Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1W2M0

Protein Details
Accession A0A1Y1W2M0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
212-240LEEVVEKRPRKKKRGKESKSERRARKAVKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
218-240KRPRKKKRGKESKSERRARKAVK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
Gene Ontology GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
Amino Acid Sequences MDDKWRQVKVVLSGYRDPGEGEQKIMRYLESTRDTRFQHCVWSNDADTVLLERTPNGVPTYTVVDIDELESQLVKRYAPTQEITGNIVRRQKFIDDLVFMSFLAGNDFLPPAVNMQTTDSDALDRLWRLYAGSPLVDMNIHDRGVINVDAFRILLDLLEVEYEQRDFRKHIGVMSLGSQLTALRIRRLAWDSQRHQLSNSESATATETEVLLEEVVEKRPRKKKRGKESKSERRARKAVKQKQDLPFASDTELEVKLLPEAAPLDEIFPVYVPLGECRSEPTLKYDGKPLLSPILLSATQFITDFAAKKPTMPVCEIIGYVNSGKLRWLQSMARAQGLEPKLVGPSDVEYEGMCRKWKLQRASKASDILLSTAMVVIGDIDYCPPSHILTLIHAEDTPASTTIALVSDNDWDILYADAKTEHRREQEHHEWRLRRYMQTYRTADAAFISHLCKHYALAVGWTAQYYFAQTVPSWHYAWPRDIESMGTAPMFSDFQLYIEAFAEVWSSVPRSDQPPPLPREHMLSVLPKEAWKLLDADEQQWAQMLAGQQYSESARKVVRARMENRLEDIACVRIWF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.47
3 0.42
4 0.36
5 0.32
6 0.35
7 0.3
8 0.3
9 0.3
10 0.3
11 0.33
12 0.31
13 0.27
14 0.22
15 0.23
16 0.28
17 0.31
18 0.33
19 0.35
20 0.41
21 0.44
22 0.46
23 0.49
24 0.42
25 0.45
26 0.47
27 0.46
28 0.44
29 0.46
30 0.43
31 0.39
32 0.38
33 0.28
34 0.22
35 0.21
36 0.18
37 0.13
38 0.12
39 0.1
40 0.13
41 0.14
42 0.15
43 0.15
44 0.15
45 0.15
46 0.17
47 0.22
48 0.19
49 0.19
50 0.17
51 0.16
52 0.15
53 0.16
54 0.16
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.15
60 0.15
61 0.14
62 0.14
63 0.19
64 0.23
65 0.26
66 0.28
67 0.26
68 0.29
69 0.3
70 0.32
71 0.33
72 0.32
73 0.32
74 0.38
75 0.36
76 0.35
77 0.36
78 0.34
79 0.32
80 0.33
81 0.33
82 0.28
83 0.28
84 0.28
85 0.25
86 0.22
87 0.19
88 0.16
89 0.12
90 0.11
91 0.1
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.12
103 0.14
104 0.15
105 0.16
106 0.14
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.14
111 0.13
112 0.12
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.13
117 0.16
118 0.14
119 0.14
120 0.13
121 0.13
122 0.13
123 0.12
124 0.11
125 0.11
126 0.12
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.14
132 0.14
133 0.11
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.09
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.06
150 0.07
151 0.08
152 0.1
153 0.12
154 0.14
155 0.2
156 0.2
157 0.21
158 0.23
159 0.23
160 0.22
161 0.22
162 0.22
163 0.15
164 0.15
165 0.13
166 0.1
167 0.11
168 0.14
169 0.13
170 0.12
171 0.14
172 0.15
173 0.19
174 0.23
175 0.27
176 0.31
177 0.4
178 0.41
179 0.48
180 0.52
181 0.47
182 0.46
183 0.44
184 0.4
185 0.36
186 0.33
187 0.27
188 0.23
189 0.23
190 0.23
191 0.19
192 0.16
193 0.1
194 0.09
195 0.07
196 0.08
197 0.07
198 0.05
199 0.04
200 0.05
201 0.06
202 0.09
203 0.15
204 0.17
205 0.25
206 0.35
207 0.44
208 0.53
209 0.63
210 0.7
211 0.76
212 0.86
213 0.85
214 0.87
215 0.89
216 0.9
217 0.9
218 0.89
219 0.85
220 0.82
221 0.83
222 0.77
223 0.76
224 0.75
225 0.74
226 0.75
227 0.76
228 0.76
229 0.74
230 0.77
231 0.68
232 0.61
233 0.53
234 0.43
235 0.36
236 0.28
237 0.22
238 0.16
239 0.15
240 0.11
241 0.09
242 0.09
243 0.07
244 0.08
245 0.07
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.1
265 0.13
266 0.13
267 0.14
268 0.17
269 0.22
270 0.23
271 0.23
272 0.26
273 0.25
274 0.25
275 0.25
276 0.21
277 0.17
278 0.15
279 0.15
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.06
290 0.07
291 0.09
292 0.08
293 0.13
294 0.13
295 0.13
296 0.18
297 0.19
298 0.2
299 0.2
300 0.21
301 0.18
302 0.18
303 0.18
304 0.14
305 0.12
306 0.11
307 0.09
308 0.1
309 0.09
310 0.08
311 0.08
312 0.12
313 0.13
314 0.13
315 0.16
316 0.15
317 0.2
318 0.27
319 0.27
320 0.25
321 0.23
322 0.22
323 0.26
324 0.26
325 0.21
326 0.15
327 0.14
328 0.13
329 0.13
330 0.13
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.09
338 0.11
339 0.12
340 0.12
341 0.11
342 0.16
343 0.22
344 0.3
345 0.37
346 0.45
347 0.53
348 0.6
349 0.65
350 0.64
351 0.6
352 0.53
353 0.46
354 0.37
355 0.28
356 0.2
357 0.15
358 0.11
359 0.08
360 0.07
361 0.05
362 0.04
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.05
371 0.06
372 0.06
373 0.07
374 0.08
375 0.08
376 0.1
377 0.13
378 0.13
379 0.13
380 0.12
381 0.12
382 0.11
383 0.12
384 0.11
385 0.08
386 0.08
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.06
393 0.06
394 0.07
395 0.08
396 0.08
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.08
402 0.06
403 0.07
404 0.09
405 0.11
406 0.16
407 0.2
408 0.25
409 0.29
410 0.32
411 0.36
412 0.43
413 0.52
414 0.56
415 0.6
416 0.63
417 0.63
418 0.63
419 0.69
420 0.62
421 0.56
422 0.53
423 0.53
424 0.52
425 0.57
426 0.57
427 0.49
428 0.48
429 0.44
430 0.38
431 0.3
432 0.24
433 0.15
434 0.13
435 0.14
436 0.14
437 0.15
438 0.16
439 0.15
440 0.15
441 0.16
442 0.19
443 0.17
444 0.16
445 0.16
446 0.16
447 0.16
448 0.16
449 0.13
450 0.1
451 0.1
452 0.1
453 0.1
454 0.09
455 0.11
456 0.11
457 0.15
458 0.19
459 0.22
460 0.21
461 0.23
462 0.28
463 0.3
464 0.34
465 0.33
466 0.31
467 0.3
468 0.29
469 0.28
470 0.24
471 0.22
472 0.19
473 0.15
474 0.12
475 0.11
476 0.12
477 0.11
478 0.08
479 0.1
480 0.09
481 0.09
482 0.12
483 0.12
484 0.12
485 0.12
486 0.12
487 0.09
488 0.09
489 0.09
490 0.07
491 0.07
492 0.08
493 0.08
494 0.08
495 0.11
496 0.14
497 0.19
498 0.25
499 0.32
500 0.4
501 0.48
502 0.53
503 0.57
504 0.58
505 0.54
506 0.55
507 0.49
508 0.44
509 0.38
510 0.39
511 0.36
512 0.35
513 0.34
514 0.29
515 0.29
516 0.28
517 0.25
518 0.2
519 0.19
520 0.18
521 0.26
522 0.27
523 0.26
524 0.29
525 0.28
526 0.27
527 0.25
528 0.23
529 0.15
530 0.15
531 0.16
532 0.13
533 0.15
534 0.15
535 0.14
536 0.16
537 0.19
538 0.2
539 0.18
540 0.19
541 0.2
542 0.26
543 0.31
544 0.36
545 0.41
546 0.48
547 0.52
548 0.59
549 0.65
550 0.62
551 0.61
552 0.6
553 0.51
554 0.44
555 0.41
556 0.33