Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1WDQ0

Protein Details
Accession A0A1Y1WDQ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-281LDKPGSTGRKSKKQKREERAEKRAEKQSABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-279TGRKSKKQKREERAEKRAEKQ
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003034  SAP_dom  
IPR036361  SAP_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF02037  SAP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50800  SAP  
Amino Acid Sequences MVSVQPSDMKVSDLRKELSTRSLSTKGVKKELIERLEEALKQSGETVGETSDDFDLLPANELAEVDNAAAAEELPTEEAVEAMETEKNTPAEVAETETKPEGDLKRKLEDDDDQDMEEAKEEAAIDDAQMSADNSSNTDGRPALYIKNLERPLTTFRMHDLLDKFGTVKDLRLNAIKTRCYVLFTSGAEAQAAFNSVDGTEFPSGRGKQLECGFLTESRFTQLVGQEERSQDNVGSLDLINVPEENGNCGVWLDKPGSTGRKSKKQKREERAEKRAEKQSAEEAKSNKDAQAGESRKQSKWENDPRVQWTKAKPSVMYRLPTDDEIAARKAQQSAATQA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.36
3 0.39
4 0.39
5 0.42
6 0.42
7 0.39
8 0.41
9 0.43
10 0.42
11 0.47
12 0.52
13 0.5
14 0.52
15 0.51
16 0.47
17 0.52
18 0.57
19 0.53
20 0.49
21 0.44
22 0.41
23 0.42
24 0.4
25 0.34
26 0.3
27 0.26
28 0.23
29 0.22
30 0.19
31 0.16
32 0.16
33 0.14
34 0.1
35 0.1
36 0.1
37 0.11
38 0.1
39 0.09
40 0.08
41 0.07
42 0.09
43 0.08
44 0.1
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.05
58 0.04
59 0.04
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.07
71 0.07
72 0.09
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.1
78 0.11
79 0.11
80 0.14
81 0.16
82 0.16
83 0.17
84 0.18
85 0.18
86 0.16
87 0.21
88 0.22
89 0.25
90 0.31
91 0.33
92 0.37
93 0.39
94 0.39
95 0.37
96 0.37
97 0.35
98 0.34
99 0.31
100 0.26
101 0.25
102 0.25
103 0.21
104 0.18
105 0.12
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.04
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.1
129 0.11
130 0.11
131 0.13
132 0.16
133 0.16
134 0.24
135 0.25
136 0.24
137 0.23
138 0.24
139 0.26
140 0.27
141 0.27
142 0.19
143 0.19
144 0.21
145 0.21
146 0.23
147 0.2
148 0.18
149 0.17
150 0.17
151 0.16
152 0.13
153 0.16
154 0.11
155 0.11
156 0.11
157 0.12
158 0.13
159 0.16
160 0.17
161 0.19
162 0.23
163 0.23
164 0.21
165 0.23
166 0.22
167 0.21
168 0.2
169 0.18
170 0.17
171 0.16
172 0.17
173 0.16
174 0.16
175 0.13
176 0.13
177 0.1
178 0.07
179 0.08
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.14
191 0.15
192 0.16
193 0.19
194 0.17
195 0.21
196 0.24
197 0.26
198 0.21
199 0.23
200 0.23
201 0.22
202 0.24
203 0.19
204 0.17
205 0.16
206 0.15
207 0.13
208 0.14
209 0.15
210 0.18
211 0.19
212 0.21
213 0.23
214 0.24
215 0.25
216 0.24
217 0.22
218 0.17
219 0.16
220 0.14
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.08
228 0.07
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.09
236 0.09
237 0.1
238 0.09
239 0.11
240 0.1
241 0.1
242 0.12
243 0.17
244 0.22
245 0.25
246 0.33
247 0.39
248 0.48
249 0.58
250 0.67
251 0.73
252 0.79
253 0.86
254 0.88
255 0.91
256 0.92
257 0.92
258 0.92
259 0.92
260 0.89
261 0.85
262 0.84
263 0.76
264 0.67
265 0.59
266 0.59
267 0.57
268 0.54
269 0.51
270 0.45
271 0.45
272 0.48
273 0.46
274 0.38
275 0.33
276 0.29
277 0.28
278 0.36
279 0.36
280 0.35
281 0.43
282 0.47
283 0.44
284 0.49
285 0.53
286 0.51
287 0.57
288 0.64
289 0.64
290 0.67
291 0.72
292 0.75
293 0.75
294 0.7
295 0.66
296 0.63
297 0.64
298 0.63
299 0.61
300 0.56
301 0.56
302 0.62
303 0.62
304 0.58
305 0.51
306 0.5
307 0.49
308 0.47
309 0.42
310 0.35
311 0.31
312 0.3
313 0.3
314 0.25
315 0.24
316 0.25
317 0.25
318 0.25
319 0.27