Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VXD0

Protein Details
Accession A0A1Y1VXD0    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
153-200GATGRKTKKAKRVDRHQKWMEKMQAARNADRKHKQRKGRSTNKSALIRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
157-193RKTKKAKRVDRHQKWMEKMQAARNADRKHKQRKGRST
226-234KKAKKAAAA
244-257GPKSLKAKHKAAIK
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 5, cyto 3, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MSTVGEAAKWGRERMLCCRSNMPGGTICPVRASDETNGLLILCLNRLNIISTAFFPSTPSVARIALFSSPLCNSTKQCPVSLANVQSIILPRPQQQQLPQSAHRLPDRASSQACLQPWRSQRRRRLISFRPLCHSFAGPVSSNDIDGEENEDGATGRKTKKAKRVDRHQKWMEKMQAARNADRKHKQRKGRSTNKSALIRGMGGLEESLREIQADQLAKDLFAPAKKAKKAAAAGGTTGPLQQGPKSLKAKHKAAIKEEKRFVQILGHPAFKADPLATIRQHLANSLNQQQQQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.47
3 0.45
4 0.46
5 0.5
6 0.49
7 0.52
8 0.5
9 0.44
10 0.38
11 0.36
12 0.38
13 0.34
14 0.3
15 0.25
16 0.24
17 0.25
18 0.21
19 0.24
20 0.21
21 0.25
22 0.25
23 0.24
24 0.23
25 0.19
26 0.17
27 0.14
28 0.12
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.09
33 0.09
34 0.11
35 0.11
36 0.12
37 0.12
38 0.13
39 0.17
40 0.17
41 0.16
42 0.16
43 0.16
44 0.17
45 0.16
46 0.16
47 0.14
48 0.14
49 0.15
50 0.14
51 0.14
52 0.13
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.14
58 0.15
59 0.16
60 0.18
61 0.22
62 0.31
63 0.3
64 0.3
65 0.31
66 0.32
67 0.34
68 0.37
69 0.34
70 0.27
71 0.25
72 0.24
73 0.22
74 0.21
75 0.17
76 0.15
77 0.14
78 0.16
79 0.22
80 0.25
81 0.26
82 0.3
83 0.36
84 0.41
85 0.45
86 0.44
87 0.44
88 0.43
89 0.45
90 0.41
91 0.36
92 0.3
93 0.3
94 0.3
95 0.28
96 0.26
97 0.24
98 0.25
99 0.26
100 0.26
101 0.23
102 0.23
103 0.26
104 0.33
105 0.42
106 0.48
107 0.54
108 0.62
109 0.69
110 0.75
111 0.75
112 0.77
113 0.75
114 0.77
115 0.76
116 0.7
117 0.65
118 0.6
119 0.54
120 0.46
121 0.38
122 0.28
123 0.21
124 0.21
125 0.15
126 0.13
127 0.14
128 0.13
129 0.13
130 0.12
131 0.11
132 0.08
133 0.08
134 0.1
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.1
144 0.15
145 0.21
146 0.27
147 0.36
148 0.46
149 0.55
150 0.62
151 0.72
152 0.79
153 0.83
154 0.87
155 0.86
156 0.82
157 0.76
158 0.73
159 0.67
160 0.6
161 0.55
162 0.5
163 0.49
164 0.45
165 0.46
166 0.46
167 0.44
168 0.48
169 0.53
170 0.56
171 0.6
172 0.65
173 0.71
174 0.74
175 0.81
176 0.84
177 0.86
178 0.87
179 0.85
180 0.84
181 0.82
182 0.76
183 0.66
184 0.57
185 0.47
186 0.38
187 0.29
188 0.22
189 0.14
190 0.09
191 0.08
192 0.06
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.11
201 0.12
202 0.11
203 0.14
204 0.14
205 0.14
206 0.14
207 0.15
208 0.13
209 0.13
210 0.18
211 0.21
212 0.29
213 0.31
214 0.34
215 0.35
216 0.39
217 0.41
218 0.42
219 0.41
220 0.34
221 0.34
222 0.32
223 0.3
224 0.23
225 0.21
226 0.16
227 0.11
228 0.11
229 0.1
230 0.16
231 0.19
232 0.28
233 0.34
234 0.4
235 0.48
236 0.55
237 0.6
238 0.59
239 0.63
240 0.62
241 0.64
242 0.69
243 0.68
244 0.7
245 0.7
246 0.69
247 0.64
248 0.59
249 0.5
250 0.46
251 0.43
252 0.42
253 0.4
254 0.38
255 0.34
256 0.34
257 0.34
258 0.27
259 0.25
260 0.16
261 0.17
262 0.19
263 0.25
264 0.25
265 0.28
266 0.3
267 0.3
268 0.3
269 0.28
270 0.28
271 0.28
272 0.33
273 0.39