Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1W0Y8

Protein Details
Accession A0A1Y1W0Y8    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-50KARTDTAKPPEQKKRLRGSKMSTHydrophilic
196-245EFARRETEKQERKERKYKKSVAELRKRTRVEEWERKRRERLRIEQAHEHTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-45RKKALERLKATKARTDTAKPPEQKKRLRG
204-236KQERKERKYKKSVAELRKRTRVEEWERKRRERL
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR022658  XPA_CS  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF05181  XPA_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00753  XPA_2  
Amino Acid Sequences MARELTDDQKQKIEENRKKALERLKATKARTDTAKPPEQKKRLRGSKMSTNYYEYNLTTMRDTKAGFIEEDPQKSPEKRRKILTLDEIPYDPSSTQKCRECASLDLDVAYLKVFKVPVCRKCIESVPDKYSLLTKTEAKDDYLLTDGELRDRERLPVWEKPNPHKHTWNNMLLYLREHLEAFAIEKWGGLEELDGEFARRETEKQERKERKYKKSVAELRKRTRVEEWERKRRERLRIEQAHEHTFEAIGDDSCEQKCTICGLTVEVEEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.58
3 0.65
4 0.66
5 0.68
6 0.7
7 0.69
8 0.68
9 0.67
10 0.67
11 0.68
12 0.68
13 0.69
14 0.69
15 0.63
16 0.59
17 0.57
18 0.55
19 0.53
20 0.55
21 0.62
22 0.61
23 0.67
24 0.72
25 0.75
26 0.78
27 0.79
28 0.81
29 0.82
30 0.83
31 0.82
32 0.79
33 0.8
34 0.79
35 0.76
36 0.68
37 0.63
38 0.56
39 0.5
40 0.45
41 0.35
42 0.29
43 0.24
44 0.22
45 0.19
46 0.21
47 0.19
48 0.19
49 0.19
50 0.18
51 0.2
52 0.2
53 0.19
54 0.17
55 0.23
56 0.25
57 0.27
58 0.27
59 0.26
60 0.29
61 0.32
62 0.41
63 0.42
64 0.48
65 0.51
66 0.55
67 0.61
68 0.62
69 0.66
70 0.65
71 0.63
72 0.55
73 0.51
74 0.46
75 0.4
76 0.34
77 0.28
78 0.19
79 0.15
80 0.18
81 0.19
82 0.25
83 0.28
84 0.3
85 0.3
86 0.33
87 0.32
88 0.3
89 0.31
90 0.27
91 0.23
92 0.21
93 0.19
94 0.16
95 0.14
96 0.11
97 0.07
98 0.04
99 0.05
100 0.06
101 0.06
102 0.16
103 0.24
104 0.29
105 0.35
106 0.37
107 0.37
108 0.39
109 0.43
110 0.37
111 0.37
112 0.36
113 0.33
114 0.35
115 0.33
116 0.31
117 0.29
118 0.26
119 0.21
120 0.18
121 0.17
122 0.16
123 0.19
124 0.2
125 0.18
126 0.18
127 0.16
128 0.14
129 0.13
130 0.12
131 0.08
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.12
136 0.11
137 0.13
138 0.13
139 0.14
140 0.13
141 0.18
142 0.2
143 0.26
144 0.31
145 0.33
146 0.37
147 0.45
148 0.54
149 0.55
150 0.55
151 0.57
152 0.57
153 0.61
154 0.64
155 0.62
156 0.53
157 0.5
158 0.47
159 0.39
160 0.35
161 0.27
162 0.2
163 0.14
164 0.13
165 0.11
166 0.1
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.15
189 0.25
190 0.34
191 0.41
192 0.53
193 0.61
194 0.69
195 0.78
196 0.83
197 0.83
198 0.85
199 0.86
200 0.83
201 0.84
202 0.85
203 0.86
204 0.87
205 0.87
206 0.85
207 0.86
208 0.78
209 0.71
210 0.67
211 0.66
212 0.66
213 0.66
214 0.68
215 0.7
216 0.77
217 0.8
218 0.83
219 0.81
220 0.81
221 0.8
222 0.8
223 0.8
224 0.81
225 0.82
226 0.81
227 0.79
228 0.74
229 0.65
230 0.55
231 0.45
232 0.35
233 0.28
234 0.21
235 0.17
236 0.11
237 0.11
238 0.12
239 0.14
240 0.14
241 0.16
242 0.14
243 0.14
244 0.15
245 0.17
246 0.18
247 0.17
248 0.17
249 0.19
250 0.21