FuNGI

H0EQ00

Protein Details

Accession

H0EQ00

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
411-434	KPPTSPELKKRRDSKKHEVKPVLQ	Basic
499-520	YNPQKSSKPESKKSKQDKKAAD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
4-23	KAARGPRAARGARGRGRGRP
93-166	SRGRGGAVGQRGKPAVESKFKPRAIRRDAGERERIRKEEMDKQAALEKEAEAEAARIARGLGRGRGRGGRGRGD
418-426	LKKRRDSKK
506-532	KPESKKSKQDKKAADAAASPSKSGKPI

Subcellular Location(s)

mito 15, nucl 9, cyto_mito 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002938 FAD-bd IPR036188 FAD/NAD-bd_sf IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0071949 F:FAD binding GO:0016491 F:oxidoreductase activity GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF01494 FAD_binding_3 PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKAARGPRAARGARGRGRGRPAAEAESSAPVIKSEEPDTHSLHEHTPSEAADPPSTTPQNVSPNSSPATVPTETPAPTPVRVAPPRAESSSRGRGGAVGQRGKPAVESKFKPRAIRRDAGERERIRKEEMDKQAALEKEAEAEAARIARGLGRGRGRGGRGRGDRLDRAVSSRNTNSASGLFGVAPEELARRTEGFSASRIGGGAGGGGGGGGGGGGGSGPSGTRIKSEGGGLAGLSGGSGGQNPFMYGANFVPEYDDDDDETERIDIDSMNDKWKLDRDGFAITGSRTREAGDGKMSNMDLMLPIRLSRIHHETKKAYINIPDDADLDVKQEEADGMEIDEEKSTNIPDGNESLPVKSESAMEEEVEPEEVPPPASIPSSPESKRKVARQIKPDIPSSPEAQFSDKVKPPTSPELKKRRDSKKHEVKPVLQTEEDTAEYERHLDEMEHLAKELGGVRARTRLDTDGDELMENEEEAFELDGKLFLFQFPPVLPSLYNPQKSSKPESKKSKQDKKAADAAASPSKSGKPIKVKNEPETEERIEHEVEVEEETKLVEQEGWIGKMVVRKSGKVELAWGGTSMIVHAGTAGDFLSTAVMVDGRERPTSLFRENEASEGSAVGMGKVFGKDGLNADVTIRAGLAGLSAAISTKLANSNHKVTILESAKELAEVGAGLQLTPNATRLFKSWGVYNTLLPLATAPAALHVRRYDGTKTLSSTPDFQSQIQERYNAPFWGMHRVDLQHALVSRCKELGVTIKLNSKVANVNFATATVTLESGEQIKGDLVLAADGLWSATRSQFLGHDSPPVHTGDLAYRIVINTADLADPDLRAFVEKKEVNFWIGPETHVDGAVVGALLKDVASAEELPRAAKIYEELRKGRGESIQRETFGQRVDFHRGDGLEQRARDEVFKKYEGREVGLDVEGWPSRWQGGTVQKWLYGYDAYEEVEKVLKEKHS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.69
2	0.67
3	0.7
4	0.68
5	0.65
6	0.71
7	0.7
8	0.64
9	0.6
10	0.57
11	0.53
12	0.48
13	0.43
14	0.37
15	0.34
16	0.32
17	0.26
18	0.22
19	0.17
20	0.18
21	0.18
22	0.19
23	0.2
24	0.23
25	0.26
26	0.3
27	0.33
28	0.33
29	0.34
30	0.33
31	0.32
32	0.33
33	0.31
34	0.28
35	0.28
36	0.25
37	0.24
38	0.27
39	0.27
40	0.23
41	0.24
42	0.25
43	0.31
44	0.32
45	0.3
46	0.27
47	0.31
48	0.38
49	0.39
50	0.44
51	0.38
52	0.41
53	0.43
54	0.42
55	0.35
56	0.29
57	0.32
58	0.26
59	0.24
60	0.22
61	0.24
62	0.23
63	0.24
64	0.27
65	0.24
66	0.24
67	0.26
68	0.28
69	0.33
70	0.36
71	0.4
72	0.4
73	0.43
74	0.47
75	0.49
76	0.48
77	0.42
78	0.47
79	0.52
80	0.49
81	0.43
82	0.38
83	0.34
84	0.36
85	0.39
86	0.39
87	0.36
88	0.35
89	0.39
90	0.39
91	0.38
92	0.36
93	0.35
94	0.34
95	0.36
96	0.39
97	0.45
98	0.54
99	0.58
100	0.64
101	0.67
102	0.7
103	0.7
104	0.72
105	0.68
106	0.69
107	0.73
108	0.71
109	0.73
110	0.69
111	0.68
112	0.68
113	0.65
114	0.59
115	0.56
116	0.55
117	0.55
118	0.57
119	0.56
120	0.5
121	0.49
122	0.51
123	0.45
124	0.41
125	0.32
126	0.23
127	0.18
128	0.18
129	0.16
130	0.11
131	0.1
132	0.1
133	0.1
134	0.09
135	0.07
136	0.08
137	0.09
138	0.13
139	0.16
140	0.21
141	0.25
142	0.28
143	0.31
144	0.36
145	0.39
146	0.42
147	0.44
148	0.47
149	0.47
150	0.52
151	0.54
152	0.55
153	0.54
154	0.51
155	0.51
156	0.42
157	0.41
158	0.42
159	0.39
160	0.39
161	0.38
162	0.38
163	0.36
164	0.36
165	0.33
166	0.26
167	0.24
168	0.18
169	0.17
170	0.13
171	0.1
172	0.11
173	0.09
174	0.08
175	0.07
176	0.08
177	0.08
178	0.09
179	0.1
180	0.1
181	0.12
182	0.14
183	0.16
184	0.16
185	0.17
186	0.19
187	0.18
188	0.17
189	0.16
190	0.14
191	0.11
192	0.09
193	0.08
194	0.05
195	0.04
196	0.03
197	0.03
198	0.02
199	0.02
200	0.02
201	0.01
202	0.01
203	0.01
204	0.01
205	0.01
206	0.02
207	0.02
208	0.02
209	0.02
210	0.05
211	0.07
212	0.07
213	0.09
214	0.11
215	0.12
216	0.14
217	0.15
218	0.13
219	0.13
220	0.13
221	0.11
222	0.1
223	0.08
224	0.07
225	0.05
226	0.04
227	0.03
228	0.03
229	0.04
230	0.04
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.07
235	0.08
236	0.09
237	0.09
238	0.09
239	0.11
240	0.11
241	0.11
242	0.11
243	0.11
244	0.14
245	0.15
246	0.15
247	0.13
248	0.14
249	0.15
250	0.13
251	0.14
252	0.1
253	0.08
254	0.07
255	0.07
256	0.06
257	0.07
258	0.14
259	0.15
260	0.19
261	0.2
262	0.2
263	0.21
264	0.25
265	0.27
266	0.22
267	0.24
268	0.22
269	0.24
270	0.24
271	0.24
272	0.21
273	0.18
274	0.2
275	0.18
276	0.17
277	0.14
278	0.15
279	0.17
280	0.17
281	0.18
282	0.2
283	0.19
284	0.19
285	0.21
286	0.2
287	0.17
288	0.15
289	0.13
290	0.08
291	0.08
292	0.08
293	0.06
294	0.06
295	0.07
296	0.09
297	0.1
298	0.14
299	0.21
300	0.28
301	0.32
302	0.39
303	0.4
304	0.44
305	0.5
306	0.48
307	0.43
308	0.41
309	0.39
310	0.35
311	0.34
312	0.29
313	0.22
314	0.21
315	0.19
316	0.13
317	0.12
318	0.09
319	0.08
320	0.07
321	0.06
322	0.06
323	0.05
324	0.05
325	0.04
326	0.04
327	0.05
328	0.05
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.05
333	0.06
334	0.06
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.08
339	0.11
340	0.11
341	0.14
342	0.15
343	0.14
344	0.14
345	0.15
346	0.14
347	0.12
348	0.12
349	0.09
350	0.12
351	0.12
352	0.11
353	0.1
354	0.11
355	0.1
356	0.1
357	0.09
358	0.06
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.06
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.09
368	0.11
369	0.17
370	0.19
371	0.25
372	0.29
373	0.34
374	0.39
375	0.42
376	0.5
377	0.54
378	0.59
379	0.61
380	0.65
381	0.66
382	0.65
383	0.61
384	0.52
385	0.46
386	0.41
387	0.35
388	0.28
389	0.24
390	0.21
391	0.21
392	0.23
393	0.21
394	0.26
395	0.27
396	0.29
397	0.28
398	0.28
399	0.3
400	0.37
401	0.43
402	0.43
403	0.49
404	0.57
405	0.63
406	0.69
407	0.74
408	0.76
409	0.78
410	0.8
411	0.81
412	0.82
413	0.83
414	0.85
415	0.81
416	0.75
417	0.73
418	0.69
419	0.61
420	0.49
421	0.41
422	0.33
423	0.29
424	0.24
425	0.17
426	0.12
427	0.1
428	0.09
429	0.1
430	0.08
431	0.07
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.1
436	0.12
437	0.11
438	0.11
439	0.11
440	0.11
441	0.11
442	0.11
443	0.09
444	0.09
445	0.1
446	0.1
447	0.15
448	0.16
449	0.16
450	0.16
451	0.15
452	0.16
453	0.16
454	0.18
455	0.14
456	0.14
457	0.14
458	0.12
459	0.11
460	0.09
461	0.07
462	0.05
463	0.04
464	0.03
465	0.04
466	0.04
467	0.03
468	0.03
469	0.03
470	0.04
471	0.04
472	0.05
473	0.04
474	0.05
475	0.05
476	0.05
477	0.06
478	0.06
479	0.07
480	0.07
481	0.08
482	0.08
483	0.08
484	0.16
485	0.21
486	0.24
487	0.24
488	0.26
489	0.31
490	0.34
491	0.41
492	0.42
493	0.44
494	0.52
495	0.61
496	0.66
497	0.72
498	0.79
499	0.82
500	0.82
501	0.82
502	0.78
503	0.73
504	0.73
505	0.63
506	0.53
507	0.44
508	0.39
509	0.35
510	0.3
511	0.24
512	0.18
513	0.17
514	0.2
515	0.21
516	0.23
517	0.28
518	0.35
519	0.43
520	0.52
521	0.56
522	0.59
523	0.64
524	0.61
525	0.55
526	0.53
527	0.46
528	0.38
529	0.33
530	0.29
531	0.23
532	0.19
533	0.16
534	0.11
535	0.09
536	0.1
537	0.09
538	0.07
539	0.07
540	0.07
541	0.06
542	0.06
543	0.06
544	0.04
545	0.04
546	0.08
547	0.09
548	0.1
549	0.1
550	0.1
551	0.11
552	0.15
553	0.16
554	0.18
555	0.18
556	0.19
557	0.22
558	0.26
559	0.26
560	0.23
561	0.24
562	0.19
563	0.2
564	0.19
565	0.16
566	0.11
567	0.1
568	0.09
569	0.07
570	0.06
571	0.04
572	0.04
573	0.04
574	0.03
575	0.03
576	0.04
577	0.04
578	0.03
579	0.03
580	0.03
581	0.03
582	0.03
583	0.03
584	0.03
585	0.03
586	0.04
587	0.05
588	0.09
589	0.11
590	0.11
591	0.12
592	0.13
593	0.17
594	0.21
595	0.23
596	0.22
597	0.21
598	0.26
599	0.26
600	0.26
601	0.22
602	0.19
603	0.15
604	0.13
605	0.12
606	0.08
607	0.08
608	0.06
609	0.05
610	0.05
611	0.06
612	0.06
613	0.06
614	0.06
615	0.07
616	0.08
617	0.09
618	0.11
619	0.11
620	0.11
621	0.11
622	0.11
623	0.11
624	0.1
625	0.08
626	0.06
627	0.05
628	0.05
629	0.04
630	0.03
631	0.03
632	0.03
633	0.03
634	0.03
635	0.03
636	0.04
637	0.04
638	0.05
639	0.1
640	0.12
641	0.17
642	0.21
643	0.25
644	0.26
645	0.28
646	0.27
647	0.23
648	0.3
649	0.27
650	0.24
651	0.2
652	0.2
653	0.19
654	0.18
655	0.18
656	0.08
657	0.06
658	0.05
659	0.05
660	0.05
661	0.05
662	0.05
663	0.05
664	0.05
665	0.06
666	0.06
667	0.08
668	0.09
669	0.09
670	0.1
671	0.12
672	0.18
673	0.2
674	0.21
675	0.23
676	0.24
677	0.29
678	0.3
679	0.28
680	0.24
681	0.23
682	0.21
683	0.16
684	0.14
685	0.09
686	0.08
687	0.08
688	0.06
689	0.08
690	0.11
691	0.12
692	0.14
693	0.14
694	0.16
695	0.17
696	0.21
697	0.2
698	0.21
699	0.26
700	0.25
701	0.28
702	0.3
703	0.32
704	0.3
705	0.32
706	0.31
707	0.33
708	0.33
709	0.3
710	0.33
711	0.34
712	0.38
713	0.36
714	0.35
715	0.3
716	0.33
717	0.35
718	0.28
719	0.25
720	0.22
721	0.22
722	0.29
723	0.29
724	0.25
725	0.25
726	0.26
727	0.27
728	0.27
729	0.27
730	0.19
731	0.21
732	0.22
733	0.22
734	0.23
735	0.22
736	0.19
737	0.19
738	0.16
739	0.16
740	0.22
741	0.24
742	0.25
743	0.27
744	0.33
745	0.34
746	0.35
747	0.34
748	0.28
749	0.29
750	0.26
751	0.3
752	0.24
753	0.25
754	0.24
755	0.23
756	0.22
757	0.16
758	0.17
759	0.1
760	0.09
761	0.08
762	0.08
763	0.09
764	0.09
765	0.09
766	0.08
767	0.08
768	0.07
769	0.07
770	0.07
771	0.07
772	0.06
773	0.06
774	0.05
775	0.05
776	0.05
777	0.04
778	0.04
779	0.04
780	0.04
781	0.05
782	0.06
783	0.08
784	0.08
785	0.09
786	0.11
787	0.16
788	0.2
789	0.2
790	0.25
791	0.25
792	0.26
793	0.27
794	0.26
795	0.22
796	0.18
797	0.18
798	0.16
799	0.19
800	0.18
801	0.16
802	0.16
803	0.15
804	0.16
805	0.15
806	0.11
807	0.08
808	0.09
809	0.08
810	0.08
811	0.1
812	0.1
813	0.1
814	0.1
815	0.1
816	0.09
817	0.11
818	0.12
819	0.12
820	0.2
821	0.23
822	0.25
823	0.29
824	0.31
825	0.32
826	0.32
827	0.31
828	0.28
829	0.26
830	0.25
831	0.22
832	0.24
833	0.2
834	0.19
835	0.18
836	0.13
837	0.12
838	0.11
839	0.08
840	0.05
841	0.04
842	0.04
843	0.04
844	0.04
845	0.04
846	0.04
847	0.04
848	0.06
849	0.08
850	0.09
851	0.13
852	0.13
853	0.14
854	0.14
855	0.16
856	0.14
857	0.13
858	0.16
859	0.21
860	0.28
861	0.35
862	0.37
863	0.39
864	0.42
865	0.43
866	0.43
867	0.42
868	0.44
869	0.43
870	0.49
871	0.51
872	0.49
873	0.5
874	0.49
875	0.45
876	0.4
877	0.36
878	0.32
879	0.31
880	0.39
881	0.36
882	0.35
883	0.36
884	0.33
885	0.33
886	0.35
887	0.38
888	0.35
889	0.34
890	0.35
891	0.34
892	0.35
893	0.37
894	0.33
895	0.33
896	0.34
897	0.39
898	0.4
899	0.4
900	0.46
901	0.44
902	0.44
903	0.38
904	0.34
905	0.32
906	0.29
907	0.26
908	0.2
909	0.22
910	0.18
911	0.18
912	0.17
913	0.15
914	0.16
915	0.17
916	0.18
917	0.2
918	0.3
919	0.35
920	0.41
921	0.42
922	0.42
923	0.42
924	0.41
925	0.37
926	0.28
927	0.22
928	0.18
929	0.18
930	0.17
931	0.18
932	0.18
933	0.16
934	0.19
935	0.18
936	0.16

H0EQ00

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer