Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2B5J3

Protein Details
Accession A0A1Y2B5J3    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
149-173AEGEAKPKKKKARKPRRRVPEEGEDBasic
202-227DEDSEPKERKPRERKPKLQLTNEQSEAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-121R
123-128AAKAEK
147-166KTAEGEAKPKKKKARKPRRR
206-218EPKERKPRERKPK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 11.833, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSAESANVNGTAPAAETEAAAPQEEGFRVYIGNLAYTSTEEDIRSFVTKAGDYEILSVVMPKKFGKRPAGFAFVLYKNEEDAKAVVEKLNGEELGDRKLSLEVARSKEEQAARREAIIEKRNAAKAEKAEQKAAASGAEQKAEGDEKTAEGEAKPKKKKARKPRRRVPEEGEDSSTAVEGGSSEVKSSKSSRSRVPREARIDEDSEPKERKPRERKPKLQLTNEQSESTVFVANLPFDVDDDALAAIFTNLSIRVKSAKVIRGLRSGRGGRRFYASRGFGFVEIEDAAQQKEAVEKVEGSLIGDRTISAKIAQEMKPIEVENATEGTE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.08
4 0.09
5 0.11
6 0.12
7 0.11
8 0.11
9 0.1
10 0.13
11 0.12
12 0.13
13 0.11
14 0.11
15 0.1
16 0.11
17 0.13
18 0.11
19 0.12
20 0.1
21 0.1
22 0.11
23 0.11
24 0.13
25 0.12
26 0.13
27 0.12
28 0.13
29 0.13
30 0.15
31 0.16
32 0.14
33 0.15
34 0.16
35 0.17
36 0.17
37 0.2
38 0.19
39 0.18
40 0.19
41 0.17
42 0.15
43 0.14
44 0.16
45 0.16
46 0.15
47 0.16
48 0.17
49 0.24
50 0.28
51 0.36
52 0.44
53 0.44
54 0.52
55 0.56
56 0.6
57 0.52
58 0.48
59 0.48
60 0.4
61 0.38
62 0.31
63 0.25
64 0.2
65 0.22
66 0.2
67 0.15
68 0.13
69 0.13
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.14
77 0.12
78 0.11
79 0.13
80 0.13
81 0.15
82 0.14
83 0.13
84 0.12
85 0.12
86 0.13
87 0.11
88 0.16
89 0.19
90 0.22
91 0.26
92 0.26
93 0.27
94 0.31
95 0.35
96 0.35
97 0.34
98 0.36
99 0.33
100 0.32
101 0.33
102 0.31
103 0.34
104 0.34
105 0.31
106 0.29
107 0.32
108 0.34
109 0.34
110 0.32
111 0.28
112 0.25
113 0.32
114 0.37
115 0.35
116 0.34
117 0.33
118 0.32
119 0.29
120 0.26
121 0.18
122 0.1
123 0.14
124 0.13
125 0.13
126 0.12
127 0.11
128 0.12
129 0.13
130 0.12
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.08
135 0.09
136 0.08
137 0.07
138 0.14
139 0.19
140 0.27
141 0.32
142 0.37
143 0.46
144 0.55
145 0.64
146 0.69
147 0.75
148 0.77
149 0.84
150 0.88
151 0.9
152 0.89
153 0.85
154 0.8
155 0.79
156 0.74
157 0.65
158 0.57
159 0.46
160 0.39
161 0.32
162 0.25
163 0.15
164 0.08
165 0.06
166 0.03
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.07
172 0.08
173 0.1
174 0.12
175 0.19
176 0.25
177 0.28
178 0.36
179 0.45
180 0.52
181 0.6
182 0.65
183 0.65
184 0.66
185 0.66
186 0.62
187 0.55
188 0.5
189 0.42
190 0.42
191 0.35
192 0.33
193 0.31
194 0.29
195 0.33
196 0.35
197 0.44
198 0.49
199 0.58
200 0.64
201 0.73
202 0.82
203 0.84
204 0.9
205 0.89
206 0.86
207 0.85
208 0.8
209 0.78
210 0.7
211 0.6
212 0.5
213 0.41
214 0.34
215 0.25
216 0.2
217 0.11
218 0.09
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.07
226 0.06
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.04
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.08
241 0.11
242 0.12
243 0.16
244 0.22
245 0.26
246 0.33
247 0.39
248 0.42
249 0.48
250 0.5
251 0.49
252 0.51
253 0.52
254 0.52
255 0.55
256 0.54
257 0.46
258 0.51
259 0.5
260 0.46
261 0.48
262 0.44
263 0.36
264 0.38
265 0.37
266 0.3
267 0.29
268 0.25
269 0.18
270 0.15
271 0.14
272 0.12
273 0.11
274 0.11
275 0.1
276 0.1
277 0.08
278 0.11
279 0.12
280 0.13
281 0.13
282 0.13
283 0.14
284 0.17
285 0.16
286 0.15
287 0.18
288 0.17
289 0.16
290 0.15
291 0.15
292 0.14
293 0.15
294 0.14
295 0.11
296 0.13
297 0.18
298 0.25
299 0.26
300 0.31
301 0.32
302 0.32
303 0.34
304 0.32
305 0.29
306 0.23
307 0.23
308 0.19