Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1W5E9

Protein Details
Accession A0A1Y1W5E9    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MDSHRIRQQKRKEWLALKRERYGKBasic
388-411NESKMAKRRRLAKEFLNRKKQRPVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
393-410AKRRRLAKEFLNRKKQRP
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045146  SF3A1  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01805  Surp  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50128  SURP  
Amino Acid Sequences MDSHRIRQQKRKEWLALKRERYGKGFLASTDDEPDSTPIVFGYGARIFEQAERSDRADLIQLAETNTLVDRYDIRYLIDMNSIRRNEDTGTVVADPEMDARRFKSLETEENERCIFYMDSPERQAYIRQISEPDSEDASEASGTALQYDVEGKPVAPAVSALQLNHLDEANTDPPFCPSFSLSDGMAAPKSQRHFEIIERTARFISSQPADRSNQMELTIQGKQGNNSDFYFLNRDDSLYPFYKHIRWLMQAGLYGYNDESDSGSQSADDSKHDPESGSEEPSPDGDDKHANGEAAVPIQVPDDIMVPDGNARAVIDKVAKLVSQSADPPKLETKLRVEKATSMAMYSFLSPFDKCNAYYVFRRDCFARGVQVEDIVCVPAEPVMDDNESKMAKRRRLAKEFLNRKKQRPV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.87
3 0.86
4 0.83
5 0.82
6 0.8
7 0.75
8 0.69
9 0.65
10 0.59
11 0.53
12 0.48
13 0.4
14 0.39
15 0.37
16 0.34
17 0.32
18 0.28
19 0.24
20 0.23
21 0.24
22 0.19
23 0.16
24 0.14
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.09
29 0.13
30 0.14
31 0.15
32 0.16
33 0.17
34 0.17
35 0.2
36 0.24
37 0.21
38 0.23
39 0.25
40 0.26
41 0.28
42 0.27
43 0.25
44 0.25
45 0.22
46 0.21
47 0.2
48 0.19
49 0.18
50 0.19
51 0.17
52 0.14
53 0.14
54 0.11
55 0.09
56 0.09
57 0.1
58 0.13
59 0.17
60 0.17
61 0.17
62 0.18
63 0.19
64 0.2
65 0.24
66 0.23
67 0.23
68 0.3
69 0.3
70 0.3
71 0.29
72 0.29
73 0.24
74 0.25
75 0.24
76 0.17
77 0.19
78 0.17
79 0.17
80 0.15
81 0.13
82 0.11
83 0.11
84 0.14
85 0.12
86 0.13
87 0.15
88 0.19
89 0.19
90 0.19
91 0.24
92 0.25
93 0.31
94 0.35
95 0.41
96 0.38
97 0.42
98 0.42
99 0.34
100 0.3
101 0.24
102 0.2
103 0.13
104 0.22
105 0.21
106 0.24
107 0.27
108 0.27
109 0.26
110 0.26
111 0.27
112 0.22
113 0.26
114 0.24
115 0.22
116 0.24
117 0.26
118 0.27
119 0.27
120 0.24
121 0.18
122 0.17
123 0.16
124 0.14
125 0.12
126 0.09
127 0.07
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.09
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.12
151 0.12
152 0.13
153 0.12
154 0.08
155 0.08
156 0.12
157 0.12
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.13
162 0.14
163 0.13
164 0.11
165 0.1
166 0.11
167 0.13
168 0.14
169 0.12
170 0.13
171 0.13
172 0.12
173 0.12
174 0.1
175 0.09
176 0.1
177 0.12
178 0.12
179 0.12
180 0.14
181 0.16
182 0.19
183 0.26
184 0.26
185 0.31
186 0.3
187 0.31
188 0.28
189 0.27
190 0.24
191 0.17
192 0.18
193 0.14
194 0.18
195 0.19
196 0.22
197 0.23
198 0.24
199 0.25
200 0.22
201 0.21
202 0.17
203 0.16
204 0.13
205 0.15
206 0.14
207 0.13
208 0.16
209 0.15
210 0.15
211 0.18
212 0.19
213 0.18
214 0.17
215 0.18
216 0.15
217 0.16
218 0.19
219 0.15
220 0.17
221 0.14
222 0.15
223 0.14
224 0.16
225 0.18
226 0.17
227 0.18
228 0.17
229 0.2
230 0.2
231 0.22
232 0.23
233 0.22
234 0.22
235 0.23
236 0.22
237 0.21
238 0.2
239 0.19
240 0.17
241 0.14
242 0.13
243 0.11
244 0.1
245 0.09
246 0.08
247 0.07
248 0.06
249 0.08
250 0.08
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.1
255 0.1
256 0.11
257 0.12
258 0.14
259 0.15
260 0.16
261 0.15
262 0.14
263 0.19
264 0.19
265 0.2
266 0.19
267 0.18
268 0.18
269 0.18
270 0.2
271 0.14
272 0.13
273 0.12
274 0.14
275 0.14
276 0.17
277 0.17
278 0.15
279 0.14
280 0.15
281 0.14
282 0.11
283 0.11
284 0.08
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.06
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.09
303 0.11
304 0.11
305 0.12
306 0.13
307 0.13
308 0.12
309 0.15
310 0.14
311 0.14
312 0.19
313 0.24
314 0.28
315 0.28
316 0.3
317 0.31
318 0.34
319 0.35
320 0.35
321 0.37
322 0.43
323 0.47
324 0.47
325 0.45
326 0.45
327 0.46
328 0.45
329 0.36
330 0.27
331 0.23
332 0.21
333 0.2
334 0.18
335 0.15
336 0.11
337 0.13
338 0.12
339 0.14
340 0.17
341 0.19
342 0.18
343 0.23
344 0.25
345 0.28
346 0.34
347 0.4
348 0.45
349 0.43
350 0.45
351 0.42
352 0.41
353 0.42
354 0.38
355 0.37
356 0.3
357 0.33
358 0.31
359 0.33
360 0.3
361 0.26
362 0.24
363 0.17
364 0.15
365 0.11
366 0.1
367 0.08
368 0.08
369 0.07
370 0.08
371 0.1
372 0.13
373 0.14
374 0.15
375 0.19
376 0.2
377 0.21
378 0.29
379 0.35
380 0.4
381 0.47
382 0.56
383 0.61
384 0.69
385 0.75
386 0.76
387 0.78
388 0.82
389 0.86
390 0.87
391 0.84