Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H0ERE2

Protein Details
Accession H0ERE2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
160-180TPPLHFARKRRFRKGISRNAIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
167-173RKRRFRK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11, nucl 10, cyto 10, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MSLKLKLKVNTGGQPKSPTAGEGYDSEASDREIDPAIEEEFILRMMPGEDCEYLRAAINDKKIGVPISQGGPNIQMKFFHSEGRRAAVIIKGRPYAATLVDLPCIIEGMKSWDKRGWWKTADICQMLWVFAKVDKEEQAKTIPLPSIIDKETHQYPHGITPPLHFARKRRFRKGISRNAIEAVEDAIEKLLAADDAAISTRFEMIDPDMGRASQMYSPAPGSSPGRAQLDEDEYSEDDAEGEEDDNPEGYFGHIPQPMVEEDGDIDPDLEADLEAAFDAEETAAEPAPVPEEDSGDESIEGDDGEDDDEDDDAEIDEDEKARLAQIQGTKEDIEDLMKQIEMAQAQLAVQNNPILRRRVEENVRKLKAEVQLKKSSIGEGDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.52
3 0.48
4 0.42
5 0.35
6 0.29
7 0.26
8 0.24
9 0.2
10 0.23
11 0.22
12 0.22
13 0.22
14 0.19
15 0.18
16 0.18
17 0.17
18 0.14
19 0.13
20 0.13
21 0.14
22 0.15
23 0.14
24 0.12
25 0.12
26 0.1
27 0.1
28 0.1
29 0.08
30 0.06
31 0.06
32 0.07
33 0.08
34 0.09
35 0.11
36 0.13
37 0.13
38 0.15
39 0.15
40 0.15
41 0.16
42 0.15
43 0.17
44 0.2
45 0.25
46 0.26
47 0.26
48 0.26
49 0.26
50 0.27
51 0.23
52 0.2
53 0.19
54 0.2
55 0.21
56 0.21
57 0.2
58 0.23
59 0.27
60 0.26
61 0.24
62 0.21
63 0.22
64 0.27
65 0.27
66 0.29
67 0.28
68 0.31
69 0.33
70 0.35
71 0.33
72 0.28
73 0.28
74 0.26
75 0.29
76 0.27
77 0.29
78 0.26
79 0.26
80 0.26
81 0.26
82 0.23
83 0.18
84 0.16
85 0.15
86 0.14
87 0.15
88 0.14
89 0.13
90 0.11
91 0.1
92 0.08
93 0.06
94 0.05
95 0.12
96 0.19
97 0.2
98 0.22
99 0.24
100 0.26
101 0.36
102 0.4
103 0.4
104 0.36
105 0.41
106 0.44
107 0.49
108 0.53
109 0.45
110 0.4
111 0.36
112 0.34
113 0.29
114 0.24
115 0.17
116 0.11
117 0.12
118 0.14
119 0.11
120 0.13
121 0.17
122 0.19
123 0.19
124 0.2
125 0.2
126 0.19
127 0.19
128 0.2
129 0.16
130 0.14
131 0.15
132 0.14
133 0.16
134 0.15
135 0.16
136 0.14
137 0.17
138 0.19
139 0.19
140 0.19
141 0.17
142 0.17
143 0.21
144 0.24
145 0.23
146 0.2
147 0.2
148 0.27
149 0.28
150 0.31
151 0.28
152 0.31
153 0.39
154 0.5
155 0.56
156 0.58
157 0.64
158 0.67
159 0.76
160 0.8
161 0.8
162 0.78
163 0.72
164 0.64
165 0.57
166 0.5
167 0.39
168 0.29
169 0.18
170 0.11
171 0.07
172 0.06
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.03
177 0.03
178 0.02
179 0.02
180 0.02
181 0.02
182 0.03
183 0.03
184 0.04
185 0.03
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.06
192 0.1
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.1
199 0.11
200 0.08
201 0.09
202 0.08
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.12
211 0.15
212 0.16
213 0.16
214 0.16
215 0.16
216 0.19
217 0.18
218 0.17
219 0.16
220 0.14
221 0.15
222 0.14
223 0.11
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.12
240 0.13
241 0.13
242 0.13
243 0.15
244 0.15
245 0.15
246 0.14
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.1
251 0.08
252 0.08
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.04
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.1
280 0.13
281 0.13
282 0.12
283 0.12
284 0.11
285 0.1
286 0.09
287 0.08
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.1
310 0.1
311 0.15
312 0.2
313 0.23
314 0.25
315 0.27
316 0.27
317 0.25
318 0.25
319 0.2
320 0.17
321 0.15
322 0.15
323 0.14
324 0.13
325 0.13
326 0.13
327 0.15
328 0.13
329 0.12
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.13
334 0.14
335 0.12
336 0.13
337 0.16
338 0.18
339 0.23
340 0.28
341 0.29
342 0.28
343 0.32
344 0.36
345 0.42
346 0.51
347 0.55
348 0.61
349 0.68
350 0.7
351 0.67
352 0.63
353 0.6
354 0.58
355 0.58
356 0.56
357 0.54
358 0.6
359 0.59
360 0.62
361 0.57
362 0.51
363 0.43