Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1VWN1

Protein Details
Accession A0A1Y1VWN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
357-386EEENTKKSKKLKSKTKKRKRGQDKEYGVSRBasic
562-590VGFVPFNKDAKRRKGGRRGGNKKSKSGDPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
362-377KKSKKLKSKTKKRKRG
570-599DAKRRKGGRRGGNKKSKSGDPLKNLGKKRR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.833, cyto 13, nucl 12.5, mito_nucl 7.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008412  BSP_II  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005576  C:extracellular region  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0007155  P:cell adhesion  
GO:0001503  P:ossification  
Pfam View protein in Pfam  
PF05432  BSP_II  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17961  DEADc_DDX56  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MDEKLLDSKATFLSLDLDDRLLRALGNMGLVHPTLVQAKAIPLALAGKDILARAKTGSGKTAAYCLPVLHKILQAKDELSVNSEERKRTRSLILVPTRELAEQVSKYIADLSKFCGKDITAVNIATNAALHIQAPLLAESPDVVVSTPAKILKHLVAKSTSLETLETLVIDEADLVLSFGYEEDIRGILAHLPKIYQSMLMSATLNKGVESLKKLILTKPAILRLEDDKEESSSLVQYVVRCTEEDKFLLAYVILKLKLIAGKCILFVNDIDRSYRLKLFLEQFSIRACVLNSELPLNSRYHIVEEFNRGVYDYIIATDESDKMGEGDTKEDEEEEEEEAVEETEAAEEAKGEEDAEEENTKKSKKLKSKTKKRKRGQDKEYGVSRGIDFKGVAAVINFDFPLSARAYTHRVGRTARGGRRGMSLSFVTKEDAKQKTVQANEEPVFERVAVQQRKQGSEILPYKFDMAQVDGFRYRANDAMRSVTKTSIREARIKEIKQEILNSEKLKAHFEDKPRDLQFLRHDKELHPQQIQPHMRHIPQYLVPKIAGVAHADGVATTPEVGFVPFNKDAKRRKGGRRGGNKKSKSGDPLKNLGKKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.19
3 0.17
4 0.18
5 0.16
6 0.16
7 0.17
8 0.13
9 0.12
10 0.1
11 0.11
12 0.1
13 0.12
14 0.12
15 0.11
16 0.13
17 0.13
18 0.13
19 0.1
20 0.11
21 0.12
22 0.12
23 0.12
24 0.12
25 0.13
26 0.15
27 0.15
28 0.13
29 0.11
30 0.14
31 0.13
32 0.13
33 0.12
34 0.1
35 0.11
36 0.12
37 0.15
38 0.13
39 0.14
40 0.13
41 0.19
42 0.23
43 0.23
44 0.26
45 0.25
46 0.27
47 0.27
48 0.3
49 0.26
50 0.24
51 0.23
52 0.2
53 0.22
54 0.23
55 0.25
56 0.23
57 0.27
58 0.29
59 0.31
60 0.32
61 0.29
62 0.27
63 0.26
64 0.27
65 0.23
66 0.21
67 0.22
68 0.21
69 0.27
70 0.3
71 0.33
72 0.34
73 0.38
74 0.39
75 0.39
76 0.43
77 0.42
78 0.45
79 0.5
80 0.55
81 0.55
82 0.53
83 0.51
84 0.47
85 0.4
86 0.33
87 0.25
88 0.22
89 0.19
90 0.18
91 0.18
92 0.16
93 0.16
94 0.2
95 0.2
96 0.16
97 0.16
98 0.2
99 0.27
100 0.27
101 0.27
102 0.25
103 0.23
104 0.27
105 0.29
106 0.29
107 0.24
108 0.24
109 0.24
110 0.23
111 0.23
112 0.17
113 0.14
114 0.09
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.05
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.1
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.15
139 0.19
140 0.26
141 0.27
142 0.28
143 0.28
144 0.29
145 0.3
146 0.3
147 0.25
148 0.18
149 0.17
150 0.14
151 0.13
152 0.12
153 0.1
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.09
176 0.1
177 0.12
178 0.11
179 0.11
180 0.12
181 0.13
182 0.13
183 0.11
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.11
188 0.11
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.12
197 0.15
198 0.17
199 0.17
200 0.2
201 0.21
202 0.22
203 0.28
204 0.28
205 0.28
206 0.29
207 0.32
208 0.31
209 0.3
210 0.3
211 0.27
212 0.28
213 0.25
214 0.23
215 0.18
216 0.18
217 0.18
218 0.16
219 0.13
220 0.09
221 0.09
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.1
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.12
230 0.13
231 0.14
232 0.14
233 0.13
234 0.12
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.11
250 0.12
251 0.12
252 0.11
253 0.09
254 0.09
255 0.11
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.13
260 0.15
261 0.16
262 0.17
263 0.16
264 0.14
265 0.17
266 0.2
267 0.21
268 0.24
269 0.22
270 0.21
271 0.21
272 0.21
273 0.17
274 0.14
275 0.12
276 0.08
277 0.09
278 0.1
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.1
283 0.12
284 0.11
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.11
290 0.12
291 0.13
292 0.17
293 0.17
294 0.16
295 0.16
296 0.15
297 0.14
298 0.12
299 0.11
300 0.06
301 0.05
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.05
311 0.06
312 0.07
313 0.06
314 0.08
315 0.08
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.06
328 0.05
329 0.04
330 0.03
331 0.03
332 0.03
333 0.03
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.07
344 0.08
345 0.08
346 0.1
347 0.13
348 0.14
349 0.17
350 0.23
351 0.3
352 0.39
353 0.49
354 0.59
355 0.67
356 0.78
357 0.87
358 0.91
359 0.93
360 0.93
361 0.94
362 0.94
363 0.93
364 0.9
365 0.9
366 0.85
367 0.81
368 0.76
369 0.67
370 0.56
371 0.46
372 0.38
373 0.31
374 0.25
375 0.19
376 0.14
377 0.12
378 0.12
379 0.11
380 0.11
381 0.06
382 0.08
383 0.07
384 0.07
385 0.07
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.11
394 0.16
395 0.18
396 0.24
397 0.24
398 0.26
399 0.27
400 0.3
401 0.37
402 0.42
403 0.44
404 0.45
405 0.45
406 0.43
407 0.45
408 0.44
409 0.35
410 0.3
411 0.27
412 0.22
413 0.22
414 0.21
415 0.19
416 0.18
417 0.2
418 0.25
419 0.26
420 0.27
421 0.28
422 0.33
423 0.38
424 0.39
425 0.41
426 0.36
427 0.4
428 0.38
429 0.38
430 0.34
431 0.29
432 0.26
433 0.22
434 0.19
435 0.17
436 0.26
437 0.27
438 0.27
439 0.31
440 0.35
441 0.37
442 0.37
443 0.37
444 0.29
445 0.34
446 0.39
447 0.37
448 0.35
449 0.33
450 0.34
451 0.3
452 0.29
453 0.21
454 0.17
455 0.19
456 0.18
457 0.22
458 0.2
459 0.2
460 0.2
461 0.2
462 0.19
463 0.18
464 0.2
465 0.2
466 0.2
467 0.27
468 0.29
469 0.32
470 0.32
471 0.33
472 0.35
473 0.33
474 0.37
475 0.37
476 0.38
477 0.42
478 0.44
479 0.49
480 0.53
481 0.53
482 0.55
483 0.53
484 0.54
485 0.5
486 0.5
487 0.44
488 0.41
489 0.45
490 0.39
491 0.37
492 0.36
493 0.34
494 0.35
495 0.33
496 0.33
497 0.34
498 0.41
499 0.47
500 0.46
501 0.55
502 0.52
503 0.55
504 0.5
505 0.5
506 0.52
507 0.53
508 0.53
509 0.49
510 0.49
511 0.46
512 0.55
513 0.58
514 0.55
515 0.48
516 0.47
517 0.48
518 0.56
519 0.62
520 0.53
521 0.53
522 0.52
523 0.51
524 0.53
525 0.49
526 0.44
527 0.44
528 0.5
529 0.44
530 0.4
531 0.38
532 0.34
533 0.32
534 0.28
535 0.23
536 0.17
537 0.16
538 0.13
539 0.13
540 0.13
541 0.12
542 0.11
543 0.1
544 0.08
545 0.07
546 0.06
547 0.07
548 0.07
549 0.08
550 0.09
551 0.1
552 0.17
553 0.22
554 0.26
555 0.31
556 0.39
557 0.48
558 0.57
559 0.65
560 0.68
561 0.73
562 0.81
563 0.85
564 0.87
565 0.89
566 0.9
567 0.91
568 0.92
569 0.87
570 0.85
571 0.81
572 0.77
573 0.76
574 0.76
575 0.74
576 0.71
577 0.75
578 0.76
579 0.78