FuNGI

A0A1Y2B1A1

Protein Details

Accession

A0A1Y2B1A1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-26	MADASLFLRKRKDKQRRGVSSVRVLS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
11-12	RK
163-167	RKRRK
435-442	RLRRMMKK
634-638	RKKKK

Subcellular Location(s)

mito_nucl 11.666, nucl 11, mito 11, cyto_nucl 8.666, cyto_mito 8.666

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MADASLFLRKRKDKQRRGVSSVRVLSAAPSPPVASTSSPRPGSVQPPQTVKSEVEPVSGEGITEIKLYSISPDERSRYSLFKLHSDRACDPTELAPPVLFNRKHPGPRAPPTLAYNAEGKVVGRYLFDGEGKPILDENGKHRMEKREEMDMSLVGTADGAGPRKRRKGVREVYNTDVEAIRLKREEATPWVLETGTPKDSGTGTGPSASASGAMPEHWVGRMVDQSHMPSVLFVNDGTGEAGFKVIPVARHYRFNPERPFQVLDSDQANKLFETQQKQKITDRWSHRPGGSIPPEKIKREVLDQELRARRIEERIAASKSTGTGGSSAAAVKKEPKWDDDYKREGRRLERGLEGGADEELDYDETEMFQDDEENNTFYHNAEEEEDQKLQDEQLKKEFRLANANVGDRPQIDDEASDEDLEEMLDDGKLNSEGKRLRRMMKKRGGDDLFGDSDSDDESEEEEETATKDEKKEADGDKDKDKDNSVPGSAERPSRPPSRGPNGRGTSSPTGNRRAQPPSSGKASTAPPGSGAALLAQRAASRGASPRRSRGTTPTSGRATSPENRASSPSGTAGRRSASPAVSSASTSKRPGGPSTRSPEPNSNSNSSASTPGAGAGGTKRKPSPLPTQANEISRKKKKSSSSSTPTPTPGPPDDLPTFPGAITADEVRAWFASQTTDEVPFGAVVSAFKGRLGAVASEHKEQNQKAFTQLIPMFAKREKGVFKIKPGVRPGA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.8
2	0.88
3	0.89
4	0.89
5	0.89
6	0.86
7	0.84
8	0.78
9	0.69
10	0.58
11	0.48
12	0.42
13	0.38
14	0.32
15	0.23
16	0.2
17	0.19
18	0.18
19	0.2
20	0.2
21	0.18
22	0.2
23	0.27
24	0.34
25	0.35
26	0.35
27	0.38
28	0.4
29	0.45
30	0.5
31	0.51
32	0.48
33	0.53
34	0.54
35	0.54
36	0.52
37	0.45
38	0.4
39	0.39
40	0.34
41	0.3
42	0.29
43	0.27
44	0.27
45	0.25
46	0.21
47	0.13
48	0.13
49	0.12
50	0.11
51	0.1
52	0.07
53	0.07
54	0.07
55	0.09
56	0.14
57	0.16
58	0.21
59	0.27
60	0.31
61	0.32
62	0.37
63	0.37
64	0.36
65	0.38
66	0.39
67	0.36
68	0.41
69	0.46
70	0.49
71	0.5
72	0.53
73	0.52
74	0.51
75	0.51
76	0.43
77	0.38
78	0.33
79	0.35
80	0.3
81	0.27
82	0.22
83	0.2
84	0.24
85	0.31
86	0.29
87	0.27
88	0.34
89	0.41
90	0.47
91	0.51
92	0.57
93	0.57
94	0.65
95	0.7
96	0.65
97	0.61
98	0.59
99	0.59
100	0.51
101	0.43
102	0.37
103	0.29
104	0.27
105	0.23
106	0.19
107	0.15
108	0.15
109	0.13
110	0.11
111	0.12
112	0.13
113	0.14
114	0.15
115	0.14
116	0.15
117	0.17
118	0.16
119	0.16
120	0.14
121	0.14
122	0.16
123	0.17
124	0.2
125	0.28
126	0.28
127	0.3
128	0.35
129	0.43
130	0.46
131	0.52
132	0.51
133	0.5
134	0.5
135	0.5
136	0.46
137	0.37
138	0.31
139	0.23
140	0.2
141	0.1
142	0.09
143	0.07
144	0.06
145	0.08
146	0.1
147	0.14
148	0.21
149	0.28
150	0.35
151	0.42
152	0.49
153	0.55
154	0.62
155	0.68
156	0.72
157	0.76
158	0.74
159	0.72
160	0.68
161	0.61
162	0.51
163	0.41
164	0.31
165	0.26
166	0.22
167	0.19
168	0.17
169	0.17
170	0.19
171	0.2
172	0.22
173	0.22
174	0.27
175	0.24
176	0.24
177	0.24
178	0.21
179	0.2
180	0.21
181	0.19
182	0.15
183	0.15
184	0.14
185	0.15
186	0.15
187	0.17
188	0.16
189	0.14
190	0.13
191	0.14
192	0.14
193	0.13
194	0.13
195	0.11
196	0.09
197	0.07
198	0.07
199	0.06
200	0.06
201	0.07
202	0.07
203	0.08
204	0.08
205	0.09
206	0.08
207	0.1
208	0.13
209	0.13
210	0.14
211	0.15
212	0.17
213	0.16
214	0.16
215	0.15
216	0.11
217	0.11
218	0.1
219	0.09
220	0.07
221	0.07
222	0.07
223	0.07
224	0.07
225	0.06
226	0.06
227	0.05
228	0.06
229	0.05
230	0.04
231	0.05
232	0.06
233	0.08
234	0.11
235	0.19
236	0.2
237	0.26
238	0.28
239	0.37
240	0.41
241	0.48
242	0.52
243	0.49
244	0.5
245	0.48
246	0.5
247	0.39
248	0.38
249	0.31
250	0.25
251	0.25
252	0.24
253	0.21
254	0.19
255	0.19
256	0.14
257	0.15
258	0.17
259	0.18
260	0.23
261	0.3
262	0.37
263	0.4
264	0.43
265	0.46
266	0.48
267	0.49
268	0.51
269	0.51
270	0.52
271	0.54
272	0.56
273	0.52
274	0.49
275	0.46
276	0.46
277	0.46
278	0.42
279	0.38
280	0.43
281	0.46
282	0.44
283	0.45
284	0.39
285	0.32
286	0.32
287	0.35
288	0.32
289	0.35
290	0.35
291	0.4
292	0.42
293	0.41
294	0.37
295	0.34
296	0.29
297	0.26
298	0.26
299	0.21
300	0.21
301	0.24
302	0.25
303	0.24
304	0.23
305	0.2
306	0.19
307	0.16
308	0.12
309	0.08
310	0.07
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.08
317	0.08
318	0.11
319	0.13
320	0.19
321	0.19
322	0.21
323	0.27
324	0.35
325	0.42
326	0.45
327	0.51
328	0.53
329	0.57
330	0.57
331	0.54
332	0.49
333	0.5
334	0.46
335	0.41
336	0.35
337	0.31
338	0.27
339	0.24
340	0.21
341	0.13
342	0.1
343	0.07
344	0.05
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.05
357	0.05
358	0.07
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.09
363	0.09
364	0.08
365	0.09
366	0.07
367	0.07
368	0.08
369	0.09
370	0.1
371	0.12
372	0.12
373	0.12
374	0.12
375	0.11
376	0.1
377	0.14
378	0.16
379	0.16
380	0.24
381	0.27
382	0.26
383	0.33
384	0.34
385	0.31
386	0.36
387	0.34
388	0.33
389	0.33
390	0.34
391	0.27
392	0.26
393	0.25
394	0.17
395	0.18
396	0.12
397	0.1
398	0.09
399	0.08
400	0.09
401	0.11
402	0.11
403	0.09
404	0.08
405	0.08
406	0.08
407	0.07
408	0.06
409	0.03
410	0.03
411	0.04
412	0.04
413	0.03
414	0.04
415	0.05
416	0.06
417	0.07
418	0.12
419	0.16
420	0.2
421	0.29
422	0.32
423	0.39
424	0.48
425	0.56
426	0.62
427	0.67
428	0.7
429	0.64
430	0.69
431	0.63
432	0.54
433	0.48
434	0.41
435	0.33
436	0.26
437	0.23
438	0.14
439	0.12
440	0.11
441	0.09
442	0.06
443	0.05
444	0.05
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.08
452	0.08
453	0.09
454	0.1
455	0.13
456	0.14
457	0.15
458	0.21
459	0.22
460	0.3
461	0.36
462	0.38
463	0.42
464	0.44
465	0.45
466	0.41
467	0.4
468	0.34
469	0.31
470	0.3
471	0.24
472	0.23
473	0.22
474	0.23
475	0.23
476	0.24
477	0.22
478	0.24
479	0.28
480	0.32
481	0.34
482	0.37
483	0.43
484	0.49
485	0.56
486	0.56
487	0.61
488	0.6
489	0.59
490	0.54
491	0.52
492	0.46
493	0.42
494	0.43
495	0.38
496	0.41
497	0.43
498	0.46
499	0.44
500	0.46
501	0.43
502	0.45
503	0.46
504	0.44
505	0.44
506	0.42
507	0.37
508	0.35
509	0.35
510	0.32
511	0.27
512	0.23
513	0.19
514	0.19
515	0.19
516	0.15
517	0.13
518	0.1
519	0.09
520	0.09
521	0.09
522	0.08
523	0.08
524	0.08
525	0.09
526	0.08
527	0.09
528	0.16
529	0.24
530	0.33
531	0.37
532	0.43
533	0.49
534	0.53
535	0.53
536	0.54
537	0.54
538	0.54
539	0.56
540	0.56
541	0.53
542	0.5
543	0.48
544	0.42
545	0.4
546	0.37
547	0.39
548	0.37
549	0.36
550	0.36
551	0.38
552	0.38
553	0.34
554	0.3
555	0.27
556	0.27
557	0.26
558	0.27
559	0.27
560	0.26
561	0.25
562	0.27
563	0.27
564	0.23
565	0.22
566	0.21
567	0.21
568	0.2
569	0.2
570	0.2
571	0.22
572	0.24
573	0.25
574	0.28
575	0.29
576	0.31
577	0.37
578	0.41
579	0.43
580	0.48
581	0.53
582	0.57
583	0.58
584	0.6
585	0.62
586	0.59
587	0.6
588	0.57
589	0.54
590	0.48
591	0.45
592	0.42
593	0.35
594	0.33
595	0.26
596	0.21
597	0.16
598	0.15
599	0.13
600	0.11
601	0.11
602	0.13
603	0.2
604	0.22
605	0.26
606	0.27
607	0.31
608	0.35
609	0.41
610	0.46
611	0.48
612	0.56
613	0.54
614	0.61
615	0.62
616	0.64
617	0.67
618	0.64
619	0.64
620	0.64
621	0.68
622	0.66
623	0.68
624	0.71
625	0.73
626	0.76
627	0.76
628	0.76
629	0.79
630	0.79
631	0.75
632	0.69
633	0.62
634	0.54
635	0.5
636	0.44
637	0.41
638	0.36
639	0.39
640	0.38
641	0.36
642	0.36
643	0.31
644	0.29
645	0.22
646	0.22
647	0.16
648	0.14
649	0.15
650	0.14
651	0.13
652	0.12
653	0.13
654	0.13
655	0.12
656	0.12
657	0.1
658	0.1
659	0.11
660	0.12
661	0.15
662	0.16
663	0.18
664	0.17
665	0.17
666	0.17
667	0.15
668	0.14
669	0.11
670	0.09
671	0.07
672	0.1
673	0.12
674	0.12
675	0.12
676	0.12
677	0.11
678	0.13
679	0.15
680	0.13
681	0.15
682	0.24
683	0.27
684	0.32
685	0.34
686	0.36
687	0.41
688	0.42
689	0.46
690	0.42
691	0.4
692	0.39
693	0.41
694	0.37
695	0.39
696	0.38
697	0.37
698	0.36
699	0.36
700	0.37
701	0.36
702	0.41
703	0.33
704	0.39
705	0.36
706	0.39
707	0.48
708	0.49
709	0.54
710	0.6
711	0.63
712	0.64

A0A1Y2B1A1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer