FuNGI

A0A1Y1W2H2

Protein Details

Accession

A0A1Y1W2H2

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-21	MSSGIKKKERKPIPSFLRPAG	Hydrophilic
28-51	APGSDLRRRRPLPPPNRAKPKSED	Basic
100-120	KLTRLSRTYYRRKAEKARAAA	Hydrophilic
477-499	MANNTSAKKRKRPMPSAHSHSNE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-50	KKKERKPIPSFLRPAGLRPGQAAPGSDLRRRRPLPPPNRAKPKSE
110-133	RRKAEKARAAAEEKRKEEEAKRAK
328-333	RKKRRP
484-504	KKRKRPMPSAHSHSNESRKHA

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 12, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSSGIKKKERKPIPSFLRPAGLRPGQAAPGSDLRRRRPLPPPNRAKPKSEDRPLAAAPPEDKRACTDYRLVSSAHERTHNVMRFLTSKPVDVTKFTQPVKLTRLSRTYYRRKAEKARAAAEEKRKEEEAKRAKETGMEIKEEEEQVPAAGEPVDPSKDRPKADTSIIAPFGGATRNKQMLFKKRTKQVFFADEEQRRLNIEEARPWVLEDYDEKESWNGTLEGGQKSDYVLFVLMDDGFKVVPVDRWYKFTPKLKYQTLTLDEAEEELKKAAKNETQNRWLMKKRTKQQGEEDEDEEPAEKPTKKTLVEYDNADEFDDDDDDDDGGARKKRRPTKHGDADEVDFDEEFADDEEMGDDLFGNEDDEADKQQQKNKKSELDSDVEEEDEGELGSAGKEMKKLMRKREENDAYDSDGEENPYLSVSEIDSDEEEQQPKPEEDKKDAVATDAKRAVSANAAAPAKEAAPKAAVLQKGQSDMANNTSAKKRKRPMPSAHSHSNESRKHAKTAPKPAESDDLITEKEVIELIKSGVTTTKALIGKVRSKLKANPANKARIQTIVRTVAILKDGNLSLKKRS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.84
2	0.82
3	0.75
4	0.75
5	0.65
6	0.61
7	0.59
8	0.53
9	0.43
10	0.4
11	0.39
12	0.34
13	0.34
14	0.32
15	0.27
16	0.32
17	0.35
18	0.38
19	0.42
20	0.45
21	0.54
22	0.56
23	0.59
24	0.61
25	0.67
26	0.72
27	0.76
28	0.8
29	0.81
30	0.89
31	0.86
32	0.82
33	0.8
34	0.8
35	0.79
36	0.78
37	0.75
38	0.68
39	0.71
40	0.66
41	0.62
42	0.53
43	0.46
44	0.4
45	0.37
46	0.4
47	0.35
48	0.34
49	0.33
50	0.36
51	0.35
52	0.35
53	0.37
54	0.35
55	0.39
56	0.4
57	0.36
58	0.34
59	0.39
60	0.4
61	0.37
62	0.35
63	0.32
64	0.35
65	0.44
66	0.46
67	0.4
68	0.36
69	0.36
70	0.35
71	0.35
72	0.39
73	0.31
74	0.29
75	0.29
76	0.34
77	0.32
78	0.33
79	0.35
80	0.35
81	0.42
82	0.4
83	0.43
84	0.39
85	0.43
86	0.45
87	0.48
88	0.44
89	0.43
90	0.48
91	0.47
92	0.53
93	0.58
94	0.63
95	0.65
96	0.7
97	0.71
98	0.73
99	0.79
100	0.81
101	0.81
102	0.77
103	0.73
104	0.71
105	0.69
106	0.69
107	0.68
108	0.66
109	0.59
110	0.55
111	0.52
112	0.5
113	0.49
114	0.52
115	0.52
116	0.52
117	0.54
118	0.52
119	0.5
120	0.48
121	0.47
122	0.46
123	0.39
124	0.33
125	0.29
126	0.28
127	0.3
128	0.28
129	0.24
130	0.16
131	0.13
132	0.11
133	0.11
134	0.09
135	0.07
136	0.06
137	0.06
138	0.06
139	0.08
140	0.11
141	0.11
142	0.15
143	0.23
144	0.28
145	0.3
146	0.32
147	0.35
148	0.36
149	0.39
150	0.4
151	0.34
152	0.34
153	0.34
154	0.3
155	0.25
156	0.21
157	0.19
158	0.18
159	0.16
160	0.13
161	0.18
162	0.22
163	0.23
164	0.28
165	0.35
166	0.41
167	0.49
168	0.56
169	0.59
170	0.64
171	0.72
172	0.71
173	0.69
174	0.65
175	0.62
176	0.57
177	0.55
178	0.56
179	0.5
180	0.49
181	0.44
182	0.38
183	0.33
184	0.3
185	0.27
186	0.23
187	0.21
188	0.23
189	0.26
190	0.27
191	0.26
192	0.25
193	0.23
194	0.17
195	0.16
196	0.13
197	0.14
198	0.15
199	0.15
200	0.15
201	0.15
202	0.15
203	0.14
204	0.14
205	0.1
206	0.07
207	0.11
208	0.15
209	0.15
210	0.15
211	0.16
212	0.14
213	0.14
214	0.14
215	0.1
216	0.07
217	0.06
218	0.06
219	0.05
220	0.06
221	0.06
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.04
226	0.04
227	0.05
228	0.04
229	0.07
230	0.1
231	0.15
232	0.16
233	0.21
234	0.23
235	0.28
236	0.34
237	0.39
238	0.42
239	0.46
240	0.52
241	0.52
242	0.51
243	0.48
244	0.48
245	0.44
246	0.4
247	0.32
248	0.25
249	0.2
250	0.19
251	0.18
252	0.12
253	0.09
254	0.07
255	0.08
256	0.08
257	0.09
258	0.11
259	0.15
260	0.23
261	0.31
262	0.37
263	0.41
264	0.45
265	0.46
266	0.48
267	0.5
268	0.5
269	0.5
270	0.52
271	0.55
272	0.62
273	0.65
274	0.64
275	0.66
276	0.68
277	0.66
278	0.6
279	0.53
280	0.43
281	0.38
282	0.33
283	0.26
284	0.16
285	0.11
286	0.12
287	0.12
288	0.12
289	0.16
290	0.2
291	0.2
292	0.22
293	0.26
294	0.27
295	0.28
296	0.3
297	0.28
298	0.26
299	0.25
300	0.23
301	0.17
302	0.13
303	0.11
304	0.09
305	0.06
306	0.05
307	0.06
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.06
312	0.08
313	0.12
314	0.15
315	0.2
316	0.28
317	0.37
318	0.46
319	0.52
320	0.59
321	0.66
322	0.74
323	0.74
324	0.7
325	0.64
326	0.56
327	0.5
328	0.41
329	0.3
330	0.19
331	0.14
332	0.1
333	0.07
334	0.06
335	0.05
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.05
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.03
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.04
348	0.03
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.07
353	0.1
354	0.15
355	0.16
356	0.23
357	0.29
358	0.34
359	0.41
360	0.45
361	0.49
362	0.48
363	0.54
364	0.53
365	0.5
366	0.46
367	0.41
368	0.35
369	0.28
370	0.24
371	0.17
372	0.12
373	0.09
374	0.07
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.05
381	0.06
382	0.07
383	0.09
384	0.15
385	0.24
386	0.3
387	0.4
388	0.49
389	0.55
390	0.58
391	0.67
392	0.69
393	0.64
394	0.63
395	0.55
396	0.47
397	0.41
398	0.38
399	0.29
400	0.22
401	0.2
402	0.14
403	0.12
404	0.09
405	0.09
406	0.09
407	0.07
408	0.07
409	0.06
410	0.07
411	0.07
412	0.08
413	0.09
414	0.1
415	0.12
416	0.14
417	0.15
418	0.14
419	0.16
420	0.19
421	0.19
422	0.22
423	0.27
424	0.29
425	0.34
426	0.38
427	0.38
428	0.39
429	0.38
430	0.36
431	0.36
432	0.32
433	0.33
434	0.33
435	0.3
436	0.27
437	0.27
438	0.25
439	0.21
440	0.21
441	0.16
442	0.19
443	0.19
444	0.18
445	0.19
446	0.19
447	0.17
448	0.18
449	0.17
450	0.12
451	0.13
452	0.13
453	0.16
454	0.2
455	0.21
456	0.19
457	0.22
458	0.23
459	0.24
460	0.24
461	0.22
462	0.2
463	0.2
464	0.22
465	0.24
466	0.22
467	0.24
468	0.32
469	0.38
470	0.43
471	0.51
472	0.56
473	0.6
474	0.7
475	0.76
476	0.79
477	0.81
478	0.85
479	0.84
480	0.84
481	0.8
482	0.74
483	0.71
484	0.7
485	0.64
486	0.6
487	0.61
488	0.55
489	0.57
490	0.58
491	0.61
492	0.61
493	0.69
494	0.71
495	0.67
496	0.66
497	0.64
498	0.64
499	0.55
500	0.48
501	0.4
502	0.33
503	0.28
504	0.27
505	0.24
506	0.17
507	0.16
508	0.14
509	0.1
510	0.09
511	0.09
512	0.09
513	0.1
514	0.1
515	0.1
516	0.13
517	0.15
518	0.15
519	0.15
520	0.21
521	0.22
522	0.23
523	0.27
524	0.31
525	0.37
526	0.44
527	0.52
528	0.49
529	0.53
530	0.6
531	0.65
532	0.68
533	0.66
534	0.68
535	0.68
536	0.73
537	0.71
538	0.69
539	0.6
540	0.58
541	0.56
542	0.51
543	0.51
544	0.47
545	0.44
546	0.4
547	0.39
548	0.33
549	0.33
550	0.28
551	0.21
552	0.2
553	0.21
554	0.26
555	0.31

A0A1Y1W2H2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer