Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1W009

Protein Details
Accession A0A1Y1W009    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-35MFKPHPPKRRPKPQEPASCESKRQRTNRQSPVLEEHydrophilic
452-471MRKAPSFKRAEQTRNKREAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-12PKRRPK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9.5, mito 9, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
Gene Ontology GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
CDD cd00043  CYCLIN_SF  
Amino Acid Sequences MFKPHPPKRRPKPQEPASCESKRQRTNRQSPVLEEATQTRNLLACSECGSEEIIDNDSETYCGECGTVIDDLLLTADYSYEATGEQISRGNYVFLPRVIGDSGEAKDRLSKYINKVNMSLVRGRIAQLSALLGLPGLEDRAKHLFEDTAAILANRAESRIFGKFGHVYAAACVYIAGVEDGRPLTLVDLAAHAHLSVYVIGRAVKQVCTMLKLALSLKDPLLLIERTANRLFGQVIHSGANPDTLRTLEAQISVNYKVAKEFPRAIVEFLSTHGQLRPKIIEISGQVMNFARSCSLDTGCNPAAIASAAVVIGVEHAYLTDDETEVPDLKRAQRDVISKLLAATSGGSHHTTSKHVLAIQRSLVPASQTVPWLGDLKITTDTAALHVADIVSCFQRAQAWVFSTANVNGDERQDFSLVAADMRPATNAGDESDDSRRLSGPPLELDKLIAEMRKAPSFKRAEQTRNKREAVLGALGDNAELPGSISAEDFAIASLARQGINREALLSLPLSTLELLSSSIQRQADIGGQALDSVDVGPNDMPDEELCLYLKSHDKEQP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.94
2 0.91
3 0.87
4 0.84
5 0.8
6 0.77
7 0.76
8 0.75
9 0.74
10 0.74
11 0.79
12 0.81
13 0.86
14 0.87
15 0.88
16 0.81
17 0.76
18 0.75
19 0.68
20 0.58
21 0.49
22 0.44
23 0.38
24 0.36
25 0.32
26 0.25
27 0.23
28 0.22
29 0.22
30 0.18
31 0.16
32 0.17
33 0.18
34 0.17
35 0.16
36 0.17
37 0.15
38 0.15
39 0.15
40 0.13
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.11
46 0.1
47 0.1
48 0.08
49 0.08
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.09
54 0.09
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.05
62 0.04
63 0.04
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.06
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.12
74 0.13
75 0.14
76 0.15
77 0.15
78 0.14
79 0.18
80 0.19
81 0.16
82 0.18
83 0.17
84 0.18
85 0.17
86 0.17
87 0.14
88 0.15
89 0.16
90 0.18
91 0.17
92 0.16
93 0.21
94 0.22
95 0.24
96 0.26
97 0.31
98 0.34
99 0.43
100 0.48
101 0.44
102 0.45
103 0.47
104 0.47
105 0.44
106 0.41
107 0.34
108 0.31
109 0.3
110 0.29
111 0.25
112 0.2
113 0.17
114 0.14
115 0.12
116 0.11
117 0.1
118 0.09
119 0.06
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.09
127 0.13
128 0.14
129 0.14
130 0.15
131 0.14
132 0.14
133 0.17
134 0.14
135 0.11
136 0.11
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.1
141 0.07
142 0.08
143 0.07
144 0.08
145 0.11
146 0.13
147 0.15
148 0.13
149 0.17
150 0.18
151 0.18
152 0.2
153 0.18
154 0.15
155 0.14
156 0.15
157 0.11
158 0.09
159 0.09
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.1
190 0.11
191 0.1
192 0.11
193 0.13
194 0.13
195 0.15
196 0.15
197 0.13
198 0.12
199 0.13
200 0.13
201 0.13
202 0.14
203 0.13
204 0.12
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.14
209 0.12
210 0.11
211 0.15
212 0.16
213 0.18
214 0.19
215 0.19
216 0.16
217 0.17
218 0.17
219 0.13
220 0.14
221 0.12
222 0.13
223 0.13
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.14
228 0.12
229 0.11
230 0.1
231 0.09
232 0.1
233 0.1
234 0.12
235 0.08
236 0.1
237 0.11
238 0.11
239 0.13
240 0.13
241 0.14
242 0.13
243 0.12
244 0.12
245 0.15
246 0.16
247 0.18
248 0.19
249 0.2
250 0.24
251 0.24
252 0.24
253 0.21
254 0.19
255 0.16
256 0.14
257 0.14
258 0.1
259 0.1
260 0.12
261 0.14
262 0.13
263 0.15
264 0.15
265 0.14
266 0.14
267 0.14
268 0.14
269 0.12
270 0.15
271 0.15
272 0.14
273 0.13
274 0.13
275 0.13
276 0.11
277 0.11
278 0.07
279 0.06
280 0.07
281 0.08
282 0.09
283 0.1
284 0.1
285 0.17
286 0.16
287 0.16
288 0.15
289 0.13
290 0.12
291 0.11
292 0.1
293 0.04
294 0.04
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.02
303 0.02
304 0.03
305 0.03
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.05
310 0.06
311 0.07
312 0.08
313 0.08
314 0.09
315 0.11
316 0.14
317 0.18
318 0.18
319 0.2
320 0.23
321 0.27
322 0.28
323 0.3
324 0.28
325 0.24
326 0.24
327 0.21
328 0.16
329 0.13
330 0.1
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.08
335 0.09
336 0.11
337 0.12
338 0.14
339 0.16
340 0.17
341 0.16
342 0.18
343 0.21
344 0.22
345 0.23
346 0.23
347 0.22
348 0.2
349 0.19
350 0.17
351 0.14
352 0.13
353 0.12
354 0.11
355 0.1
356 0.1
357 0.11
358 0.11
359 0.12
360 0.11
361 0.12
362 0.11
363 0.12
364 0.13
365 0.13
366 0.12
367 0.11
368 0.11
369 0.1
370 0.11
371 0.09
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.06
376 0.07
377 0.07
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.07
382 0.09
383 0.1
384 0.12
385 0.15
386 0.16
387 0.2
388 0.2
389 0.2
390 0.21
391 0.2
392 0.19
393 0.16
394 0.15
395 0.13
396 0.15
397 0.15
398 0.14
399 0.15
400 0.14
401 0.13
402 0.12
403 0.14
404 0.12
405 0.12
406 0.1
407 0.1
408 0.1
409 0.1
410 0.1
411 0.08
412 0.08
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.11
417 0.11
418 0.14
419 0.17
420 0.19
421 0.18
422 0.19
423 0.19
424 0.17
425 0.21
426 0.21
427 0.21
428 0.23
429 0.28
430 0.28
431 0.27
432 0.27
433 0.24
434 0.22
435 0.21
436 0.17
437 0.13
438 0.16
439 0.2
440 0.25
441 0.26
442 0.25
443 0.33
444 0.38
445 0.43
446 0.48
447 0.53
448 0.57
449 0.67
450 0.77
451 0.78
452 0.8
453 0.76
454 0.68
455 0.61
456 0.54
457 0.47
458 0.4
459 0.3
460 0.22
461 0.21
462 0.19
463 0.17
464 0.14
465 0.09
466 0.05
467 0.04
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.07
475 0.07
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.05
480 0.05
481 0.07
482 0.08
483 0.09
484 0.1
485 0.13
486 0.17
487 0.2
488 0.2
489 0.19
490 0.18
491 0.17
492 0.18
493 0.16
494 0.12
495 0.09
496 0.09
497 0.09
498 0.09
499 0.09
500 0.07
501 0.07
502 0.08
503 0.1
504 0.12
505 0.12
506 0.17
507 0.18
508 0.18
509 0.17
510 0.18
511 0.2
512 0.19
513 0.19
514 0.14
515 0.14
516 0.14
517 0.14
518 0.12
519 0.08
520 0.07
521 0.08
522 0.07
523 0.09
524 0.09
525 0.1
526 0.11
527 0.11
528 0.11
529 0.09
530 0.14
531 0.14
532 0.15
533 0.15
534 0.15
535 0.15
536 0.18
537 0.26
538 0.25