Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VZS0

Protein Details
Accession A0A1Y1VZS0    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
63-82APAPARPRGRPKKTTEEPLDHydrophilic
120-140PETPVRRGPGRPRKNQTPDGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
39-77RTAAEPAKRGRGRPSGTKIRSKAAAPAPARPRGRPKKTT
87-133PVKRGSGRPKKSADNEPAQHKSSRAKKNPEAAQPETPVRRGPGRPRK
183-192RRGPGRPRKH
203-225PVRKAGRAKKPRSPTPSPARRKR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR040349  Csm1/Pcs1  
IPR020981  Csm1/Pcs1_C  
IPR038608  Csm1/Pcs1_C_sf  
Gene Ontology GO:0033551  C:monopolin complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12539  Csm1  
Amino Acid Sequences MPPRKIPDDDLAVAAKAGKLTPPPNAKRAAPPDTPLGVRTAAEPAKRGRGRPSGTKIRSKAAAPAPARPRGRPKKTTEEPLDASEMPVKRGSGRPKKSADNEPAQHKSSRAKKNPEAAQPETPVRRGPGRPRKNQTPDGSAITPVHSPAASAASPQSSVSRGPGRPRKHSEPPLDDPLATPVRRGPGRPRKHADTPTDPLTTPVRKAGRAKKPRSPTPSPARRKRTVAESLSDVDSRPAQHSQAKRARTEPPANDLIVDIVSPARFAKARAAVPTLERMRSADSDETMRWRRKFEDLSALRVTQAEKTLAELQKSAHKQTASAEAVISTLRKDNEELRRQIKKDGEKQQDSAELEARKALEKDVKVLQQQVETLSLDLVTKDAQIEQLEHHQRLAETSVDFNLRDSLRILQMISGLTIEEVVPEDQGMSYKCLQAGPTLTIGYVLTVFDDLPDEFQYTPYEETAELDVLPDFLRETMSFSQDSASLFFWRVCDHLNQIALQEPATNGNL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.2
3 0.14
4 0.13
5 0.12
6 0.17
7 0.2
8 0.29
9 0.38
10 0.43
11 0.48
12 0.53
13 0.53
14 0.57
15 0.63
16 0.61
17 0.54
18 0.52
19 0.53
20 0.51
21 0.49
22 0.4
23 0.35
24 0.28
25 0.25
26 0.23
27 0.24
28 0.24
29 0.25
30 0.28
31 0.29
32 0.39
33 0.42
34 0.43
35 0.45
36 0.5
37 0.54
38 0.6
39 0.66
40 0.66
41 0.7
42 0.77
43 0.72
44 0.68
45 0.66
46 0.57
47 0.56
48 0.52
49 0.54
50 0.46
51 0.52
52 0.52
53 0.57
54 0.59
55 0.56
56 0.61
57 0.63
58 0.71
59 0.7
60 0.72
61 0.74
62 0.79
63 0.84
64 0.8
65 0.76
66 0.69
67 0.64
68 0.6
69 0.49
70 0.42
71 0.38
72 0.31
73 0.26
74 0.24
75 0.22
76 0.21
77 0.28
78 0.37
79 0.42
80 0.49
81 0.55
82 0.59
83 0.67
84 0.7
85 0.73
86 0.7
87 0.69
88 0.68
89 0.68
90 0.67
91 0.62
92 0.57
93 0.5
94 0.51
95 0.51
96 0.56
97 0.57
98 0.61
99 0.65
100 0.73
101 0.78
102 0.78
103 0.75
104 0.69
105 0.65
106 0.6
107 0.59
108 0.53
109 0.46
110 0.39
111 0.35
112 0.36
113 0.37
114 0.44
115 0.49
116 0.56
117 0.65
118 0.72
119 0.8
120 0.82
121 0.84
122 0.78
123 0.74
124 0.67
125 0.62
126 0.54
127 0.46
128 0.38
129 0.31
130 0.26
131 0.19
132 0.17
133 0.11
134 0.1
135 0.09
136 0.11
137 0.1
138 0.1
139 0.11
140 0.1
141 0.11
142 0.11
143 0.12
144 0.1
145 0.11
146 0.14
147 0.2
148 0.22
149 0.31
150 0.39
151 0.44
152 0.52
153 0.6
154 0.64
155 0.67
156 0.73
157 0.73
158 0.72
159 0.72
160 0.7
161 0.62
162 0.55
163 0.45
164 0.41
165 0.38
166 0.29
167 0.24
168 0.19
169 0.23
170 0.24
171 0.27
172 0.32
173 0.38
174 0.46
175 0.55
176 0.6
177 0.61
178 0.68
179 0.73
180 0.69
181 0.66
182 0.62
183 0.57
184 0.52
185 0.45
186 0.4
187 0.37
188 0.32
189 0.25
190 0.27
191 0.25
192 0.26
193 0.34
194 0.42
195 0.48
196 0.56
197 0.61
198 0.63
199 0.7
200 0.75
201 0.75
202 0.72
203 0.71
204 0.71
205 0.76
206 0.78
207 0.79
208 0.79
209 0.75
210 0.72
211 0.66
212 0.63
213 0.6
214 0.53
215 0.45
216 0.39
217 0.36
218 0.34
219 0.31
220 0.23
221 0.16
222 0.14
223 0.13
224 0.13
225 0.12
226 0.12
227 0.18
228 0.21
229 0.3
230 0.35
231 0.37
232 0.37
233 0.39
234 0.42
235 0.44
236 0.48
237 0.4
238 0.39
239 0.38
240 0.36
241 0.33
242 0.27
243 0.2
244 0.13
245 0.11
246 0.06
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.11
255 0.15
256 0.17
257 0.18
258 0.2
259 0.2
260 0.21
261 0.27
262 0.24
263 0.2
264 0.19
265 0.18
266 0.18
267 0.18
268 0.2
269 0.14
270 0.13
271 0.15
272 0.15
273 0.21
274 0.25
275 0.3
276 0.29
277 0.3
278 0.32
279 0.36
280 0.38
281 0.35
282 0.4
283 0.35
284 0.4
285 0.4
286 0.37
287 0.31
288 0.29
289 0.27
290 0.17
291 0.17
292 0.13
293 0.1
294 0.13
295 0.2
296 0.21
297 0.21
298 0.2
299 0.19
300 0.26
301 0.28
302 0.27
303 0.24
304 0.22
305 0.22
306 0.23
307 0.31
308 0.25
309 0.23
310 0.21
311 0.17
312 0.18
313 0.17
314 0.15
315 0.07
316 0.09
317 0.09
318 0.1
319 0.12
320 0.19
321 0.29
322 0.36
323 0.41
324 0.46
325 0.53
326 0.54
327 0.58
328 0.58
329 0.57
330 0.59
331 0.63
332 0.65
333 0.61
334 0.62
335 0.58
336 0.56
337 0.49
338 0.41
339 0.36
340 0.27
341 0.23
342 0.23
343 0.22
344 0.18
345 0.17
346 0.18
347 0.19
348 0.18
349 0.22
350 0.26
351 0.29
352 0.29
353 0.32
354 0.31
355 0.27
356 0.27
357 0.24
358 0.21
359 0.18
360 0.16
361 0.12
362 0.1
363 0.09
364 0.08
365 0.08
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.08
371 0.09
372 0.1
373 0.11
374 0.21
375 0.26
376 0.26
377 0.26
378 0.25
379 0.24
380 0.25
381 0.25
382 0.18
383 0.13
384 0.14
385 0.16
386 0.16
387 0.16
388 0.15
389 0.19
390 0.17
391 0.17
392 0.17
393 0.18
394 0.18
395 0.19
396 0.19
397 0.14
398 0.16
399 0.15
400 0.13
401 0.1
402 0.08
403 0.07
404 0.07
405 0.06
406 0.05
407 0.07
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.07
412 0.07
413 0.09
414 0.1
415 0.12
416 0.14
417 0.16
418 0.17
419 0.18
420 0.18
421 0.2
422 0.21
423 0.2
424 0.2
425 0.18
426 0.17
427 0.17
428 0.16
429 0.13
430 0.1
431 0.08
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.06
436 0.08
437 0.08
438 0.09
439 0.11
440 0.12
441 0.12
442 0.13
443 0.15
444 0.16
445 0.17
446 0.16
447 0.16
448 0.14
449 0.16
450 0.17
451 0.16
452 0.13
453 0.12
454 0.12
455 0.11
456 0.11
457 0.09
458 0.08
459 0.07
460 0.1
461 0.09
462 0.15
463 0.17
464 0.2
465 0.21
466 0.2
467 0.21
468 0.21
469 0.22
470 0.18
471 0.17
472 0.16
473 0.17
474 0.17
475 0.17
476 0.17
477 0.17
478 0.18
479 0.2
480 0.23
481 0.27
482 0.29
483 0.28
484 0.28
485 0.3
486 0.28
487 0.25
488 0.21
489 0.16