Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VSM2

Protein Details
Accession A0A1Y1VSM2    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-74ALVFKPKTQVQRHKKEAPAPHydrophilic
230-257VERRERERLERRDERRRKREAEQKKTEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-21KKPEAPRRGRGVVRGR
67-104HKKEAPAPSLLASAPKREHKPHGPARGAERGRGRGRGR
233-253RERERLERRDERRRKREAEQK
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 11.5, cyto_nucl 8, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MPDAPKKPEAPRRGRGVVRGRGGMPTGRLGSFRPTITGNTRATSSGSVSSSSGSALVFKPKTQVQRHKKEAPAPSLLASAPKREHKPHGPARGAERGRGRGRGRVELIQTVSGPFAQGPAMISSTSRRGGAGGFSGVLAPGMPKSENPNVDEPAQTDLSDPNAPVLLLTDHNEEITEDFDVQTEEMALKAAEEMRALKLDNNTAEVFSGEKLLVWQLPAMPEFELTAEVVERRERERLERRDERRRKREAEQKKTEDVKPSMAELEAGEPIDVEDKPVDDKPIDDKPDTEEETVEESDSEDSSLLDGRVGTLVVLKSGAVKLKIGQDLLLDVSLGADCQFFRGLMALDTKGSNSAFVLGNIDEQLVCTPDLENML
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.75
3 0.75
4 0.73
5 0.69
6 0.64
7 0.56
8 0.5
9 0.49
10 0.42
11 0.34
12 0.3
13 0.28
14 0.24
15 0.25
16 0.24
17 0.27
18 0.29
19 0.27
20 0.24
21 0.23
22 0.27
23 0.32
24 0.37
25 0.34
26 0.31
27 0.32
28 0.31
29 0.31
30 0.27
31 0.24
32 0.21
33 0.2
34 0.19
35 0.18
36 0.18
37 0.17
38 0.15
39 0.13
40 0.09
41 0.11
42 0.11
43 0.19
44 0.19
45 0.19
46 0.24
47 0.28
48 0.38
49 0.45
50 0.55
51 0.58
52 0.67
53 0.76
54 0.8
55 0.81
56 0.79
57 0.78
58 0.72
59 0.67
60 0.58
61 0.5
62 0.43
63 0.37
64 0.36
65 0.28
66 0.28
67 0.27
68 0.33
69 0.38
70 0.41
71 0.49
72 0.51
73 0.6
74 0.64
75 0.69
76 0.67
77 0.64
78 0.65
79 0.67
80 0.59
81 0.54
82 0.51
83 0.49
84 0.47
85 0.52
86 0.48
87 0.44
88 0.47
89 0.48
90 0.46
91 0.43
92 0.42
93 0.38
94 0.37
95 0.32
96 0.28
97 0.22
98 0.19
99 0.14
100 0.12
101 0.08
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.08
108 0.07
109 0.08
110 0.09
111 0.13
112 0.13
113 0.13
114 0.12
115 0.11
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.06
125 0.05
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.12
132 0.17
133 0.19
134 0.22
135 0.25
136 0.26
137 0.27
138 0.27
139 0.22
140 0.2
141 0.19
142 0.16
143 0.13
144 0.12
145 0.13
146 0.13
147 0.12
148 0.09
149 0.09
150 0.08
151 0.07
152 0.08
153 0.06
154 0.06
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.07
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.03
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.07
184 0.09
185 0.1
186 0.12
187 0.12
188 0.14
189 0.13
190 0.13
191 0.12
192 0.1
193 0.1
194 0.08
195 0.08
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.06
216 0.06
217 0.08
218 0.09
219 0.11
220 0.15
221 0.16
222 0.24
223 0.34
224 0.41
225 0.49
226 0.57
227 0.63
228 0.7
229 0.79
230 0.82
231 0.81
232 0.82
233 0.78
234 0.78
235 0.81
236 0.81
237 0.81
238 0.81
239 0.77
240 0.76
241 0.77
242 0.71
243 0.68
244 0.59
245 0.52
246 0.43
247 0.38
248 0.31
249 0.25
250 0.22
251 0.14
252 0.14
253 0.1
254 0.09
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.08
263 0.1
264 0.12
265 0.14
266 0.12
267 0.13
268 0.17
269 0.24
270 0.28
271 0.26
272 0.26
273 0.28
274 0.35
275 0.36
276 0.32
277 0.25
278 0.22
279 0.25
280 0.25
281 0.2
282 0.14
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.11
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.09
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.08
303 0.1
304 0.12
305 0.16
306 0.13
307 0.14
308 0.17
309 0.23
310 0.26
311 0.24
312 0.22
313 0.2
314 0.2
315 0.2
316 0.17
317 0.11
318 0.08
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.05
325 0.07
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.1
330 0.1
331 0.12
332 0.15
333 0.15
334 0.15
335 0.16
336 0.16
337 0.17
338 0.17
339 0.15
340 0.12
341 0.14
342 0.14
343 0.14
344 0.16
345 0.14
346 0.15
347 0.15
348 0.15
349 0.12
350 0.11
351 0.12
352 0.11
353 0.11
354 0.1
355 0.1