Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VSB0

Protein Details
Accession A0A1Y1VSB0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-29TTSAVTTRKSHRPYRQYPLPRPENFHydrophilic
275-295KELHRIPAKKRPCYLQRKFASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
128-157SKASAAARKEKREKAAKAKAEAKAPVRITK
Subcellular Location(s) nucl 17, mito_nucl 12.333, cyto_nucl 10.833, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000232  HSF_DNA-bd  
IPR027725  HSF_fam  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00447  HSF_DNA-bind  
Amino Acid Sequences MIRSTTSAVTTRKSHRPYRQYPLPRPENFISILYNILEHHNYWCLHWNEDGTQIIVEHPESVAREVLPHHFGTRKYQSFTRQFHLYRFRRIADSRRDKKYKGYCRFFHPDFLRDHPHLISGITRVKVSKASAAARKEKREKAAKAKAEAKAPVRITKGAEIKIWRLNPASPNTSPSNDGTISPSALTMSGDDMSTPDIERTAPEFNTPEAKDAIGSLQILEDVVDELSLRGKSSRNHSLHSAPLFSAHSWPPAPSKTPSFICKINLSVRARLFHKELHRIPAKKRPCYLQRKFASSLPDDVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.65
3 0.73
4 0.77
5 0.8
6 0.83
7 0.84
8 0.87
9 0.88
10 0.87
11 0.79
12 0.78
13 0.7
14 0.63
15 0.55
16 0.47
17 0.38
18 0.29
19 0.28
20 0.2
21 0.18
22 0.15
23 0.16
24 0.16
25 0.14
26 0.16
27 0.19
28 0.19
29 0.2
30 0.28
31 0.27
32 0.27
33 0.28
34 0.29
35 0.25
36 0.28
37 0.28
38 0.2
39 0.18
40 0.16
41 0.15
42 0.14
43 0.12
44 0.09
45 0.08
46 0.09
47 0.1
48 0.11
49 0.11
50 0.1
51 0.11
52 0.12
53 0.16
54 0.17
55 0.17
56 0.18
57 0.21
58 0.23
59 0.3
60 0.38
61 0.38
62 0.39
63 0.43
64 0.5
65 0.55
66 0.58
67 0.55
68 0.54
69 0.51
70 0.54
71 0.6
72 0.55
73 0.55
74 0.55
75 0.51
76 0.49
77 0.52
78 0.54
79 0.54
80 0.61
81 0.6
82 0.66
83 0.69
84 0.64
85 0.69
86 0.71
87 0.71
88 0.7
89 0.71
90 0.64
91 0.68
92 0.75
93 0.66
94 0.65
95 0.57
96 0.51
97 0.46
98 0.47
99 0.45
100 0.38
101 0.38
102 0.29
103 0.27
104 0.22
105 0.19
106 0.16
107 0.13
108 0.16
109 0.14
110 0.15
111 0.14
112 0.15
113 0.16
114 0.16
115 0.16
116 0.16
117 0.2
118 0.25
119 0.29
120 0.38
121 0.4
122 0.47
123 0.52
124 0.52
125 0.55
126 0.58
127 0.59
128 0.61
129 0.65
130 0.61
131 0.59
132 0.62
133 0.57
134 0.51
135 0.49
136 0.41
137 0.38
138 0.35
139 0.33
140 0.28
141 0.27
142 0.25
143 0.26
144 0.28
145 0.23
146 0.24
147 0.22
148 0.24
149 0.27
150 0.26
151 0.23
152 0.2
153 0.21
154 0.23
155 0.25
156 0.27
157 0.23
158 0.26
159 0.27
160 0.27
161 0.27
162 0.24
163 0.23
164 0.19
165 0.19
166 0.18
167 0.16
168 0.15
169 0.13
170 0.12
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.05
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.1
188 0.12
189 0.12
190 0.13
191 0.15
192 0.15
193 0.22
194 0.21
195 0.21
196 0.18
197 0.18
198 0.16
199 0.15
200 0.15
201 0.1
202 0.09
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.09
218 0.13
219 0.17
220 0.25
221 0.35
222 0.35
223 0.38
224 0.42
225 0.44
226 0.47
227 0.46
228 0.4
229 0.29
230 0.29
231 0.28
232 0.24
233 0.25
234 0.19
235 0.21
236 0.2
237 0.21
238 0.23
239 0.25
240 0.28
241 0.28
242 0.32
243 0.34
244 0.38
245 0.41
246 0.41
247 0.41
248 0.42
249 0.4
250 0.41
251 0.4
252 0.45
253 0.44
254 0.47
255 0.47
256 0.48
257 0.47
258 0.47
259 0.44
260 0.42
261 0.46
262 0.5
263 0.5
264 0.54
265 0.61
266 0.62
267 0.66
268 0.69
269 0.71
270 0.69
271 0.71
272 0.71
273 0.72
274 0.78
275 0.81
276 0.81
277 0.79
278 0.78
279 0.76
280 0.7
281 0.67
282 0.59