FuNGI

A0A1Y1W2Q5

Protein Details

Accession

A0A1Y1W2Q5

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
566-593	PQEGSRTKKYRASRQRRLAKNPPKNYDP	Hydrophilic
601-630	RWIPLRQRSYYKPRGRNRKQLKMRGGAQGG	Hydrophilic
683-704	KSKGGKGGKKGGKKGGKGKRGW	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
549-624	ARSKKSAAAAKQPVKAKPQEGSRTKKYRASRQRRLAKNPPKNYDPERKPDSERWIPLRQRSYYKPRGRNRKQLKMR
682-704	SKSKGGKGGKKGGKKGGKGKRGW

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013699 Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd IPR026270 SRP72 IPR031545 SRP_TPR-like IPR011717 TPR-4 IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR019734 TPR_repeat
Gene Ontology	GO:0005783 C:endoplasmic reticulum GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0042802 F:identical protein binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
Pfam	View protein in Pfam PF08492 SRP72 PF17004 SRP_TPR_like PF07721 TPR_4 PF13174 TPR_6

Amino Acid Sequences

MSGQSVDSYYSAIKEAIENGNVAEAKIEVIGLIKQDLAAQALLAIKKARAAKLFTAKELEFEAAYCHFTLGSYDDAKKALKKVTASKAVTHLLAQIAYKSDDYAECVNLYEELLRDTDKESEEYQDLLLNQSAAKAAALQSAQSAGEQRPTEEHGSSYELMFNAATDLLVRGRIAEAADLLEMAATQARSSLASEGWSQEDIEGEVAPIEAQRGVALQTQGKTAEARAVFSRLLADKSLEGSARDIVAHNAAVLSISEYARRDIALDRVKRALQLPGSATRQLSRAQRALMRFNMAVVQFSQGQYASARRSLSRLSKSYSDIPNASAGTLSAAISLHLGSVDKALNELATISRSQQPSDAVFATLAAAQVAISAGDNQRALDVLTAWKDRAEGVSLGSLSAADQFARYYFGIVQLIGWLSGSRMSSTAPDAAKHLYTQVSKPGTYSARLLAAVGDCLALAGEPDAAKSCFNQAKQAAAEQNADVGTLGSTCLHAVLASGDNGAHQMSIAQLLKGYSRRSRVTRVIPGVRIRVSRQYQPKSSNASAGDGARSKKSAAAAKQPVKAKPQEGSRTKKYRASRQRRLAKNPPKNYDPERKPDSERWIPLRQRSYYKPRGRNRKQLKMRGGAQGGASEAGAGLGVTGSARIAGHIDGSQTPGHDSDDDHHEDSAAKNPQQTSGAGHSKSKGGKGGKKGGKKGGKGKRGW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.17
3	0.2
4	0.2
5	0.19
6	0.18
7	0.22
8	0.22
9	0.2
10	0.16
11	0.12
12	0.11
13	0.11
14	0.11
15	0.06
16	0.07
17	0.08
18	0.09
19	0.09
20	0.09
21	0.09
22	0.1
23	0.11
24	0.11
25	0.1
26	0.08
27	0.1
28	0.14
29	0.14
30	0.15
31	0.15
32	0.14
33	0.19
34	0.24
35	0.27
36	0.28
37	0.33
38	0.4
39	0.49
40	0.51
41	0.49
42	0.5
43	0.45
44	0.42
45	0.39
46	0.32
47	0.22
48	0.19
49	0.19
50	0.14
51	0.16
52	0.14
53	0.12
54	0.11
55	0.11
56	0.12
57	0.11
58	0.14
59	0.17
60	0.18
61	0.2
62	0.22
63	0.24
64	0.27
65	0.3
66	0.31
67	0.32
68	0.36
69	0.43
70	0.51
71	0.58
72	0.57
73	0.55
74	0.55
75	0.53
76	0.48
77	0.39
78	0.32
79	0.23
80	0.22
81	0.19
82	0.15
83	0.14
84	0.15
85	0.15
86	0.13
87	0.13
88	0.13
89	0.16
90	0.17
91	0.16
92	0.15
93	0.15
94	0.15
95	0.14
96	0.14
97	0.12
98	0.1
99	0.1
100	0.1
101	0.1
102	0.11
103	0.12
104	0.15
105	0.16
106	0.18
107	0.18
108	0.21
109	0.21
110	0.21
111	0.2
112	0.19
113	0.17
114	0.17
115	0.16
116	0.13
117	0.11
118	0.11
119	0.11
120	0.09
121	0.08
122	0.07
123	0.07
124	0.1
125	0.1
126	0.1
127	0.1
128	0.11
129	0.11
130	0.1
131	0.13
132	0.1
133	0.16
134	0.16
135	0.17
136	0.18
137	0.22
138	0.25
139	0.23
140	0.23
141	0.18
142	0.22
143	0.22
144	0.2
145	0.18
146	0.15
147	0.15
148	0.14
149	0.12
150	0.08
151	0.08
152	0.07
153	0.05
154	0.06
155	0.06
156	0.07
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.08
161	0.08
162	0.07
163	0.07
164	0.07
165	0.07
166	0.06
167	0.06
168	0.05
169	0.04
170	0.04
171	0.05
172	0.05
173	0.04
174	0.05
175	0.06
176	0.07
177	0.08
178	0.09
179	0.08
180	0.09
181	0.11
182	0.11
183	0.13
184	0.13
185	0.12
186	0.11
187	0.11
188	0.09
189	0.09
190	0.07
191	0.06
192	0.05
193	0.05
194	0.05
195	0.05
196	0.05
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.05
201	0.06
202	0.09
203	0.11
204	0.12
205	0.13
206	0.14
207	0.15
208	0.15
209	0.14
210	0.12
211	0.16
212	0.14
213	0.15
214	0.15
215	0.17
216	0.16
217	0.15
218	0.18
219	0.14
220	0.15
221	0.13
222	0.13
223	0.11
224	0.13
225	0.14
226	0.12
227	0.11
228	0.11
229	0.11
230	0.11
231	0.11
232	0.09
233	0.09
234	0.09
235	0.09
236	0.07
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.05
241	0.05
242	0.06
243	0.06
244	0.08
245	0.09
246	0.1
247	0.1
248	0.1
249	0.1
250	0.1
251	0.18
252	0.24
253	0.25
254	0.27
255	0.29
256	0.29
257	0.3
258	0.3
259	0.26
260	0.19
261	0.2
262	0.2
263	0.23
264	0.25
265	0.25
266	0.24
267	0.21
268	0.21
269	0.23
270	0.25
271	0.25
272	0.25
273	0.25
274	0.29
275	0.31
276	0.33
277	0.3
278	0.28
279	0.24
280	0.22
281	0.22
282	0.18
283	0.16
284	0.12
285	0.13
286	0.11
287	0.11
288	0.11
289	0.08
290	0.09
291	0.09
292	0.11
293	0.11
294	0.12
295	0.13
296	0.13
297	0.15
298	0.19
299	0.25
300	0.28
301	0.29
302	0.3
303	0.32
304	0.34
305	0.39
306	0.38
307	0.33
308	0.28
309	0.26
310	0.25
311	0.23
312	0.19
313	0.13
314	0.1
315	0.08
316	0.07
317	0.06
318	0.05
319	0.04
320	0.04
321	0.05
322	0.05
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.05
328	0.06
329	0.05
330	0.06
331	0.06
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.04
336	0.05
337	0.05
338	0.07
339	0.12
340	0.12
341	0.13
342	0.14
343	0.15
344	0.15
345	0.17
346	0.15
347	0.11
348	0.1
349	0.1
350	0.09
351	0.08
352	0.07
353	0.04
354	0.04
355	0.03
356	0.03
357	0.03
358	0.03
359	0.03
360	0.04
361	0.04
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.05
369	0.06
370	0.06
371	0.08
372	0.09
373	0.09
374	0.09
375	0.09
376	0.09
377	0.09
378	0.1
379	0.08
380	0.08
381	0.09
382	0.09
383	0.08
384	0.08
385	0.07
386	0.05
387	0.06
388	0.05
389	0.04
390	0.04
391	0.05
392	0.05
393	0.07
394	0.07
395	0.07
396	0.08
397	0.09
398	0.1
399	0.1
400	0.09
401	0.08
402	0.08
403	0.06
404	0.06
405	0.04
406	0.04
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.07
412	0.08
413	0.09
414	0.14
415	0.12
416	0.12
417	0.14
418	0.15
419	0.15
420	0.14
421	0.14
422	0.13
423	0.15
424	0.15
425	0.21
426	0.21
427	0.21
428	0.21
429	0.24
430	0.23
431	0.22
432	0.23
433	0.17
434	0.16
435	0.16
436	0.16
437	0.12
438	0.11
439	0.09
440	0.08
441	0.07
442	0.05
443	0.05
444	0.04
445	0.03
446	0.03
447	0.03
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.06
452	0.07
453	0.07
454	0.08
455	0.14
456	0.17
457	0.18
458	0.24
459	0.24
460	0.27
461	0.28
462	0.31
463	0.27
464	0.25
465	0.26
466	0.19
467	0.2
468	0.16
469	0.15
470	0.11
471	0.08
472	0.06
473	0.05
474	0.05
475	0.04
476	0.05
477	0.04
478	0.05
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.06
483	0.07
484	0.07
485	0.07
486	0.07
487	0.07
488	0.07
489	0.07
490	0.05
491	0.04
492	0.04
493	0.04
494	0.09
495	0.09
496	0.09
497	0.09
498	0.1
499	0.13
500	0.17
501	0.21
502	0.22
503	0.28
504	0.33
505	0.37
506	0.44
507	0.49
508	0.53
509	0.57
510	0.6
511	0.6
512	0.6
513	0.6
514	0.57
515	0.53
516	0.47
517	0.42
518	0.43
519	0.41
520	0.44
521	0.5
522	0.53
523	0.56
524	0.59
525	0.62
526	0.61
527	0.58
528	0.55
529	0.46
530	0.41
531	0.37
532	0.32
533	0.3
534	0.26
535	0.26
536	0.23
537	0.22
538	0.2
539	0.2
540	0.25
541	0.28
542	0.29
543	0.37
544	0.45
545	0.51
546	0.57
547	0.6
548	0.59
549	0.59
550	0.59
551	0.52
552	0.48
553	0.51
554	0.55
555	0.59
556	0.63
557	0.67
558	0.7
559	0.71
560	0.73
561	0.72
562	0.72
563	0.75
564	0.78
565	0.78
566	0.8
567	0.86
568	0.88
569	0.9
570	0.9
571	0.89
572	0.89
573	0.88
574	0.85
575	0.79
576	0.77
577	0.76
578	0.76
579	0.72
580	0.7
581	0.68
582	0.65
583	0.67
584	0.67
585	0.68
586	0.66
587	0.66
588	0.64
589	0.67
590	0.68
591	0.69
592	0.7
593	0.66
594	0.65
595	0.67
596	0.7
597	0.71
598	0.75
599	0.77
600	0.79
601	0.85
602	0.88
603	0.9
604	0.9
605	0.9
606	0.91
607	0.91
608	0.9
609	0.87
610	0.83
611	0.8
612	0.72
613	0.63
614	0.53
615	0.44
616	0.35
617	0.26
618	0.2
619	0.11
620	0.09
621	0.07
622	0.06
623	0.04
624	0.03
625	0.03
626	0.03
627	0.03
628	0.03
629	0.03
630	0.04
631	0.05
632	0.05
633	0.07
634	0.07
635	0.09
636	0.1
637	0.12
638	0.12
639	0.14
640	0.15
641	0.14
642	0.16
643	0.15
644	0.17
645	0.15
646	0.16
647	0.18
648	0.24
649	0.29
650	0.28
651	0.27
652	0.25
653	0.26
654	0.26
655	0.3
656	0.3
657	0.27
658	0.31
659	0.32
660	0.35
661	0.36
662	0.35
663	0.32
664	0.34
665	0.4
666	0.37
667	0.4
668	0.38
669	0.43
670	0.45
671	0.43
672	0.43
673	0.44
674	0.5
675	0.56
676	0.64
677	0.67
678	0.72
679	0.76
680	0.79
681	0.79
682	0.79
683	0.81
684	0.8

A0A1Y1W2Q5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer