FuNGI

A0A1Y2BJU7

Protein Details

Accession

A0A1Y2BJU7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
67-89	DQPIQRMKFKPRVPIRRPKTEVD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
104-118	GGFRGRGRGGHLGRR
206-210	GKGKD
212-221	LSGREKIKRI

Subcellular Location(s)

mito_nucl 11.666, nucl 11.5, mito 10.5, cyto_nucl 8.333, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSGPRRGRGRPALIVAAQAEVPSPSAPMEITNSQPGTIDSGSARSTPTLPDSASVLSVGYGDSQAGDQPIQRMKFKPRVPIRRPKTEVDVKPEISEPSSSAARGGFRGRGRGGHLGRRGSPIKYSSTSTGIFSGNRISPGQRHTPIPAPRVGIFQQEAEQYSDGEDDSKGTSNGEGHIDIDQVSGMGESAPTSLYRDRTPHGGVKGKGKDTLSGREKIKRIRRVVVNDDDDVTMVKAERLSPVKSHSGLPERDDEVIMPDNDDDHDPNALGQRVRTFMRTGGIEDEVDGEQDVNEAQKVDLSESESEEEEEDLTGDFIQLEDGDPPEDKLFMFQFPHLFPKFLSSDPVDMTKDEKPDIKPDIAAAPSTKGKKKANLPPPEGRIGTMVVMKSGRVKMVLGDNIVMNVTPGVPPTFIQHLVHVDQPSKSLTVLGEVNTQYTVSPDIDRLLQDLFIIGGQTPGDLENEKRKRMVKLEPGLVKLEDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.43
3	0.35
4	0.27
5	0.21
6	0.16
7	0.11
8	0.12
9	0.09
10	0.09
11	0.08
12	0.09
13	0.09
14	0.1
15	0.15
16	0.17
17	0.2
18	0.26
19	0.26
20	0.25
21	0.25
22	0.24
23	0.24
24	0.21
25	0.2
26	0.14
27	0.17
28	0.18
29	0.18
30	0.18
31	0.15
32	0.16
33	0.17
34	0.2
35	0.2
36	0.19
37	0.19
38	0.2
39	0.19
40	0.19
41	0.16
42	0.12
43	0.1
44	0.09
45	0.08
46	0.07
47	0.06
48	0.06
49	0.06
50	0.06
51	0.07
52	0.09
53	0.09
54	0.1
55	0.15
56	0.21
57	0.24
58	0.28
59	0.32
60	0.4
61	0.48
62	0.51
63	0.57
64	0.61
65	0.69
66	0.75
67	0.81
68	0.8
69	0.82
70	0.82
71	0.76
72	0.75
73	0.74
74	0.7
75	0.68
76	0.67
77	0.57
78	0.54
79	0.51
80	0.43
81	0.34
82	0.29
83	0.22
84	0.18
85	0.18
86	0.16
87	0.15
88	0.16
89	0.15
90	0.17
91	0.19
92	0.21
93	0.22
94	0.27
95	0.27
96	0.28
97	0.31
98	0.38
99	0.39
100	0.41
101	0.45
102	0.44
103	0.45
104	0.49
105	0.47
106	0.39
107	0.39
108	0.34
109	0.34
110	0.32
111	0.33
112	0.29
113	0.31
114	0.3
115	0.27
116	0.26
117	0.23
118	0.21
119	0.18
120	0.2
121	0.17
122	0.18
123	0.18
124	0.17
125	0.19
126	0.24
127	0.31
128	0.29
129	0.3
130	0.31
131	0.39
132	0.43
133	0.42
134	0.4
135	0.36
136	0.34
137	0.36
138	0.33
139	0.29
140	0.24
141	0.22
142	0.21
143	0.19
144	0.2
145	0.17
146	0.17
147	0.13
148	0.12
149	0.12
150	0.1
151	0.09
152	0.08
153	0.07
154	0.08
155	0.09
156	0.09
157	0.08
158	0.09
159	0.09
160	0.1
161	0.11
162	0.1
163	0.09
164	0.1
165	0.1
166	0.09
167	0.08
168	0.07
169	0.05
170	0.05
171	0.04
172	0.03
173	0.03
174	0.03
175	0.03
176	0.04
177	0.04
178	0.04
179	0.07
180	0.09
181	0.11
182	0.13
183	0.15
184	0.16
185	0.2
186	0.23
187	0.25
188	0.28
189	0.33
190	0.33
191	0.39
192	0.43
193	0.4
194	0.4
195	0.36
196	0.36
197	0.32
198	0.39
199	0.35
200	0.36
201	0.38
202	0.41
203	0.44
204	0.48
205	0.54
206	0.53
207	0.53
208	0.55
209	0.58
210	0.58
211	0.61
212	0.6
213	0.54
214	0.46
215	0.43
216	0.35
217	0.29
218	0.22
219	0.16
220	0.09
221	0.06
222	0.06
223	0.05
224	0.05
225	0.09
226	0.11
227	0.12
228	0.13
229	0.16
230	0.19
231	0.2
232	0.2
233	0.21
234	0.25
235	0.25
236	0.26
237	0.26
238	0.24
239	0.23
240	0.22
241	0.18
242	0.14
243	0.15
244	0.13
245	0.1
246	0.09
247	0.09
248	0.09
249	0.1
250	0.08
251	0.06
252	0.07
253	0.06
254	0.07
255	0.09
256	0.1
257	0.1
258	0.1
259	0.11
260	0.13
261	0.14
262	0.15
263	0.14
264	0.13
265	0.15
266	0.15
267	0.15
268	0.14
269	0.14
270	0.13
271	0.12
272	0.13
273	0.1
274	0.09
275	0.08
276	0.06
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.06
285	0.06
286	0.07
287	0.08
288	0.1
289	0.1
290	0.11
291	0.12
292	0.11
293	0.11
294	0.11
295	0.1
296	0.08
297	0.07
298	0.06
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.05
309	0.05
310	0.06
311	0.07
312	0.08
313	0.08
314	0.08
315	0.08
316	0.09
317	0.1
318	0.11
319	0.13
320	0.13
321	0.16
322	0.17
323	0.24
324	0.23
325	0.22
326	0.2
327	0.24
328	0.25
329	0.22
330	0.25
331	0.19
332	0.21
333	0.21
334	0.24
335	0.2
336	0.18
337	0.21
338	0.21
339	0.21
340	0.21
341	0.24
342	0.23
343	0.29
344	0.32
345	0.3
346	0.27
347	0.26
348	0.28
349	0.25
350	0.24
351	0.19
352	0.18
353	0.22
354	0.28
355	0.31
356	0.34
357	0.39
358	0.45
359	0.53
360	0.6
361	0.64
362	0.69
363	0.72
364	0.72
365	0.72
366	0.71
367	0.62
368	0.52
369	0.43
370	0.34
371	0.29
372	0.23
373	0.19
374	0.15
375	0.14
376	0.14
377	0.18
378	0.18
379	0.17
380	0.15
381	0.15
382	0.16
383	0.23
384	0.25
385	0.21
386	0.21
387	0.2
388	0.19
389	0.19
390	0.16
391	0.09
392	0.07
393	0.07
394	0.06
395	0.07
396	0.08
397	0.08
398	0.09
399	0.13
400	0.17
401	0.19
402	0.19
403	0.21
404	0.24
405	0.25
406	0.3
407	0.28
408	0.27
409	0.24
410	0.25
411	0.25
412	0.21
413	0.19
414	0.16
415	0.14
416	0.15
417	0.16
418	0.16
419	0.2
420	0.19
421	0.2
422	0.19
423	0.19
424	0.15
425	0.14
426	0.16
427	0.12
428	0.13
429	0.13
430	0.15
431	0.17
432	0.17
433	0.17
434	0.16
435	0.14
436	0.13
437	0.12
438	0.1
439	0.08
440	0.09
441	0.07
442	0.07
443	0.07
444	0.07
445	0.07
446	0.08
447	0.09
448	0.11
449	0.15
450	0.25
451	0.32
452	0.36
453	0.41
454	0.45
455	0.5
456	0.55
457	0.61
458	0.61
459	0.63
460	0.69
461	0.69
462	0.67
463	0.63

A0A1Y2BJU7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer