Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1W3V9

Protein Details
Accession A0A1Y1W3V9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
214-235FAPVATQKSRKSKNQKEKVFVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-108SRSRQSARGPRGGRPEGGRPARR
250-265RGGRGGQRGGDRRGPR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 16.5, cyto 15, nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Amino Acid Sequences MSVASSNPFALLPDNAVDTDVSVQVVKSAKKAAAKTAAATPAAERAQPAERSLKRDYPTRGGHRRTVGRNAGASEETAAYPTHDKSRSRQSARGPRGGRPEGGRPARRQFDRHSGTGLVDSEKKEKQGWLGDDKATVEDGEKAAEQAKKDGQETATPAPEEVEEDVKTLEDYLKERATVSVDTDREIRKANEAGVDKKQLKEAVQFSREEDVFFAPVATQKSRKSKNQKEKVFVDIEQRFVDEQRRGAFRGGRGGQRGGDRRGPRQGRVDVNDQRAFPSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.14
4 0.13
5 0.11
6 0.12
7 0.11
8 0.1
9 0.09
10 0.09
11 0.12
12 0.16
13 0.17
14 0.17
15 0.21
16 0.24
17 0.29
18 0.31
19 0.35
20 0.39
21 0.39
22 0.39
23 0.4
24 0.4
25 0.35
26 0.34
27 0.27
28 0.24
29 0.24
30 0.22
31 0.17
32 0.17
33 0.22
34 0.23
35 0.25
36 0.29
37 0.31
38 0.37
39 0.42
40 0.45
41 0.42
42 0.49
43 0.51
44 0.5
45 0.56
46 0.6
47 0.65
48 0.63
49 0.66
50 0.67
51 0.69
52 0.66
53 0.66
54 0.61
55 0.55
56 0.52
57 0.46
58 0.41
59 0.34
60 0.28
61 0.21
62 0.16
63 0.13
64 0.12
65 0.1
66 0.09
67 0.11
68 0.12
69 0.18
70 0.21
71 0.23
72 0.27
73 0.38
74 0.47
75 0.5
76 0.54
77 0.58
78 0.64
79 0.68
80 0.72
81 0.63
82 0.59
83 0.62
84 0.59
85 0.51
86 0.44
87 0.44
88 0.44
89 0.49
90 0.49
91 0.45
92 0.5
93 0.55
94 0.54
95 0.52
96 0.48
97 0.51
98 0.51
99 0.47
100 0.42
101 0.35
102 0.33
103 0.31
104 0.26
105 0.17
106 0.15
107 0.16
108 0.17
109 0.17
110 0.18
111 0.17
112 0.17
113 0.19
114 0.22
115 0.23
116 0.24
117 0.26
118 0.25
119 0.24
120 0.24
121 0.21
122 0.16
123 0.13
124 0.08
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.09
131 0.11
132 0.11
133 0.12
134 0.14
135 0.15
136 0.15
137 0.17
138 0.14
139 0.15
140 0.18
141 0.18
142 0.18
143 0.16
144 0.16
145 0.14
146 0.13
147 0.12
148 0.1
149 0.1
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.08
159 0.12
160 0.12
161 0.13
162 0.13
163 0.14
164 0.15
165 0.14
166 0.16
167 0.18
168 0.18
169 0.19
170 0.22
171 0.22
172 0.21
173 0.24
174 0.21
175 0.19
176 0.2
177 0.2
178 0.23
179 0.25
180 0.27
181 0.28
182 0.35
183 0.33
184 0.33
185 0.35
186 0.31
187 0.3
188 0.32
189 0.35
190 0.35
191 0.36
192 0.36
193 0.35
194 0.38
195 0.36
196 0.3
197 0.25
198 0.19
199 0.16
200 0.15
201 0.14
202 0.09
203 0.12
204 0.15
205 0.17
206 0.2
207 0.26
208 0.36
209 0.44
210 0.54
211 0.62
212 0.69
213 0.77
214 0.83
215 0.85
216 0.84
217 0.8
218 0.76
219 0.69
220 0.6
221 0.59
222 0.51
223 0.45
224 0.37
225 0.35
226 0.29
227 0.27
228 0.31
229 0.25
230 0.26
231 0.29
232 0.31
233 0.32
234 0.36
235 0.39
236 0.35
237 0.41
238 0.43
239 0.43
240 0.44
241 0.44
242 0.43
243 0.47
244 0.51
245 0.47
246 0.5
247 0.5
248 0.52
249 0.61
250 0.62
251 0.59
252 0.61
253 0.63
254 0.64
255 0.64
256 0.68
257 0.65
258 0.69
259 0.67
260 0.59