FuNGI

H0EL50

Protein Details

Accession

H0EL50

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
85-107	AADHRKKNGKAWRKKMRGIKITQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
88-102	HRKKNGKAWRKKMRG

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 11.5, nucl 10.5, cyto 9.5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007252 Nup84/Nup107
Gene Ontology	GO:0031965 C:nuclear membrane GO:0031080 C:nuclear pore outer ring GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0006406 P:mRNA export from nucleus GO:0006606 P:protein import into nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF04121 Nup84_Nup100

Amino Acid Sequences

MSEGLRPPKELQLQGSEDHEDILHPLREAANRVGREVEKFAEVLDGYNPLRVTEKEERHARTIELIDQYHAIAKETLGRLREQHAADHRKKNGKAWRKKMRGIKITQETDEIDSEESDEEEFSEKLGHTTVDDMQRWEQEAQTWDLLARLVRLRYLQPQTEKPQATPVNKYSTAKELWEDFLATDELAIERKTVLDWLKDAADESGEDIDEMVQELQHNADRGDMIAHGWLHTNLQIKNVKRLKAAKETIDPSSGVASALMNTAGTELLVTQLDPDAVTRQGRAIQPEDQYFERAVWLGCYEMLRRGRSQSDVREWCVERSQVWRAVSMAGLPDEQLDEENEEGLDPESWILWRRMCYALAHNEVTDEYECAVYGILSGDSGSVEPVCRTFDDFIFAHYNALLRTQFDHYLQRIFHDNSIAATVGSFGISDAVQKHGESHSSGKRLIEISRMVPPYRRPLE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.45
3	0.4
4	0.32
5	0.29
6	0.25
7	0.17
8	0.17
9	0.2
10	0.18
11	0.16
12	0.17
13	0.2
14	0.23
15	0.27
16	0.32
17	0.34
18	0.33
19	0.35
20	0.38
21	0.36
22	0.37
23	0.36
24	0.31
25	0.25
26	0.24
27	0.22
28	0.2
29	0.19
30	0.16
31	0.14
32	0.16
33	0.15
34	0.18
35	0.18
36	0.15
37	0.19
38	0.18
39	0.26
40	0.31
41	0.37
42	0.43
43	0.51
44	0.54
45	0.56
46	0.57
47	0.5
48	0.45
49	0.41
50	0.38
51	0.35
52	0.31
53	0.28
54	0.27
55	0.26
56	0.25
57	0.22
58	0.18
59	0.14
60	0.13
61	0.19
62	0.21
63	0.25
64	0.22
65	0.23
66	0.24
67	0.27
68	0.34
69	0.28
70	0.32
71	0.38
72	0.47
73	0.54
74	0.6
75	0.65
76	0.67
77	0.68
78	0.7
79	0.7
80	0.71
81	0.74
82	0.76
83	0.79
84	0.78
85	0.85
86	0.86
87	0.85
88	0.84
89	0.79
90	0.78
91	0.76
92	0.72
93	0.65
94	0.58
95	0.49
96	0.42
97	0.36
98	0.27
99	0.18
100	0.14
101	0.14
102	0.12
103	0.1
104	0.08
105	0.07
106	0.07
107	0.08
108	0.08
109	0.07
110	0.09
111	0.09
112	0.09
113	0.1
114	0.09
115	0.08
116	0.1
117	0.14
118	0.18
119	0.19
120	0.21
121	0.22
122	0.23
123	0.26
124	0.24
125	0.2
126	0.18
127	0.2
128	0.2
129	0.18
130	0.17
131	0.14
132	0.14
133	0.14
134	0.11
135	0.1
136	0.11
137	0.11
138	0.12
139	0.13
140	0.15
141	0.23
142	0.27
143	0.3
144	0.32
145	0.39
146	0.43
147	0.5
148	0.48
149	0.41
150	0.45
151	0.46
152	0.45
153	0.44
154	0.43
155	0.41
156	0.43
157	0.43
158	0.36
159	0.34
160	0.32
161	0.27
162	0.25
163	0.2
164	0.19
165	0.18
166	0.17
167	0.12
168	0.12
169	0.11
170	0.09
171	0.07
172	0.06
173	0.06
174	0.06
175	0.06
176	0.05
177	0.05
178	0.05
179	0.05
180	0.08
181	0.1
182	0.1
183	0.1
184	0.11
185	0.12
186	0.12
187	0.12
188	0.09
189	0.08
190	0.07
191	0.07
192	0.06
193	0.05
194	0.05
195	0.05
196	0.04
197	0.04
198	0.05
199	0.04
200	0.03
201	0.04
202	0.04
203	0.05
204	0.06
205	0.07
206	0.06
207	0.07
208	0.06
209	0.06
210	0.07
211	0.06
212	0.05
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.09
220	0.13
221	0.12
222	0.17
223	0.22
224	0.22
225	0.32
226	0.36
227	0.36
228	0.36
229	0.42
230	0.41
231	0.46
232	0.48
233	0.42
234	0.42
235	0.43
236	0.4
237	0.35
238	0.3
239	0.21
240	0.19
241	0.15
242	0.1
243	0.08
244	0.06
245	0.05
246	0.06
247	0.05
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.05
263	0.06
264	0.08
265	0.08
266	0.08
267	0.09
268	0.14
269	0.15
270	0.18
271	0.19
272	0.22
273	0.24
274	0.26
275	0.28
276	0.24
277	0.24
278	0.21
279	0.18
280	0.15
281	0.13
282	0.11
283	0.09
284	0.08
285	0.07
286	0.07
287	0.08
288	0.09
289	0.14
290	0.19
291	0.2
292	0.21
293	0.25
294	0.26
295	0.3
296	0.35
297	0.35
298	0.41
299	0.43
300	0.44
301	0.47
302	0.46
303	0.43
304	0.41
305	0.35
306	0.27
307	0.28
308	0.31
309	0.3
310	0.29
311	0.28
312	0.25
313	0.25
314	0.23
315	0.18
316	0.14
317	0.1
318	0.09
319	0.08
320	0.08
321	0.08
322	0.08
323	0.07
324	0.07
325	0.07
326	0.07
327	0.08
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.07
337	0.1
338	0.11
339	0.13
340	0.14
341	0.18
342	0.2
343	0.21
344	0.23
345	0.27
346	0.32
347	0.35
348	0.34
349	0.3
350	0.29
351	0.28
352	0.27
353	0.21
354	0.14
355	0.1
356	0.09
357	0.09
358	0.09
359	0.09
360	0.06
361	0.06
362	0.06
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.1
375	0.11
376	0.14
377	0.16
378	0.16
379	0.2
380	0.2
381	0.23
382	0.25
383	0.25
384	0.22
385	0.2
386	0.21
387	0.16
388	0.2
389	0.16
390	0.13
391	0.16
392	0.19
393	0.22
394	0.23
395	0.3
396	0.29
397	0.34
398	0.33
399	0.32
400	0.35
401	0.35
402	0.34
403	0.31
404	0.29
405	0.24
406	0.26
407	0.23
408	0.16
409	0.13
410	0.12
411	0.09
412	0.08
413	0.07
414	0.05
415	0.06
416	0.06
417	0.09
418	0.09
419	0.13
420	0.14
421	0.14
422	0.17
423	0.18
424	0.2
425	0.21
426	0.28
427	0.33
428	0.37
429	0.39
430	0.37
431	0.39
432	0.39
433	0.38
434	0.36
435	0.32
436	0.3
437	0.37
438	0.4
439	0.38
440	0.41
441	0.45

H0EL50

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer