Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H0ECA2

Protein Details
Accession H0ECA2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
251-270AQAASKKKRKVKTQLSPSELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
256-260KKKRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 14, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031127  E3_UB_ligase_RBR  
IPR002867  IBR_dom  
IPR006575  RWD-domain  
IPR016135  UBQ-conjugating_enzyme/RWD  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PF05773  RWD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50908  RWD  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd23134  RING-HC_ITT1-like  
Amino Acid Sequences MDLREESDNEAKAIFPEIILNPNEPFSATIDLQVKPSNPVKVVFPAAADGILPTPPHSDTSSQHEGEPTRELENRSKFESHDLSYLPSLHLSIALPEGYPEEKPPQFKLSTNPAWLSRTHLDELEAYGKTMWEEAGRAVVAYGYIDFLQQSAENAFGFAEKGRLLEIPQDHKISLLDLDIRATQAAFAKETFDCGVCLDPKKGLVCHRMIDCGHVFCVECLQDFYNNAIKEGDLTFVRCLDPDCAKNRIAAQAASKKKRKVKTQLSPSELLQIPLEPEIVARYVKLKRKAALESDKNTIYCPRSWCQGAARSTKHKKSVGLEADDSSDEEGENDEQAAKAPNFLRNLYLRQHQPLLRVVATLAAIDKPNRDSHNEETYVAFKAVELMFEIESLEISLNRNLILMDKKQLNKPGCRCLFKWL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.11
3 0.14
4 0.15
5 0.2
6 0.22
7 0.23
8 0.21
9 0.22
10 0.22
11 0.19
12 0.18
13 0.15
14 0.19
15 0.17
16 0.22
17 0.24
18 0.25
19 0.27
20 0.29
21 0.27
22 0.28
23 0.33
24 0.32
25 0.3
26 0.31
27 0.32
28 0.33
29 0.36
30 0.3
31 0.26
32 0.22
33 0.21
34 0.19
35 0.16
36 0.11
37 0.09
38 0.1
39 0.09
40 0.09
41 0.11
42 0.12
43 0.15
44 0.16
45 0.19
46 0.21
47 0.29
48 0.36
49 0.34
50 0.34
51 0.36
52 0.35
53 0.34
54 0.35
55 0.28
56 0.25
57 0.28
58 0.31
59 0.35
60 0.42
61 0.43
62 0.43
63 0.43
64 0.4
65 0.43
66 0.44
67 0.38
68 0.34
69 0.31
70 0.29
71 0.29
72 0.29
73 0.22
74 0.18
75 0.16
76 0.12
77 0.12
78 0.1
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.12
88 0.17
89 0.2
90 0.24
91 0.27
92 0.3
93 0.31
94 0.33
95 0.36
96 0.39
97 0.41
98 0.42
99 0.41
100 0.38
101 0.38
102 0.36
103 0.37
104 0.3
105 0.29
106 0.26
107 0.24
108 0.23
109 0.22
110 0.24
111 0.21
112 0.18
113 0.14
114 0.13
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.09
119 0.06
120 0.07
121 0.06
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.12
153 0.15
154 0.19
155 0.22
156 0.23
157 0.22
158 0.22
159 0.22
160 0.17
161 0.14
162 0.1
163 0.09
164 0.08
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.11
176 0.11
177 0.12
178 0.12
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.1
183 0.1
184 0.12
185 0.12
186 0.11
187 0.13
188 0.14
189 0.15
190 0.18
191 0.21
192 0.22
193 0.24
194 0.24
195 0.26
196 0.25
197 0.26
198 0.22
199 0.17
200 0.16
201 0.13
202 0.13
203 0.09
204 0.11
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.11
212 0.15
213 0.15
214 0.15
215 0.14
216 0.13
217 0.14
218 0.13
219 0.13
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.14
229 0.17
230 0.2
231 0.23
232 0.23
233 0.25
234 0.25
235 0.25
236 0.23
237 0.21
238 0.23
239 0.29
240 0.37
241 0.44
242 0.48
243 0.51
244 0.58
245 0.64
246 0.67
247 0.69
248 0.72
249 0.74
250 0.79
251 0.81
252 0.79
253 0.74
254 0.64
255 0.6
256 0.5
257 0.4
258 0.29
259 0.21
260 0.16
261 0.14
262 0.14
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.12
270 0.18
271 0.26
272 0.33
273 0.37
274 0.39
275 0.45
276 0.49
277 0.52
278 0.55
279 0.56
280 0.52
281 0.52
282 0.51
283 0.46
284 0.43
285 0.39
286 0.32
287 0.28
288 0.3
289 0.27
290 0.3
291 0.32
292 0.33
293 0.34
294 0.38
295 0.41
296 0.44
297 0.47
298 0.53
299 0.6
300 0.64
301 0.66
302 0.62
303 0.6
304 0.56
305 0.61
306 0.57
307 0.53
308 0.48
309 0.42
310 0.4
311 0.35
312 0.32
313 0.22
314 0.15
315 0.1
316 0.08
317 0.09
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.07
323 0.09
324 0.14
325 0.12
326 0.16
327 0.18
328 0.23
329 0.25
330 0.26
331 0.29
332 0.28
333 0.33
334 0.33
335 0.38
336 0.37
337 0.4
338 0.46
339 0.43
340 0.43
341 0.44
342 0.44
343 0.37
344 0.33
345 0.29
346 0.24
347 0.22
348 0.18
349 0.14
350 0.11
351 0.12
352 0.14
353 0.16
354 0.17
355 0.23
356 0.25
357 0.29
358 0.33
359 0.38
360 0.45
361 0.45
362 0.43
363 0.4
364 0.39
365 0.36
366 0.31
367 0.24
368 0.14
369 0.17
370 0.16
371 0.14
372 0.14
373 0.14
374 0.13
375 0.13
376 0.14
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.08
381 0.07
382 0.1
383 0.12
384 0.12
385 0.12
386 0.12
387 0.12
388 0.16
389 0.21
390 0.21
391 0.27
392 0.34
393 0.4
394 0.46
395 0.54
396 0.58
397 0.62
398 0.66
399 0.7
400 0.71
401 0.72