Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2B4J3

Protein Details
Accession A0A1Y2B4J3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
283-307VGKINKDMSKVKRKKKDDGDEEVNYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-30RARGK
293-297VKRKK
Subcellular Location(s) mito 13.5, nucl 10, cyto_mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPRGKPREVKSAAPSPSPAVSRASSRARGKGKQPATEVVEETTEEQETSAAEDDEAETEPVAVESEAEPVVDESEVVEGDGDAGEDGDADAGEGSSTKLTMAERLAKMKELRQRMNQSTAANRRDLVADHQKAKVTAKELQRLEKQRKLAQTLRLKSEAEEAGEDMERKKAWEWSIEQNERWEAKMEDQKVRGDSSFHNAEDDAHKLYNRNIRSTKPDVAAYARAKEAALGLAPGTLVPGTSNSSALVASGRGLTAAEDLYRGADTLSYGDSKPSEDAIDRVVGKINKDMSKVKRKKKDDGDEEVNYINDRNKVFNKKIARYYDKYTKEIRANFERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.45
3 0.45
4 0.4
5 0.34
6 0.29
7 0.27
8 0.29
9 0.34
10 0.38
11 0.42
12 0.45
13 0.53
14 0.56
15 0.6
16 0.64
17 0.67
18 0.67
19 0.65
20 0.64
21 0.63
22 0.6
23 0.57
24 0.51
25 0.42
26 0.36
27 0.29
28 0.27
29 0.21
30 0.16
31 0.13
32 0.12
33 0.1
34 0.09
35 0.11
36 0.1
37 0.09
38 0.08
39 0.08
40 0.09
41 0.1
42 0.11
43 0.09
44 0.08
45 0.07
46 0.08
47 0.07
48 0.07
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.08
53 0.08
54 0.07
55 0.08
56 0.07
57 0.08
58 0.07
59 0.06
60 0.05
61 0.06
62 0.06
63 0.05
64 0.05
65 0.04
66 0.05
67 0.05
68 0.04
69 0.03
70 0.03
71 0.03
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.03
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.06
86 0.06
87 0.09
88 0.11
89 0.18
90 0.2
91 0.23
92 0.24
93 0.27
94 0.28
95 0.32
96 0.36
97 0.37
98 0.41
99 0.46
100 0.53
101 0.54
102 0.58
103 0.56
104 0.51
105 0.52
106 0.54
107 0.48
108 0.41
109 0.37
110 0.32
111 0.29
112 0.27
113 0.25
114 0.27
115 0.29
116 0.3
117 0.32
118 0.32
119 0.32
120 0.33
121 0.29
122 0.23
123 0.25
124 0.28
125 0.34
126 0.35
127 0.4
128 0.45
129 0.51
130 0.55
131 0.53
132 0.52
133 0.49
134 0.51
135 0.52
136 0.5
137 0.5
138 0.53
139 0.52
140 0.51
141 0.49
142 0.45
143 0.39
144 0.38
145 0.29
146 0.2
147 0.17
148 0.13
149 0.11
150 0.12
151 0.12
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.11
158 0.12
159 0.15
160 0.18
161 0.26
162 0.35
163 0.36
164 0.36
165 0.34
166 0.36
167 0.33
168 0.3
169 0.23
170 0.15
171 0.18
172 0.23
173 0.26
174 0.27
175 0.28
176 0.3
177 0.29
178 0.29
179 0.24
180 0.21
181 0.19
182 0.2
183 0.21
184 0.19
185 0.19
186 0.17
187 0.18
188 0.18
189 0.18
190 0.14
191 0.12
192 0.12
193 0.13
194 0.17
195 0.23
196 0.23
197 0.28
198 0.29
199 0.31
200 0.38
201 0.43
202 0.43
203 0.39
204 0.38
205 0.33
206 0.33
207 0.37
208 0.32
209 0.28
210 0.23
211 0.21
212 0.2
213 0.19
214 0.16
215 0.1
216 0.08
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.05
252 0.06
253 0.07
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.11
258 0.12
259 0.13
260 0.14
261 0.14
262 0.14
263 0.13
264 0.14
265 0.14
266 0.18
267 0.17
268 0.17
269 0.22
270 0.22
271 0.22
272 0.26
273 0.31
274 0.29
275 0.33
276 0.41
277 0.44
278 0.54
279 0.63
280 0.68
281 0.72
282 0.76
283 0.82
284 0.85
285 0.86
286 0.84
287 0.84
288 0.82
289 0.74
290 0.7
291 0.61
292 0.51
293 0.4
294 0.33
295 0.27
296 0.23
297 0.22
298 0.25
299 0.32
300 0.41
301 0.45
302 0.51
303 0.58
304 0.61
305 0.68
306 0.72
307 0.73
308 0.69
309 0.73
310 0.75
311 0.71
312 0.68
313 0.66
314 0.64
315 0.64
316 0.64
317 0.64
318 0.62
319 0.62
320 0.58