0.63
229 0.61
230 0.59
231 0.57
232 0.58
233 0.61
234 0.62
235 0.67
236 0.69
237 0.72
238 0.68
239 0.62
240 0.6
241 0.52
242 0.46
243 0.38
244 0.32
245 0.26
246 0.25
247 0.24
248 0.18
249 0.16
250 0.14
251 0.12
252 0.11
253 0.09
254 0.07
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.1
262 0.13
263 0.12
264 0.15
265 0.16
266 0.17
267 0.18
268 0.19
269 0.16
270 0.17
271 0.17
272 0.14
273 0.13
274 0.12
275 0.11
276 0.1
277 0.12
278 0.09
279 0.1
280 0.12
281 0.13
282 0.12
283 0.12
284 0.12
285 0.09
286 0.1
287 0.1
288 0.08
289 0.09
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.12
294 0.11
295 0.1
296 0.11
297 0.1
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.08
303 0.07
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.08
310 0.1
311 0.11
312 0.12
313 0.12
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.1
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.1
323 0.1
324 0.12
325 0.11
326 0.19
327 0.2
328 0.21
329 0.21
330 0.24
331 0.24
332 0.22
333 0.22
334 0.19
335 0.21
336 0.25
337 0.25
338 0.25
339 0.27
340 0.27
341 0.37
342 0.33
343 0.31
344 0.27
345 0.28
346 0.24
347 0.23
348 0.25
349 0.14
350 0.14
351 0.16
352 0.18
353 0.21
354 0.27
355 0.29
356 0.34
357 0.41
358 0.41
359 0.42
360 0.46
361 0.45
362 0.44
363 0.42
364 0.37
365 0.31
366 0.29
367 0.25
368 0.18
369 0.16
370 0.13
371 0.12
372 0.1
373 0.09
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.09
378 0.08
379 0.11
380 0.12
381 0.11
382 0.12
383 0.12
384 0.12